遗传性结直肠癌基因突变研究获突破

近日,中国科学院深圳先进技术研究院医工所医学机器人与微创手术器械研究中心赵国如团队在中国人群中基因胚系突变与家族性腺瘤性息肉病的基因型与表型关系图谱研究领域取得突破。相关工作分别在Oncotarget杂志与《科学报告》发表。 家族性腺瘤性息肉病(FAP)的发生主要由APC基因的胚系突变导致,早期在人体的肠道中出现成百上千个息肉,如果不进行手术干预切除,癌变不可避免。如果能够早期发现个体携带APC基因的致病原因,提示定期检测从而早期发现癌前病变,将会大大降低癌症的发生和死亡率。 研究团队在前期影像引导治疗及人体传感器网络相关工作的基础上,利用临床采集的中国系家族性腺瘤性息肉病患者的影像学资料、病理检测结果及病人临床症状,抽血提取基因组DNA,采用定制的基因片段捕获探针获得了与遗传性结直肠癌密切相关的14个基因,读出原始测序数据后进行多个数据库的比对,并对产物进行Sanger测序,从而验证探针捕获和高通量测序的结果。研究人员......阅读全文

与结直肠癌相关的基因突变类型CDX2基因

该基因是尾相关同源盒转录因子基因家族的成员。编码蛋白是参与细胞生长和分化的肠道特异性基因的主要调节因子。这种蛋白也在肠道的早期胚胎发育中起作用。这种基因的异常表达与肠道炎症和肿瘤发生有关。

与结直肠癌相关的基因突变类型IRS2基因

该基因编码胰岛素受体底物2,这是一种胞质信号分子,通过充当不同受体酪氨酸激酶和下游效应器之间的分子接头来调节胰岛素、胰岛素样生长因子1和其他细胞因子的作用。这种基因的产物在受体刺激时被胰岛素受体酪氨酸激酶磷酸化,在IL4治疗后被白细胞介素4受体相关激酶磷酸化。

与结直肠癌相关的基因突变类型EPHB4基因

肾上腺素受体及其配体,肾上腺素,介导许多发育过程,特别是在神经系统。根据其结构和序列关系,肾素被分为通过糖基磷脂酰肌醇连接锚定在膜上的肾素-A(efna)类和作为跨膜蛋白的肾素-B(efnb)类。EPH受体家族根据其胞外结构域序列的相似性及其与肾素A和肾素B配体结合的亲缘关系分为2组。肾上腺素受体构

与结直肠癌相关的基因突变类型BARD1基因

这个基因编码一种与BRCA1的N端区域相互作用的蛋白质。除了在体内和体外结合BRCA1的能力外,它还与BRCA1最保守的2个区域具有同源性:N端环基序和C端BRCT域。环基序是一个富含半胱氨酸的序列,存在于多种调节细胞生长的蛋白质中,包括肿瘤抑制基因和显性原癌基因的产物。该蛋白还含有3个串联锚蛋白重

与结直肠癌相关的基因突变类型-CDKN1A基因

这个基因编码一种有效的细胞周期蛋白依赖激酶抑制剂。编码蛋白结合并抑制细胞周期蛋白依赖性激酶2或-细胞周期蛋白依赖性激酶4复合物的活性,因此在G1期起调节细胞周期进展的作用。该基因的表达受到肿瘤抑制蛋白p53的严格控制,通过该蛋白介导p53依赖细胞周期G1期停滞,以响应各种应激刺激。该蛋白可与DNA聚

与结直肠癌相关的基因突变类型HLAC基因

HLA-C属于HLA I类重链相似度。这一类分子是由重链和轻链(β-2微球蛋白)组成的异二聚体。重链锚定在膜上。I类分子通过呈现内质网腔中的肽在免疫系统中起着中心作用。几乎在所有细胞中都有表达。重链约45kDa,其基因包含8个外显子。外显子1编码先导肽,外显子2和3编码α1和α2结构域,两者结合肽,

与结直肠癌相关的基因突变类型HIF1A基因

该基因编码转录因子缺氧诱导因子-1(hif-1)的α亚单位,是由α亚单位和β亚单位组成的异二聚体。HIF-1通过激活许多基因的转录,包括那些参与能量代谢、血管生成、细胞凋亡和其他蛋白质产物增加氧气输送或促进对缺氧的代谢适应的基因,作为细胞和全身对缺氧的稳态反应的主要调节器。因此,HIF-1在胚胎血管

与结直肠癌相关的基因突变类型NOTCH1基因

NOTCH1基因所编码的蛋白是一种高度保守的细胞表面受体,Notch家族包括4种受体,分别为NOTCH1,NOTCH2,NOTCH3和NOTCH4,他们的配体包括JAG1,JAG2,DLL1,DLL3和DLL4。Notch信号的紊乱不仅直接而且还可通过其他多条信号通路间接的诱导肿瘤发生,已发现Not

与结直肠癌相关的基因突变类型SMAD4基因

SMAD4基因编码的蛋白属于SMAD家族,可以被跨膜丝氨酸/苏氨酸受体激酶激活,如转化生长因子TGF-β受体,因此作为TGF-β信号的重要胞浆内信号级联分子,SMAD4可以自身形成同源复合物或与激活型其他的SMAD家族成员形成异源复合物,转移位到细胞核内,与其他转录因子协同作用,调节TGF-β应答基

与结直肠癌相关的基因突变类型ERBB3基因

该基因编码受体酪氨酸激酶的表皮生长因子受体(egfr)家族的一个成员。这种膜结合蛋白具有神经调节蛋白结合域,但不具有活性激酶域。因此,它可以结合这个配体,但不能通过蛋白磷酸化将信号传递到细胞中。然而,它确实与其他具有激酶活性的表皮生长因子受体家族成员形成异二聚体。异二聚化导致激活导致细胞增殖或分化的

与结直肠癌相关的基因突变类型-EPAS1基因

该基因编码一个转录因子,参与氧调节基因的诱导,随着氧水平的下降而诱导。编码蛋白包含一个基本的螺旋-环-螺旋结构域蛋白二聚结构域以及一个在信号转导途径中发现的对氧水平有反应的结构域。该基因突变与红细胞增多症家族性4型有关。

与结直肠癌相关的基因突变类型NTRK1基因

原肌球蛋白受体激酶A(TrkA),也称为高亲和力神经生长因子受体,神经营养性酪氨酸激酶受体1型或TRK1转化酪氨酸激酶蛋白,是人类中由NTRK1基因编码的蛋白质。 该基因编码神经营养性酪氨酸激酶受体(NTKR)家族的成员。 该激酶是膜结合受体,其在神经营养蛋白结合后磷酸化自身(自身磷酸化)和MAPK

与结直肠癌相关的基因突变类型FLT3基因

FLT3(FMS样酪氨酸激酶3)基因所编码蛋白一种调节造血的III类受体酪氨酸激酶,激活的受体激酶磷酸化激活多个信号通路,包括细胞凋亡、增殖及骨髓造血细胞的分化。FLT3的突变或者高表达可能会造成该蛋白的持续激活,从而导致急性髓细胞白血病和急性淋巴细胞白血病。

与结直肠癌相关的基因突变类型HSPA5基因

该基因编码的蛋白是热休克蛋白70(hsp70)家族的成员。局限于内质网(ER)内腔,参与ER中蛋白质的折叠和组装。由于这种蛋白质与许多ER蛋白质相互作用,它可能在监测蛋白质通过细胞的转运中起到关键作用。

与结直肠癌相关的基因突变类型EZH2基因

EZH2基因编码的是一种组蛋白赖氨酸N-甲基转移酶,参与DNA甲基化从而抑制其他基因转录,EZH2也可甲基化组蛋白H3第27位赖氨酸。EZH2的甲基化活性促进异染色质的形成从而使基因沉默,是PRC2复合物的组分之一。EZH2的突变或者过表达与多种类型癌症相关,如乳腺癌、前列腺癌、黑色素瘤和膀胱癌等。

与结直肠癌相关的基因突变类型FBXW7基因

FBXW7基因所编码的蛋白属于F-box蛋白家族的一员,为SCF(SKP1-cullin-F-box)型泛素连接酶的靶蛋白识别成分,包含了若干蛋白质相互作用的保守结构域。作为泛素蛋白酶体降解途径的重要识别因子之一,FBXW7的底物很多都是癌基因,例如cyclinE、 c-myc、c-jun及Notc

与结直肠癌相关的基因突变类型ERBB2基因

ERBB2编码的蛋白属于表皮生长因子受体家族,该家族包括HER1(erbB1,EGFR)、HER2(erbB2,NEU)、HER3(erbB3)及HER4(erbB4),也属于受体酪氨酸激酶家族。ERBB2没有与配体结合的结构域,但可以与家族成员形成异源二聚体来结合配体如表皮生长因子(EGF),从而

与结直肠癌相关的基因突变类型TP53基因

TP53基因编码的是分子量约为53kDa的蛋白,P35根据其分子量大小命名的,首次是在1979年发现致瘤病毒SV40可以与该蛋白形成复合物,并且将克隆得到p53转入到细胞可引起细胞癌变,所以最初的10年普遍认为p53是抑癌基因。后来发现之前肿瘤细胞来源的p53基因突变体能够促使细胞发生转化,而野生型

AJHG:科学家鉴别出新型的遗传性结直肠癌风险因子

  近日,一项刊登在国际杂志the American Journal of Human Genetics上的研究报告中,来自MIT博德研究所等机构的研究人员对将近3800名结直肠癌患者进行研究揭示了有望改善疾病风险筛查的机会及治疗手段,这是迄今为止最大的一项种系研究。个体患结直肠癌的风险有30%都是

与结直肠癌相关的基因突变类型-B2M基因

该基因编码与主要组织相容性复合体(MHC)I类重链在几乎所有有核细胞的表面上发现的血清蛋白。这种蛋白主要是β-折叠片结构,在某些病理条件下可以形成淀粉样纤维。编码的抗菌蛋白在羊水中显示出抗菌活性。这种基因的突变已被证明导致高凝性低蛋白血症。

与结直肠癌相关的基因突变类型MIR2181基因

micrornas(micrornas)是短的(20-24nt)非编码RNAs,通过影响mRNas的稳定性和翻译,参与多细胞生物中基因表达的转录后调控。小RNA被RNA聚合酶II转录,作为可编码蛋白质或不编码的有帽和多聚腺苷酸化的初级转录物(pri-mirnas)的一部分。初级转录物被Drosha核

与结直肠癌相关的基因突变类型-PTP4A3基因

这个基因编码蛋白酪氨酸磷酸酶家族的一个成员。蛋白酪氨酸磷酸酶是在多种细胞过程中起调节作用的细胞信号分子。这类蛋白酪氨酸磷酸酶在小鼠体内的研究表明,它们在体内是预酰化的,这表明它们与细胞质膜有关。编码蛋白可促进细胞增殖,该基因的过度表达与肿瘤转移有关。选择性剪接导致多个转录变体。

与结直肠癌相关的基因突变类型NT5E基因

该基因编码的蛋白是一种质膜蛋白,催化胞外核苷酸转化为膜渗透性核苷。编码蛋白被用作淋巴细胞分化的决定因素。这种基因的缺陷会导致关节和动脉钙化。两个编码不同亚型的转录变体已经被发现。

与结直肠癌相关的基因突变类型PIK3CA基因

PIK3CA基因编码的蛋白是PI3Ks的催化亚单位,PI3Ks是一种脂激酶家族,能特异性磷酸化磷脂酰肌醇的3位羟基,产生第二信使肌醇类物质。PI3Ks家族分I型、II型和III型,其中IA型又分为IA和IB两个亚型,PIK3CA则是IA型的催化亚单位。PIK3CA基因的突变可以导致PI3Ks的催化活

与结直肠癌相关的基因突变类型PTGS2E基因

前列腺素内过氧化物合酶(PTGS),又称环加氧酶,是前列腺素生物合成中的关键酶,既是一种双加氧酶又是一种过氧化物酶。PTGS有两种同工酶:组成型PTGS1和诱导型PTGS2,它们在表达和组织分布的调节上存在差异。这个基因编码诱导同工酶。它由特定的刺激事件调节,提示它与炎症和有丝分裂发生相关的前列腺素

与结直肠癌相关的基因突变类型NR2F2基因

这个基因编码一个核受体类固醇甲状腺激素超家族成员。编码蛋白是一种参与许多不同基因调控的配体诱导转录因子。交替剪接导致多个转录变体。

与结直肠癌相关的基因突变类型EIF4EBP1基因

这个基因编码翻译抑制蛋白家族的一个成员。该蛋白直接与真核细胞翻译起始因子4e(eif4e)相互作用,该因子是多亚单位复合物的一个限制性成分,在mRNAs的5'端招募40s核糖体亚单位。这种蛋白与eif4e的相互作用抑制复杂的装配和翻译。这种蛋白被磷酸化,以响应各种信号,包括紫外线辐射和胰岛素

与结直肠癌相关的基因突变类型MAP2K1基因

双特异性丝裂原活化蛋白激酶激酶1是人体中由MAP2K1基因编码的酶。 由该基因编码的蛋白质是双特异性蛋白激酶家族的成员,其充当促分裂原活化蛋白(MAP)激酶激酶。 MAP激酶,也称为细胞外信号调节激酶(ERK),充当多种生化信号的整合点。 该蛋白激酶位于MAP激酶的上游,并且在多种细胞外和细胞内信号

与结直肠癌相关的基因突变类型PPP1R15基因

这个基因是一组基因的一员,在紧张的生长停滞状态和用DNA破坏剂治疗后,这些基因的转录水平会增加。无论p53的状态如何,电离辐射对该基因的诱导都发生在某些细胞系中,其蛋白反应与电离辐射后细胞凋亡有关。

与结直肠癌相关的基因突变类型SH2B3基因

SH2B衔接蛋白3(SH2B3),也称为淋巴细胞衔接蛋白(LNK),是人类中的蛋白质,由12号染色体上的SH2B3基因编码。 SH2B衔接蛋白3是一种蛋白质,在人类中由染色体12上的SH2B3基因编码。它在许多组织和细胞类型中普遍表达.LNK在与造血,炎症和细胞迁移相关的信号传导途径中起调节作用。