阐明介导子如何与TFIID串扰促进启动子-增强子之间的交流沟通对于揭示增强子功能的机制非常重要;近日,一篇发表在国际杂志Genes & Development上题为“The Pol II preinitiation complex (PIC) influences Mediator binding but not promoter–enhancer looping”的研究报告中,来自加利福尼亚大学医学院等机构的科学家们通过研究发现,名为转录因子TAF12的关键蛋白或在始发前复合体(preinitiation complex)的形成过程中扮演关键角色,这种始发前复合体包括了对蛋白编码基因转录所必需的100多个蛋白质,研究者还发现,通过消除TAF12蛋白就能破坏完整的始发前复合体,而且全基因组的转录也会被大幅下调。
本文研究结果或为靶向作用TAF12的癌症疗法的开发铺平了道路,并能潜在阻断癌细胞的转录以及降低癌变肿瘤的生长,此前研究人员发现,TAF12对于小鼠模型急性髓性白血病的进展至关重要。Michael Carey博士说道,识别出TAF12是始发前复合体的基石对于帮助我们促进对细胞中始发前复合体的消除至关重要,这在此前是并没有过的。
在过去几十年里,科学家们关于基因组如何被组装的机制以及对转录因子的结构的理解取得了重要的进展和进步;然而,增强子如何预启动子相互作用来开启基因表达的详细细节,研究人员却并不完全清除,启动子是一种能控制人类和小鼠机体基因组转录的关键遗传元件。有效的转录需要形成一种始发前复合体,而该复合体有100多个转录因子,其中包括两个称之为共激活因子的复合体,转录是机体中在制造蛋白质过程中扮演重要角色的基本生物学过程。
理解细胞中这两种主要的共激活因子的功能对于确定基因激活的精确机制是非常重要的,本文研究中,研究人员通过研究在共激活因子中识别出了关键蛋白,来观察是否关于基因调节和转录的知识是否最终会应用到癌症治疗过程中去。此外,研究人员还进行了一项shRNA基因敲除筛查来识别小鼠胚胎干细胞中基因转录过程中的关键蛋白,随后他们采用了一种名为“生长素诱导降解技术”(auxin-inducible degradation)的方法来快速移除所识别的转录因子,从而就能确定其对整个基因组中始发前复合体形成的影响效应。
综上,本文研究结果表明,TAF12和MED4能以不同的方式对启动子-增强子之间的交流沟通产生机械性上的贡献,但这两种因子似乎都没有直接控制启动子-增强子循环,从而就会使得其二者之间的通讯与物理循环相分离。
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