为什么要进行单细胞测序?
传统的测序是以组织为单位进行的测序,所得的测序结果是多个细胞的平均值,无法精确到单个细胞的遗传信息;而实际上,细胞与细胞之间由于存在异质性,即便在肿瘤组织中,肿瘤组织中心的细胞、周围的细胞、以及出现远端转移的细胞,在基因组和转录组水平上的遗传信息也是有差异的。而单细胞测序是在单个细胞水平上对DNA或RNA进行测序,分析单个细胞的基因结构和基因表达情况,实现更高分辨率的基因表达分析。
单细胞测序目前主要包括单细胞基因组测序、单细胞转录组测序、单细胞表观组测序。
早期单细胞测序流程首先是通过稀释、流式分选、显微切割等方式分选出单细胞,然后进行微量建库,该流程操作复杂、通量低、成本高;目前主流的高通量单细胞捕获测序是通过Barcode标记单个细胞,将多个细胞混合建库测序,后续数据分析的时候,将同一Barcode标记的分子信息视为来自同一个细胞。
单细胞转录组测序流程
以下流程以寻因生物为代表的微流控数字液滴+Barcoded Beads技术的高通量单细胞转录组建库试剂盒流程,结合睿科Vitae 120 NGS-SA建库仪,实现8个样本的高效单细胞转录组的测序文库构建。
在单细胞转录组测序流程中,文库构建环节可搭载睿科Vitae 120 NGS-SA建库仪自动化完成文库构建流程。
Vitae 120 NGS-SA建库仪可以完成的建库流程
Vitae 120 NGS-SA建库仪
专业稳定的自动化文库构建平台
包含建库所需要的所有功能模块(PCR板冷槽、PCR 板加热模块、PCR 板振荡模块、PCR板磁力架、PCR仪),满足不同建库流程的需要;
软件功能模块化,无需编写脚本,通过拖拽式编辑即可适配不同的实验流程;
积累多个厂家建库流程的测试(诺唯赞、华大、KAPA、illumina、Pacbio、Nanopore),建库结果稳定有保证。
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