加拿大开发出DNA条形码融合技术实验效率可提高10倍
据最新一期《分子系统生物学》报道,加拿大研究人员开发出一种新技术,可将DNA(脱氧核糖核酸)条形码拼接在单个细胞内,以同时搜索数以百万计蛋白质对之间的相互作用。 近年来,DNA条形码技术使科学家开展高并行试验(许多不同类型的细胞在同一试管内进行试验)成为可能,而新一代DNA测序技术的发展,进一步提高了对条形码计数和读取结果的效率。 然而,可在同一试管内进行的试验次数,却受限于编码的细胞类型数量。一直以来,DNA条形码都是一维的,也就是一个条形码只能做一次试验。允许条形码在细胞内融合在一起,意味着科学家们现在可以打破这一障碍。新技术可显著提高在单一试管内进行的实验次数,在同等成本条件下能将效率提高10倍。 在广泛使用的酵母双杂交(Y2H)方法中,携带一个“诱饵”蛋白的酵母细胞与携带一个“猎物”蛋白的酵母细胞配对。对Y2H系统进行操纵后,只有“诱饵”与“猎物”蛋白黏在一起的细胞才能存活,从而使科学家可以观察到哪些蛋白间互相......阅读全文
食品条形码“8”开头无关转基因
关于转基因食品的安全性争论还未停止,日前一条关于食品条形码以"8"开头即为转基因食品的微博引起不少人的重视,声称条形码以"8"开头的即为转基因食品。该微博同时认为,肿瘤的大面积爆发也与转基因食品有关。对此,记者向有关专家求证,条形码为"8"开头与转基因食品之间并无必然联系,国内所实行的编码标准也
分泌毒素的细菌分子“条形码”现形
加拿大科学家发现了一种致病细菌中用来区分有益分子和有毒分子的“条形码”系统。研究显示,许多细菌可扫描遗传密码,以了解保留哪些蛋白质,排出哪些蛋白质。而这些被排出的蛋白质通常对人体细胞有毒,因此细菌区分蛋白质的能力对是否会导致传染病至关重要。相关论文发表于最新一期《美国国家科学院院刊》杂志。最新研究负
研究蛋白质相互作用的新技术
近期,来自多伦多大学Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute (LTRI)和Donnelly中心的一组研究人员,开发出一种新技术,可以将细胞内的DNA条形码拼接在一起,以同时搜寻数百万个蛋白质配对,用以分析蛋白质相互作用。相关研究结果发表在4月22日的《Mol
利用PerturbSeq和CRISPSeq大规模平行分析数以万计基因扰动
确定细胞中的基因如何影响它的功能是分子遗传学研究的首要目标。但是大多数基因型-表型筛选受限于一项实验实际能够测量的基因扰动(genetic perturbation)数量。简言之,研究的基因扰动越多,实验就变得更加成本高昂和更加耗时。 确实,美国加州大学圣地亚哥分校的Trey Ideker说,
纳米孔测序和DNA“条形码”相结合-一次检测数十种生物标志物
英国帝国理工学院的科学家与牛津纳米孔技术公司合作研制出一种新方法,可同时分析数十种不同类型的生物标志物,改变了对心脏病和癌症等疾病的检测,从而让临床医生收集到有关患者疾病的更多信息。研究成果25日发表在《自然·纳米技术》杂志上。 目前,许多疾病是通过血检来诊断的,血检能寻找一种生物标志物(例如
美国家卫生研究院拨款790万资助开展单个细胞研究
美国国家卫生研究院近日宣布,去年该院已拨款790万美元,资助25个研究小组开展单个细胞的研究,这是在细胞尺度上个性化疗法研究的一部分。 随着细胞生物学研究的深入,科学家逐渐认识到,每个细胞个体可能都有较大差别,了解细胞的个性化,有望为疾病研究和治疗提供新线索,因此,单个细胞的研究近几年成为热点
美开发碳纳米管“鱼叉”-可捕获单个脑细胞信号
据美国物理学家组织网6月20日(北京时间)报道,美国杜克大学科学家开发出一种碳纳米管制成的“鱼叉”,可用于捕获单个脑细胞发出的信号。相关论文发表在6月19日的《公共科学图书馆·综合》上。 目前用于记录脑细胞信号的电极主要有两种:金属和玻璃。金属电极可用在活动物中,记录脑细胞群体活
ECCITEseq,实现单个细胞的多种信息形式和高通量测量
纽约基因组中心(NYGC)技术创新实验室(@NYGCTech)的科学家开发的一种称为ECCITE-seq的新技术,允许研究人员对来自单个细胞的多种信息形式进行高通量测量。 这项技术,ECCITE-seq,发表在《Nature Methods》上,代表了通过测序扩展CRISPR兼容的转录物组和表
关于细胞凋亡细胞DNA-含量的测定
细胞凋亡时,核酸内切酶激活,导致DNA 断裂,这是凋亡的特征性表现,也为FCM 鉴别凋亡细胞奠定了基础。而检测细胞凋亡DNA 断裂的方法中,最常用、最简便的就是细胞DNA 含量分析。当细胞用乙醇、TrtionX—100 处理后细胞膜上出现漏洞,小片段DNA 从细胞内释放出来,使其DNA 含量低于
单个补体成分的测定
单个补体成分的测定 C3、C4、C1q、B因子和C1酯酶抑制物等,常被作为单个补体成分的检测指标。常用免疫溶血法检测单个补体成分的活性;基于抗原抗体反应的血清学法(免疫化学法)测定其含量。目前应用自动化免疫散射比浊法可准确测定体液中C3、C4等多个单一的补体成分。 一、 免疫溶血法 该方法
10x-Genomics独创短读序列技术-两年收入增涨20倍
近日,基因检测初创公司10x Genomics又筹集了3500万美元。本次融资是该公司D轮融资的延续,10x Genomics将用这笔资金继续推进研发工作和扩大产品营销。 在2018年4月,10x Genomics就已筹集了5000万美元的D轮融资,由Meritech Capital领投,Fi
基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(五)
二、DNA标记与细胞谱系示踪发育生物学的重点包括构成器官或生物体的细胞类型的多样性以及这些细胞的发育谱系历史。这些方面通常作为一个方向被单独研究,但最近的四篇新论文报道了一种将单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术与基于CRISPR的谱系示踪技术相结合来同时解剖转录组细胞表型和谱系历史的方法。近
单细胞RNA性能分析新方法
人体由130亿个细胞按不同功能、分门别类顺序组成,每个细胞都有其独特的分子“指纹”,即使是坐落于同一族群之中的细胞也可以彼此不同。并且它们的活动也会随时间变化。单细胞分析工具的应运而生就是为了解决细胞-细胞间非均质的复杂机制。正如德国慕尼黑大学(LMU)分子生物学家Wolfgang Enard教
单细胞RNA性能分析新方法
人体由130亿个细胞按不同功能、分门别类顺序组成,每个细胞都有其独特的分子“指纹”,即使是坐落于同一族群之中的细胞也可以彼此不同。并且它们的活动也会随时间变化。单细胞分析工具的应运而生就是为了解决细胞-细胞间非均质的复杂机制。正如德国慕尼黑大学(LMU)分子生物学家Wolfgang Enard教
大大简化药物发现过程的新方法
最近在《Nature Biotechnology》发表的一篇论文,来自麻省理工学院-哈佛大学布罗德研究所和Dana-Farber癌症研究所的研究人员描述了一种新的方法,大大简化了早期药物发现中一个费力的实验过程。他们的方法称为PRISM,采用一种分子条形码系统,以前所未有的规模和速度,在癌症和其
商业条形码检测仪常用款型
CCD扫描器,激光手持式扫描器和全角度激光扫描器二种。 一、HHP QC条形码检测仪是利用光电藕合(HHP)原理,对条形码印刷图案进行成像,然后再译码。它的优势是:无转轴,马达,使用寿命长;价格便宜。HHP因战略原因,从2012年停产全线所有检测仪相关产品,专注于条码扫描枪的业务。 选择C
条形码8字开头是转基因食品?
近日,一篇“8开头的条形码是转基因食品”的帖子又在网上流转开来。信息时报记者多方求证了解到,该说法并不准确,条形码开头数字代表的是区域而非产品,而目前国内对于商品条形码并没有强制标准。此外,转基因食品必须在外包装文字说明,消费者通过外包装便可以辨别商品是否转基因。 “8”字开头不特指产品只代
哈佛尹鹏组开发组织中多蛋白同时成像的新技术
为了更好地理解组织和器官是如何发育、功能衰竭以及随着时间的推移而再生的,研究人员想要在三维空间中可视化它们的组成细胞的分子库。"人类生物分子图谱计划"、"人类细胞图谱计划"和几个大脑图谱计划等雄心勃勃的计划正在进行中,这些计划旨在绘制出许多蛋白质(基因表达的产物)在人体器官和组织中单细胞水平上的
细胞化学词汇丰余DNA
中文名称:丰余DNA英文名称:redundant DNA定 义:在真核生物基因组中具有多个拷贝数的重复DNA序列。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
检测DNA分析细胞周期
Ⅰ、样品准备 准备以下一种或几种样品A、组织单细胞悬浮液(如淋巴腺、脾、骨髓、胎盘细胞)B、组织培养细胞C、Ficoll-hypaque分离的单核细胞Ⅱ、反应体系-DNA低渗缓冲液柠檬酸三钠 0.25gTriton-X 100 0.75mlPropidium iod
细胞化学词汇低度重复DNA
中文名称:低度重复DNA英文名称:lowly repetitive DNA定 义:在单倍体基因组中含1至10个拷贝的重复DNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
细胞化学词汇DNA自复制
中文名称:自复制英文名称:self-replicating定 义:质粒或其他染色体外DNA分子复制的时间以及速率不受染色体DNA控制的过程。应用学科:细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)
细胞化学词汇隐蔽卫星DNA
隐蔽卫星DNA(cryptic satellite DNA)是用密度梯度离心分析出一条卫星带,但仍存在于DNA主带中的高度重复序列。
细胞化学词汇高度重复DNA
中文名称:高度重复DNA英文名称:highly repetitive DNA;hyperreiterated DNA定 义:真核生物基因组中存在的拷贝数可达数千以上的短核苷酸重复序列,不负责编码蛋白质或RNA,它们在基因组中发挥着各种不同的功能。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基
细胞化学词汇微卫星DNA
微卫星DNA,重复单位序列最短,只有1~6bp,串联成簇,长度50~100bp,又称为短串联重复序列(Short Tandem Repeat STR)。广泛分布于基因组中。 其中富含A-T碱基对,是在研究DNA多态性标记过程中发现的。1981年Miesfeld等首次发现微卫星DNA,其重复单位长度一
细胞化学词汇DNA超螺旋
由于双螺旋DNA的弯曲,正超螺旋或负超螺旋而造成的DNA分子的进一步扭曲所形成的DNA的三级结构。有两种:当DNA分子沿轴扭转的方向与通常双螺旋的方向相反时,造成双螺旋的欠旋而形成负超螺旋;方向相同时则形成正超螺旋。生物体内一般以负超螺旋结构存在。
细胞化学词汇DNA解旋
中文名称:DNA解旋英文名称:DNA unwinding定 义:在一定的物理条件或相关酶类的催化作用下,维系DNA双链结构的氢键发生断裂使DNA双螺旋结构局部解体的现象。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
细胞化学词汇DNAθ型复制
θ型复制是DNA在复制原点解开成单链状态的复制,其分别作为模板,各自合成其互补链,出现两个叉子状的生长点,也叫做复制叉。
细胞周期的DNA检测
Ⅰ、样品准备 准备以下一种或几种样品A、组织单细胞悬浮液(如淋巴腺、脾、骨髓、胎盘细胞)B、组织培养细胞C、Ficoll-hypaque分离的单核细胞Ⅱ、反应体系-DNA低渗缓冲液柠檬酸三钠 0.25gTriton-X 100 0.75mlPropidium iodide 0.025g核糖核
体内无细胞DNA的表达
对于一些由缺乏三种特定蛋白质的基因突变引起的疾病(如Leber先天性黑蒙和血友病),直接的想法是将能够表达相关蛋白质的基因“播种”到体内,而不是“种”到基因组中,但在细胞质中自由表达。最典型的例子是几种批准的病毒转染基因疗法(如FDA批准的用于治疗遗传性眼病的基因药物“Luxturna”)。这种方法