中科院发表CellRes文章:三维基因组组装重要新机制

来自上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学中心,中科院北京生物物理所的研究人员发表了题为“Molecular mechanism of directional CTCF recognition of a diverse range of genomic sites”的文章,阐明了染色质架构蛋白CTCF方向性识别原钙粘蛋白启动子和增强子位点的分子机制,为进一步研究CTCF在三维基因组组装过程中的功能奠定了重要基础。 这一研究成果公布在Cell Research杂志上,文章通讯作者为上海交大吴强教授和中科院北京生物物理所王艳丽研究员。 CTCF蛋白属于锌指蛋白家族,具有11个串联排列的锌指结构。CTCF通过其不同组合的锌指结构结合到人类基因组中的很多位点上,并介导染色质环化和染色质高级拓扑结构的形成,在染色质折叠组装、基因表达调控、DNA断裂修复等生命过程中起到十分重要的作用,CTCF及其基因组结合位点的突变与肿瘤等多种......阅读全文

染色质高级结构调控多能干细胞诱导机制获进展

中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员姚红杰课题组联合美国加州大学圣地亚哥分校教授付向东课题组,运用体细胞重编程到诱导多能干细胞为模型结合多维组学技术并联合生物信息分析,揭示了CCCTC结合因子(以下简称CTCF)介导的染色质绝缘和染色质结构变化协同调控干细胞多能性获得的新机制。相关研究4月5日发

原子力显微镜测量架构

原子力显微镜测量架构AFM 的探针一般由悬臂梁及针尖所组成,主要原理是由针尖与试片间的原子作用力,使悬臂梁产生微细位移,以测得表面结构形状,其中最常用的距离控制方式为光束偏折技术。AFM 的主要结构可分为探针、偏移量侦测器、扫描仪、回馈电路及计算机控制系统五大部分。AFM 探针长度只有几微米长,探针

原子力显微镜测量架构

原子力显微镜测量架构AFM 的探针一般由悬臂梁及针尖所组成,主要原理是由针尖与试片间的原子作用力,使悬臂梁产生微细位移,以测得表面结构形状,其中最常用的距离控制方式为光束偏折技术。AFM 的主要结构可分为探针、偏移量侦测器、扫描仪、回馈电路及计算机控制系统五大部分。AFM 探针长度只有几微米长,探针

NVIDIA-RTX-30系列架构详解(一)

在当前的显卡市场上,占据80%的NVIDIA公司被玩家爱且恨着——他们带来了最近十多年来最好的显卡,同时也让高端游戏卡的价格高企,发烧显卡至少五位数起。在RTX 30系列显卡发布之后,玩家的不满似乎释然了,相比当前的图灵显卡,安培架构的RTX 3090/3080/3070显卡一下子变得真香了,因为它

NVIDIA-RTX-30系列架构详解(七)

有关NVIDIA的安培GPU架构及技术上的介绍差不多了,不过最后这一点留给一个看似不起眼但有可能改变游戏体验的新技术——RTX IO,它可以让SSD硬盘实现游戏近乎实时加载的体验。SSD硬盘现在差不多普及了,它超快的性能也让游戏玩家受益不少,游戏加载速度大幅提升,不过这还没到头,随着游戏容量越来大,

NVIDIA-RTX-30系列架构详解(五)

安培GPU架构详解之:第三代Tensor Core、8K游戏成为可能Tensor Core是伏特GPU引入的一种新核心,现在也是SM单元的三大子核心之一,不过在数据中心GPU上,AI加速功能非常重要,所以A100大核心的Tensor Core占据了相当大的面积,功能及性能都改进不少。在GA102核心

NVIDIA-RTX-30系列架构详解(三)

GA102核心的SM单元按照之前图灵GPU的路线走,安培GPU的SM单元增加的并不多,但实际上FP32性能翻倍了还多,算上频率,RTX 3080的理论性能差不多是RTX 2080的三倍了,这是怎么做到的?答案就是CUDA核心的FP32翻倍,但翻倍的方式有点特殊,每个SM单元中有4个分区,每个分区除了

谈谈架构层级的“开闭原则”(一)

简介:本文是关于架构层级SOLID原则的文章系列的第一篇。你可能熟悉如何在面向对象的层级遵循SOLID原则来进行类的设计,或者你也曾经疑惑这些原则是否适用于系统的架构设计,关于这一点,我将尝试给出一些我的见解。在类的层级,开闭原则(the-Open-Closed-Principle,简称OC

谈谈架构层级的“开闭原则”(二)

有界上下文还好,确实有其他方案可供选择。我们可以让领域驱动设计(DDD)来帮忙。只要将领域拆分成有界上下文,就可以利用其优势来完成工作。在一个超简化的系统模型中,我们可以定义如下的有界上下文:租赁协议客户 车辆。租赁专员:使用系统来办理租赁协议租赁中介:通常情况下客户并不直接租车,而是通过代理人来租

NVIDIA-RTX-30系列架构详解(六)

首先,安培GPU更新的NVDEC首次实现了AV1的8K 60p解码支持,这个编码比H264能够节省大量带宽,但CPU软解的话,9900K这样的CPU占用率也要达到85%,而安培GPU的NVDEC硬解占有率只有4%,同时帧速能从28fps达到60fps,流畅度也提升了。·首发HDMI 2.1接

NVIDIA-RTX-30系列架构详解(四)

安培GPU架构详解之:RTX光追升级 从能用到好用上代的图灵GPU架构最大的亮点就是引入了RTX实时光追技术,开启了3D游戏的光追时代,意义重大。但是先行者的代价也不小,而且图灵GPU的光追效果在实际游戏中并不明显,对性能的影响颇大,第一代RTX光追只能说解决了有无问题,现在的安培GPU才是RTX光

NVIDIA-RTX-30系列架构详解(二)

与台积电的7nm工艺晶体管密度大约1亿/mm2相比,8nm工艺大概是6000万晶体管/mm2,但这是单一的SRAM芯片的对比,实际上GPU芯片比较复杂,差距会缩小很多。根据是NVIDIA公布的信息,台积电7nm工艺制造的安培A100核心是540亿晶体管,核心面积826mm2,而三星8nm工艺制造的G

详解USBC应用新架构

USB-C接口正在彻底改变电子设备的充电方式。USB-C连接线无论哪一端都能连接智能手机或超级本。物理上,C型连接器既是双向的(无论线缆的哪一端都能插入两头的设备),也是无极性的(连接器插入时可以正面朝上,也可以反面朝上)。在协商过程中,连接系统可以电子地分辨出电极性。除了数据传输,USB-

FAT4基因的结构特点及作用

这个基因编码的蛋白质是原钙粘蛋白家族的一员。该基因可能在调节平面细胞极性(pcp)中发挥作用。对小鼠的研究表明,pcp信号缺失可能导致囊性肾病,该基因突变与van-maldergem综合征2有关。另外,该基因的剪接转录变体已经被发现。

CDH10基因的结构特点和功能作用

该基因编码钙粘蛋白超家族的ii型经典钙粘蛋白。该基因的选择性剪接导致多个转录变体这些变体中至少有一个编码蛋白前体,该蛋白经蛋白质水解处理后生成成熟的钙粘蛋白。这些完整的膜蛋白介导钙依赖性细胞粘附,由一个大的n端胞外结构域、一个单一的跨膜结构域和一个小的高度保守的c端胞质结构域组成。细胞外结构域由5个

蛋白质原转换酶的基本信息

中文名称蛋白质原转换酶英文名称proprotein convertase定  义催化蛋白质原转化为成熟的蛋白质的蛋白酶类。如蛋白质原转换酶1(编号:EC 3.4.21.93)、蛋白质原转换酶3(编号:EC 3.4.21.94)、蛋白质原转换酶(编号:EC 3.4.21.61)等,切割蛋白质原的位点多

纤维蛋白原(Fg,FIB)的作用

  纤维蛋白原可以促进血小板的聚集,促进平滑肌和内皮细胞的生长、增殖和收缩,增加血液粘滞性和外周阻力,引起内皮细胞损伤,促进胶原和去氧核糖核酸合成,趋化单核/巨噬细胞向内膜下迁移,促进红细胞粘着和血栓形成,因此,它在心血管疾病的发病中具有十分重要作用。

关于纤维蛋白原的信息介绍

  纤维蛋白原尚有与血小板膜糖蛋白GPⅡb-Ⅲa结合的位点,从而介导血小板的聚集反应,协同起到止血作用。  纤维蛋白原Aα、Bβ、γ3条多肽链分别由3个独立的基因FGA、FGB、FGG编码,集中于4q28~4q31约50 kb的区域内,3个基因由5′至3′的排列顺序为FGG、FGA、FGB。FGA基

纤维蛋白原增加临床意义

1、感染如毒血症、肺炎、轻型肝炎、胆囊炎、肺结核及长期的局部炎症等。2、无菌炎症如肾病综合征、风湿热、恶性肿瘤、医|学教育网搜集整理风湿性关节炎等。3、其他如外科手术、放射治疗、月经期及妊娠也可轻度增高。

纤维蛋白原(Fb)的决定水平

参考值 2.0~4.0g/L    决定水平 临床意义及措施    0.3g/L 血浆含量低于此水平,可能发生自发性出血,应及时采取相应措施  1.0g/L 低于此值为DIC的诊断指标之一的另两项诊断指标为血小板减少及凝血酶原时间延长,同时可注意V因子和VIII因子均可有减少。    5.0g/L

儿童癌症治疗新靶点:-原肌球蛋白

  儿童患癌并不是因为生活方式引起的,依靠目前的研究也并未在儿童生存率的提高上做出多大贡献。在澳大利亚,平均每周就有三个儿童死于癌症。近日,新南威尔士大学的研究人员发明了一项突破性的研究,这项研究可以拯救患有致命性特殊癌症的儿童,使他们受益于这种新研究的潜在抗癌疗法。   研究人员第一次

血浆纤维蛋白原浓度的简介

  血浆中的纤维蛋白原即凝血因子Ⅰ,是一种糖蛋白,在肝脏合成,相对分子量约330000,其分子为一个二聚体,呈长条状,含有三对多肽链,由二硫键连接,是凝血系统中的重要凝血因子。血浆纤维蛋白原浓度增高是血栓性疾病的重要危险因子,它对心脑血管病、糖尿病、肿瘤等疾病的诊断、治疗和预后有重要的意义。

纤维蛋白原偏高容易引起什么

“纤维蛋白原”是血栓形成的原料,如果把血栓比喻做面包的话,“纤维蛋白原”就相当于面。据流行病学调查,纤维蛋白原是血栓栓塞相关疾病的危险因素。纤维蛋白原升高,除了与遗传和生活方式有关系以外,纤维蛋白原还是一种与炎症和应激有关的蛋白,风湿热等也可以导致纤维蛋白原升高,某些恶性肿瘤可以导致纤维蛋白原异常升

原核蛋白诱导表达过夜菌稀释的意义

原核蛋白诱导表达是指利用大肠杆菌等原核生物来表达目标蛋白质。通常情况下,表达过程中会添加一定量的异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)等诱导剂,来促进目标蛋白的高效表达。在诱导过程中,过夜菌稀释的意义在于控制大肠杆菌细胞的生长速率,从而更好地实现目标蛋白的表达。因为在初始阶段表达的蛋白比较少,如果

降钙素原与C反应蛋白临床之应用

  降钙素原(PCT)和C-反应蛋白(CRP)是近年来随着医学检验技术的发展逐渐在临床普遍应用的实验室检查。早期识别和诊断感染,及时给予针对性的治疗措施、合理的经验性抗感染治疗及评估和监控疗效,可避免因抗生素的滥用而产生多重耐药性,也可明显改善患者预后,因而,快捷有效地实验室监测指标对于感染性疾病的

蛋白质在原核生物中的表达

实验概要将克隆化基因插入合适载体后导入大肠杆菌用于表达大量蛋白质的方法一般称为原核表达。这种方法在蛋白纯化、定位及功能分析等方面都有应用。大肠杆菌用于表达重组蛋白有以下特点:易于生长和控制;用于细菌培养的材料不及哺乳动物细胞系统的材料昂贵;有各种各样的大肠杆菌菌株及与之匹配的具各种特性的质粒可供选择

蛋白质原转换酶的基本信息

中文名称蛋白质原转换酶英文名称proprotein convertase定  义催化蛋白质原转化为成熟的蛋白质的蛋白酶类。如蛋白质原转换酶1(编号:EC 3.4.21.93)、蛋白质原转换酶3(编号:EC 3.4.21.94)、蛋白质原转换酶(编号:EC 3.4.21.61)等,切割蛋白质原的位点多

纤维蛋白原(Fg,FIB)的作用

  纤维蛋白原主要由肝细胞合成的、具有凝血功能的蛋白质,是血浆中含量最高的凝血因子。纤维蛋白原分子量约为340 kDa,呈三联球形,由α、β、γ 三对不同多肽链组成,两端为D 区,中间为E 区,D 区与E 区通过3 条呈α 螺旋的肽链相连。纤维蛋白原是血栓形成的重要反应底物,参与血栓形成的关键步骤。

纤维蛋白原(Fg,FIB)的结构

  纤维蛋白原包括Aα、Bβ、γ多肽链,每条肽链分别由610、461及411个氨基酸残基构成。纤维蛋白原的分子量是340 kD,血浆浓度为2~4 g/L,半衰期近4天。纤维蛋白原的中心结构域称为“E结构域”,末端形成膨大球状结构域称为“D结构域”。  纤维蛋白原由三个独立基因编码。编码Aα、Bβ链、

关于血浆纤维蛋白原的介绍

  在人的血浆中含有0.2—0.3g/dl左右。是一种球蛋白.含有3%的碳水化合物,在对血浆进行Tiselius电泳、滤纸电泳、醋酸纤维素膜电泳中存在于4分段中。用25—50%饱和度的硫酸铵、半饱和的氯化钠和1.1—1.2M磷酸盐可沉淀。含于Cohn的第一分段中.人的血纤维蛋白等电点而为pH5.2—