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单细胞基因组测序如何实现:从实验到分析,步步解析

随着生命科学研究的微观化,基于细胞群体的研究方法已不适用于某些研究领域(如肿瘤异质性、早期胚胎发育等)。单细胞基因组测序通过在单个细胞水平上进行测序,解决了用组织样本无法获得不同细胞间的异质性信息或样本量太少无法进行常规测序的难题,为科学家研究单个细胞的行为、机制等提供了新的方向。 【应用概览】 从2011年Navin等人将全基因组扩增技术与高通量测序技术结合起来进行乳腺癌细胞研究开始,单细胞基因组测序技术已逐渐被应用于神经科学、生殖系演化、器官发生、肿瘤、临床诊断、免疫学、微生物学、组织嵌合、胚胎发育以及产前遗传学诊断等研究领域,并被《自然方法》杂志( Nature Methods )列入2013年度值得期待的技术之一。单细胞测序发展历程及出版物数量和类目[1]单细胞基因组测序技术被广泛应用于生物科学和生物医学领域[1] 【技术流程】 单细胞基因组测序主要包括四个步骤:单细胞分离→全基因组扩增→高通量测序→数据分析......阅读全文

当宏基因组遇上单细胞测序

  日前,科学家们通过宏基因组测序和单细胞测序鉴定了一类新细菌。  16S rRNA基因序列的保守性和普遍性,使其成为了微生物检测和分类鉴定的强有力工具。这种方法为科学家们揭示了微生物群体的高度复杂性,但它还是有所遗漏。美国能源部联合基因组研究所上周的一次会议上,研究者人员向人们展示了在四个温泉样本

对疟原虫的单细胞基因组测序

  美国圣安东尼奥,2014年5月8日——美国德克萨斯生物医学研究所的科研人员和他们的同事开发出了一种分离单个疟原虫细胞然后对其基因组测序的新方法。这一进展将让科学家能够改进他们识别病人感染的多种类型的疟原虫的能力,而且还可带来最佳的经设计的药物何疫苗以应对这种主要的全球性杀手。疟疾仍然是全世界最致

单细胞测序推进了基因组的发展领域

单细胞测序能够帮助我们了解那些难以培养的微生物的基因组功能、了解遗传镶嵌功能在普通生物学功能或是疾病发生中的作用、肿瘤内在异质性对肿瘤发展以及耐药性的影响、重新定义细胞亚型等等。  单细胞测序可以揭示出每个细胞独特的微妙变化,甚至可以揭示全新的细胞类型,测序技术可谓是科技发展的一大创举,它推进了基因

谢晓亮:单细胞全基因组测序曙光初现

   谢晓亮  12月21日出版的美国《科学》杂志发表了题为《单细胞全基因组测序探索精子重组规律和遗传缺陷》的论文。同时,该期《科学》杂志也将单细胞全基因测序列为2013年六大值得关注的科学领域之一。  该论文由美国科学院院士、哈佛大学教授谢晓亮课题组与北京大学生物动态光学成像中心(

单细胞基因组测序:从实验到分析,步步解析

随着生命科学研究的微观化,基于细胞群体的研究方法已不适用于某些研究领域(如肿瘤异质性、早期胚胎发育等)。单细胞基因组测序通过在单个细胞水平上进行测序,解决了用组织样本无法获得不同细胞间的异质性信息或样本量太少无法进行常规测序的难题,为科学家研究单个细胞的行为、机制等提供了新的方向。【应用概览】从20

单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna

深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列,如测序前将dna打成小的片段,测序是从这个片段的两端测的,即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组,这要看你做什么了,一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转,这其实要看你想做什么分析,如做转

单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna

深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列,如测序前将dna打成小的片段,测序是从这个片段的两端测的,即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组,这要看你做什么了,一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转,这其实要看你想做什么分析,如做转

单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna

深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列,如测序前将dna打成小的片段,测序是从这个片段的两端测的,即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组,这要看你做什么了,一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转,这其实要看你想做什么分析,如做转

单细胞基因组测序如何实现:从实验到分析,步步解析

  随着生命科学研究的微观化,基于细胞群体的研究方法已不适用于某些研究领域(如肿瘤异质性、早期胚胎发育等)。单细胞基因组测序通过在单个细胞水平上进行测序,解决了用组织样本无法获得不同细胞间的异质性信息或样本量太少无法进行常规测序的难题,为科学家研究单个细胞的行为、机制等提供了新的方向。  【应用概览

华人学者Nature子刊单细胞基因组测序新突破

  在加州大学圣地亚哥分校生物工程师们的领导下,研究人员生成了来自单个大肠杆菌细胞以及人类大脑单个神经元的最完整基因组序列。采用一项新的单细胞基因组测序技术,他们在只有12纳升体积、充满液体的小孔中完成了基因组扩充,从而获得了这一突破性的成果。该项研究发表在11月10日的《自然生物技术》(Natur