多基因风险评分(PRS)是一个时髦的新名词。它可以预测一个人患上冠状动脉疾病、乳腺癌或糖尿病等疾病的风险。最近,23andMe公司也开始提供2型糖尿病的多基因风险评分。
许多疾病是由一系列常见变异和低频变异所介导的。尽管每个变异的影响很小,不过综合起来可以预测一个人的风险。多基因风险评分的目标就是将患者分到不同的风险类别,为精准医疗打下基础。
然而,根据《Nature Genetics》上发表的一项研究,因来源数据缺乏多样性,多基因风险评分的有效性存在限制。研究发现,根据欧洲数据开发的多基因风险评分在预测欧洲人群的疾病风险方面比其他人群准确性更高。
Broad研究所和麻省总医院的研究人员利用UK Biobank的大量遗传数据,开发出身高、体重指数(BMI)、2型糖尿病及其他性状和疾病的预测评分。他们发现,多基因评分对欧洲人群的预测准确性比非洲人群高4.5倍,比东亚人群高2倍。
这篇文章的通讯作者、麻省总医院的博士后研究员Alicia Martin表示:“从临床角度来说,这意味着目前的多基因评分在预测欧洲人群的常见病风险方面要明显优于非洲人群。”
随着基因组测序技术的进步,欧洲人群的研究在过去几年迅速增长,而非欧洲人群的基因组研究自2014年以来停滞不前。截至2016年,遗传学研究中80%的参与者属于欧洲血统,相比之下,欧洲人口才占世界人口的16%。
UK Biobank(英国生物样本库)是目前最大的开放遗传数据库之一。它包含50万人的信息,其中超过90%是欧洲血统,而非洲、东南亚、西班牙裔或拉丁裔的人不到10%。
同时,Martin及其同事还利用东亚数据库BioBank Japan Project的数据开发出多基因评分,并发现与UK Biobank的评分相比,此评分在预测东亚人疾病风险方面的准确性要高出近50%。
“这进一步证实,如果风险评分是根据相关祖先的遗传数据得出的,那么会更准确,”Martin说。“研究人员在未来的遗传学研究中应当招募更多的少数族裔,并且将数据公开,这一点至关重要。如果不这样做,将导致医疗保健体系愈发不公平。”
研究人员认为,尽管非欧洲样本的规模远远小于目前最大规模的研究,但早期的多样化研究仍有望消除这种巨大的不平衡。为了充分实现多基因风险评估的潜力,遗传学研究必须优先考虑提高多样性,以确保那些被忽视个体的健康差距不会扩大。
水稻作为起源于热带或亚热带的粮食作物,其生长发育对低温胁迫敏感。伴随全球气候变化加剧,极端低温事件发生频率显著上升,发掘耐冷基因并解析分子机制,有利于水稻高产稳产遗传改良。目前,利用自然群体挖掘的水稻......
东南亚人群基因组计划概念图。受访者供图东南亚是全球最重要的人类演化区域之一。该地区人群拥有极高的遗传多样性,但基因组学研究却长期缺失,制约了人类环境适应性进化与疾病遗传机制的深度解析,因而被称为全球人......
近日,中国农业科学院油料所(以下简称油料所)油料基因工程与转基因安全评价创新团队发布了油菜害虫西北斑芫菁染色体水平高质量基因组数据,明确该害虫含10条染色体和11687个蛋白编码基因,为研发害虫绿色防......
经过20多年的努力,科研人员成功地对6种现存猿类的基因组进行了完整测序,为研究人类进化提供了近距离视角,这被英国《自然》杂志称为“遗传学的一个里程碑”。123名来自多个国家和地区的科研人员组成的团队9......
以色列特拉维夫大学近日发布公报说,该大学研究人员开发出一种基于人工智能的scNET系统,能深入了解细胞在肿瘤等复杂生物环境中的行为变化,有望为疾病治疗研究提供新途径。公报说,当前单细胞测序技术日益成熟......
以色列耶路撒冷希伯来大学近日发布公报说,该校研究人员绘制出一份较为全面的人类基因“隐秘开关”图谱,有助于推动遗传疾病等方面研究。人类遗传物质脱氧核糖核酸(DNA)上的基因可以被甲基化,这可以使相关基因......
在植物的奇妙世界里,油茶作为重要的木本食用油料植物,有着超2300年的栽培历史,其用途广泛,在全球粮食危机的大背景下愈发受到关注。攸茶(Camelliameiocarpa Hu)是其中一员,......
研究背景在广袤的农田里,有一种害虫正悄无声息地威胁着农作物的生长,它就是粘虫(Mythimnaseparata)。粘虫堪称农业界的“破坏大王”,凭借着强大的迁飞能力和不挑食的习性,所到之处,水稻、玉米......
杂种坏死是一种在植物杂交后代中常见的遗传不亲和现象,表现为叶片坏死、生长迟缓和不育等症状。杂种坏死的发生严重阻碍了优良性状的聚合,限制了新品种的培育。早在一百年前,育种家便发现了小麦中的杂种坏死现象,......
近日,北京市农林科学院玉米所赵久然/王凤格团队在国际著名植物学期刊《JournalofIntegrativePlantBiology》在线发表了题为“Insightsintothegenomicdiv......