DNA双螺旋结构的发现证实了我们的遗传密码是以更复杂的对称性制造的,这些分子变体的形式影响我们的生物学功能。

“大多数人想到DNA时,首先想到的是双螺旋,这项新研究提醒我们,存在完全不同的DNA结构,对我们的细胞很重要。”来自澳大利亚加文医学研究所的抗体疗法研究员丹尼尔·克里斯特说。
该团队确定的新DNA成分被称为嵌入基序(i-motif)结构,该结构最早在20世纪90年代由研究人员发现,但到目前为止只有在体外见过,而不是在活细胞中。
因为这个所谓的i-motif喜欢酸性环境(科学家可以在实验室中创造一种条件,但不会在体内自然发生),许多科学家认为它不可能存在于人体细胞中。
而这回的研究终于实打实地发现:i-motif天然存在于人类细胞中,这意味着这个结构对细胞生物学的重要性,需要研究者们重新重视这个关键点。

019 dna i motif结构活细胞2。(Zeraati et al., Nat Chem, 2018)
如果你对DNA形状的唯一熟悉是由沃森和克里克所创造的双螺旋螺旋结构,那么i-motif的结构可能会让你大吃一惊。
联合主导这项研究的基因组学家Marcel Dinger解释道,“i-motif是DNA的四个链结,在结型结构中,DNA的相同链上的C [胞嘧啶]字母彼此结合 ,而在以往的双螺旋结构中,碱基反向识别匹配,C与G[鸟嘌呤]结合在一起。”
根据新研究的第一作者Garvan的Mahdi Zeraati的说法,i-motif还只是许多不采用双螺旋形式的DNA结构之一,而A-DNA,Z-DNA,三链DNA和十字形DNA也可能存在于我们的细胞中。
另一种名为G-quadruplex(G4)的DNA结构在2013年首次被人类细胞的研究人员可视化,他们利用一种工程抗体来揭示细胞内的G4。
在这项新研究中,Zeraati和其他研究人员采用了相同的技术,开发了一种能够特异性识别和结合i-motif的抗体片段(称为iMab)。这使得研究人员能用免疫荧光法突出了它们在细胞中的位置。

艺术家的印象,覆盖在细胞核心的iMab抗体(绿色)成像(Chris Hammang)
Zeraati说:“最让我们兴奋的是,我们可以看到绿色的斑点,i-motif随着时间的推移而出现和消失,我们成功观察到了它们形成、溶解和再次形成的全过程。”
虽然关于i-motif结构的功能还有很多东西需要了解,但研究结果表明,在细胞的“生命周期”中,短暂的i-motif通常形成于晚期(G1期),也就是DNA被积极“读取”时。
i-motifs也倾向于出现在所谓的“启动子”区域(控制基因是否开启或关闭的DNA区域)以及与衰老相关的端粒中。
“我们认为,i-motifs的到来和发展影响了这两个重点区域的功能,它们很可能在那里帮助开启或关闭基因,并影响基因是否被积极地阅读。”
现在我们已经明确知道细胞中存在这种新的DNA形式,它将使研究人员有权弄清楚这些结构在我们体内的作用,不管是i-motif,还是A-DNA,Z-DNA,三重DNA,和十字形DNA。
“这些替代的DNA构象,可能对细胞中的蛋白质识别其同源DNA序列并发挥其调节功能很重要,影响细胞正常运作,这些结构中的任何畸变都可能导致病理结果。”
Dinger补充说,“同样地,由于与常规形状的DNA相比,特殊结构的DNA数较少,靶向DNA的药物可能更具体地结合。这些类型的药物可能有助于癌症治疗。”
1812年夏,法兰西皇帝拿破仑·波拿巴率50万大军入侵俄罗斯帝国。然而到12月时,这支军队仅余零星残部。历史记载将此次“全军覆没”归因于饥寒交迫与斑疹伤寒。但一项新研究表示,从士兵牙齿中提取的DNA,......
美国北卡罗来纳大学研究团队研发出一种名为“DNA花朵”的微型机器人。这种机器人具有独特的自适应环境变化能力,能够像生物体一样,根据周围环境改变形状和行为。“DNA花朵”机器人由DNA与无机材料结合形成......
瑞士苏黎世联邦理工学院科学家在最新一期《自然》杂志上发表论文称,他们开发出一款名为MetaGraph的DNA搜索引擎,能快速、高效地检索公共生物学数据库中的海量信息,为研究生命科学提供了强大的专业工具......
究竟是什么让人脑与众不同?美国加州大学圣迭戈分校研究团队发现了一个名为HAR123的小型DNA片段,这将是解开人类大脑独特性之谜的关键。相关研究成果发表于新一期《科学进展》杂志。最新研究表明,HAR1......
究竟是什么让人脑与众不同?美国加州大学圣迭戈分校研究团队发现了一个名为HAR123的小型DNA片段,这将是解开人类大脑独特性之谜的关键。相关研究成果发表于新一期《科学进展》杂志。最新研究表明,HAR1......
基因组编辑技术作为生命科学领域的一项重要突破,为基础研究和应用开发提供了技术支撑。以CRISPR及其衍生技术为代表的编辑系统通过可编程的向导RNA引导Cas9等核酸酶靶向基因组特定位点,被广泛应用于特......
神经元中基因编辑的插图。图片来源:杰克逊实验室哪怕在五年前,人们也会认为在活体大脑中进行DNA修复是科幻小说中才有的情节。但现在,科学家已能进入大脑、修复突变,并让细胞在整个生命周期中维持住这种修复效......
国际知名学术期刊《自然》北京时间7月2日夜间在线发表一篇基因组学论文称,研究人员从上埃及Nuwayrat地区一个古王国墓葬中提取到一名古埃及个体的全基因组测序数据,这些数据分析可追溯至古埃及第三至第四......
在一项研究中,科学家对埃及一座墓葬中的一名古埃及人进行了全基因组测序。这些数据可追溯至古埃及第三至第四王朝,揭示了其与北非及中东地区,包括美索不达米亚古人群的亲缘关系,为早期埃及人的遗传多样性研究提供......
近年来,环状单链DNA(CssDNA)因其稳定性高、免疫原性弱、可编程性强,成为基因调控、细胞治疗等医学合成生物学领域很有潜力的分子工具之一。近期,中国科学院杭州医学研究所研究员宋杰团队针对此前开发的......