NatureMethods：单细胞TCR研究新进展
引言 今年三月份，来自英国的科学家Michael Stubbington博士和Tapio Lönnberg博士一起，基于Fluidigm公司C1 mRNA测序样本及相应数据，开发出一套用于研究T细胞基因序列信息的开放型分析工具 ---TraCeR，同时结合T细胞亚群的转录组数据分析，从而进一步揭示在不同免疫反应中蕴含的更深层次的T细胞功能特异性。该研究成果发表在著名的《nature methods》杂志上。 研究背景及成果 当机体受到外源性入侵时，免疫系统会召集所有免疫细胞亚群通过产生免疫反应与病原体进行对抗。由于病原体存在着多种多样的差异，因而相应产生的免疫反应和和每个阶段内涉及的细胞类型也有所不同。T细胞受体中V(D)J基因区域的随机重排，导致了T细胞种类的复杂多样化；这种多样化使T细胞在识别和杀伤特异外源性抗原时则更为快速、准确和有效。 目前对T细胞受体（TCR）的主要鉴别方法之一是对其α和β链进行测序。但是，......阅读全文
单细胞生物的大智慧
地球上绝大多数物种是单细胞生物。它们大多隐居在这个星球不为人知的角落里，籍籍无名。但生命是如此的奇妙，总会有一些看似简单的生物，向我们展示着它们无与伦比的能力，一种生命的力量。有的微生物十分强壮;有的微生物能够一睡万年;有的微生物则可在极端环境中茁壮成长，尽管其他大多数生命在这种环境下会刹那间凋
单细胞蛋白质的用途
①用作食品有些单细胞蛋白质，特别是用农产品培养生长的酵母菌菌体可用作食品（必要时要先经过处理）。 ②用作饲料用单细胞蛋白质作为饲料，可以节约粮食，促进畜牧业发展。 ③用作其他从单细胞蛋 白质中可提取许多有用之物，如辅酶A，细胞色素C和辅酶I等医药产品，如酵母浸出汁等生物试剂。
单细胞蛋白的优点有哪些？
单细胞蛋白具有以下优点： 第一、生产效率高，比动植物高成千上万倍，这主要是因为微生物的生长繁殖速率快。 第二、生产原料来源广，一般有以下几类：①农业废物、废水，如秸秆、蔗渣、甜菜渣、木屑等含纤维素的废料及农林产品的加工废水；②工业废物、废水，如食品、发酵工业中排出的含糖有机废水、亚硫酸纸浆废
Fluidigm推出单细胞TCR测序产品
解析细胞表型是免疫学中一个共同的单细胞分析目标。然而，T细胞受体V(D)J基因区域的随机重排带来了T细胞群体的复杂变化。这形成了庞大的T细胞部队，以便识别特定的外源蛋白，引发有效的免疫反应。 为了在单细胞水平实现深度的T细胞分析，Fluidigm近日在C1™系统上推出了一个全新的免疫学应用 –
结肠癌亚型单细胞分析
一项由新加坡（通讯作者Shyam Prabhakar和Iain Beehuat Tan）、印度、美国（通讯作者Paul Robson）三国共同开展的计算基因组学项目，鉴定了11种结肠癌肿瘤和附近临近的非癌细胞的细胞组成。为更有针对性的结肠癌诊断和治疗开启了一扇门。 来自杰克逊实验室的科学家，本
Namocell单细胞铺板基本工作原理
单细胞铺板新选择传统的细胞铺板一般采用手动的有限稀释法来进行，这种方法在需要的操作简单，只需要普通的排枪就能实现，但是效果却很不理想。主要体现在：一致性差，有效孔比例低下，耗费时间等。近年来，单抗药物的开发领域又被推上了一个新的高度，越来越多的公司都纷纷投入到这个热潮当中，随之而来的相关法规的要求也
单细胞分离策略的优缺点
据美国能源部微生物基因组学计划的主管Tanja Woyke介绍，研究人员使用几种方法分离单细胞，它们各有优缺点。Quake曾使用微流体方法来分离一种称为TM7的无法培养微生物1。TM7是杆状的，于是Quake及其团队专门捕获口腔微生物群落中的杆状细菌。随后他们通过核糖体RNA来追踪所要的细胞。在35
单细胞的分离方法有哪些
一、悬浮细胞的分离方法：利用离心方法对细胞进行分离。二、实体组织材料的细胞分离方法：对于实体组织材料，由于细胞间结合紧密，为了使组织中的细胞充分分散，形成细胞悬液，可采用机械分散法( 物理裂解)和消化分离法。
单细胞蛋白质的介绍
从单细胞微生物中提取出的蛋白。由于微生物繁殖速度快，原料要求低(包括农林副产物及废料，食品加工后的废物、副产品，石油衍生原料，厌氧废物处理过程中产生的生物质副产品等)，营养价值高(含有碳水化合物、脂肪、维生素和矿物质等多种营养成分)，是人类和动物获得蛋白质的手段之一。可制取蛋白质的微生物，包括含
单细胞蛋白的简介和分类
单细胞蛋白，也叫微生物蛋白，它是用许多工农业废料及石油废料人工培养的微生物菌体。因而，单细胞蛋白不是一种纯蛋白质，而是由蛋白质、脂肪、碳水化合物、核酸及不是蛋白质的含氮化合物、维生素和无机化合物等混合物组成的细胞质团。单细胞蛋白中重要的是酵母蛋白、细菌蛋白和藻类蛋白，它们的化学组成中一般以蛋白质
单细胞蛋白质的优点
从单细胞微生物中提取出的蛋白。由于微生物繁殖速度快，原料要求低(包括农林副产物及废料，食品加工后的废物、副产品，石油衍生原料，厌氧废物处理过程中产生的生物质副产品等)，营养价值高(含有碳水化合物、脂肪、维生素和矿物质等多种营养成分)，是人类和动物获得蛋白质的手段之一。可制取蛋白质的微生物，包括含
单细胞技术分类及应用（一）
2019年10月22日，Biogen与日本Eisai宣布，经与FDA协商，计划于2020年初向FDA提交Aducanumab治疗阿尔兹海默症（AD）的上市申请。如果获批，Aducanumab将成为首个逆转疾病进展的AD药物。从技术角度看，Aducanumab也将有可能成为首个单B细胞测序来源的抗体药
漫谈单细胞测序及其临床应用
一、概述随着现代生物学的发展，细胞群体的研究已不再能满足科研需求。单细胞测序解决了用组织样本测序或样本少时无法解决的细胞异质性难题，为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向。单细胞测序正在成为科研热点。二、单细胞测序倍受青睐的原因人们最初以为一个细胞类群是均质的（即各细胞都是
单细胞悬液制备方法介绍
01取样→预处理 取样是原代单细胞悬液制备非常重要的一步，其质量会直接影响到后续处理效果。 操作时，首先根据不同实验需求麻醉或处死动物后进行消毒、固定并切开相应位置皮肤暴露目的组织。 其次操作过程中有以下几点也需要注意： 严格无菌操作，快速处理； 针对不同组织类型控制环境温度； 保证
单细胞技术分类及应用（二）
什么是OEP呢？OEP的前身是2018年诺贝尔物理学奖获得者之一的Ashkin发明的Optical Tweeszer（OET）光镊技术，其原理是利用单个激光束通过高倍的显微物镜聚焦形成光阱，微观粒子受光压而束缚在光阱处，使用皮牛级别的力操纵和移动陷入光阱的微观粒子。这项技术在生物学上为单细胞
单细胞分析色谱仪分类方法
单细胞分析色谱仪种类有多种。1、按流动相物理状态可分：气相单细胞分析色谱仪和液相单细胞分析色谱仪。2、按洗脱方式可分：等度洗脱单细胞分析色谱仪和梯度洗脱单细胞分析色谱仪。3、按产地可分：国产单细胞分析色谱仪和进口单细胞分析色谱仪。4、按分离规模可分：微型单细胞分析色谱仪、小型单细胞分析色谱仪和大型单
单细胞RNA性能分析新方法
人体由130亿个细胞按不同功能、分门别类顺序组成，每个细胞都有其独特的分子“指纹”，即使是坐落于同一族群之中的细胞也可以彼此不同。并且它们的活动也会随时间变化。单细胞分析工具的应运而生就是为了解决细胞-细胞间非均质的复杂机制。正如德国慕尼黑大学（LMU）分子生物学家Wolfgang Enard教
高通量单细胞技术获得新突破
人类肠道是一件了不起的事情。每周，肠道都会再生一层新的内皮细胞，脱落的表面面积相当于一个小型公寓，并用新的细胞进行修复。几十年来，研究人员已经知道，负责这一改头换面行为的是肠道干细胞，但是直到今年，美国北卡大学教堂山分校(UNC)医学、细胞生物学和生理学、生物医学工程副教授Scott Magne
单细胞技术让这些研究成为现实
如今，细胞群体的平均值数据已不再能够满足研究的需求。研究人员开始转向单细胞来探索基本的生物学。在这一期的《BioTechniques》上，Jeffrey Perkel博士介绍了让单细胞实验成为现实的技术。 2015年底，巴西卫生部门和世界卫生组织报告，新生儿中小头症的发病率急剧增加。没过多久，
低成本单细胞分析新型“移动”设备
近年来人们发现研究单细胞如何影响疾病和治疗反应的潜力越来越大，但是由于缺乏富于成本效益和便于操作的仪器，现阶段单细胞分析的应用发展尚比较受限。 新年伊始，纽约基因组研究中心和纽约大学2月23日在《Nature Communications》发表文章，向我们介绍了一款3D打印便携式低成本微流控单
解析古老的单细胞基因组
单细胞的古细菌用肉眼根本看不到，甚至在使用显微镜时，也必须特别用心才能观察到它们。近日由丹麦奥尔胡斯大学地质微生物学中心领导的一个国际研究人员小组，却成功地从海底淤泥中获得了四个古细菌细胞，并绘制出了每个细胞的基因组图谱。这一突破性研究成果发表在著名的《自然》(Nature)杂志上。 “直
单细胞转录组制备仪的功能
fluidigm C1 单细胞自动制备仪用于 mRNA 测序 更完整的流程 -首尾相连的流程对单细胞进行全转录组分析 最高的通量 -每次运行可前所未有的平行处理 96 个单细胞 更容易的操作 -直接从单细胞开始，简化的样本制备，只需 3 小时手工操作时间，没有 片段化和纯化步骤 更节省的成
Nature子刊报道单细胞技术突破
人类肠道是一件了不起的事情。每周，肠道都会再生一层新的内皮细胞，脱落的表面面积相当于一个小型公寓，并用新的细胞进行修复。几十年来，研究人员已经知道，负责这一改头换面行为的是肠道干细胞，但是直到今年，美国北卡大学教堂山分校（UNC）医学、细胞生物学和生理学、生物医学工程副教授Scott Magne
单细胞RNA性能分析新方法
人体由130亿个细胞按不同功能、分门别类顺序组成，每个细胞都有其独特的分子“指纹”，即使是坐落于同一族群之中的细胞也可以彼此不同。并且它们的活动也会随时间变化。单细胞分析工具的应运而生就是为了解决细胞-细胞间非均质的复杂机制。正如德国慕尼黑大学（LMU）分子生物学家Wolfgang Enard教
Nature重建单细胞的生命史
研究人员开发出了一些新方法来追溯单个细胞的生命史，揭示它们在受精卵中的起源。通过检测健康细胞中人类基因组拷贝，他们构建出了从早期胚胎一路发育成为成体器官的组成部分每个细胞的图像。这项研究发表在6月29日的《自然》（Nature）杂志上。 在个体的生命过程中，机体内所有的细胞都会产生体细胞突变，
培养细胞单细胞悬液的制备
实验材料 胰蛋白酶 细胞 试剂、试剂盒 EDTA·2Na PBS
Science：单细胞分析？并行测序技术可以
近日，一项发表于国际杂志Science上的研究论文中，来自美国的研究者描述了一种新型的大规模并行技术，通过利用新一代测序技术来在单细胞水平上实现对基因表达的监测；研究者表示，单细胞分析对于理解人类造血系统的必要性及重要性不断凸显，如果没有这种分析的话，来自少许细胞的大量表达改变就和来自许多细胞的
PRL：单细胞生物记忆揭示智慧起源
科学家在多头绒泡菌身上发现了原始的学习和记忆能力（图片来源：EYE OF SCIENCE/SPL） 学习和记忆能力是智慧的根本。日本科学家的一项最新研究，首次在一种原生质粘菌（protoplasmic slime，单细胞生物，但具有多个细胞核）中发现了记忆能力和神经活动性。该研究成果有望揭示智
－GEN报告重磅解析单细胞分析技术
本期GEN Market & Tech Analysis报告的重点是单细胞分析（Single Cell Analysis ，SCA）市场。 SCA的应用涉及多个的领域，包括癌症、神经科学等。目前，SCA主要应用于生命科学的研究领域，但报告认为，在未来的5-7年，SCA将对诊
《细胞》：单细胞测序助力基因重组图谱
来自斯坦福大学医学院等处的研究人员发表了题为“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章，首次公布了来自一个成人男子91个