Oligopulldown结合质谱、蛋白解构技术等研究实体瘤膀胱癌

　　m⁵C修饰是mRNA上分布广泛的碱基修饰形式之一，但对于进入细胞质内的含有m⁵C修饰的mRNA的命运决定及其在生理和病理中的调控作用目前尚不清楚。中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队联合中山大学肿瘤医院周芳坚团队、谢丹团队和中科院生物化学与细胞生物学研究所黄旲团队合作研究，发现m⁵C通过细胞质内新结合蛋白YBX1调控mRNA的稳定性，进而调控膀胱癌的增殖和转移。相关研究成果以5-methylcytosine promotes pathogenesis of the bladder cancer through stabilizing mRNAs为题在线发表于Nature Cell Biology。

　　研究团队首先绘制了膀胱癌组织中mRNA上的m⁵C单位点图谱，发现癌症通路相关基因的mRNA倾向于高甲基化修饰，随着膀胱癌分级、淋巴结转移的疾病进展，相关原癌基因mRNA m⁵C甲基化水平逐渐升高。利用Oligo-pull down结合质谱、蛋白解构技术和高通量测序技术发现了细胞质内新的m⁵C结合蛋白YBX1，W65是YBX1识别mRNA m⁵C的关键氨基酸，并且YBX1以m⁵C依赖的方式调控mRNA稳定蛋白ELAVL1的RNA结合能力。相比于癌旁组织，m⁵C甲基转移酶NSUN2和m⁵C结合蛋白YBX1在膀胱癌组织中高表达。进一步通过体内、体外小鼠成瘤和转移实验及高通量测序技术，证明了NSUN2和YBX1以m⁵C依赖的方式促进HDGF mRNA的稳定性并最终促进膀胱癌肿瘤的增殖和转移。

　　该研究揭示了mRNA甲基化调控实体瘤膀胱癌发生的分子机制，为膀胱癌预防和治疗提供了新的研究方向；在新的层面上揭示了mRNA 甲基化修饰作为新的调控手段调控肿瘤的发生，这种转录后修饰可能在其它肿瘤疾病中也发挥着重要作用。该研究得到国家重点研发计划、国家自然科学基金以及中科院战略性先导科技专项等的资助。

NSUN2/YBX1通过m5C介导调控HDGF mRNA稳定性促进膀胱癌的发生