奥密克戎出现更“人类化”的基因片段，可能导致免疫逃逸

　　由于Omicron突变株（B.1.1.529）发生了更多功能性突变，因此很可能对人类造成更大威胁。

　　其中Omicron极强的传染性和潜在的免疫逃逸最令人忧虑。

　　英国COVID基因组联盟（GOG-UK）公布的最新研究显示，Omicron突变株S蛋白的32个突变部位中，至少有3个与其传染性增强有关。

（Covid Genomics UK Consortium (COG-UK) 昨天发布了 Omicron 突变株的 32 个突变（左）的新图像，并与Delta突变株（右）对比。他们展示了该变体的三个突变——H655Y、N679K 和 P681H，位于图像的右下方——这可以帮助病毒更容易地进入到人体。图源：每日邮报）

　　Omicron也确实展现了更高的传染性。

　　Trevor Bedford刚刚发表的Twitter指出，根据Gauteng地区Delta和Omicron的流行病学数据和他的模型对比，估算出Omicron突变株在南非的实时传播系数Rt大约为3-3.5；而Delta突变株在南非和美国的初始Rt是1.5。

（Omicro突变株飙升的传染率）

　　2021年12月2日，OSF预印网站发布了位于美国剑桥的生物医学数据分析公司Nference Inc的研究论文，显示Omicron突变株有一个插入突变，其遗传物质很可能来源于导致普通感冒的HCoV-229E冠状病毒。

　　但这段特殊的基因序列也存在于能导致艾滋病的人类免疫缺陷病毒（HIV）和人类基因组中，COVID-19；Omicron突变株；免疫逃逸

　　研究者认为，这可能意味着Omicron突变株更容易传播，但相对来说症状更为轻微。

　　该研究迅速受到各主要媒体的关注和解读。

　　研究者首先比较了Omicron突变株和既往突变株的基因组差异，发现Omicron的S蛋白有26个氨基酸突变，其中23个替换、2个缺失和1个插入。

　　替换和缺失的突变在之前的突变株中均出现过，但是插入突变（ins214EPE）却是首次在新冠病毒（SARS-CoV-2）中出现。

（突变对比）

　　进一步单细胞RNA测序显示，该插入序列表达于普通感冒冠状病毒（HCoV-229E）。

　　而早期研究显示，宿主的肺脏和肠道可以同时存在新冠病毒和普通感冒冠状病毒。研究者推测，可能由此为两种病毒重组创造了条件。

（研究者推测的两种病毒重组）

　　尽管这段插入基因序列引发了科学家和媒体的广泛兴趣，并看起来似乎确实“Omicron突变株更容易传播，但症状相对轻微”；但我们还是需要强调：对于突变株最重要的关键特征，传播能力、毒力和免疫逃逸能力，目前仍没有一锤定音的数据。

　　另外也需要看到，这篇预印论文尚未经专业的同行评议，且公布的论文缺乏Omicron这段“可能来自于普通感冒冠状病毒”基因序列发生过程及作用的确凿证据。

　　根据世界卫生组织公布的消息，Omicron已经在全球38个国家和地区蔓延。

　　面对这个尚待研究的突变株，我们有理由担心会有更多恐怖的突变株会出现。

　　我们更不能心怀侥幸，期待Omicron可能的“传染性强、却毒力弱”，从而取代Delta突变株。

　　人类不能把自己的命运交给新冠病毒。

　　更快速度普及疫苗接种，才是真正能够把人类从可怕的新冠病毒大瘟疫中解救出来的方法。

（本文来源：Hanson临床科研公众号）