Nature：像海绵一样的非编码RNA

　　一种称为RsmZ的小分子RNA具有特殊的功能：屏蔽细菌中抑制翻译的蛋白的作用，最新一项研究揭示了这种RNA如何能完成其功能的分子机制，指出RsmZ像海绵一样能吸收多种阻遏蛋白（repressor proteins）。

　　小 RNA（small RNAs 或 sRNAs）是一类长度为40-400个核苷酸的非编码 RNA 分子，广泛存在于从细菌到哺乳动物等多种不同的生物体内，执行多种生物学功能，如 mRNA分子的翻译抑制、降解断裂等。

　　在荧光假单胞杆菌 Pseudomonas fluorescens CHA0 中存在RsmA 和 RsmE 两个小分子阻遏蛋白，它们通过与目标基因 mRNA的核糖体结合位点结合，达到阻碍蛋白合成的效果；小RNA因子 RsmX、RsmY和RsmZ 则竞争性结合 RsmA和RsmE，释放mRNA 的核糖体结合位点，从而促进其翻译。

　　之前的研究表明这些Rsm分子具有特殊的作用，但是其具体的结构分子机制还并不清楚。在这篇文章中，研究人员利用一种特殊的操作指南，结合核磁共振（NMR）等方法，解析了RsmZ的分子结构，为深入了解相关作用机制铺平了道路。

　　相对于蛋白，RNA和RNA-蛋白结合复合物的结构更加难以破解，在这项研究中，来自苏黎世联邦理工学院的研究人员采用了一种来自Nature Communications论文的详细操作指南方法，并结合核磁共振（NMR）和电子顺磁共振波普（electron paramagnetic resonance spectroscopy，EPRS）方法，确定了这一复合物的结构。

　　这是一个“非常强大”的工具，杜克大学医学院生物化学教授Hashim Al-Hashimi表示（他未参与该项研究）。电子顺磁共振波谱，又称作电子自旋共振，是由不配对电子的磁矩发源的一种磁共振技术，可用于从定性和定量方面检测物质原子或分子中所含的不配对电子，并探索其周围环境的结构特性。电子顺磁共振波谱仪主要由微波发生与传导系统、谐振腔系统、电磁铁系统以及调制和检测系统四个部分组成。

　　在这项研究中，研究人员利用核磁共振确定了结合在一个单阻遏蛋白上的RNA分子结构，并同时采用电子顺磁共振波谱技术，确定了复合物的结构，这一结构破解了RNA如何与不同的阻遏蛋白相互作用的。

　　“RNA-蛋白结合是一种合作状态——一个二聚体诱导改变RNA的结构，从而促进后续二聚体的结合”。