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世界首个梅花全基因组重测序研究完成

日前,北京林业大学张启翔教授领衔的国家花卉工程技术研究中心,与青岛华大基因研究院、深圳华大生命科学研究院以及宾夕法尼亚州立大学等单位通力合作完成了首个梅花全基因组重测序研究,构建完成了世界首张梅花全基因组变异图谱,“梅花花部性状的遗传结构”(The genetic architecture of floral traits in the woody plant Prunus mume)研究论文在《自然通讯》(Nature Communications)在线发表。 梅花全基因组重测序的完成将为其分子标记辅助育种的研究提供重要的理论框架,也将在应用上为其花色、花型、株型等重要观赏性状基因的遗传选育及品种改良提供重要平台,对梅花重要观赏性状的遗传解析具有里程碑的作用。 鉴于梅花栽培品种经过长期的人工驯化和自然授粉,其遗传背景极为复杂,为了揭示梅花和李属的演化历史,开展梅花分子标记辅助育种工作,揭示梅花重要观赏性状的遗传机理,该......阅读全文

重测序构建芝麻超高密度图谱以及花序基因的定位

连锁分析寻找QTL位点,是最经典的性状定位方法。而遗传图谱的密度是限制定位精度的其中一个方面。目前,构建图谱的方法已从基于传统的SSR、AFLP等基于片段长度多态性的分子标记,过渡到了基于SNP芯片或NGS测序的SNP分子标记。NGS测序最常用的是简化基因组测序和全基因组重测序,区别在于标记数量的多

GEN预测:2020年下一代测序市场将达49亿美元

  测序技术的发展已经经历了很长的时间,而下一代测序(NGS)彻底改变了人类基因组测序的方式。据专家预测,未来的几年内,人类基因组测序的费用将在1000美元,1-2天即可出结果。自实现第一个人类基因组测序以来(花了十年时间,30亿美元),测序所需的费用和时间大幅度降低。NGS的发展为临床诊断打开了新

GEN预测:2020年下一代测序市场将达49亿美元

资料来源: IQ4I Research & Consultancy  测序技术的发展已经经历了很长的时间,而下一代测序(NGS)彻底改变了人类基因组测序的方式。据专家预测,未来的几年内,人类基因组测序的费用将在1000美元,1-2天即可出结果。自实现第一个人类基因组测序以来(花了十年时间,3

DNA测序40周年:DNA测序的过去、现在和未来(上篇)

  在DNA测序过去的40年中,我们见证了诸多技术的变革和测序规模的极度增长。从几千个碱基到第一个人体基因组,乃至当前数以万计的人体和无数其它的基因组。包括作为大量分子现象的“计数器”在内,DNA测序被广泛和创造性地应用于各个领域。从长远来看,我们可以预测DNA测序技术所带来的影响将会与显微镜的使用

省部共建国家重点实验室取得基因组学重要成果

  1月26日,省部共建猪遗传改良与养殖技术国家重点实验室撰写的“全基因组重测序揭示猪环境适应性的分子机理及可能的属间杂交现象”论文,在国际上首次采用新一代测序技术,对猪开展了深度(25X)基因组重测序分析,全文在线发表于国际顶级学术期刊《自然-遗传》,这是我国猪遗传育种领域第2篇发表于该刊物的论文

我国完成桑蚕大规模基因组重测序和遗传变异图谱构建

  北京时间8月28日凌晨2时,由深圳华大基因研究院与西南大学合作的研究成果“40个基因组的重测序揭示了蚕的驯化事件及驯化相关基因”在国际权威学术刊物《科学》上发表,这是科学家继2003年在家蚕基因组研究领域取得进展后的又一重要成果。   据悉,科学家共获得了40个家蚕突变品系和中国野桑蚕的全基因

多篇研究共同解读近期单细胞测序重磅级研究成果

  本文中,小编整理了近年来单细胞测序领域的重磅级研究成果,与大家一起学习!  【1】Cell:开发出空间单细胞测序技术,有助揭示早期乳腺癌产生浸润性之谜  doi:10.1016/j.cell.2017.12.007  在一项新的研究中,来自美国德州大学MD安德森癌症中心的研究人员报道一种新的遗传

新一代超高通量基因组测序系统 GS FLX开创科研无限新...

新一代超高通量基因组测序系统 GS FLX开创科研无限新可能GS FLX系统是由罗氏454生命科学公司推出的目前应用最广的超高通量基因组测序系统,研究人员利用高准确性、长读长的GS FLX系统快速的获得高质量的生物数据,取得科研突破性进展。自GS系统问世以来,于世界顶级杂志共发表250余篇高质量

专访华大基因蒋慧:测序仪“规模化量产”是顺应市场需求

  两年前,华大基因发布了其自主研发的新型桌面化测序系统BGISEQ-500,这款仪器的问世备受瞩目。本月初,开放期刊GigaScience公布了BGISEQ-500测序平台完成的首个人类基因组重测序数据,由华大基因、中国食品药品检定研究院(NIFDC)和国家食品药品监督管理局湖北医疗器械质量监督检

新一代高通量测序技术SOLiD简介

   目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligation

高通量测序技术的应用

  测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行重头测序(de novosequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测

年终盘点:2016年国内不容错过的重磅生物研究

  时间总是过得很快,2016年马上就要过去了,迎接我们的将是崭新的2017年,2016年,我国有很多优秀科研机构的科学家们都做出了意义重大、影响深远的研究成果,发表在国际顶级期刊上。本文中小编盘点了2016年我国科学家发表的一些重磅级研究,以饕读者。   --结构生物学 --  1.清华大学 施一

高通量测序技术SOLiD简介

目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligat

新一代高通量测序技术SOLiD简介

   目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligation

万元全基因组测序在望 全新分析平台登场

今年早期,ABI公司应用SOLiD 3系统领先的寡核苷酸连接和检测技术对人类基因组进行了测序,费用低于6万美元。这台新仪器的技术改进使更高的样品和数据通量成为可能,从而有望进一步降低基因组测序的费用。例如,更廉价的基因组数据有望加速疾病关联和生物标志物的发现,从而改善诊断和疾病处理,支持与个人最佳治

北大汤富酬、乔杰团队Cell Res表观遗传学新成果

  生物通报道:2016年11月8日,国际著名期刊《Cell Research》在线发表了北京大学汤富酬、乔杰团队题为“DNA methylation and chromatin accessibility profiling of mouse and human fetal germ cells”

研究团队部通过基因组重测序结果揭示枣树起源

  近日,《植物生物技术》在线发表了洛阳师范学院教授赵旭升课题组的研究成果。他们通过对分布广泛的493份枣种质(包括202份野生种和291份栽培种)进行基因组重测序,结合群体基因组进化分析、全基因组关联分析系统揭示了枣树的起源、驯化历史,解析了枣树重要园艺性状变异的遗传基础,为后续其他重要性状的研究

重测序结果揭示枣树起源于山西—陕西地区

 全基因组选择消除分析及调控含仁率的候选基因筛选   洛阳师范学院供图 近日,《植物生物技术》在线发表了洛阳师范学院教授赵旭升课题组的研究成果。他们通过对分布广泛的493份枣种质(包括202份野生种和291份栽培种)进行基因组重测序,结合群体基因组进化分析、全基因组关联分析系

2019年中国学者发表CNS统计,谁是CNS发表之王?

  【51/52】2019年4月4日,清华大学柴继杰课题组、中科院遗传发育所周俭民课题组和清华大学王宏伟课题联合同期背靠背发表两篇重量级Science文章,完成了植物NLR蛋白复合物的组装、结构和功能分析,揭示了NLR作用的关键分子机制,是植物免疫研究的里程碑事件。两篇文章分别是: "Li

大跃进 | 中国学者CNS发表超过100篇生命科学领域研究成果

  【50】2019年4月12日,中科院上海药物所徐华强,王明伟,浙江大学张岩及匹兹堡大学医学院Jean-Pierre Vilardaga共同通讯在Science发表题为“Structure and dynamics of the active human parathyroid hormone r

RainDance的定向DNA测序方案

  当今,生物医学研究面临的一个主要挑战是确定复杂疾病的特定表型下隐藏的遗传变异。就临床可行性和成本而言,与低覆盖度的全基因组测序、甚至全外显子组测序相比,定向测序是目前最有希望且最可行的方式,有望可靠发现人类基因组中的常见和稀有变异。   定向DNA测序提供了目标区域的更深度覆盖,实现

2012最受欢迎的测序文章,点滴决定成败

  作为测序生力军的第三代测序技术能够大大增加测序的效率和通量,不过很显然第二代测序技术仍会继续被广泛采用。近日BioTechniques杂志评出了今年最受欢迎的两篇测序文章以飨读者,而这两篇文章正是目前技术过渡时期的写照。   近年来,基因组学、转录组学和宏基因组学等领域迎来了爆炸式的增长,这都

基因测序市场发展现状分析 下一个万亿市场在哪里?

  一项新技术或产品的问世,给人们带来欣喜的同时,也必然会引起担忧,基因测序技术便是其中之一。基因测序技术被看作自疫苗问世以来疾病预防最重要的科技突破,它不仅可以大大降低遗传相关的疾病发生率,减少出生缺陷,还可以实现对疾病预测、预防、预警以及个体化诊疗;但目前,国内的基因测序市场却并不让人满意,甚至

第七届国际基因组学大会在香港成功召开

  2012年11月29日至12月1日,为期三天的第七届国际基因组学大会暨2012年亚太区生物信息学峰会在香港九龙成功召开。本次会议由华大基因主办,《GigaScience》杂志协办。来自全球300多名专家学者云集香港,共同探讨了基因组学、生物信息学、云计算、生物伦理等研究领域内的最新进展,并深入探

第七届国际基因组学大会在香港成功召开

  2012年11月29日至12月1日,为期三天的第七届国际基因组学大会暨2012年亚太区生物信息学峰会在香港九龙成功召开。本次会议由华大基因主办,《GigaScience》杂志协办。来自全球300多名专家学者云集香港,共同探讨了基因组学、生物信息学、云计算、生物伦理等研究领域内的最新进展,并深入探

科学家一项基因组研究揭示梅花香奥秘

  梅花因其独特的花香,在很多诗词中成为人们吟诵的对象。那么,它的花香到底来自何处呢?我国科学家从基因组水平,揭示了合成梅花花香中重要成分乙酸苯甲酯的BEAT基因家族34个成员,并构建完成了首张梅花全基因组精细图谱。其研究论文在2012年12 月27日《自然通讯》亮点论文在线发表。   我国梅

华大基因引入亚洲首台Sequel测序仪更全面的基因组研究服务

2015年12月24日,中国深圳--全球最大的基因组研发机构华大基因今天宣布与实时单分子测序技术(SMRT)领导者加利福尼亚太平洋生物科学公司(Pacific Biosciences of California, Inc.,以下简称PacBio)再次合作,购入亚洲第一台Seque

中国学者首次详细发表冠状病毒等的检测方法

  由病毒或细菌引起的呼吸道病毒感染是全球人类最常见的疾病之一,而由新兴病毒引起的疾病则是造成新型感染的疾病,例如最近导致中国武汉爆发肺炎的新型冠状病毒2019-nCoV,对全球公共卫生的产生巨大威胁。识别呼吸道病毒感染的致病性病原对于选择适当的治疗方法,挽救人们的生命,停止流行病以及避免不必要地使

中美科学家揭开甘蓝型油菜“家族血统”之谜

  甘蓝型油菜是油菜的常见类型,也是人类食用植物油的重要来源。中美科研人员历时4年研究,通过全基因组重测序揭开甘蓝型油菜“家族血统”之谜,有助于通过基因选育提升甘蓝型油菜的产量和品质。相关研究成果已于近日由国际学术期刊《自然·通讯》在线发表。  甘蓝型油菜由白菜与甘蓝通过自然杂交进化而来,因产量高、

中美科学家揭开甘蓝型油菜“家族血统”之谜

  甘蓝型油菜是油菜的常见类型,也是人类食用植物油的重要来源。中美科研人员历时4年研究,通过全基因组重测序揭开甘蓝型油菜“家族血统”之谜,有助于通过基因选育提升甘蓝型油菜的产量和品质。相关研究成果已于近日由国际学术期刊《自然·通讯》在线发表。  甘蓝型油菜由白菜与甘蓝通过自然杂交进化而来,因产量高、