昆明动物所研究发现选择性剪切在果蝇新基因中的进化

选择性剪切(alternative splicing)是一个基因编码出不同转录本和蛋白质的重要途径,对满足生物体所需蛋白多样性具有重要意义。此前的研究显示,新基因通常在序列、基因结构和表达模式上与其祖先基因发生快速的分化。基因结构的改变可能伴随着选择性剪切的改变,但关于新基因选择性剪切的进化还未被研究过。 中国科学院昆明动物研究所中德马普进化基因组学青年科学家小组博士生占祖兵等在导师王文研究员的指导下,对之前该研究组从黑腹果蝇内鉴定出的新基因作了基因内选择性剪切的改变以及其改变的序列基础与功能后果的分析。结果显示,选择性剪切的新基因比祖先基因所占的比例要少,提示新基因起源后倾向于丢失选择性剪切。逆转座、部分基因复制和完整的基因复制都能导致选择性剪切的丢失,这说明选择性剪切的丢失是新基因起源和进化的机制之一。通过EST分析,进一步发现选择性剪切改变的新基因表达水平比祖先基因更低,表达组织更少,而且更倾向于在......阅读全文

MUTYH基因编码功能及结构描述

该基因编码一种参与dna氧化损伤修复的dna糖苷酶。这种酶在腺嘌呤与鸟嘌呤、胞嘧啶或8-氧-7,8-二氢鸟嘌呤(一种主要的氧化损伤的DNA损伤)不适当配对的部位从DNA主干上切除腺嘌呤碱。蛋白质定位于细胞核和线粒体。这种基因产物被认为通过在氧化损伤后引入单链断裂而在细胞凋亡信号中发挥作用。该基因突变

KDR基因编码功能及结构描述

KDR所编码的蛋白也命名为血管内皮生长因子受体-2(Vascular endothelial growth factor receptor-2,VEGFR-2),是血管生长因子重要信号转导的重要受体,迄今已发现的VEGF信号转导的主要受体包括fms样酪氨酸激酶VEGFR-1,即Flt- 1,胎儿肝激

ITK基因编码功能及结构描述

该基因编码在t细胞中表达的细胞内酪氨酸激酶。该蛋白包含sh2和sh3两个结构域,它们通常存在于细胞内激酶中。它被认为在t细胞增殖和分化中起作用。[由RefSeq提供,2008年7月]This gene encodes an intracellular tyrosine kinase expresse

GNRHR基因的结构及主要作用

该基因编码1型促性腺激素释放激素受体该受体是七个跨膜g蛋白偶联受体(gpcr)家族的成员。它在垂体促性腺激素细胞以及淋巴细胞、乳腺、卵巢和前列腺的表面表达。在促性腺激素释放激素结合后,受体与激活磷脂酰肌醇钙第二信使系统的G蛋白结合。受体的激活最终导致促性腺激素黄体生成素(LH)和卵泡刺激素(FSH)

BTLA基因的结构特点及作用

这个基因编码免疫球蛋白超家族的一个成员编码的蛋白质包含一个免疫球蛋白(Ig)结构域,是一个受体,通过传递抑制信号来抑制免疫应答选择性剪接导致多个转录变体这个基因的多态性与类风湿关节炎的风险增加有关。

CBL基因编码功能及结构描述

这个基因是一个原癌基因,编码一个无名指E3泛素连接酶。编码蛋白是蛋白酶体降解底物所需的酶之一。该蛋白介导泛素从泛素结合酶(E2)转移到特定底物。该蛋白还包含一个N端磷酸酪氨酸结合域,使其与许多酪氨酸磷酸化底物相互作用,并以蛋白酶体降解为靶点。因此,它作为许多信号转导途径的负调节器发挥作用。该基因在包

EED基因编码功能及结构描述

该基因编码一个多囊组(pcg)家族成员。pcg家族成员形成多聚蛋白复合物,参与维持基因在连续细胞世代中的转录抑制状态。该蛋白与zeste 2的增强子、整合素beta7的细胞质尾、免疫缺陷病毒1型(hiv-1)ma蛋白和组蛋白脱乙酰酶蛋白相互作用。该蛋白通过组蛋白去乙酰化介导基因活性的抑制,并可能作为

FHIT基因的结构及主要作用

该基因编码的蛋白是一种参与嘌呤代谢的P1-P3-双(5'-腺苷)三磷酸水解酶这个基因包含了3号染色体上常见的脆性位点fra3b,致癌物引起的损伤可导致易位和异常转录。事实上,在大约一半的食管癌、胃癌和结肠癌中发现了这种基因的异常转录物。编码的蛋白质也是一种肿瘤抑制因子,因为其活性的丧失会导致

PALLD基因编码功能及结构描述

这个基因编码一种细胞骨架蛋白,这是组织肌动蛋白细胞骨架所必需的。这种蛋白质是含有肌动蛋白微丝的一种成分,它参与控制细胞的形状、粘附和收缩。该基因多态性与1型胰腺癌易感性相关,也与心肌梗死风险相关。选择性剪接导致多个转录变体。This gene encodes a cytoskeletal prote

HFE基因编码功能及结构描述

该基因编码的蛋白是一种膜蛋白,与mhcⅠ类蛋白相似,与beta2微球蛋白(beta2m)相关。认为该蛋白通过调节转铁蛋白受体与转铁蛋白的相互作用来调节铁的吸收。铁储存障碍,遗传性血色素沉着症,是一种隐性遗传疾病,是由该基因缺陷引起的。至少有9个选择性剪接的变异已经被描述为这个基因。已发现其他变体,但

HRAS基因编码功能及结构描述

HRAS编码的HRAS蛋白为GTP酶,HRas是一种小的G蛋白,属于小GTP酶超家族,当HRas与鸟苷三磷酸结合后,会结合Raf激酶比如c-Raf,再进一步激活MAPK/ERK通路。这个基因的突变与多种癌症相关,包括膀胱癌,滤泡状甲状腺癌,口腔鳞状细胞癌。

KALRN基因编码功能及结构描述

亨廷顿病(hd)是一种以纹状体神经元丧失为特征的神经退行性疾病,是由hd蛋白亨廷顿蛋白中的多聚谷氨酸束扩张引起的。该基因编码一种与huntingtin相关蛋白1相互作用的蛋白质,huntingtin相关蛋白1是一种huntingtin结合蛋白,可能在囊泡运输中发挥作用。[由RefSeq提供,2016

GUSB基因编码功能及结构描述

该基因编码一种降解糖胺聚糖的水解酶,包括硫酸乙酰肝素、硫酸皮肤素和硫酸软骨素。这种酶形成一个定位于溶酶体的四聚体该基因突变导致粘多糖病第七型。选择性剪接导致多个转录变体人类基因组中有许多这个位点的假基因。[由RefSeq提供,2014年5月]This gene encodes a hydrolase

RARG基因的结构特点和作用

该基因编码一种视黄酸受体,属于核激素受体家族。视黄酸受体(rars)作为配体依赖的转录调节因子。当与配体结合时,rars以异二聚体的形式与靶基因启动子区发现的视黄酸反应元件(稀有)结合,从而激活转录。rars以未结合的形式抑制靶基因的转录。rars参与多种生物学过程,包括肢芽发育、骨骼生长和基质内稳

TERC基因的结构特点和作用

端粒酶是一种核糖核蛋白聚合酶,通过增加端粒重复序列ttaggg来维持端粒末端。这种酶由具有逆转录酶活性的蛋白质组分和由该基因编码的rna组分构成端粒重复序列的模板。端粒酶的表达在细胞衰老中起作用,因为它通常在出生后的体细胞中被抑制,导致端粒的进行性缩短。端粒酶在体细胞中的表达下调可能与肿瘤的发生有关

ECSCR基因编码功能及结构描述

该基因编码的蛋白质主要存在于内皮细胞和血管中,参与细胞形态变化和表皮生长因子诱导的细胞迁移。能增强血管内皮生长因子受体-2/激酶插入结构域受体的活化,并促进内化激酶插入结构域受体的蛋白水解。该基因可能在血管生成相关疾病中发挥作用。选择性剪接导致多个转录变体。The protein encoded b

FPGS基因编码功能及结构描述

该基因编码叶酸聚谷氨酸合成酶这种酶在建立和维持细胞液和线粒体的叶酸多聚谷氨酸浓度方面起着中心作用,因此,对于叶酸的稳态和增殖细胞的生存至关重要这种酶催化谷氨酸部分对叶酸和叶酸衍生物的ATP依赖性加成选择性剪接导致编码不同亚型的转录变体。[由RefSeq提供,2014年1月]This gene enc

APLNR基因编码功能及结构描述

该基因编码G蛋白偶联受体基因家族的一个成员编码蛋白与血管紧张素受体有关,但实际上是一种抑制腺苷酸环化酶活性的apelin受体,通过发挥高血压作用,对血管紧张素ii的压力作用起反调节作用。它在心血管和中枢神经系统、葡萄糖代谢、胚胎和肿瘤血管生成以及作为人类免疫缺陷病毒(HIV-1)受体发挥作用由选择性

ASPM基因编码功能及结构描述

该基因是果蝇“纺锤体异常”基因(asp)的人类同源基因,对胚胎神经母细胞的正常有丝分裂纺锤体功能至关重要在小鼠中的研究也表明该基因在有丝分裂纺锤体调控中的作用,在调节神经发生中具有优先作用。该基因突变与小头畸形原发性5型相关。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提供,2011年5

MYCNOS基因编码功能及结构描述

该基因反义转录至v-myc禽骨髓细胞瘤病毒癌基因神经母细胞瘤衍生同源基因(mycn)。它被认为编码一种稳定MYCN、防止细胞凋亡和促进细胞增殖的新型小蛋白该位点的转录物也可以直接作为功能性rnas向mycn的启动子招募转录调节因子并刺激该癌基因的转录。因此,这种基因通过rna和蛋白质产物发挥作用。[

DHFR基因编码功能及结构描述

二氢叶酸还原酶将二氢叶酸转化为四氢叶酸,这是嘌呤、胸苷酸和某些氨基酸从头合成所需的甲基穿梭剂。功能性二氢叶酸还原酶基因已被定位到5号染色体上,多个无内含子处理的假基因或类似二氢叶酸还原酶的基因已被鉴定在不同的染色体上。二氢叶酸还原酶缺乏与巨幼细胞性贫血有关。已经发现了一些编码不同亚型的转录变体。[由

EPCAM基因的结构特点和作用

该基因编码癌相关抗原,是一个家族的成员,至少包含两种I型膜蛋白。这种抗原在大多数正常上皮细胞和胃肠道癌上表达,并作为一种同型钙依赖性细胞粘附分子发挥作用。该抗原正被用作人类癌免疫治疗的靶点。该基因突变导致先天性丛生性肠病。

HFE基因编码功能及结构描述

该基因编码的蛋白是一种膜蛋白,与mhcⅠ类蛋白相似,与beta2微球蛋白(beta2m)相关。认为该蛋白通过调节转铁蛋白受体与转铁蛋白的相互作用来调节铁的吸收。铁储存障碍,遗传性血色素沉着症,是一种隐性遗传疾病,是由该基因缺陷引起的。至少有9个选择性剪接的变异已经被描述为这个基因。已发现其他变体,但

EREG基因的结构特点和作用

该基因编码一种分泌肽激素和表皮生长因子(egf)蛋白家族成员。编码蛋白是表皮生长因子受体(egfr)和结构相关的erb-b2受体酪氨酸激酶4(erbb4)的配体。编码蛋白可能参与多种生物学过程,包括炎症、伤口愈合、卵母细胞成熟和细胞增殖。此外,编码蛋白可能促进各种人体组织癌症的进展。

FUS基因的结构及主要作用

该基因编码异质核核糖核蛋白(hnrnp)复合物的多功能蛋白成分。hnRNP复合物参与mRNA的前剪接和全加工mRNA向细胞质的输出该蛋白属于FET家族的RNA结合蛋白,参与了包括基因表达调控、基因组完整性维护和mRNA/microRNA处理在内的细胞过程选择性剪接导致多个转录变体该基因缺陷导致肌萎缩

DMD基因编码功能及结构描述

该基因的基因组范围大于2 Mb,编码一个含有N端肌动蛋白结合域和多个谱蛋白重复序列的大蛋白编码的蛋白质形成了抗肌萎缩蛋白糖蛋白复合物(dgc)的一个组成部分,dgc连接细胞内骨架和细胞外基质。该基因位点的缺失、重复和点突变可能导致杜氏肌营养不良(DMD)、贝克肌营养不良(BMD)或心肌病。选择性启动

ACADSB基因的结构特点和作用

短/支链酰基辅酶a脱氢酶(ACADSB)是脂肪酸或支链氨基酸代谢中催化酰基辅酶a衍生物脱氢的酶家族中的一员底物特异性是定义该基因家族成员的主要特征。acadsb基因产物对短支链酰基辅酶a衍生物(s)-2-甲基丁基辅酶a具有最大的活性,但也与其他2-甲基支链底物和短直链酰基辅酶a发生显著反应。该cDN

QKI基因的结构特点和作用

该基因编码的蛋白质是一种RNA结合蛋白,可调节mRNA的前剪接,从细胞核输出mRNA,蛋白质翻译和mRNA稳定性。 编码的蛋白质参与髓鞘化和少突胶质细胞分化,并且可能在精神分裂症中起作用。 已经为该基因发现了编码不同同工型的多个转录物变体。 

FNTA基因的结构及主要作用

Prenyl转移酶可通过C-末端Caax盒将硫醚连接的法尼酰基或香叶基与蛋白质的半胱氨酸残基结合。caax-geranylgeranyltransferase和caax-farnesyltransfer是具有相同α亚基但具有不同β亚基的异二聚体。这个基因编码这些转移酶的α亚单位。选择性剪接导致多个转

PARP基因的结构特点及作用

聚[ADP-核糖]聚合酶1(PARP-1)也称为NAD + ADP-核糖基转移酶1或聚[ADP-核糖]合酶1是人类中由PARP1基因编码的酶。 它是PARP家族的酶之一。 PARP1的工作原理: · 通过聚ADP-核糖基化修饰核蛋白。 · 与BRCA一起发挥作用于双链; PARP家庭的成员以单股行事