上海有机所发明新一代高效糖苷化方法
形成糖苷键的糖苷化反应是化学合成寡糖和糖缀合物的关键反应。100多年来，大量的糖苷化反应被不断发展出来，实现了对几乎所有天然存在的糖苷键的化学合成。然而，在许多情况下糖苷化的效率还很低，难以进行大量合成。 近来，中科院上海有机化学研究所生命有机化学国家重点实验室俞飚课题组发展了新一代的糖苷化反应：以糖基邻炔基苯甲酸酯为给体的一价金催化的糖苷化反应。使用该反应他们完成了一系列活性寡糖和糖缀合物的高效合成，如四糖抗生素TMG－chitotrimycin（J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 12076-12077）。 相比于经典的糖苷化反应，新反应具有独特的反应机理（Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 8329-8332），因而具备独特的优势。其中的一个优势是对于核苷的合成。核苷在生命过程中起关键作用，大量人工合成的核苷类化合物则通过干涉这些作用而成为......阅读全文
核酸的组成介绍
核酸完全水解产生嘌呤和嘧啶等碱性物质、戊糖（核糖或脱氧核糖）和磷酸的混合物。核酸部分水解则产生核酸和核苷酸。每个核苷分子含一分子碱基和一分子戊糖，一分子核苷酸部分水解后除产生核苷外，还有一分子磷酸。DNA和RNA含有的核糖同，DNA含有脱氧核糖，而RNA含有核糖。此外，DNA和RNA中含有的碱基也有
DNA碱基家族迎新成员－甲基腺嘌呤碱基成新表观遗传标记
西班牙科学家在最新出版的《细胞》杂志上撰文指出，或许存在着第六种碱基——甲基腺嘌呤（mA），其主要作用是确定表观基因组的性质，并因此在细胞的生命过程中发挥重要作用。 脱氧核糖核酸（DNA）是遗传物质的主要组成成分，一般认为，它由A（腺嘌呤）、C（胞嘧啶）、G（鸟嘌呤）和T（胸腺嘧啶）四种碱基结
β葡萄糖苷酶的结构及催化机理
1 β-葡萄糖苷酶的结构按糖苷酶的氨基酸序列分，大多数β-葡萄糖苷酶属于糖苷酶族1，糖苷酶族1有明显的桶状结构。但是，也有一些β-葡萄糖苷酶属于糖苷酶族4，属于糖苷酶族4的β-葡萄糖苷酶往往要求在催化过程中有脱氢酶和辅助因子参与，有文献报道，6-磷酸-β-D-葡萄糖苷酶在催化过程中需要Mn2+和辅酶
核苷酸的化学结构
核苷酸是组成核酸的基本单位。组成DNA的核苷酸是脱氧核糖核苷酸(deoxyribonucleotide)。组成RNA的是核糖核苷酸(ribonudeotide)。核苷酸可以进一步水解为核苷(nucleoside)和磷酸，核苷又可以水解为戊糖(pentose)和碱基(base)(图8－1)核苷酸中的戊
其他类糖苷的相关介绍
（1）环烯醚萜甙类（Iridoid g1ycosides）和裂环烯醚萜甙类（Secoiridoid glycosides）是由环烯醚单萜（Iridoids）衍生物与糖所成的甙类。广泛分布于植物界，尤以茜草科、玄参科、龙胆科、鹿蹄草科等为多，如地黄、栀子、玄参、龙胆、鹿蹄草等。目前已发现的在80种
氨基糖苷类的临床应用
氨基糖苷类抗生素主要用于敏感需氧革兰阴性杆菌所致的全身感染。虽然近年来有多种cephalosporins和quinolones药物在临床广泛应用，但由于氨基糖苷类抗生素对铜绿假单胞菌、肺炎杆菌、大肠杆菌等常见革兰阴性杆菌的PAE较长，所以，仍然被用于治疗需氧革兰阴性杆菌所致的严重感染，如脑膜炎、
β葡萄糖苷酶的催化机理
对分别来自Agrobacterium和Pyrococcus furiosus的β-葡萄糖苷酶进行研究发现，两种来源的β-葡萄糖苷酶在催化反应时是按同一种反应机制进行的，即在催化水解糖苷键反应时都遵循双取代反应机制（Double Displacement Mechanism）。其反应方程式如下：在催化
科学家找到基因治疗新利器
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503037.shtm6月16日，华东师范大学生命科学学院教授李大力团队在《自然-生物技术》发表论文，报道了一系列新型腺嘌呤颠换编辑工具（AXBEs和ACBEs），并证明了ACBEs在不同细胞系与小鼠胚胎中
细胞化学词汇无嘌呤嘧啶位点
所有细胞中都带有不同细胞类型，能识别受损核酸位点的糖苷水解酶，它能特异性切除受损核苷酸上的N-β糖苷键，在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点，统称为AP位点。AP位点所有细胞中都带有不同细胞类型，能识别受损核酸位点的糖苷水解酶，它能特异性切除受损核苷酸上的N-β糖苷键，在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位
福尔根反应的方法介绍
专一显示DNA的一种染色法。标本经水解去掉RNA后，DNA的嘌呤—脱氧核糖糖苷键中的嘌呤被酸水解，暴露出了脱氧核糖的醛基，游离的醛基同Schiff‘s试剂反应，呈紫红色。
简述氨基糖苷类的临床应用
氨基糖苷类抗生素主要用于敏感需氧革兰阴性杆菌所致的全身感染。虽然近年来有多种cephalosporins和quinolones药物在临床广泛应用，但由于氨基糖苷类抗生素对铜绿假单胞菌、肺炎杆菌、大肠杆菌等常见革兰阴性杆菌的PAE较长，所以，仍然被用于治疗需氧革兰阴性杆菌所致的严重感染，如脑膜炎、
关于氨基糖苷类的基本介绍
氨基糖苷类抗生素（Aminoglycosides）是由氨基糖与氨基环醇通过氧桥连接而成的苷类抗生素。氨基糖苷类抗生素是抑制蛋白质合成、为静止期杀菌性抗生素。其以抗需氧革兰阴性杆菌、假单胞菌属、结核菌属和葡萄菌属为特点，由于氨基糖苷类抗生素在发挥抗菌作用时必须有氧参加，所以对厌氧菌无效。
糖苷酶的概念
糖苷酶即糖苷水解酶(Glycoside hydrolases,GH,EC3.2.1)，是一类水解糖苷键(glycosidic bonds)的酶，在生物体糖和糖缀合物的水解与合成过程中扮演着重要角色。糖苷酶在催化糖苷反应时，如果水分子的氧原子进攻受体葡萄糖上的异头碳，即发生水解反应，但如果是葡萄糖
基于糖苷键质谱可碎裂交联剂的蛋白质复合物原位解析
近日，中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员张丽华团队，研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂，显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度，同时具有良好的两亲性和生物兼容性，实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和规模化精准解析。作为生命活动的执行者，蛋白质通过相
核酸的分子大小与化学组成
分子大小核酸分子通常很大。实际上，DNA分子可能是已知的最大的单个生物分子。但也有比较小的核酸分子。核酸分子的大小范围从21个核苷酸（小干扰RNA）到大染色体（人类染色体是一个含有2.47亿个碱基对的单个分子 ）不等。化学组成核酸完全水解产生嘌呤和嘧啶等碱性物质、戊糖（核糖或脱氧核糖）和磷酸的混合物
关于核酸的分子大小及组成的介绍
1、分子大小 核酸分子通常很大。实际上，DNA分子可能是已知的最大的单个生物分子。 但也有比较小的核酸分子。 核酸分子的大小范围从21个核苷酸（小干扰RNA）到大染色体（人类染色体是一个含有2.47亿个碱基对的单个分子）不等。 2、化学组成 核酸完全水解产生嘌呤和嘧啶等碱性物质、戊糖（
核酸的分子大小及组成
分子大小核酸分子通常很大。实际上，DNA分子可能是已知的最大的单个生物分子。但也有比较小的核酸分子。核酸分子的大小范围从21个核苷酸（小干扰RNA）到大染色体（人类染色体是一个含有2.47亿个碱基对的单个分子）不等。化学组成核酸完全水解产生嘌呤和嘧啶等碱性物质、戊糖（核糖或脱氧核糖）和磷酸的混合物。
首位！上海有机所俞飚研究员荣获国际糖化学最高奖项
近日，国际碳水化合物组织（International Carbohydrate Organization）正式宣布2022年惠斯勒糖化学奖(Roy L. Whistler Award in Carbohydrate Chemistry)授予中国科学院上海有机化学研究所俞飚研究员。俞飚是迄今唯一获
β葡萄糖苷酶的研究
1837年，Liebig和Wohler首次在苦杏仁汁中发现了β-葡萄糖苷酶。β-葡萄糖苷酶(EC 3.2.1.21)的英文名是β-glucosidase，属于水解酶类，又称β-D-葡萄糖苷水解酶，别名龙胆二糖酶、纤维二糖酶和苦杏仁苷酶。它可催化水解结合于末端非还原性的β-D-糖苷键，同时释放出配基与
稀有碱基的基本信息
中文名稀有碱基外文名Rare base过 程甲基化、乙酰化、氢化主要碱基甲基衍生物多半是主要碱基的甲基衍生物。如：5-甲基胞苷、5，6-双氢脲苷等。另外有一种比较特殊的的核苷：假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同，即尿嘧啶5位碳与核苷形成的C-C糖苷键。tRNA中含有修饰碱基比较多，
碱基切除修复技术的内容介绍
一类DNA糖苷水解酶一般只对应于某一特定的类型的损伤，如尿嘧啶糖苷水解酶就特异性识别DNA中胞嘧啶自发脱氨形成的尿嘧啶，而不会水解RNA分子中尿嘧啶上的N-β-糖苷键。DNA分子中一旦产生了AP位点，AP核酸内切酶就会把受损核苷酸的糖苷-磷酸键切开，并移去包括AP位点核苷酸在内的小片段DNA，由DN
氨基糖苷类的作用机理与特点
氨基糖苷类抗生素对于细菌的作用主要是抑制细菌蛋白质的合成，作用点在细胞30S核糖体亚单位的16SrRNA解码区的A部位。研究表明：此类药物可影响细菌蛋白质合成的全过程，妨碍初始复合物的合成，诱导细菌合成错误蛋白以及阻抑已合成蛋白的释放，从而导致细菌死亡。氨基糖苷类抗生素在敏感菌体内的积蓄是通过一系列
氨基糖苷类的作用机理及特点
早期发现氨基糖苷类药物是经直接作用于细菌30S核糖体亚单位、使细菌发生读码错误而最终导致细菌死亡的。近年来更加深入的研究表明，此类药物是直接与30S核糖体亚单位的16S rRNA解码区的A部位结合的。虽然氨基糖苷类药物的结合点都是16S rRNA的保守区域，但它们对原核和真核核糖体的作用并不相同
氨基糖苷的不良反应
氨基糖苷类抗生素主要不良反应是肾毒性和耳毒性。 1．耳毒性 耳毒性包括前庭功能障碍和耳蜗听神经损伤。前庭功能障碍表现为头昏、视力减退、眼球震颤、眩晕、恶心、呕吐和共济失调，其发生率依次为neomycin> kanamycin> streptomycin> gentamicin、amikaci
稀有碱基是天然还是人工合成？
又称稀有碱基，这些碱基在核酸分子中含量比较少，但他们是天然存在不是人工合成的，是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。多半是主要碱基的甲基衍生物。如：5-甲基胞苷、5，6-双氢脲苷等。另外有一种比较特殊的的核苷：假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同，即尿嘧啶5位碳与核苷形成
修饰碱基的基本信息
又称稀有碱基，这些碱基在核酸分子中含量比较少，但他们是天然存在不是人工合成的，是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。多半是主要碱基的甲基衍生物。如：5-甲基胞苷、5，6-双氢脲苷等。另外有一种比较特殊的的核苷：假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同，即尿嘧啶5位碳与核苷形成
细胞化学基础修饰碱基
又称稀有碱基，这些碱基在核酸分子中含量比较少，但他们是天然存在不是人工合成的，是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。多半是主要碱基的甲基衍生物。如：5-甲基胞苷、5，6-双氢脲苷等。另外有一种比较特殊的的核苷：假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同，即尿嘧啶5位碳与核苷形成
什么是N糖苷酶和O糖苷酶？
N-糖苷酶和O-糖苷酶是两种不同类型的糖基转移酶，它们在生物体内负责催化糖基转移反应。 N-糖苷酶是一类能够水解N-糖苷键的酶，N-糖苷键是连接糖基与蛋白质或脂质分子之间的化学键。在生物体内，N-糖苷酶参与了许多重要的生物学过程，如蛋白质的折叠、修饰和降解等。此外，N-糖苷酶还与一些疾病的发生
上海有机所完成抗生素A201A的首次全合成
A201A是一个结构独特的核苷类抗生素，其中含环外烯醚的呋喃糖单元从未在其它天然产物中出现过。该抗生素由美国礼来公司于1976年从链霉菌Streptomyces capreolus NRRL 3817中分离得到，对革兰氏阳性菌和大多数厌氧性革兰氏阴性菌显示出强烈的抗菌活性。由于该化合物含有模拟
上海有机所完成抗生素A201A的首次全合成
A201A是一个结构独特的核苷类抗生素，其中含环外烯醚的呋喃糖单元从未在其它天然产物中出现过。该抗生素由美国礼来公司于1976年从链霉菌Streptomyces capreolus NRRL 3817中分离得到，对革兰氏阳性菌和大多数厌氧性革兰氏阴性菌显示出强烈的抗菌活性。由于该化合物含有模拟t