转座子广泛存在于生物的基因组中,能够自我复制,并随机插入到染色体上,因此又被称为跳跃基因。转座子在生殖细胞中特别危险,可能导致不孕或对后代发育产生严重影响。在进化过程中,复杂生物形成了一套生殖细胞基因组的防御机制,这一机制被称为piRNA通路。
冷泉港实验室(CSHL)Gregory Hannon教授领导的研究团队对piRNA通路进行了研究。他们在雌性果蝇的卵巢中,鉴定了参与转座子抑制的一系列基因,获得了piRNA通路核心元件的综合列表。文章发表在Cell旗下的Molecular Cell杂志上。
动物的piRNA通路包括Piwi蛋白家族和小RNA分子(即piRNA)。自2006年发现piRNA以来,人们一直试图了解这些RNA如何产生又怎样发挥功能。此前,科学家们已经鉴定了piRNA通路中的一些重要成员,但该通路中还有许多成员是未知的。
“我们鉴定了piRNA通路发挥正常功能所必需的大量基因,并对其中一些进行了深入研究。”Hannon说。这项研究增进了人们对piRNA通路的理解,为解析整个转座子抑制机制提供了基础。
研究人员认为,这些发现可以帮助人们在体外重建piRNA通路,以便深入理解细胞选择性沉默基因的具体机制。在此基础上,人们有望开发新疗法,治疗与基因功能异常有关的复杂疾病,例如癌症和精神分裂症等。
这项研究在果蝇体内进行,因为它们具有人类生殖细胞防御系统的全部基本元素。研究人员在雌性生殖细胞和滤泡细胞(源自体细胞)中,通过RNA干涉(RNAi)对大量基因进行了筛选。为了分析单个基因对转座子水平的影响,他们在雌性生殖细胞中,一一下调了在卵巢表达的8000个基因,并用同样的方法在滤泡细胞中分别下调了果蝇基因组的全部13,900个基因。
在此基础上,研究人员鉴定了大量参与转座子抑制的基因,并选取影响最大的基因进行深入研究。研究显示,抑制asterix基因会使gypsy转座子的水平显著升高。当asterix基因被下调时,gypsy转座子活化,先生成一段RNA。正常情况下,Piwi蛋白与小RNA形成的复合体,能够识别该RNA序列,并使转录过程停止。
研究显示,piRNA使包装gypsy DNA的组蛋白发生化学修饰(H3K9三甲基化),以此给gypsy打上“沉默”标签。这时基因表达系统无法接触gypsy,使其保持在休眠状态。如果缺乏asterix,gypsy就可以开始转录,转座子得以扩散。
研究人员发现,一些在生殖细胞抑制转座子的基因,也在滤泡细胞中发挥同样的作用,说明它们是“核心piRNA通路”中的成员。在果蝇的生殖细胞中,可能活跃的转座子约有80 -100个,比滤泡和其他体细胞多得多。因此雌性生殖细胞中的piRNA机制更为精密,转座子的抑制系统包括更多的基因和辅助蛋白。
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