重磅!科学家质疑巨病毒存在类似CRISPR/Cas的系统

在很多细菌中发现的CRISPR/Cas免疫防御系统,因其能够简单地而又优雅地编辑宿主基因组,而成为时下最火热的生物技术,在近期产生一大批发现。在今年3月,来自法国艾克斯-马赛大学的Didier Raoult和同事们发表一篇论文,指出一种被称作mimivirus的巨病毒(giant virus)拥有一种类似于CRISPR系统的被称作mimivirus噬病毒体抵抗元件(mimivirus virophage resistance element, MIMIVIRE)的噬病毒体抵抗机制(Nature, 10 March 2016, doi:10.1038/nature17146)。而在上个月发表在Virologica Sinica期刊上的一篇论文中,来自法国国家科学研究院(CNRS)的Jean-Michel Claverie和Chantal Abergel对这种观点提出挑战。 Claverie和Abergel在他们的论文中写道,......阅读全文

BMC-Biology:含Cas酶的新型转座子

  转座子是一种可移动的遗传元件,能够在基因组的不同位点之间跳跃,这种DNA片段广泛存在于自然界的各种生物中。近日,科学家们在细菌和古生菌中发现了一类新型的转座子,这种转座子不仅含有Cas内切酶的编码基因,还依赖这种酶整合到新的基因组区域。  细菌一直在与病毒或入侵核酸(质粒)进行斗争,为此它们演化

温和噬菌体衣壳蛋白防御超感染研究获进展

近日,中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室研究员王晓雪团队解析了丝状噬菌体编码的衣壳蛋白在细菌宿主超感染排除和噬菌体防御方面的作用。相关研究发表于《环境微生物学》。噬菌体是一种侵染细菌的病毒。烈性噬菌体在侵染细菌宿主后会迅速繁殖,以裂解细胞的方式从细菌宿主中释放。温和噬菌体在侵染

Cell头条:奇妙的基因组“手风琴”

  单个基因的复制就能对抗宿主抗病毒防御,这听起来好像不太真实,但是痘病毒(poxviruses)在病毒演化过程中,通过一个基因的快速多拷贝扩增,就能适应并对抗宿主的抗病毒防御,这被称为“基因组手风琴”(Genomic Accordions),利用这个机制,痘病毒实现了突变率虽然低,但能快速进化

重磅!科学家质疑巨病毒存在类似CRISPR/Cas的系统

  在很多细菌中发现的CRISPR/Cas免疫防御系统,因其能够简单地而又优雅地编辑宿主基因组,而成为时下最火热的生物技术,在近期产生一大批发现。在今年3月,来自法国艾克斯-马赛大学的Didier Raoult和同事们发表一篇论文,指出一种被称作mimivirus的巨病毒(giant virus)拥

细菌宿主对温和噬菌体“沉默—激活”机制获揭示

  中国科学院南海海洋研究所研究员王晓雪团队发现细菌宿主H-NS蛋白调控原噬菌体的“沉默—激活”过程的新机制。相关研究3月8日在线发表于《核酸研究》。刘晓晓副研究员为该论文第一作者,王晓雪研究员为论文通讯作者。 噬菌体是海洋中最丰富、最多样化的一类病毒。同其他病毒一样,噬菌体依靠宿主进行生存繁殖

噬菌体疗法的细菌宿主特异性特点介绍

  临床应用中,细菌噬菌体的宿主范围一般比抗生素较窄。一种噬菌体一般只对一种特定的细菌,或一种细菌的某个特定菌株产生效力。这种有限的宿主范围对疾病治疗非常有利,原则上讲,噬菌体疗法对胃肠道菌群和体内生态的不良影响比常用的抗生素小得多,因为抗生素的使用通常会影响肠道菌群,并导致诸如梭状芽孢杆菌的继发性

Science:宿主细胞利用芳烃受体侦查细菌群体感应信号

  细菌感染不会自动导致疾病;许多细菌只有在大量出现时才变得危险。在一项新的研究中,来自德国马克斯普朗克感染生物学研究所等研究机构的研究人员发现宿主细胞具有一种受体,它不能识别细菌本身,但可以侦察细菌之间的通讯。当有大量细菌存在时,宿主就会使用这种受体来记录它们分泌的称为毒力因子的致病性物质。相关研

细菌劫持免疫细胞

   沙门氏菌可劫持免疫细胞,并利用它们在体内传播。针对小鼠细胞进行的实验表明,这种细菌通过扰乱肠道内的电信号达到这一目的。相关成果日前发表于美国《科学公共图书馆·综合》。  人类肠道拥有小电场。这是由钾离子和氯离子等带电离子进出肠道细胞造成的。诸如食物中毒等沙门氏菌感染会扰乱电场,因为它们会破坏警

新机制:自己破坏自己的免疫防御系统

  《Cell Reports》报道了自己破坏自己免疫防御系统的新机制,这一发现将帮助我们调整策略对抗慢性感染。  像许多慢性感染一样,内脏利什曼病(visceral leishmaniasis thwarts)能阻碍免疫系统防御,让自己舒服地安顿在宿主体内。每年数百万人死于内脏利什曼病,紧跟在疟原

细菌基因组DNA提取实验

细菌基因组DNA提取可应用于:(1)获得细菌基因组DNA;(2)作为PCR模板;(3)用于测序、遗传信息分析等。实验方法原理本试剂盒采用独特的细胞裂解和相分离技术,结合DNA 制备膜选择性地吸附DNA 的方法达到纯化基因组DNA 的目的。适合于从1.0x109 细菌中获得多至20 ug 的基因组DN

细菌基因组DNA提取实验

            实验方法原理 本试剂盒采用独特的细胞裂解和相分离技术,结合DNA 制备膜选择性地吸附DNA 的方法达到纯化基因组DNA 的目的。适合于从1.0x109 细菌中获得多至20 ug 的基因组DNA。用于PCR、Southern 印迹分析、RAPD

细菌基因组DNA提取实验

实验方法原理 本试剂盒采用独特的细胞裂解和相分离技术,结合DNA 制备膜选择性地吸附DNA 的方法达到纯化基因组DNA 的目的。适合于从1.0×109 细菌中获得多至20 μg 的基因组DNA。用于PCR、Southern 印迹分析、RAPD、RFLD 等分子生物学实验。实验材料 细菌培养物

细胞也用“洗涤剂”!蛋白质帮细胞自主消灭细菌

  像很多人一样,细胞也会用“清洁产品”抵御细菌。  这种细胞“洗涤剂”实际上是一种蛋白质,人体大多数组织都能产生这种分子,它可以清除入侵的细菌,就像清洗油渍的洗洁精。在杀死沙门氏菌之前,像洗涤剂一样的蛋白质APOL3必须通过细菌外膜。图片来源:霍华德·休斯医学研究所  美国霍华德·休斯医学研究所研

重磅!科学家深入解析CRISPR起源的5个谜团

  Francisco Mojica并不是第一个观察到CRISPR的研究者,但他却是第一个被CRISPR“深深打动”的人,他还记得,1992年的某一天当他首次看到微生物的免疫系统时,他就认为这或许能够带来一场生物技术的变革,随后Francisco Mojica对来自地中海富盐菌(Haloferax

PNAS:免疫新形式-友好病毒为防御病原体提供免疫屏障

  细菌能变成我们的朋友也能变成敌人,一项新研究发现,病毒也具有类似的双重性。   在这项最新研究中,研究人员发现了此前没有被记录过的一种免疫的形式,在这种免疫形式中,被称为噬菌体的会感染细菌的病毒保护身体不受入侵病原体的侵害。身体表面的保护性的粘液层既是病原体的进入点,也是一大群有益微生物的栖息

温和噬菌体的免疫性功能介绍

温和噬菌体的基因组能与宿主菌基因组整合,并随细菌分裂传至子代细菌的基因组中,不引起细菌裂解。整合在细菌基因组中的噬菌体基因组称为前噬菌体(prophage),带有前噬菌体基因组的细菌称为溶原性细菌(lysogenic bacterium)。 前噬菌体偶尔可自发地或在某些理化和生物因素的诱导下脱离宿主

关于温和噬菌体的免疫性的介绍

  温和噬菌体的基因组能与宿主菌基因组整合,并随细菌分裂传至子代细菌的基因组中,不引起细菌裂解。整合在细菌基因组中的噬菌体基因组称为前噬菌体(prophage),带有前噬菌体基因组的细菌称为溶原性细菌(lysogenic bacterium)。 [1]  前噬菌体偶尔可自发地或在某些理化和生物因素的

抗传染免疫—抗细菌免疫的基本信息介绍

  抗细菌免疫—细菌感染通常分为两大类:  ①细菌基本在宿主的细胞外存活,这类感染叫做细胞外感染;  ②细菌大部分时间在宿主细胞内存活,这类感染叫做细胞内感染。体液免疫在抵抗细胞外感染(包括常见的化脓性细菌感染)方面起很大作用。抗体有几种作用:①协助吞噬细胞进行吞噬(调理作用);  ②中和毒素的毒性

科学家揭示宿主识别肠道菌群调控免疫新机制

  人体肠道内栖息着数万亿微生物,它们不仅协助消化食物,更在免疫系统塑造中扮演关键角色。这些微生物通过释放各类分子与宿主“对话”,调控免疫细胞的生长与功能。为维持肠道微生态平衡,人体配备了黏液层、抗菌蛋白、抗体和补体系统等多重防御工具,以管控菌群活动并抵御有害病原体。但是,一个核心谜题始终未解:在如

从历史探究病毒的免疫系统

  CRISPR/Cas的工作原理不是很复杂,当病毒感染细菌之后,细菌会把病毒的基因组序列的片段插入自己的基因组里,这样病毒的“模样”就被记录下来了,细菌存放入侵病毒序列的基因区域呈现出“规律间隔成簇短回文重复序列”(Clustered Regularly Interspaced Short Pal

“双剑合璧,百毒不侵”——朱斌课题组首次揭示Gabija免疫机制

  原核生物及其病毒之间的免疫与侵染是自然界最大规模的军备竞赛,也是生物技术的宝库。解析清楚的原核生物免疫机制如限制修饰系统和CRISPR系统分别带来了基因工程和基因编辑的技术革命。最近宏基因组生物信息学分析预测了大量潜在的未发掘原核生物免疫系统,其中一个是存在于15%已测序细菌和古菌基因组之中,在

细菌感染不会自动导致疾病?!

  细菌感染不会自动导致疾病;许多细菌只有在大量出现时才变得危险。在一项新的研究中,来自德国马克斯普朗克感染生物学研究所等研究机构的研究人员发现宿主细胞具有一种受体,它不能识别细菌本身,但可以侦察细菌之间的通讯。当有大量细菌存在时,宿主就会使用这种受体来记录它们分泌的称为毒力因子的致病性物质。相关研

窃取CRISPR的免疫“黑客”

  英属哥伦比亚大学的研究人员发现,一种感染主要淡水细菌的病毒使用“偷来”的CRISPR劫持宿主的免疫系统。这种病毒黑客在控制宿主免疫系统之后,迅速给系统打上补丁,以确保其他黑客无法闯入。这项研究发表在美国微生物学会旗下的mBio杂志上。  细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争,为此它们演化出了多种防

噬菌体竟然可以保护自身基因组免受CRISPR核酸酶切割

  细菌和感染它们的病毒正在进行一场与生命本身一样古老的分子军备竞赛。进化为细菌配备了一系列可靶向并破坏病毒DNA的免疫酶,包括CRISPR-Cas系统。但是,杀死细菌的病毒(也称为噬菌体)已设计出了它们自己的工具来帮助它们战胜这些最强大的细菌防御。  如今,在一项新的研究中,来自美国加州大学旧金山

Nature首次揭示噬菌体保护自身基因组免受CRISPR核酸酶切割

  细菌和感染它们的病毒正在进行一场与生命本身一样古老的分子军备竞赛。进化为细菌配备了一系列可靶向并破坏病毒DNA的免疫酶,包括CRISPR-Cas系统。但是,杀死细菌的病毒(也称为噬菌体)已设计出了它们自己的工具来帮助它们战胜这些最强大的细菌防御。  如今,在一项新的研究中,来自美国加州大学旧金山

NIBS邵峰连发Nature,PNAS文章解析致病机理

  来自北京生命科学研究所的邵峰研究员(专访邵峰:着眼于感兴趣,但机理完全不清楚的研究),主要研究方向是病原细菌感染宿主和宿主先天性免疫防御的分子机制,曾发表多篇Nature,Science,Cell杂志文章,荣获HHMI首届国际青年科学家奖。近期其研究组接连发表Nature,PNAS文章,分别报道

细菌效应蛋白拮抗宿主细胞焦亡通路机理获揭示

细胞焦亡作为机体重要的天然免疫反应,在拮抗和清除病原菌感染中发挥关键作用。当革兰氏阴性菌侵入宿主细胞后,其外膜的重要病原分子模式LPS(脂多糖,也称内毒素)会被宿主细胞内的天然免疫受体caspase-4/5/11识别,LPS激活的caspase-4/5/11会进一步切割活化焦亡蛋白GSDMD释

细菌效应蛋白拮抗宿主细胞焦亡通路机理获揭示

细胞焦亡作为机体重要的天然免疫反应,在拮抗和清除病原菌感染中发挥关键作用。当革兰氏阴性菌侵入宿主细胞后,其外膜的重要病原分子模式LPS(脂多糖,也称内毒素)会被宿主细胞内的天然免疫受体caspase-4/5/11识别,LPS激活的caspase-4/5/11会进一步切割活化焦亡蛋白GSDMD释

细菌宿主对温和噬菌体“沉默激活”机制研究进展

  近期,中国科学院南海海洋研究所研究员王晓雪团队发现细菌宿主H-NS蛋白调控原噬菌体的“沉默-激活”过程的新机制。相关研究成果以Xenogeneic silencing relies on temperature-dependent phosphorylation of the host H-NS

Nature:特殊的“诱饵”外泌体机制能保护宿主抵御细菌感染

  近日,一篇发表在国际杂志Nature上的研究报告中,来自纽约大学等机构的科学家们通过研究在人类和动物细胞中发现了一种诱饵机制(decoy mechanism),其或能保护细胞免于诸如细菌等外来入侵物所释放的危险毒素;研究者表示,细胞经常会暴露于细菌所释放的微小、蛋白包被的特殊物质中,即外泌体(e