一个新软件让CRISPR方法更加容易
最近,瑞典卡罗林斯卡学院和哥德堡大学的科学家,研发出了一个基于网络的软件——Green Listed,可以方便CRISPR方法的使用。该软件发表在《Bioinformatics》,可以通过greenlisted.cmm.ki.se网站免费获取。延伸阅读:Cell最新公布CRISPR技术新发现:更多的Anti-CRISPR蛋白;张锋2017年开年综述:CRISPR-Cas系统——细胞的生死抉择。 细胞是非常小的,并构成了一个生物体。人类身体中的细胞数量,大约相当于地球上人类数量的100倍。在绝大多数的这些细胞中是DNA长链。这些DNA链使得不同类型细胞的外观和行为产生了差异。CRISPR可以用来快速研究“DNA的不同部分对细胞有何直接影响”。使用这种方法,研究人员可以了解疾病的原因,并给出如何治疗的建议。 卡罗林斯卡学院医学系分子医学中心(CMM)的Fredrik Wermeling说:“我们使用CRISPR方法来研究免疫......阅读全文
计算电磁学各种方法比较和电磁仿真软件(一)
计算电磁学中有众多不同的算法,如时域有限差分法(FDTD)、时域有限积分法(FITD)、有限元法(FE)、矩量法(MoM)、边界元法(BEM)、 谱域法(SM)、传输线法(TLM)、模式匹配法(MM)、横向谐振法(TRM)、线方法(ML)和解析法等等。在频域,数值算法有:有限元法(FEM - F
Nature子刊:利用CRISPR
中东呼吸综合征冠状病毒( Middle East respiratory syndrome coronavirus ,MERS-CoV)是近年来出现的一种新型高致病性冠状病毒,于2012年在中东首次被鉴定出来,随后又在几个欧洲国家发现了它的踪迹。这种疾病会引发人类重症肺疾病,临床表现为发热、咳嗽、急
FEBS发布CRISPR技术特刊
《FEBS Journal》杂志近日发布了一份介绍如何使用CRISPR/Cas9的特刊,它包含9篇综述文章,由知名研究人员撰写,包括哈佛大学的George Church和Norbert Perrimon,西班牙阿利坎特大学的Francisco Mojica,以及Sloan Kettering纪念
CRISPR分子诊断技术(二)
6 Sherlock和Mammoth两家公司的技术并非横空出世,而是源于张锋和Doudna两家实验室于2015-2018年期间在知名期刊上发表的一系列科研成果。这场学术上的比拼犹如两个武林高手过招,精彩纷呈,让人目不暇接。两个团队互相竞争,也互相学习,开拓了CRISPR分子诊断这一全新
深挖CRISPR的治疗潜力
CRISPR-Cas9是细菌在漫长的进化史中演化出的重要防御机制。这个监控体系能够根据引导RNA的指示,靶标并降解入侵者的遗传物质。现在,CRISPR-Cas9已经成为了炙手可热的基因组编辑工具。 多伦多病童医院的科学家们对CRISPR-Cas9进行改造,并将其用于基因表达调控。他们成功在杜氏
CRISPR分子诊断技术(七)
39 加上Cas9,它们为分子诊断和基因编辑提供了多样灵活的工具。图片来源:参考资料240 CRISPR分子诊断技术并不是只有Doudna和张锋两家在开发。2019年3月,在Keck Graduate Institute任职的Kiana Aran博士与合作者在Nature Biomedic
CRISPR分子诊断技术(六)
34 不是所有的塞卡病毒都一样。2017年9月, 中科院遗传所的许执恒团队和军事医学科学院的秦成峰团队在Science上报导,prM蛋白的一个突变(S139N)增加了塞卡病毒的传染性,并引起更严重的小头症和更高的致死率。在该论文发表后一周内,Sabeti团队和张锋团队就设计、开发出几个能区分出
用CRISPR治病尚需时日
近日,科学家在美国华盛顿聚集,参加一场专注于基因治疗的年度会议。基因治疗是一个长期处于挣扎中的领域,最近因在小型临床试验中取得的一系列颇有前景的成果而重新赢得尊敬。如今,很多人相信,一种名为CRISPR的强大的新基因编辑技术,将加入到势头越来越猛的基因治疗大军中。 不过,CRISPR真的作好准
CRISPR分子诊断技术(五)
25 DETECTR达到了aM水平的灵敏度和≤7个碱基的特异性。例如,它能准确地检测出受试者携带的是哪种亚型的HPV。图片来源:参考资料2和1026 在同期Science论文中,张锋团队从三个方面着手完善SHERLOCK:多重化、定量化和去荧光。先说多重化:他们挑选了来自两个不同菌株的Cas
CRISPR分子诊断技术(三)
13 或许是因为LbuC2c2的特异性和非特异性剪切活性远远高于LshC2c2的相应活性, Doudna团队意识到LbuC2c2可以被用来构建高特异性、高灵敏度的RNA检测方法。若想检测出某一特定序列的RNA分子,先将与其互补的crRNA和LbuC2c2蛋白组装,再加上一些报告RNA分
CRISPR分子诊断技术(四)
19 由于其高灵敏度和特异性,CRISPR诊断技术或CRISPR-Dx可以有很多用途:病毒检测和病毒亚型区分,病菌识别和耐药性基因确认,即时检测(POCT), 患者基因分型,以及癌症突变分析和液体活检。这篇论文也初步展示了CRISPR-Dx在这些方面的应用前景。图片来源:参考资料320 比
Nature:CRISPR浪潮席卷学界
每当有新的CIRSPR-Cas9相关文章发表时,Addgene公司的工作人员就会迫不及待地研读。Addgene是家非盈利公司,研究者们把自己使用的分子工具存放在这里,以供其他科学家们尽快使用这一技术。Addgene公司执行董事Joanne Kamens 指出,一篇大热的论文一发表,几分钟内他们就
CRISPRCas9-原理
CRISPR/Cas技术是什么?CRISPR/Cas系统是一种原核生物的免疫系统,用来抵抗外源遗传物质的入侵,比如噬菌体病毒和外源质粒。同时,它为细菌提供了获得性免疫:这与哺乳动物的二次免疫类似,当细菌遭受病毒或者外源质粒入侵时,会产生相应的“记忆”,从而可以抵抗它们的再次入侵。CRISPR/Cas
CRISPR可以做分子诊断
CRISPR-Cas系统背景回放面对噬菌体的威胁,细菌进化出了一套专门针对噬菌体或外源性遗传物质的CRISPR-Cas免疫系统。CRISPR全称为“簇状、规律间隔的、短回文重复序列”(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repe
窃取CRISPR的免疫“黑客”
英属哥伦比亚大学的研究人员发现,一种感染主要淡水细菌的病毒使用“偷来”的CRISPR劫持宿主的免疫系统。这种病毒黑客在控制宿主免疫系统之后,迅速给系统打上补丁,以确保其他黑客无法闯入。这项研究发表在美国微生物学会旗下的mBio杂志上。 细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争,为此它们演化出了多种防
CRISPR功能研究入门指南
基因组测序让我们意识到,人类基因组只有一小部分被翻译成蛋白质。其实我们基因组的80%会转录成RNA,但这些转录本大多不生成蛋白质。近年来人们发现非编码RNA往往与人类疾病有关,不过绝大多数非编码RNA的功能还是未知的。CRISPR/Cas9在这方面可以起到重要的作用。 CRISPR激活(CRI
CRISPR分子诊断技术(一)
本篇为“连环画”系列中的第二篇。“连环画”中的每一篇都会介绍一个最新生物医药技术或趋势。以图画为主,文字为辅。虽然无法做到系统全面,但希望能给读者带来一些启发。每篇文章只代表作者个人的观点或解读,与礼来亚洲基金的投资决定无关。1 脊椎动物的免疫系统分为先天免疫(或非特异性免疫),和获得性免疫(
ACCULIBS2500专用软件
全新控制软件ACCULIBS2500配备了专用软件,软件包含了全自动控制,光谱读取和元素分析模块。用户可以使用控制软件灵活的控制平台的位置观察样品状态,调整光谱核心参数,读取光谱数据和样品元素分析全自动控制通过控制三轴电动平台的动作,可以快速找到目标的空间位置并完成对焦,进一步实现样品Mapping
数学筑基,软件突围
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/515926.shtm
流式软件如何融合图片
1、新建画布:工具栏中“新建”——然后更改对话框中的各个选项即可。2、点击选择工具图表中的“矩形选框工具m。3、框选流式图主要部分。4、点击右侧的拖移工具v。5、将刚才选定的流式图拖至新建的画布中逐一调整大小、整齐度,再裁减保存即可。
OneAttension软件实时分析
OneAttension软件 OneAttension软件将直观的用户界面和高水平的多功能化结合起来。它的一些主要特点包括: 一流的用户界面:OneAttension的核心就是最直观的用户界面。该软件易于学习,逻辑性的界面使得复杂的测试也可以简单地完成。 优越的分析精度: 使用工业标准的Young
激光粒度仪软件功能
激光粒度仪光是一种电磁波,它在传播过程中遇到颗粒时,将与之相互作用,其中的一部分将偏离原来的行进方向,这种物理现象称之为光的散射(衍射)。一束平行光在传播过程中遇到障碍物颗粒,光波发生散射偏转的角度跟颗粒的大小相关。颗粒粒径越大,光波偏转的角度越小;颗粒粒径越小,光波偏转角度越大。激光粒度分析仪就是
称重打印标签软件
系统功能简介在工厂的产品组装及包装环节,为了保存生产品质,可根据重量来判断是否多装或少装了产品,如果合格的产品自动打印出标签,用于贴在合格产品上.如果产品不合格,则报警!本套系统就是为了实现上述需求.系统框架如下所示: 利用IND560附带的DI/DO板(数字输入输出接口板),可以实现手动开关信号采
商业共定位分析软件
大多数商业共定位分析软件都能计算上面所描述的参数,包括 Pearson′s 相关系数、总 overlap 系数以及 k(X), m(X)和 M(x)共定位系数。此外,许多分析软件包含的算法可进行背景校正,产生整幅图的散点图,且可在一个双通道合成图或共聚焦图的感兴趣区域进行计算。从这些软件中获得的最重
PCB设计软件大解析
PCB(Printed Circuit Board)设计软件经过多年的发展、不断地修改和完善,或优存劣汰、或收购兼并、或强强联合,现在只剩下Cadence和Mentor两家公司独大。Cadence公司的推出的SPB(Silicon Package Board)系列,原理图工具采用Orcad CIS或
硬/软件接口:走向何方
硬件/软件接口(简称为"HSI")是一个术语,用来描述 SoC 外围设备的配置和功能,以及它们如何与CPU交互。从寄存器位到访问类型、属性和功能的各种因素的数量,在现代SoC中可能是绝对令人吃惊的。 例如,如果有一个32位地址总线,可以访问2 ^ 32内存映射寄存器。如果每个寄存器本身都
origin软件处理DLS数据
打开origin软件并导入数据,导入数据可以是新建workbook再黏贴数据上去,或者直接导入.csv等格式文件。选中数据X、Y列,选择Line作图。双击坐标轴,修改样式,根据投稿需要一般如下设置:scale-from 0.1 to 10000 -type log10(坐标轴范围设为1-10000,
SoftMax-Pro软件验证方案
对于在GLP或GMP实验室工作的科研人员,SoftMax Pro软件验证方案提供了最为全面的记录文档和可用于验证GxP管理员功能,软件运行和分析能力的工具。验证时间从6个月缩短至三天对于您实验最重要的莫过于结果的重复性,可靠性和完整性,但要做到这些可能需要多达6个月的时间进行充足的实验步骤的认证和记
FTIR气体分析软件
OPUS GA对目标气体的自动识别和定量干扰化合物的自动补偿无需对目标气体进行标定气体池内部的内置传感器感知气体压力和温度气体组分的识别和定量是由软件套件OPUS GA(气体分析)以全自动化方式进行。它使用非线性适配拟合算法和高分辨率的定量参考光谱,在无需进行气体标定的情况下可定量400多种化合物。
Empower软件详细资料
本资料来自Waters,包括以下14个pdf文件:Empower 2 安装和配置指南Empower 3维数据处理Empower System Suitability 快速参考指南Empower 采集数据Empower 谱图匹配 软件入门指南Empower 溶出度选项快速入门Empower 软件 系统