Nature重大成果:揭示125000个病毒基因组
在地球的内部、地球之上以及地球的周围,微生物的数量达到了10^30,估计超过了银河系中的星星。微生物已知在调控碳固定,维持全球氮、硫、磷和其他营养素的循环中起至关重要的作用,但目前大多数的微生物仍然是无法培养和未知的。美国能源部正以这一“微生物暗物质”作为目标,更好地了解地球微生物的多样性,收集来自自然的教训用于应对能源和环境的挑战。 然而要探索地球微生物的多样性,要求更多地了解较少研究的,微生物和感染它们的病毒,影响微生物调控全球循环能力的病毒之间的关系。尽管据估计病毒的数量至少比地球上的微生物细胞高出两个数量级,在序列数据库中相比约5万的细菌基因组,当前的测序DNA病毒基因组不超过2,200个。 在发表于8月17日《自然》(Nature)杂志上的一项研究中,美国能源部联合基因组研究院(DOE JGI)的研究人员利用来自世界各地最大规模采集的组装宏基因组数据集,揭示出了125,000个部分及完整的病毒基因组,其中大多数......阅读全文
微生物鉴定药敏分析仪细菌鉴定原理
细菌鉴定原理:采用传统的比色法和快速荧光法。根据不同类别细菌的理化性质不同,设计不同的测试卡, 每一张卡包括多项生化反应。仪器采用光电比色法测定细菌因分解底物导致PH值改变或由于细菌生长利用底物而引起的透光度变化;其荧光法是在测试卡的小孔中加入酶底物, 使其与细菌产生的酶结合生成荧光物质。仪器在
食品细菌微生物检测仪的原理介绍
食品细菌微生物检测仪替代了传统的细菌培养的方法,能够更准确的,更快的检测出食品中细菌和真菌的数同时也可以检测表面消毒清洁度。 在美国农业,海关等部门所得到了广泛的运用。 食品细菌微生物检测仪测量原理是测量一些带生物标记的分子的水平。 这些分子是由新陈代谢或繁殖中产生。因
微生物的分类(思维导图):细菌,真菌,病毒
《生物圈中的微生物》主题单元教学设计 主题单元标题 生物圈中的微生物 所需时间 课内共用4 课时,每周3 课时 主题单元学习概述 生物圈中的微生物是生物课程内容十大主题之一。微生物种类多,数量大,在生物圈中的分布范围极其广泛,不仅在促进生物圈的物质循环中起着十分重要的作用,而且与生物圈中的绿色植物、
微生物检验细菌的生物化学试验
各种细菌具有各自独特的酶系统,因而对底物的分解能力不同,其代谢产物也不同。用生物化学方法测定这些代谢产物,可用来区别和鉴定细菌的种类。利用生物化学方法来鉴别不同细菌,称为细菌的生物化学试验或称生化反应。生物化学试验的方法很多,主要有以下几类。一、碳水化合物的代谢试验1.糖(醇、苷)类发酵试验(1)原
微生物检测如何区分细菌菌落与食品颗粒?
如果平板上食品颗粒与菌落形态较为接近,为避免和细菌菌落发生混淆,可多倾注一块平板置于4℃冰箱中放置,在计数时用于对照。另外也可以在已融化而保温在46℃水浴的PCA中加入0.5%TTC溶液,培养后食品颗粒不变色,细菌为红色。注意TTC的浓度不要过高,会有抑制细菌生长作用(食品检测一般不建议使用TTC,
细菌感染的微生物学检查方法
医生根据临床上诊断和治疗的需要选择不同的标本和检查方法进行实验室诊断,从而鉴定出感染的病原菌。实验室诊断包括细菌学诊断,即检测及鉴定病原菌;检测病原菌成分(抗原和核酸)以及检测患者血清中特异性抗体(图1)。图1 细菌感染的实验诊断方法 一、细菌学诊断 形态学检查 光镜下可观察直接涂片或分离培养的
细菌形态分类微生物与寄生虫检验
细菌形态分为球菌、杆菌和螺形菌三种形态医学|教育网搜集整理。 球菌杆菌螺形菌形状球形、肾形、豆状、矛头状等直径0.8~1.2微米呈双球状、链状、葡萄状等大小杆状、球杆状、棒状及梭状等——链杆状、分枝状、栅栏状等排列方式弧状或逗点状或螺旋状弯曲或U形、S形等3~6微米或2.5~4.0微米——
影响微生物实验室细菌生长的因素
一、营养细菌是需要食物和水来维持其生命过程的活的生物体。营养必须存在于溶液中,才能输送到细胞中。所以,水是必不可少的。细菌也需要碳、氮、硫、铁、矿物质和磷等“食物”来源,才能生长和繁殖。必须采取适当的卫生措施,清除残余食物,特别是食品接触表面上的残余食物。由于微生物需要营养存在于溶液中才能将其输送到
全球首份土壤病毒图谱绘成
一个包括美国太平洋西北国家实验室在内、由全球近50个机构组成的国际联盟,成功绘制出了首份全球土壤病毒(GSV)图谱。该图谱对全球土壤病毒圈进行了全面描述,阐释了土壤病毒对全球生物地球化学过程可能的影响,并揭示了有望在哪些领域进一步开展土壤病毒生态学研究等重要信息。相关论文发表于新一期《自然·微生物学
全球首份土壤病毒图谱绘成
一个包括美国太平洋西北国家实验室在内、由全球近50个机构组成的国际联盟,成功绘制出了首份全球土壤病毒(GSV)图谱。该图谱对全球土壤病毒圈进行了全面描述,阐释了土壤病毒对全球生物地球化学过程可能的影响,并揭示了有望在哪些领域进一步开展土壤病毒生态学研究等重要信息。相关论文发表于新一期《自然·微生物学
生物活性缺损病毒分类微生物与寄生虫
生物活性的缺损病毒分类是微生物与寄生虫检验考试复习需要了解的知识,医学|教育网搜集整理了相关内容与考生分享。1.干扰缺损病毒又称干扰缺损颗粒(defective interfering particles,DI颗粒),是病毒复制时产生的一类亚基因组的缺失突变体,必须依赖于其同源的完全病毒才能复制。D
巨型病毒点燃进化树之争
进化生物学家从来都不知道是什么制造了病毒,对它们的起源争论了十几年。但一组叫作Klosneuviruses的巨型病毒的新发现可能是“缺失的环节”,有助于解决争论——或者引发更多的争论。 2003年,研究人员报道发现了巨型病毒,并将其命名为Mimiviruses。其携带的基因表明,它们的原型可以
科研人员深度挖掘人类肠道宏基因组的古菌病毒
北京时间12月30日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所马迎飞团队在国际学术期刊《自然-通讯》(nature communications,IF=17.69)上发表了题为"Metagenomic analysis reveals unexplored diversity of arch
病毒基因检测系统的系统特点
1、DNA检测系统能提供诊断依据。使用基因芯片病毒检测系统,精确的诊断出导致泌尿生殖系统的致病微生物,为治疗感染疾病提供了科学的诊断依据。 2、生物基因疗法对顽固的感染症状效果不错。这种疗法特别针对病毒有极强的生物链的这个特点,从基因生物学的角度,直接破坏病毒基因生物链,达到治疗目的。
关于汉坦病毒的病毒基因分析
J.W.Song等从韩国绒鼠(Eothenomys regulus)分离了两株PUU相关病毒,命名为Muju(MUJ)病毒。两株病毒G2基因241bp片段序列存在1.2%差异,G2基因241bp片段和S基因208bp片段与PUU病毒相应片段序列的同源性分别为79.5%~83.4%和80.3%~8
研究证实细菌DNA可整合至人类基因组
日前,马里兰大学医学院(University of Maryland School of Medicine)的科学家们找到了细菌基因可偶然性地整合至人类基因组中的强力证据。研究发现,大约 1/3 的健康基因组中含有细菌 DNA 序列,而癌细胞中则更高。从而证实了来自细菌的侧向基因转移(L
全球首份土壤病毒图谱绘成
科技日报北京8月6日电 (记者刘霞)一个包括美国太平洋西北国家实验室在内、由全球近50个机构组成的国际联盟,成功绘制出了首份全球土壤病毒(GSV)图谱。该图谱对全球土壤病毒圈进行了全面描述,阐释了土壤病毒对全球生物地球化学过程可能的影响,并揭示了有望在哪些领域进一步开展土壤病毒生态学研究等重要信息。
口腔、肠道微生物菌群元基因组关联分析
2015年7月28日,北京协和医院和华大基因等机构的研究人员共同合作完成了类风湿关节炎(RA)口腔和肠道微生物元基因组研究。本项研究揭示口腔和肠道微生物菌群异常是RA病理生理和疾控的重要环节,并且为元基因组学辅助的RA个性化诊疗方案提供基础。研究成果于今日发表在《自然医学》杂志。 RA是一种致
华大基因参与全球最大微生物基因组研究项目
华大基因3月22日宣布将参与全球最大微生物基因组研究项目EarthMicrobiomeProject(简称“EMP”),将负责EMP亚洲地区所有样本的收集和鉴定,并对整个项目提供DNA提取、扩增、建库、宏基因组测序,以及研发生物信息学分析流程所需的计算资源。 EMP将对来自全球的20万个样本进
宏基因组学:查明微生物身份新手段
背景 《美国医学会杂志》(JAMA)近期刊发了一篇题为《利用不需培养的宏基因组学测序技术研究产志贺毒素大肠杆菌O104∶H4暴发株》的研究论文,引起了学界和社会的广泛关注。这篇论文中应用了一种称为“宏基因组学”的技术方法,不通过培养,直接从病人样品中检测分析其携带的病原微生物,甚至可以
微生物宏基因组测序可以解释地球氮循环?
微生物(细菌和古细等)是全球生物地球化学循环的重要驱动者。阐明微生物生物地理分布及其驱动过程对于预测环境变化将如何影响生物地球化学循环非常重要。以往微生物生物地理学的研究常常聚焦在物种的层面。然而,越来越多的研究表明,由于微生物群落固有的功能冗余性,微生物群落的功能变化通常与其物种组成变化是解耦
“万种微生物基因组计划”在深圳启动
由深圳华大基因研究院联合中国微生物领域顶尖研究机构、院校和企业组成的“万种微生物基因计划”,八月一日在深圳启动。 据悉,该计划是深圳华大基因研究院在“国际千人基因组计划”后启动的又一重大基因组计划,目前该计划的地位为亚洲第一、世界第三。 该计划预计在三年内完成一万种微生物物种全基因组
微生物所等发表植物基因组编辑研究综述
序列特异性核酸酶使得基因组编辑成为可能,快速推动了基础和应用生物学的发展。CRISPR-Cas9系统自出现以来,作为可转化植物的基因组编辑工具已得到广泛应用。CRISPR-Cas9对基因组靶位点进行定向切割,造成DNA双链断裂。DNA双链断裂主要通过两种高度保守的机制进行修复,即非同源末端连接(
研究人员构建人类阴道微生物基因组库
6月21日,深圳市宝安中医院(集团)副院长黄链莎、转化医学中心助理研究员孙文与大连医科大学副教授鄢秋龙等课题组的最新合作成果发表于《自然—微生物学》。人类女性阴道是一个包括细菌、真菌和病毒在内的复杂微生态系统,各微生物之间是相互制约、相互作用、相互依赖、对立统一的关系,其间的平衡关乎女性生殖健康及胎
数据支撑-助力科技“战疫”
在此次疫情防控攻坚战过程中,2020年春节前一天,采集自湖北武汉一名临床患者的病毒毒株和电子显微镜照片等信息发布后,很快便吸引了媒体的注意力,申请使用相关信息的用户不乏许多英美知名媒体。 这些信息正是来自于当天开通的新型冠状病毒国家科技资源服务系统。“这个系统的特点是把实物资源优势和信息技术能
细菌微生物快速检测仪的主要特点
1) 可检测固态、液态、表面、膏状、浆状样本; 2) 样本在检测时无需任何的前处理过程,直接丢入检测瓶即可; 3) 可自动控制孵育温度和孵育时间 4) 检测样本只需1ml/1g;同一温度下可同时检测8个样品; 5) 灵敏度高达可检测到1目标微生物;特异性高达99.999%; 6) 独立
-将细菌打包进药丸,恢复人体微生物系统
喝酸奶的人已经知道并不是所有细菌都对你有害。他们也许没意识到有些细菌十分重要,也许有一天人们可以服用充满细菌的药片打败疾病。 Seres Health公司希望开发出首个接受管理并通过临床检验的细菌药片,用来治疗人体微生物失衡相关的疾病。公司在上个月募集了105亿美元的投资并正式成立。公
细菌的胆汁溶菌试验微生物学
细菌的胆汁溶菌试验是临床医学检验技士需要了解的知识,医学教育网搜索整理如下:1.胆汁溶菌试验原理:胆汁或胆盐可溶解肺炎链球菌,可能是由于胆汁降低细胞膜表面的张力,使细胞膜破损或使菌体裂解;或者是由于胆汁加速了肺炎链球菌本身自溶过程,促使细菌发生自溶。2.试剂:10%去氧胆酸钠或纯牛胆汁。3.方法:(
病原微生物中细菌常见检测方法有哪些
1、快速测试片技术法快速测试片是指以纸片、纸膜、胶片等作为培养基载体,将特定的培养基和显色物质附着在上面,通过微生物在上面的生长、显色来测定食品中微生物的方法。细菌总数检测纸片的研制始于 20 世纪 80 年代,其主要优点是简便、实用、经济、操作性强。近年来以滤纸和美国某公司的 Petrifilm
测定水中微生物(包括细菌真菌等)数量的方法
器材及培养 材料和试剂蒸馏水, 自来水, 取自儿童公园的湖水, 牛肉膏蛋白胨琼脂培养基.仪器或其他用具灭菌三角烧瓶, 灭菌带玻璃塞瓶, 灭菌培养皿, 灭菌吸管, 灭菌量筒. 研究方法采用平板菌落记数技术测定水中细菌总数. 水样的采取 自来水先将自来水水龙头用火焰灼烧3 min 灭菌, 再开放水龙头5