新基因筛选工具能绘制“垃圾DNA”
据英国《每日邮报》官网报道，美国科学家近日开发了一种新的基因筛选工具，能绘制引起癌症、糖尿病和痴呆症的基因突变，或有助于开发新疗法，进而拯救每年因此丧生的数百万人。新成果发表在《公共科学图书馆》杂志上。 领导这次研究的哥伦比亚大学教授大卫·戈尔茨坦说，现在的基因测序只能在不超过三分之一的遗传病患者基因中，鉴定出导致基因疾病的基因突变。辨识导致罕见疾病（如肌营养不良）的单基因突变相对容易，但科学家至今还无法清楚地解释人类基因组如何触发癌症和痴呆等疾病。 科学家多年来认为，人类基因组中98%的“垃圾DNA”（也被称为生命“暗物质”）跟遗传性心脏病、糖尿病、癌症和神经障碍等疾病息息相关，而秘密可能就在“垃圾DNA”所在的非编码基因区。 由于非编码基因调控能力的细节尚不清楚，因此基因组测序中的绝大多数数据无法解释清楚有关疾病的病因。为此，研究基因致病突变的科学家将搜索范围限制在蛋白质编码基因上，但这仅是整个基因组的一小部分。 ......阅读全文
Cell：光学混合筛选技术几天内筛选人细胞中的数千基因
如今，在一项新的研究中，来自美国麻省理工学院和布罗德研究所的研究人员开发出一种方法，该方法将大规模混合筛选与基于图像的细胞行为分析相结合。这种称为光学混合筛选（optical pooled screen）的方法允许人们在空间和时间分辨率下研究基因如何影响细胞过程，而其他的混合筛选方法则无法做到这
南通大学研发高效筛选平台－助力肿瘤精准诊疗
基因组水平的改变是肿瘤发生、发展的重要始动因素，对此，南通大学医学院本科生团队近日自主研发了一款高效的DNA调控元件及超增强子筛选平台——SPACE，有助于发现新的DNA调控元件，进而调控肿瘤的分子机制，为肿瘤的精准诊疗提供潜在的新方法。该成果近期发表在《中国免疫学杂志》（英文版）上。 研究发
DNA编码化合物库，新药筛选划时代的变革
在药物发现过程中面对的主要挑战是在成本可控范围内，如何快速并且高质量地找到尽可能多的能够与靶点蛋白相结合的活性化合物。为了解决这个问题，我们不断完善并创新着筛选方法。例如在一些项目中我们通过使用高通量筛选来高效地发现Hits。但是由于化合物的容量、多样性及质量的限制，只有极少数的公司能够承受得起
诺贝尔奖得主Cell揭示重要的“垃圾”DNA
来自斯坦福大学、犹他大学和清华大学等处的研究人员，发现了一类丰富的非编码DNA可以防止线虫生殖细胞中随机的基因沉默。他们的研究论文发布在6月30日的《细胞》（Cell）杂志上。 美国著名遗传学和分子生物学家、2006年诺贝尔生理学或医学奖得主、斯坦福大学的Andrew Z Fire教授，以及犹
Nature新论文再次证实“垃圾”DNA的重要性
来自加州大学旧金山分校，麻省哈佛Broad研究院，以及耶鲁大学医学院的研究人员研发出了一种新型运算工具，能深入挖掘已有DNA数据库资料。利用这一方法，他们发现了某些DNA突变如何通过遗传传递疾病的。 这一研究成果公布在10月29日Nature杂志上。 文章通讯作者，加州大学旧金山分校Sand
Nature子刊再证“垃圾”DNA的重要性
首次在全基因组范围内分析短串联重复序列(short tandem repeats，STRs)的特征，来自哥伦比亚大学工程学院及纽约基因组中心的研究人员领导的一个计算遗传学家小组，证实了过去被视作为是中性或“垃圾”的STRs实际上在调控基因表达中发挥了重要的作用。这项研究工作揭示出了调节基因表达的
干细胞牛人Cell子刊探讨癌症与“垃圾”DNA
来自Whitehead生物医学研究所、Dana-Farber癌症研究所的研究人员，在一项研究中揭示出了称作为超级增强子（super-enhancers）的基因控制元件是如何作为功能部件将多个信号通路集中于一些关键基因处以及调节转录活性的。 这项研究工作表明，这些基因控制元件为一些信号通路提供了
Nature里程碑式成果：“垃圾”DNA的起源
来自宾州大学的研究人员取得了一项里程碑式的研究新发现：他们发现了转录起始的精确位点，从而为解析基因组“暗物质”的起源迈出了重要的一步。这一研究成果公布在9月18日的《Nature》杂志上，这将有助于分析复杂疾病特征所在的确切位置。 所谓基因组“暗物质”，其实就是基因组中的非编码RNA——不
“垃圾DNA”关乎奶牛产奶量和生育能力
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507942.shtm
研究发现“垃圾DNA”或会影响机体患癌风险
近日，一项刊登在国际杂志British Journal of Cancer上的研究报告中，来自哈佛大学陈曾熙公共卫生学院等机构的科学家们通过研究发现，一个人患癌的风险或会受到垃圾DNA区域的遗传改变的影响，这些区域并不会编码产生蛋白质。 图片来源：CC0 Public Domain 研究者指
DNA发现之前的基因
三一学院地处都柏林的中心，它那灰色的三层新古典主义建筑环绕在草坪和运动场周围。校园的最东头是另一栋灰色建筑，落成于1905年，则是另一种截然不同的风格。那是菲尔兹杰拉德大楼，或者依据其门楣上刻的字叫物理实验楼。这栋楼的最顶层是一个演讲厅，1943年2月第一个周五的傍晚，约有400余人聚集在这里，
DNA（基因）检测－Southern－Blot
DNA（基因）检测－Southern BlotDNA吸印转移1．室温下将电泳后的琼脂糖凝胶浸入500ml溶液A中，摇动30分钟后换500ml新鲜溶液A再摇30分钟，使DNA双链碱变性。溶液A：5M NaCl 300.0ml10M NaOH 50.0mlH2O 650.0
基因检测也亲民－可筛选正宗大闸蟹
说起生物、生命、健康、基因检测等话题似乎很高端，但展览会实际上非常亲民，接地气。展览既有非常高端的干细胞技术介绍，也有很居家的健康食品展示，而且还有各种免费的体检体验活动。高高在上的基因检测技术原来能非常亲民，竟可以用来教您如何挑选正宗的阳澄湖大闸蟹，教您如何减肥瘦身。 展览会变成免费体检大厅
“垃圾基因”或可治疗心脏病
美国加州大学洛杉矶分校和霍华德休斯医学研究所的科学家近日发现，LeXis这个“垃圾DNA”并不是一无是处，或许可以使用它来治疗心脏病。研究成果日前发表在Circulation杂志上。 研究人员成功地使用了一种抑制胆固醇水平的基因作为治疗方法，目的是减少家族性高胆固醇血症引起的血小板增多。在临
惊喜！Cell：沉默“垃圾”基因，阻止肿瘤生长
12月14日，《Cell》期刊最新发表一篇题为“Oncogenic Role of THOR, a Conserved Cancer/Testis Long Non-coding RNA”的文章揭示了一个长非编码RNA——THOR，虽然不编码蛋白质，但是却对癌细胞有“直接影响”。科学家们最新发现
多基因风险评分技术可筛选基因，避免低智商婴儿出生
美国一家专注于筛查基因检测公司Genomic Prediction透露，利用一种叫做多基因风险评分（a polygenic risk score）的技术，可使计算出一个人拥有某些条件或特征成为可能。 譬如，如果想要筛查智商“更高”的婴儿，可以筛选与智力有关的上千种基因。 该公司声称，他们通过
纯化DNA实验_基因组DNA的快速纯化
试剂、试剂盒尾部缓冲液蛋白酶 K仪器、耗材离心管玻璃棒实验步骤第 1 天1. 大约 1.5 cm 长的尾部活检样品放在一个 1.5 ml 盛有 0.7 ml 尾部缓冲液的小离心管中，加 35 ul 10 mg/ml 蛋白酶 K，在 55℃ 振摇温育过夜。尾部缓冲液（配 25 ml）50 mmol/L
韩敬东研究员Cell子刊探讨“垃圾”DNA
人类基因组上含有大量的反转录元件，其中Alu序列的拷贝数最多，在灵长类基因组上有超过100万份拷贝，约占到人类基因组总长度的10%，仍然目前对于Alu元件的功能仍知之甚少。来自中科院上海生命科学研究院的研究人员在新研究中证实，一些Alu元件朝着增强子方向发生了演化。这一研究发现发表在《Cell
科学家找到胰腺发育不全病因－源于“垃圾DNA”
据物理学家组织网11月10日报道，最近，科学家首次利用一种新技术分析了以往被称为“垃圾DNA”的全部基因组，以寻找某些遗传病的成因。埃克塞特大学医学院和伦敦帝国学院合作领导的一个研究小组发现，一种叫做胰腺发育不全的疾病正是由位于染色体隐蔽部位的调控基因变异造成的。相关论文发表在11 月10日
DNA之父”说：奥巴马的“抗癌登月计划”是垃圾
James Watson，对，就是他，1953年与Francis Crick共同发现DNA双螺旋结构并开创了分子生物学的革命的那个人。 近日，“DNA之父”沃森在参加一个朋友的生日宴会上大肆批评，公开宣称奥巴马的“抗癌登月计划”是垃圾。获得了诺贝尔奖就可以随便攻击政治吗？他为什么要这么说？是脑
2顶级实验室《Science》“垃圾”DNA是宝
一类非编码(Non-coding)的DNA分子(不表达蛋白质)，曾经被认为是“垃圾”的DNA目前正成为遗传研究的新热点，“垃圾”DNA的真实含义早已变更，它仅仅是一个历史遗留的名称，实际上，“垃圾”DNA具有无与伦比的表达调控功能，2所顶级学府的2个独立团队在Science上发表关于垃圾DNA的
谷物筛选器筛选原理
谷物筛选是指根据粮食颗粒大小的不同，利用一层或数层静止的或运动的筛面对物料进行分选的方法。因为筛选和重力分选的主要对象是谷物，其介于固体和液体之间而被称为散粒体。散粒体具有流动性和自动分级性能。谷物筛选器就是一款专门检验颗粒粮食、油料试样的含杂率及大米中、糠粉含量，确定其品质等级的仪器。
Nature－Comm：基因融合筛选有助预测肺癌恶性程度
目前开发肺癌有效的治疗已经具有相当大的挑战性，部分是因为许多基因突变在肺癌中发挥作用。通过分析肺癌的RNA和DNA，美国密歇根州综合癌症中心研究人员发现含大量基因融合的肺癌患者比只有较少基因融合的肺癌患者有更糟糕的结果。 此外，研究人员确定肺癌（包括有吸烟史的）患者的几个新遗传异常。肺癌是一个
血清学筛选克隆新抗原/新基因（二）
19. 第一轮筛选得到阳性克隆需要进行第二轮筛选以去除假阳性并获得阳性单克隆噬菌体。过程如第一轮筛选，只不过用直径90mm 平板；具体过程见步骤4，这时所加入的噬菌体溶液是第一轮筛选得到的噬菌体上清（见步骤18），在用前要滴定好噬菌体的滴度，噬菌斑的数量以可区分出单个克隆，同时密度不能太稀为
血清学筛选克隆新抗原/新基因（一）
一、E.coli/phage 裂解液预吸附血清 1. 将E.coli /phage lysate 以1:10-20 稀释在TBST 溶液中。 2. 将4 张82mm 的nitrocellulose membranes（NC）浸入稀释后的E.coli/ phagelysate 中，室温下水平摇动30
基因编辑鼠的构建－Guide－RNA设计和筛选
众所周知，CRISPR/Cas9被业内誉为“基因剪刀”，它可以高效地实现靶基因的编辑，自问世以来就备受关注和青睐。CRISPR/Cas9系统是由CRISPR相关基因和Cas9组成，Cas9核酸酶会在向导RNA（Guide RNA, gRNA）的指引下，在完整基因组上的特定位点完成切割反应，同
南开大学团队发现“擦亮”基因筛选利器
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500326.shtm单倍体胚胎干细胞自问世以来，为正向遗传学筛选提供了非常优秀的平台，被广泛应用于各种病毒受体、药物靶点、生物发育现象等关键调控基因的筛选。然而，其在日常培养和分化过程中，常常会发生二倍化
基因芯片的应用药物筛选和新药开发
由于所有药物（或兽药）都是直接或间接地通过修饰、改变人类（或相关动物）基因的表达及表达产物的功能而生效，而芯片技术具有高通量、大规模、平行性地分析基因表达或蛋白质状况（蛋白质芯片）的能力，在药物筛选方面具有巨大的优势。用芯片作大规模的筛选研究可以省略大量的动物试验甚至临床，缩短药物筛选所用时间，提高
“垃圾基因”，治疗心脏病的新未来
来自UCLA和Howard Hughes Medical Institute的科学家成功利用抑制基因来控制小鼠的胆固醇水平，家族性高胆固醇血症会引起血小板增多，抑制胆固醇水平是控制血小板的增多治疗的一部分。在预临床实验中，研究者发现LeXis基因可以降低胆固醇水平、减少动脉阻塞，该治疗方法可以减
外源DNA的基因特点
基因有两个特点，一是能忠实地复制自己，以保持生物的基本特征；二是基因能够“突变”，突变绝大多数会导致疾病，另外的一小部分是非致病突变。非致病突变给自然选择带来了原始材料，使生物可以在自然选择中被选择出最适合自然的个体。含特定遗传信息的核苷酸序列，是遗传物质的最小功能单位。除某些病毒的基因由核糖核酸（