Science子刊解释美丽误解：密码子全新观点
重复多个腺苷会引发蛋白翻译机器：核糖体在mRNAs上骤停，这修改了之前的理论 在蛋白翻译过程中，mRNA读取中断并不常见，但一旦发生就会带来严重的后果。近期一组研究人员发现这种出错的成因之一就在于mRNA本身，尤其是mRNA序列中出现连续的多个腺苷A的时候，这一研究成果公布在7月24日的Science Advances 杂志上。 Science Advances是Science出版社旗下去年新增的一份开放性获取期刊，主要涵盖所有学术领域包括计算机、工程、环境、生命、数学、物理以及社会科学，旨在提供一个顶级的科学研究出版平台，快速发表在整个科学研究领域的高水平且在相关领域有重要进展的研究工作。 核糖体是蛋白翻译机器，能通过读取mRNA中的密码子序列，翻译成氨基酸链，但有时这个重要的元件也会停摆，导致mRNA与未完成的蛋白被降解。影响核糖体运行的原因有很多，比如mRNA序列突变，或者RNA错误折叠引发错误的二级结构。然而如......阅读全文
优化基因表达的关键因素
在基因表达研究中，研究者比较注意选择合适的表达载体和宿主系统，而往往忽视基因本身是否与载体和宿主系统为最佳匹配这样一个实质性问题。基因的最佳化表达可以通过对基因的重新设计和合成来实现，如消除稀有密码子而利用最佳化密码子，二级结构最小化，调整GC含量等。以下就密码子最佳化、翻译终止效率和真核细胞
副密码子的概念介绍
对于终产物为RNA的基因，只要进行转录并进行转录后的处理，就完成了基因表达的全过程；而对于终产物是蛋白质的基因，还必须将mRNA翻译成蛋白质。
密码子的概念和种类
密码子（codon）：mRNA（或DNA）上的三联体核苷酸残基序列，该序列编码着一个特定的氨基酸，tRNA 的反密码子与mRNA的密码子互补。起始密码子（iniation codon）：指定蛋白质合成起始位点的密码子。最常见的起始密码子是甲硫氨酸或缬氨酸密码。终止密码子（termination co
副密码子的特点介绍
（1）一种氨酰tRNA 合成酶可以识别一组同功tRNA （多达6个），它们的副密码子有共同的特征。（2）副密码子没有固定的位置，亦可能不止1个碱基对。（3）尽管副密码子不能单独与氨基酸发生作用，但副密码子可能与氨基酸的侧链基团有某种相应性。（4）并非所有的tRNA氨基酸柄上的G3·U70都是它的副密
反密码子茎的定义
中文名称反密码子茎英文名称anticodon stem定 义转移核糖核酸中与反密码子环相连的茎区，通常是含有5对碱基的螺旋。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
副密码子的特点介绍
（1）一种氨酰tRNA 合成酶可以识别一组同功tRNA （多达6个），它们的副密码子有共同的特征。（2）副密码子没有固定的位置，亦可能不止1个碱基对。（3）尽管副密码子不能单独与氨基酸发生作用，但副密码子可能与氨基酸的侧链基团有某种相应性。（4）并非所有的tRNA氨基酸柄上的G3·U70都是它的副密
反密码子臂的定义
中文名称反密码子臂英文名称anticodon arm定 义由反密码子茎和反密码子环构成，是转移核糖核酸高级结构中的一部分区域。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
副密码子的特点介绍
（1）一种氨酰tRNA 合成酶可以识别一组同功tRNA （多达6个），它们的副密码子有共同的特征。（2）副密码子没有固定的位置，亦可能不止1个碱基对。（3）尽管副密码子不能单独与氨基酸发生作用，但副密码子可能与氨基酸的侧链基团有某种相应性。（4）并非所有的tRNA氨基酸柄上的G3·U70都是它的副密
密码子适应指数的概念
中文名称：密码子适应指数英文名称：codon adaptation index;CAI定义：密码子适应指数是反映编码区同义密码子与密码子最佳使用相符合的程度，取值范围在0—1之间。应用学科：遗传学（一级学科）；进化遗传学（二级学科）
反密码子环的定义
在氨基酸臂对面的单链环称反密码子环（anticodon loop）,该环含有由三个核苷酸残基组成的反密码子。
终止密码子的发现过程
1964年Yanofsky在研究E.coli色氨酸合成酶A蛋白时推测无义密码子的存在。他的推测/是从两个不同的角度：一是为trp A编码的mRNA还编码了trpB，trpC，trpD和trpE。即一个mRNA 分子中可以作为不同多肽的模板，那么有可能在翻译时中途在某个位点（两个肽的连接处〕停止，然后
关于密码子的种类介绍
构成RNA的碱基有四种，每三个碱基的开始两个决定一个氨基酸。从理论上分析碱基的组合有4的3次方=64种，64种碱基的组合即64种密码子。怎样决定20种氨基酸呢？仔细分析20种氨基酸的密码子表，就可以发现，同一种氨基酸可以由几个不同的密码子来决定，起始密码子为AUG（甲硫氨酸），另外还有UAA、U
副密码子的概念介绍
mRNA的核苷酸顺序与蛋白质的氨基酸顺序之间在结构上并没有直接的相应关系,二者也不发生直接的相互作用。在这两种不同的遗传语言之间,必须通过译员才能互相沟通。扮演这种译员角色的就是各种tRNA分子。如果没有tRNA的存在,也就无所谓密码子了。因此密码子的意义并不是单独由mRNA决定的,而是由mRN
副密码子有哪些特点？
（1）一种氨酰tRNA 合成酶可以识别一组同功tRNA （多达6个）,它们的副密码子有共同的特征。 （2）副密码子没有固定的位置,亦可能不止1个碱基对。 （3）尽管副密码子不能单独与氨基酸发生作用,但副密码子可能与氨基酸的侧链基团有某种相应性。 （4）并非所有的tRNA氨基酸柄上的G3·U
什么是上游起始密码子？
约50%的智人（Homo Sapiens）基因带有上游起始密码子（上游AUG）。尽管真核细胞每条mRNA只表达一个蛋白，但其依然可以带有多个上游可读框和上游AUG，只是其并不翻译产生具有生物学意义的蛋白。理论上，真核细胞会翻译其mRNA上游到下游扫描遇到的第一个AUG，并且在翻译完成后解离。这意味着
细胞化学词汇反密码子
反密码子是在tRNA的三叶草形二级结构反密码臂的中部，可与mRNA中的三联体密码子形成碱基配对的三个相邻碱基。在蛋白质的合成中，起解读密码、将相应的氨基酸引入核糖体A和P位点的作用。 反密码子（anticodon）：RNA链经过折叠，看上去像三叶草的叶形，其一端是携带氨基酸的部位，另一端有3个碱基。
密码子偏倚的定义
中文名称：密码子偏倚英文名称：codon bias定 义：编码同一氨基酸的不同密码子的非平均使用现象。应用学科：遗传学（一级学科），进化遗传学（二级学科）
简述简并密码子的表现
许多氨基酸的密码子的第1和第2个碱基相同，只有第3个碱基不同，密码子的简并性,特别是第三位的胞嘧啶和尿嘧啶或鸟嘌呤和腺嘌呤的简并性常常等同(右表),这说明为什么在不同生物的DNA中的AT/GC比率会有很大的变异,而其蛋白质的氨基酸相对比例却没有很大的变化。 对应于同一种氨基酸的不同密码子称为同
起始密码子的运作原理
AUG是起始密码子，也就是说肽链起始于甲硫氨酸。这个氨基酸是甲基化的甲硫氨酸。起始密码子结合到一个与甲硫氨酸一tRNA相同的3’UAC5’反密码子的甲酰甲硫氨酸一tRNA上．也就是说，甲硫氨酸一tRNA和甲酰甲硫氨酸一tRNA都是由AUG编码．但是起始氨基酸的信号要比所有其他氨基酸的信号复杂得多。根
北京基因组所合作研究揭示密码子表的内在规律
对于绝大多数物种来说，外界所能提供的能源是有限的，如何有效利用有限的资源，往往对物种的生存起决定作用。中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室胡松年组客座研究员陈卫华以及德国杜塞尔多夫大学、欧洲分子生物实验室的合作者们从全新的角度出发，对“能量节省”压力下基因组的演化情况进行了系统研
北京基因组所合作研究揭示密码子表的内在规律
对于绝大多数物种来说，外界所能提供的能源是有限的，如何有效利用有限的资源，往往对物种的生存起决定作用。中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室胡松年组客座研究员陈卫华以及德国杜塞尔多夫大学、欧洲分子生物实验室的合作者们从全新的角度出发，对“能量节省”压力下基因组的演化情况进行了系统研
最新研究——新冠病毒装配蛋白速度可能越来越慢
“在利用人类细胞资源合成病毒蛋白方面，新冠病毒没有朝着效率最高、机制最优的方向演化，而是呈现‘去优化’的演化趋势。”6月25日，北京大学教授陆剑在接受科技日报记者采访时介绍，这一结论来自其与中国医学科学院钱朝晖课题组的合作研究，他们对900多万条高质量新冠病毒测序序列进行了分析。 “新冠病毒和
地理资源所遥感参数时间序列重构研究获进展
太阳辐射是各种陆地表层应用模型的重要输入参数，由于云、气溶胶、太阳高度角和地物双向性反射等的影响，造成了遥感反演的太阳辐射数据在时间、空间上的缺失，会严重影响应用模型的精度。“时间序列重构”是利用多种统计和数值分析方法，模拟辐射的季节变化规律，从而插补缺失观测值，优化时间序列数据。 中国科
最新研究揭示全球海洋遗传资源序列ZL分布情况
2018年6月6日出版的《科学进展》杂志（Science Advances）发表的最新研究报告显示，总部位于德国的世界最大化学品生产商巴斯夫公司注册了1988年至今的全球所有海洋遗传资源序列（Marine Genetic resources, MGRs)ZL的47％。该研究报告显示，通过对已记
细胞化学词汇反密码子臂
中文名称：反密码子臂英文名称：anticodon arm定 义：由反密码子茎和反密码子环构成，是转移核糖核酸高级结构中的一部分区域。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
密码子的应用预测进化规律
预测进化规律类似的密码子使用模式，预示着物种相近的亲缘关系或生存环境。目 前已有研究通过比较密码子偏性的差异程度，来分析物种间的亲缘关系和进化历程。线粒体基因组具有母系遗传、分子结构简单、多态性丰富等优点，是一种重要的分子标记，研究其密码子使用偏好性，可以很好地用于确定动物类群的遗传分化和系统发生关
细胞化学词汇反密码子茎
中文名称：反密码子茎英文名称：anticodon stem定 义：转移核糖核酸中与反密码子环相连的茎区，通常是含有5对碱基的螺旋。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
关于副密码子的基本介绍
对于终产物为RNA的基因，只要进行转录并进行转录后的处理，就完成了基因表达的全过程；而对于终产物是蛋白质的基因，还必须将mRNA翻译成蛋白质。 tRNA 分子上决定其携带氨基酸分子的区域称为副密码子。
密码子的应用翻译起始效应
mRNA浓度是翻译起始速率的主要影响因素之一，密码子直接影响转录效率，决定mRNA浓度。如单子叶植物在“翻译起始区”的密码子偏性大于“翻译终止区”，暗示“翻译起始区”的密码子使用对提高蛋白质翻译的效率和精确性更为重要，因此，通过修饰编码区5′端的DNA序列，来提高蛋白质的表达水平将有望成为可能。
关于副密码子的概念介绍
mRNA的核苷酸顺序与蛋白质的氨基酸顺序之间在结构上并没有直接的相应关系,二者也不发生直接的相互作用。在这两种不同的遗传语言之间,必须通过译员才能互相沟通。扮演这种译员角色的就是各种tRNA分子。如果没有tRNA的存在,也就无所谓密码子了。因此密码子的意义并不是单独由mRNA决定的,而是由mRN