单细胞研究指南:细胞分离

多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过,近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们,每一个细胞都是独一无二的。不同类型的细胞激活特定组合的机制,即使是同类型细胞,基因表达也会出现差异。 那么,细胞之间的哪些差异有生物学意义,哪些差异来自于技术偏好呢?要获得可靠的结果又需要研究多少细胞呢?这些问题曾经是单细胞研究(尤其是单细胞转录组研究)的拦路虎,令人望而却步。单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞数据分析工具在这方面为人们提供了很大的帮助。 The Scientist杂志最近联系了单细胞研究领域的一些专家,请他们分享了在单细胞中进行转录研究的秘诀。希望帮助研究者们更好地构建文库,处理和分析结果数据。 细胞分离 分离细胞是单细胞研究中最困难的步骤之一。目前的单细胞分离策略主要分为三类:手动分离、荧光激活的细胞分选和微流体技术。 在进行单细胞转录分析之前,我们需要确定自己拿到了正确的细胞。如果你想要的细胞已......阅读全文

新工具实现贴壁细胞的单细胞分析

  美国麻省理工学院的研究人员开发出一种微流体装置,一次能吸取一个细胞内的东西,而不干扰周围的细胞,这为研究人员测定单细胞的生化性质带来了一种新方法。它有助于研究不同干细胞之间的差异,或为什么同一肿瘤的不同细胞有着不同的治疗响应。   MIT电气工程与计算机科学系的Jongyoon

《细胞》:单细胞测序助力基因重组图谱

  来自斯坦福大学医学院等处的研究人员发表了题为“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了来自一个成人男子91个

脱落细胞单细胞悬液的制备

食管拉网细胞的单细胞悬液的制备 尿液脱落细胞的单细胞悬液的制备 胸、腹水脱落细胞的制备 冲洗液细胞样品的制备             实验方法原理 在临

脱落细胞单细胞悬液的制备

食管拉网细胞的单细胞悬液的制备 尿液脱落细胞的单细胞悬液的制备 胸、腹水脱落细胞的制备 冲洗液细胞样品的制备             实验方法原理 在临

美实验揭示单细胞变多细胞过程

  从单细胞生物到多细胞体这一过渡是怎么发生的?据美国物理学家组织网1月16日报道,5亿多年前,地球表面的单细胞生物开始形成多细胞簇,最终变成了植物和动物。美国明尼苏达大学研究人员在实验室用普通的啤酒酵母菌复制了这一关键进化步骤,演示了这一过渡的发生过程。相关论文发表在近期出版的《美国国家科学院院刊

培养细胞单细胞悬液的制备

实验材料胰蛋白酶细胞试剂、试剂盒EDTA·2NaPBS仪器、耗材离心管实验步骤一、培养细胞的特征一般细胞培养分为悬浮培养和贴壁培养,由于细胞的增殖有可能形成大小不等的细胞团块或连接成片。如果两个或多个细胞粘连在一块或细胞碎片过多都将影响 FCM 结果,进而导致实验失败。所以,制备合格的培养细胞单细胞

脱落细胞单细胞悬液的制备

实验方法原理 在临床工作中,可以收集到大量自然脱落细胞,这些细胞标本经过简单处理,便可成为较好的单细胞悬液供流式细胞术分析。主要包括脱落细胞、胸腹水细胞、尿液、内镜刷检细胞等。实验材料 细胞试剂、试剂盒 PBS仪器、耗材 尼龙滤网实验步骤 1. 将食管拉网器上的细胞洗脱到 20 ml PBS 液中,

培养细胞单细胞悬液的制备

            实验材料 胰蛋白酶 细胞 试剂、试剂盒 EDTA·2Na PBS

培养细胞单细胞悬液的制备

            实验材料 胰蛋白酶 细胞 试剂、试剂盒 EDTA·2Na PBS

培养细胞单细胞悬液的制备

实验材料 胰蛋白酶细胞试剂、试剂盒 EDTA·2NaPBS仪器、耗材 离心管实验步骤 一、培养细胞的特征一般细胞培养分为悬浮培养和贴壁培养,由于细胞的增殖有可能形成大小不等的细胞团块或连接成片。如果两个或多个细胞粘连在一块或细胞碎片过多都将影响 FCM 结果,进而导致实验失败。所以,制备合格的培养细

南科大程鑫课题组在微流控芯片研究领域获进展

  南科大材料科学与工程系教授程鑫带领的课题组在微纳加工技术及其在纳米压印、半导体工艺与器件、纳米光学等多种应用领域具有丰富的研究经验,近年来,在微流控芯片领域开展了大量创新性研究工作,并取得了一系列成果。  多种单元技术在微小平台上灵活组合规模集成  微流控芯片技术(Lab on a chip)是

单细胞测序技术(single-cell-sequencing)-综述(二)

DroNC-seq10月,Broad研究所张锋教授团队在Nature Methods上发表题为“Massively Parallel Single-Nucleus RNA-Seq with DroNc-Seq (doi: 10.1038/nmeth.4407)” 的文章,提出了一个新的测

颠覆传统诊断!微流控系统的应用前景盘点

  什么是微流体?  在生物、化学、材料等科学实验中,经常需要对流体进行操作,如样品DNA的制备、液相色谱、PCR反应、电泳检测等操作都是在液相环境中进行。因此,顾名思义,“微流体”即指实验所用的数量级从毫升、微升级降至纳升或皮升级的流体。  微流体概念自从20世纪80年代(1980s)被提出以后,

Dolomite的创新µEncapsulator有利于高通量单个细胞应用

  分析测试百科网讯  2015年12月16日,Dolomite—微流体创新的全球领导者,宣布了突破性的µEncapsulator 1系统,该微流控产品特别设计的来满足研究性生物学家的需求。这种人性化、高通量的系统在高精度、等大小、皮升级液滴中提供简单、明确的包装的单细胞、DNA和/或功能性微珠。 

单细胞RNA测序,众多研究都pick它

  多细胞测序和单细胞测序,你pick谁?如今,大多数研究人员也许会选择后者,因为不一样的角度,会带来不一样的见解。  多细胞测序和单细胞测序,你pick谁?如今,大多数研究人员也许会选择后者,因为不一样的角度,会带来不一样的见解。单细胞测序的最初动力来自癌症研究,可帮助人们了解肿瘤异质性和肿瘤微环

单细胞分析重大突破

生物学家对单个细胞的行为而不是对整个细胞群体的行为越来越感兴趣。在一项新的研究中,来自瑞士联邦理工学院(ETH)的研究人员开发出一种新方法可能引发单细胞分析变革。这一技术利用世界上zui小的注射器来对单个细胞的内含物进行取样以便进行分子分析。相关研究结果发表在2016年7月14日那期Cell期刊上,

单细胞生物的生产特性

  单细胞蛋白质生产周期短。单细胞生物繁殖特别快,世代周转迅速。如酵母菌在良好条件下每接种100千克,1天即可获得2500千克酵母,其生长繁殖速度约为大豆的1300倍,为动物生长的2000倍。所以,这类饲料生长速度快,世代周转迅速。  生产单细胞蛋白质饲料产品的原料多为烃类及其衍生物、天然气、石油加

单细胞测序的临床应用

近期精准医学的进展集中在发展基于基因组学的诊断和治疗。这些方法通常包括从患者的组织样本中生成DNA或RNA序列信息,并分析它以确定可用于诊断、预后或通知临床管理的特定特征。‘bulk’一词指的是从大量细胞中集体生成基因组数据的方法,或者在无细胞DNA的情况下,来自许多细胞的基因组材料。因此,这些基因

新型单细胞活性分析技术

  近日,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究论文中,来自加利福尼亚大学的研究人员通过运用一种分析单一细胞基因活性的先进技术,鉴别出了人类大脑脑细胞的特性,该研究揭示,如今进行大规模的细胞调查分析比过去我们所认为的要更加高效,而且廉价。  研究者Arnold

单细胞凝胶电泳介绍

单细胞凝胶电泳(single-cell gel eiectrophoresis,SCGE)又称慧星试验(comet assay)是一项较新的电泳方法。自1978年被Rydcbert B.等人成功地用于检验DNA单链断裂以来,经过不断的改进,已成为一种快速、灵敏、简便的检测DNA损伤的方法,广泛地应用

单细胞生物的主要影响

  单细胞生物虽然个体微小,但是与人类的生活有着密切的关系。多数单细胞生物是浮游生物的组成部分,是鱼类的天然饵料。草履虫对污水净化有一定的作用,据统计,一只草履虫每小时大约能形成60个食物泡,每个食物泡中大约含有30个细菌,因此,一只草履虫每天大约能吞食43000个细菌。但是单细胞生物也有对人类有害

单细胞mRNA差异显示实验

            实验方法原理 ##流程图 试剂、试剂盒 溶液和缓冲液 仪器、耗材

单细胞蛋白的生产特性

  单细胞蛋白质生产周期短。单细胞生物繁殖特别快,世代周转迅速。如酵母菌在良好条件下每接种100千克,1天即可获得2500千克酵母,其生长繁殖速度约为大豆的1300倍,为动物生长的2000倍。所以,这类饲料生长速度快,世代周转迅速。  生产单细胞蛋白质饲料产品的原料多为烃类及其衍生物、天然气、石油加

单细胞分选效率的分析

引言在单克隆细胞培养时,手动有限稀释法是最经典的分离单细胞手段之一。这种方式分离单细胞,每个孔中落进去的细胞数目符合泊松分布。依靠单细胞分选仪器分离单细胞的效率,无论从分选能力还是重复性都要明显优于手动的有限稀释方法。测定一款设备分选效率的标准方法,是用荧光校准微球来分选检验。实验方法Namocel

单细胞铺板的原理介绍

单细胞铺板是将一个孔加入少量无血清培养基,晃动浸润整个孔底,然后用移液枪吸至第二孔,同样方法浸润孔底,其它孔依此类推,这样整个孔底都是湿润的,细胞悬液会平铺在整个孔底。  加细胞悬液的时候可以避免加在中间中间细胞多,而加在周边晃匀后周边细胞多中间少的现象,细胞分散较均匀,注意加完细胞悬液后要放工作台

单细胞蛋白的营养特性

  单细胞蛋白质饲料由于原料及生产工艺不同,其营养成分组成变化较大,一般风干制品含粗蛋白质在50%以上。因为这类蛋白质是由多个独立生存的单细胞构成,所以富含多种酶系。动物对其消化率高。例如,猪对啤酒酵母的消化率可达92%,对木糖酵母的消化率可达88%。必需氨基酸组成和利用率与优质豆饼相似。单细胞生物

单细胞动物的进化过程

  当生命进化到真核细胞以后,便有了动物和植物之分。最早的动物叫原生动物,是最低等的一类动物,它的个体是由一个细胞构成的。仅管如此,“麻雀虽小却五脏俱全”,这是一个完整的生命活动体,拥有作为一个动物应具备的主要生活机能,如新陈代谢、刺激感应、运动和繁殖等,它的体内有了原始的分化,各具一定功能,形成了

单细胞mRNA差异显示实验

实验方法原理 ##流程图试剂、试剂盒 溶液和缓冲液仪器、耗材 水浴槽PCR热循环仪微量离心机塑料制品和滤器实验步骤 一、RNA 的分离收集对照组和实验组细胞,放入含 45ul2 mmol/L DTT 的 1.5 ml 微量离心管中。95℃ 水浴热解 2 min。每管加入以下物质:37℃ 温育 30

单细胞mRNA差异显示实验

目前有几种方法可以显示生理刺激下组织样本中未知基因的表达水平变化。然而, 很多组织内的细胞又存在形态和功能上的异质性,因此常常需要从单个细胞水平研究基因表达的差异。现在,我们介绍一种新方法,它常规用来在单细胞水平考察未知基因的差异性表达。现代神经科学研究技术作者:U.Windhorst & H. J

单细胞生物也具有“智慧”

  虽然"智慧"是一种十分复杂难以定义的概念,我们却都明白具备一个大脑是生物具有智慧的生理前提。但是对于单细胞生物来讲,它们是否也存在智慧呢?  如果我们坚信智慧来源于大脑,那么答案就是否定的。不过,最近一项研究表明情况比我们想象的要复杂,研究者们发现"无脑"的单细胞生物也具有学习的能力。  正如科