微生物所在古菌基因组复制起始领域取得新进展
基因组复制是生命得以存在和延续的最重要和最基本的遗传过程。与细菌染色体通常只有一个复制起点不同,真核生物和许多古菌的染色体均具有多个复制起始位点。这些复制起始元件可能具有不同的活性以适应体内外环境的变化,如在真核生物中普遍存在休眠状态的复制起始位点,如何解析这些休眠复制起点的激活机制及其生理功能是该领域研究的难点和热点。 中国科学院微生物研究所向华研究组前期的生物信息与遗传学分析已表明,染色体多复制起点是嗜盐古菌中普遍存在的现象(BMC Genomics.2012,13: 478),因此是研究多位点复制起始调节机制的重要模型。其后国际上对古菌多复制起点进行了系统的敲除实验分析。在这些工作中,2013年英国学者在Nature 2013,503:544发表的论文工作最引人注目。因为该论文工作发现,在沃氏富盐菌中,染色体所有已知有活性的多个复制起点可以被同时敲除,甚至敲除株比野生型还长得更快些。该论文作者大胆推测嗜盐......阅读全文
类器官培养的起始细胞来源
类器官培养的起始细胞群一般从成人或胎儿组织活检样本中获得,肿瘤组织也可类似处理以分离肿瘤细胞来培养类器官。此外,从外周血、腹水和胸腔积液等液体样本中分离的肿瘤细胞也可作为起始材料。对于肿瘤衍生类器官,需要解决癌细胞和正常细胞共存的问题,可利用培养条件,通过使用选择性培养基来实现。
起始复合物的结构功能
由一个mRNA、一个接合子mRNA的特定位点(RBS;核糖体结合位点)的30s核糖体亚基和一个与起始密码子相互作用的N-甲酰甲硫氨酸tRNA相结合而成。某些蛋白质(起始因子)也为起始复合物贡献信息,然后被快速释放。
真核起始因子的相关疾病
已知的真核起始因子中,eIF2B与人类遗传病的关系最为密切。eIF2B的五个亚基基因的常染色体遗传性隐性突变会导致白质异常,在临床上表现为一系列严重的连续症状,称为“eIF2B相关紊乱”。典型的如脑白质病,即白质消失(vanishing white matter,VWM)和卵巢衰竭(ovaria
什么是上游起始密码子?
约50%的智人(Homo Sapiens)基因带有上游起始密码子(上游AUG)。尽管真核细胞每条mRNA只表达一个蛋白,但其依然可以带有多个上游可读框和上游AUG,只是其并不翻译产生具有生物学意义的蛋白。理论上,真核细胞会翻译其mRNA上游到下游扫描遇到的第一个AUG,并且在翻译完成后解离。这意味着
起始密码子的运作原理
AUG是起始密码子,也就是说肽链起始于甲硫氨酸。这个氨基酸是甲基化的甲硫氨酸。起始密码子结合到一个与甲硫氨酸一tRNA相同的3’UAC5’反密码子的甲酰甲硫氨酸一tRNA上.也就是说,甲硫氨酸一tRNA和甲酰甲硫氨酸一tRNA都是由AUG编码.但是起始氨基酸的信号要比所有其他氨基酸的信号复杂得多。根
起始tRNA-的结构和功能特点
起始tRNA initiation tRNA是指能特异性地认别mRNA上的起始密码子,是使蛋白质合成开始的tRNA。在细胞中有两种甲硫氨酸tRNA分子,其中的一种就起这种作用。在大肠杆菌中,已接受甲硫氨酸的tRNAfMet在被甲酰化之后,以其30S核糖体亚基与mRNA共同结合,使蛋白质合成开始。即使
如何寻找转录起始位点?
一、引物延伸分析(primer extension analysis)引物延伸分析用于定量mRNA的量,测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端, 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域,随后用RNA作为模板,用反转录酶延伸引物得到cDNA,用变
如何寻找转录起始位点
一、引物延伸分析(primer extension analysis) 引物延伸分析用于定量mRNA的量,测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端, 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域,随后用RNA作为模板,用反转录酶延伸引物得到cDNA,
脂肪酸合成的起始原料
脂肪酸合成的起始原料是乙酰coa,它主要来自糖酵解产物丙酮酸,脂肪酸的合成是在胞液中。先说说饱和脂肪酸的合成:1.乙酰辅酶a的转运:脂肪酸的合成是在胞液中,而乙酰coa是在线粒体内,它们不能穿过线粒体内膜,需通过转运机制进入胞液。三羧酸循环中的柠檬酸可穿过线粒体膜进入胞液,然后在柠檬酸裂解酶的作用下
原核细胞的翻译起始过程介绍
(1)翻译起始因子IF3结合到小亚基的E位点,同时也横跨至P位点;(这一过程在起始之初就已经完成)起始因子IF1结合至A位点; (2)起始因子IF2·GTP被IF3和IF1招募至P位点; (3)起始fMet·tRNA一方面被mRNA起始密码子AUG招募,另一方面被已经结合到P位点的IF2·G
执行DNA复制的复杂分子机器复制体的介绍
复制体是一个执行DNA复制的复杂分子机器。它由大量的次级元件组成,每一个次级元件在复制的过程中都行使一个特殊的功能。解螺旋酶能切断两条DNA分子之间的氢键,从而在DNA合成前分开两条链。当解螺旋酶解开双螺旋时,引导DNA其它区域的超螺旋体排列好。 旋转酶的作用是解开由解旋酶切断DNA链产生的超
DNA复制主要阶段
DNA复制主要包括引发、延伸、终止三个阶段 。
DNA复制的特点
半保留复制:DNA在复制时,以亲代DNA的每一个单链作模板,合成完全相同的两个双链子代DNA,每个子代DNA中都含有一个亲代DNA链,这种现象称为DNA的半保留复制。DNA以半保留方式进行复制,是在1958年由M. Meselson 和 F. Stahl 所完成的实验所证明。有一定的复制起始点:DN
复制错误的概念
中文名称复制错误英文名称replication error定 义DNA复制过程中核苷酸配对发生错误的现象。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
复制期的定义
中文名称复制期英文名称replicative phase定 义常指病毒感染宿主的复制时期。如慢性乙肝病毒携带者可分为高复制期、低复制期和非复制期。高复制期时病毒在肝中大量复制,低复制期少量复制,非复制期测不到复制指标,肝损伤很少。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
复制解旋酶的定义
中文名称复制解旋酶英文名称replicative helicase定 义在DNA复制过程中解开DNA双链的酶。通过水解ATP获得能量。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)
质粒复制的定义
中文名称质粒复制英文名称plasmid replication定 义质粒在宿主细胞内独立于细菌染色体通过复制机制增加其拷贝数的过程。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
复制光栅的概念
复制光栅(replica grating),是指用原刻光栅制成的复制品,用来代替昂贵的原刻光栅。
DNA复制执照因子
DNA复制执照因子(DNA replicatin licensing):真核细胞中用于精准控制DNA分子在每个细胞周期只复制一次的蛋白质因子。
复制叉的结构
复制叉(replication fork),有时也称作生长点(growing point),是DNA复制时在DNA链上通过解旋、解链和SSB蛋白的结合等过程形成的Y字型结构。
复制滑移的概念
滑移出现在亲代分子复制过程中,在一个子代分子的新合成聚核苷酸中添加了一个重复单位。子代分子复制时产生了一个子二代分子,其微卫星序列较其原亲本多出一个重复单位。
DNA复制的特点
半保留复制:DNA在复制时,以亲代DNA的每一个单链作模板,合成完全相同的两个双链子代DNA,每个子代DNA中都含有一个亲代DNA链,这种现象称为DNA的半保留复制。DNA以半保留方式进行复制,是在1958年由M. Meselson 和 F. Stahl 所完成的实验所证明。有一定的复制起始点:DN
RNA的自我复制
进一步的研究还发现一些RNA病毒如R17、f2、MS2等,可以以RNA为模板直接复制新的RNA。这些病毒都属于最简单的类型。例如,MS2的RNA只含有大约350个核苷酸,仅编码三种蛋白质:外壳蛋白,附着蛋白(attachment protein,其功能主要是使病毒能附着于寄主细胞并进入其内部)、RN
θ型复制的概念
θ型复制是DNA在复制原点解开成单链状态的复制,其分别作为模板,各自合成其互补链,出现两个叉子状的生长点,也叫做复制叉。
DNA-复制的过程
DNA 复制是一个复杂而精细的过程,主要包括以下几个阶段:起始在复制起点,一些特殊的蛋白质识别并结合到特定的 DNA 序列上,形成复制起始复合物。解旋酶解开双螺旋结构,将两条链分开,形成“复制叉”。单链结合蛋白(SSB)结合到单链 DNA 上,防止单链重新形成双螺旋,并保持其伸展状态,以利于复制。延
复制泡的概念
复制泡replication bubble这是DNA双向复制的方式。在复制启动时,尚未解开螺旋的亲代双链DNA同新合成的两条子代双链DNA的交界处,就称为复制叉(replication fork)。
质粒滚环复制与噬菌体滚环复制的差异
某些质粒进行的滚环复制与噬菌体进行的滚环复制并非完全的相同,它们至少存在以下几点差别:1.质粒在进行滚环复制时,正链和负链必须等量复制。2.具有两个复制起始区,即双链起始区和单链起始区,它们分别起动前导链(正链)和后随链(负链)的合成。
Nature:揭示在DNA复制期间保护复制叉新机制
在DNA复制期间,复制叉遇到的问题不断威胁着基因组的完整性。BRCA1、BRCA2和一部分范科尼贫血蛋白(Fanconi anaemia protein)通过涉及RAD51的途径保护停滞的复制叉免受核酸酶的降解。BRCA1在复制叉保护中作出的贡献和发挥的调节作用以及这种作用如何与它在同源重组中的
冷热冲击箱起始温度详细说明
冷热冲击箱用于检测材料结构或复合材料,在瞬间下经极高温和极低温的连续环境下所承受的程度。但冷热冲击箱在做测试的时候,到底是先做高温开始还是先从低温开始测试的呢? 即使冷热冲击箱试验标准中通常不对冷热冲击试验的起始温度做硬性规定,但这却是试验进行时必须思考的问题。因为涉及试验是结束在低温还是高温
分子遗传学词汇转录起始
中文名称:转录起始英文名称:transcription initiation定 义:RNA聚合酶与DNA结合并在转录起点启动基因转录的过程。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)