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微生物组是微生物在自然界的存在形式，与人体、空气、土壤与海洋的健康息息相关。因此，微生物组科学与产业已经成为国际科技合作与竞争的“战略高地”。然而，大数据挖掘工具的匮乏，阻碍着微生物组研究从“数据分析”向“数据科学”的跨越。2010年，来自43个国家的500多名研究人员联合启动了“地球微生物组计划”（Earth Microbiome Project； EMP），对全球微生物组的多样性进行系统性调查，已经发表了第一阶段的成果（Thompson, et al., Nature, 2017）。而各国政府历年来陆续启动的“人体微生物组计划”（Human Microbiome Project； HMP）与“美国国家微生物组计划”（National Microbiome Initiative； NMI）等，也同样产出了海量的菌群数据。这些以元基因组为代表的微生物组数据类型多样、来源迥异、体量庞大，而且其数量正在以指数型增长。但是，大数据......阅读全文
基于菌群大数据搜索引擎实现疾病检测的原理 微生物组具有服务疾病诊治与生态监控的巨大潜力，但是其影响因素错综复杂。如何通过菌群检测实现快速精准的疾病诊断呢？中科院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心发明了基于菌群大数据搜索的疾病检测方法，为此共性问题提供了原创解决方案。该研究成果近日在线发表于《美国微
近年来，科学家们在肠道菌群研究领域进行了大量的研究，同时他们发现肠道菌群与机体多方面的健康都有着密切的关联，那么近期肠道菌群领域又有哪些重要的研究成果呢？本文中，小编就对此进行了整理，分享给大家！ 【1】Nat Med：肠道微生物能够预防食物过敏 doi：10.1038/s41591-018
微生物组具有服务疾病诊治与生态监控的巨大潜力，但是其影响因素错综复杂。如何通过菌群检测实现快速精准的疾病诊断呢？中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心发明了基于菌群大数据搜索的疾病检测方法，为此共性问题提供了原创的解决方案。该工作于3月17日在线发表于mSystems（美国微生物学会会刊）
微生物几乎是无所不在的，它们对生态环境和人体健康起到了不容忽视的作用。然而人们对微生物的了解还相当匮乏，因为许多微生物是无法在实验室中培养的。宏基因组学是了解这些微生物的重要途径，但宏基因组测序并不是一件容易的事儿，就像是把许多拼图拆散混在一起，然后在毫无参考的情况下拼接。 最近Nature
微生物组具有服务疾病诊治与生态监控的巨大潜力，但是其影响因素错综复杂。如何通过菌群检测实现快速精准的疾病诊断呢？中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心发明了基于菌群大数据搜索的疾病检测方法，为此共性问题提供了原创的解决方案。该工作于3月17日在线发表于mSystems（美国微生物学会会刊）
2019年2月5日上午，深圳华大团队在国际知名学术期刊自然旗下子刊自然生物技术上发表了关于人体肠道细菌基因组集（Culturable GenomeReference, CGR）研究成果。该研究提供了1500多条高质量的人体肠道细菌基因组，为肠道微生物组研究提供了大量全新的参考基因组数据，同时
肠道是人体最大的消化和排毒器官，其回旋盘转的结构被形象地称为人体第二大脑。肠道中寄生着数以计亿的细菌，它们是人体内最重要的一种外环境，各种微生物按一定比例组合，相互制约，相互依存，在质和量上形成一种生态平衡。然而肠道菌群并不都是人类的朋友，按特性来讲，它们可分为3大类，即好菌、坏菌和中性菌。当人
2018年3月30日，《Science》杂志（科学）的新闻版块以 “New effort to sequence microbes”为题报道了由我国科学家牵头的一项正在进行的模式微生物基因组测序、数据挖掘及功能解析全球合作计划“Global Catalogue of Microorganisms (
对于大部分实验室来说，实验动物（尤其是啮齿类）都饲养于清洁无菌的环境中。但是一些免疫学家认为，在寻求标准化、无污染的小鼠的过程中，科学家们使这些实验小鼠变得不再是人类免疫系统的可靠模型——适量带点细菌能让小鼠模型更好地用于人类疾病研究。 在 2 月一个异常温暖的早晨， Mark Pierson
上海交通大学附属第六人民医院转化医学中心贾伟教授团队目前在肠道菌群代谢物检测方面工作取得了新进展，开发了一种基于气相色谱-飞行时间质谱联用技术（GC-TOF/MS）的高通量绝对定量检测150种重要肠道菌群代谢物的微生物代谢组学分析方法，能够在15分钟内实现对血清、尿液、粪便或者细菌（如大肠杆菌）
一、前沿生物技术主题 1.蛋白质测序新技术新装备及配套试剂国产化 (1)阵列毛细管柱蛋白质分离-阵列点样装置 研制二维阵列毛细管分离新装置，第一维分离柱可分离48个馏分,第二维维阵列毛细管分离柱可同时分离48个流份；开发阵列紫外检测器； 研制多柱点样头并行点样器和流份收集器；开发
上海交通大学附属第六人民医院转化医学中心贾伟教授团队目前在肠道菌群代谢物检测方面工作取得了新进展，开发了一种基于气相色谱-飞行时间质谱联用技术（GC-TOF/MS）的高通量绝对定量检测150种重要肠道菌群代谢物的微生物代谢组学分析方法，能够在15分钟内实现对血清、尿液、粪便或者细菌（如大肠杆菌）
上海交通大学附属第六人民医院转化医学中心贾伟教授团队目前在肠道菌群代谢物检测方面工作取得了新进展，开发了一种基于气相色谱-飞行时间质谱联用技术（GC-TOF/MS）的高通量绝对定量检测150种重要肠道菌群代谢物的微生物代谢组学分析方法，能够在15分钟内实现对血清、尿液、粪便或者细菌（如大肠杆菌）等样
尽管全球老年人口的迅速增加，影响衰老的生物学因素仍然是难以捉摸的。到目前为止，研究人员一直把重点放在确定有助于健康老龄化的遗传因素，在很大程度上忽视了我们肠道微生物群的作用。最近，来自四川农业大学和美国阿肯色州大学的研究人员，在《Current Biology》上发表的一项新研究，揭示了微生物组
纽约大学Langone医学中心的研究人员在六月三十日的Nature Communications杂志上发表文章指出，常用抗生素会对儿童发育产生深远的影响。 研究显示，两类广泛使用的抗生素会让雌性小鼠体重增加、骨骼增大。此外，这两种抗生素破坏了机体的肠道微生物组（无数肠道菌组成的群体）。 研
纽约大学Langone医学中心的研究人员在六月三十日的Nature Communications杂志上发表文章指出，常用抗生素会对儿童发育产生深远的影响。 研究显示，两类广泛使用的抗生素会让雌性小鼠体重增加、骨骼增大。此外，这两种抗生素破坏了机体的肠道微生物组（无数肠道菌组成的群体）。
在人体肠道中生活着数以万亿的共生菌群，它们的种类繁多，可达上千种，数量也很惊人，是人体细胞总量的10倍以上，迄今为止，仍有80%以上的微生物不为人知。这些肠道微生物和人体存在着互利共生的关系，对于维持人类的健康发挥着重要的作用。它们在肠道中保持着一种动态的平衡，能够合成维生素、帮助人体从食物中吸收
如今人们会花费数百美元来分析其机体的肠道微生物，他们希望这种分析能帮助调整日常的饮食并改善机体的健康状况；但正如我们在最近所发表的论文中解释的那样，目前这种检测服务是建立在科学的基础上，而科学研究还处于起步阶段。因此，虽然分析机体肠道微生物组能帮助人们诊断并治疗疾病，但就目前而言，我们想知道肠道
少吃多运动是许多人深信不疑的减肥妙法，可是科学家发现，仅仅靠”管住嘴，迈开腿“还不能让人变得苗条起来。肥胖的背后其实有着更为复杂和深奥的生物学机理，我们吃下去的每日三餐，不仅提供了人体每日所需的能量，还养活了人体内大大小小的肠道微生物，从某种程度上讲，这些微生物决定了我们机体的健康程度。如果肠道
作为当下最热门的研究领域，肠道微生物被报道发现和多种人类疾病有关，如肥胖，糖尿病，癌症等。近年来有研究证明，肠道微生物在免疫反应中也扮演着重要角色。但是大多相关研究都使用动物模型，针对人类群体的研究结果相对较少。 近日，斯坦福大学的研究团队通过对健康成年人注射广谱抗生素，以改变其体内肠道微生物
近几年，肠道微生物可以说是最热的研究热点，频繁登上在CNS期刊的封面，不仅相关主题的学术论文表现强势，而且国自然资助的肠道微生物项目数也呈显著增长的趋势，其中2018年一共资助了近180项研究，资助金额高达7600万。由此可见肠道微生物一直是科研领域的研究热点，相信2019年肠道微生物仍是国自然
微生物组的研究正在如火如荼地进行中。微生物组与各种各样的疾病状态相关联，甚至被分为各种类型（enterotype）。然而，哈佛医学院的一名博士后Tami Lieberman最近在博客中质疑了微生物组分型的想法。她怀疑偶然一次的微生物组分析究竟能获得什么。 Lieberman在攻读博士阶段研究的
我们体内生活着不计其数的微生物，它们组成的生态系统就是微生物组。近年来人们发现这些微生物对人体健康有着重要的影响，微生物组研究因此受到了极大的重视，甚至被称为是人体的“第二基因组”。 微生物组参与了许多重要的机体功能，比如消化食物、合成营养物质和抵御疾病。许多人类疾病都与微生物组失衡有关。科学
今日，生物技术创投圈迎来了一条重量级的新闻：Evelo Biosciences宣布完成了B轮融资，募得的资金高达5000万美元。值得一提的是，为这家生物技术新锐注入资金的，全是大名鼎鼎的机构，它们包括谷歌风投（GV）、Celgene、梅奥诊所（Mayo Clinic）、以及Alexandria
第七届世界微生物数据中心学术研讨会于10月12至13日在京举行。会上，由世界微生物数据中心（WDCM）和中科院微生物所牵头，联合全球12个国家的微生物资源保藏中心共同发起的全球微生物模式菌株基因组和微生物组测序合作计划正式启动。该计划将建立覆盖20多个国家30个主要微生物资
近日，《核酸研究》（Nucleic AcidsResearch）在线发表了国家微生物科学数据中心（中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心）关于全球模式微生物基因组数据库gcType的论文。gcType是由我国牵头的全球模式微生物基因组测序计划的重要成果。 模式菌株（t
本文中，小编整理了近期科学家们在肠道微生物研究领域取得的新成果，分享给大家！ 【1】Nat Microbiol：肠道微生物调控诺如病毒感染过程 doi：10.1038/s41564-019-0602-7 高度传染性的诺如病毒会引起腹泻和呕吐，并且因迅速在人口密集的空间中传播而臭名昭著。每年
近几年，肠道微生物可以说是最热的研究热点，频繁登上在CNS期刊的封面，不仅相关主题的学术论文表现强势，而且国自然资助的肠道微生物项目数也呈显著增长的趋势，其中2018年一共资助了近180项研究，资助金额高达7600万。由此可见肠道微生物一直是科研领域的研究热点，相信2019年肠道微生物仍是国自然申请
受孕后不久，人类胚胎便开始组装一个对其生存至关重要的器官——胎盘。胎盘是胎儿与母体之间物质交换的重要器官，它将母体血液中的氧气、营养素和免疫分子运送到正在发育的胎儿身上，同时胎盘也是防止感染的屏障。一个多世纪以来，医生们认为这种短暂的结构——就像胎儿和子宫本身一样——是无菌的，除非出现了什么问题
2008年，美国国家卫生研究院（NIH）资助了人类微生物组计划（Human Microbiome Project, HMP）---一个雄心勃勃的项目，类似于人类基因组计划，旨在描述生活在我们每个人身上的极其复杂的微生物。六年后，该计划扩展为综合性人类微生物组计划（integrative Huma