Nature:从结构上揭示DNA解链机制

DNA是一本含有构建生命指令的分子手册。与任何手册一样,如果DNA保持未打开且未读取的状态,那么它完全是没有用的。为了让DNA进行转录,RNA聚合酶(RNA polymerase, RNAP)必须撬开DNA的两条链,这一过程称为“解链”或“解旋”。 在一项新的研究中,来自美国洛克菲勒大学的研究人员阐明了RNAP的关键特征,揭示了DNA这本填充基因的分子手册是如何被读取的。相关研究结果于2019年1月9日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Structures of an RNA polymerase promoter melting intermediate elucidate DNA unwinding”。图片来自CC0 Public Domain。 在这项新的研究中,洛克菲勒大学的Elizabeth A. Campbell、Seth A. Darst、Hande Boyaci和他们的同事们利用低温电镜技术分析了......阅读全文

DNA滚环复制的过程介绍

  环状DNA可以采取上述典型的DNA复制方式进行复制,即从复制起点开始,双向同时进行,形成θ样中间物,故又称"θ"型复制,最后两个复制方向相遇而终止复制。但有些环状DNA采用另个一种方式,即滚环复制。例如许多病毒DNA的复制、F因子在接合(conjugation)转移时其DNA的复制,以及许多基因

DNA滚环式复制过程

环状DNA可以采取上述典型的DNA复制方式进行复制,即从复制起点开始,双向同时进行,形成θ样中间物,故又称"θ"型复制,最后两个复制方向相遇而终止复制。但有些环状DNA采用另个一种方式,即滚环复制。例如许多病毒DNA的复制、F因子在接合(conjugation)转移时其DNA的复制,以及许多基因扩增

关于DNA滚环复制的基本介绍

  滚环式复制(rolling circle replication)是噬菌体中常见的DNA复制方式。许多病毒DNA的复制、质粒、F因子在接合(conjugation)转移时其DNA的复制,以及许多基因扩增时都采用这种方式。  在以这种机制进行的复制中,亲代双链DNA的一条链在DNA复制起点处被切开

DNA环的结构和应用

中文名称DNA环英文名称DNA loop定  义蛋白质因子和蛋白质或DNA间的相互作用而形成的DNA分子弯曲成环的结构。这种结构被广泛地用于解释蛋白质-蛋白质、DNA-蛋白质的相互作用。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

解链温度的定义和因素

DNA的解链温度(Tm)是引物的一个重要参数,它是当50%双链DNA分子双链结构被打开时的温度,一种DNA分子的Tm值大小与其所含碱基中的G+C比例相关,G+C比例越高,Tm值越高。Tm=4(G+C)+2(A+T)Tm值为PCR反应退火温度的重要参考依据。通常将加热变性使DNA的双螺旋结构失去一半时

复制叉的结构

复制叉(replication fork),有时也称作生长点(growing point),是DNA复制时在DNA链上通过解旋、解链和SSB蛋白的结合等过程形成的Y字型结构。

单分子荧光分析技术揭示解旋酶作用机制

单分子荧光分析技术揭示解旋酶作用机制:类似解旋酶的蛋白与核酸相互位置的转变具有重要的细胞生物学意义,但是至今科学家们还并不清楚这个过程如何解开DNA结合蛋白,而且这一过程的基本特征迄今为止仍然倍受争议。 DNA修复指双链DNA上的损伤得到修复的现象,这个过程可能使DNA结构恢复原样,重新能执行它原来

单分子荧光分析技术揭示解旋酶作用机制

  类似解旋酶的蛋白与核酸相互位置的转变具有重要的细胞生物学意义,但是至今科学家们还并不清楚这个过程如何解开DNA结合蛋白,而且这一过程的基本特征迄今为止仍然倍受争议。 DNA修复指双链DNA上的损伤得到修复的现象,这个过程可能使DNA结构恢复原样,重新能执行它原来的功能,DNA修复是探索生命的一个

单分子荧光分析技术揭示解旋酶作用机制

  类似解旋酶的蛋白与核酸相互位置的转变具有重要的细胞生物学意义,但是至今科学家们还并不清楚这个过程如何解开DNA结合蛋白,而且这一过程的基本特征迄今为止仍然倍受争议。 DNA修复指双链DNA上的损伤得到修复的现象,这个过程可能使DNA结构恢复原样,重新能执行它原来的功能,DNA修复是探索生命的一个

单分子荧光分析技术揭示解旋酶作用机制

类似解旋酶的蛋白与核酸相互位置的转变具有重要的细胞生物学意义,但是至今科学家们还并不清楚这个过程如何解开DNA结合蛋白,而且这一过程的基本特征迄今为止仍然倍受争议。 DNA修复指双链DNA上的损伤得到修复的现象,这个过程可能使DNA结构恢复原样,重新能执行它原来的功能,DNA修复是探索生命的一个重要

Science:人黏连蛋白通过DNA环挤压折叠基因组机制被揭示

  为了将大约两米长的人DNA携带的遗传信息包装到细胞核中,人细胞所要完成的工作相当于将80公里长的线放入一个足球大小的球体中。早在1882年,德国生物学家Walther Flemming便通过显微镜进行了观察,发现了有关这种包装是如何实现的线索。他当时观察到位于卵细胞细胞核内的DNA环,这让他想起

变性梯度凝胶电泳实验(一)

实验原理DNA 双链分子在全长不断增加温度或用化学变性剂条件处理下,两条链就会开始分开(即解链)。首先解链的区域由解链温度较低的碱基组成。GC碱基对比AT碱基对结合得要牢固,因此GC含量高的区域具有较高的解链温度。同时影响解链温度的因素还有相邻碱基间的吸引力。解链温度低的区域,通常位于端部称作低

DNA滚环复制的特点介绍

  1、以亲本链(+链)为模板合成互补的环状负链,形成闭合环状的复制形RF1;  2、以成环滚环复制产生多个子代RF;  3、以RF的负链为模板进行滚环复制产生多拷贝正链单环。

DNA滚环复制的特点介绍

1、以亲本链(+链)为模板合成互补的环状负链,形成闭合环状的复制形RF1;2、以成环滚环复制产生多个子代RF;3、以RF的负链为模板进行滚环复制产生多拷贝正链单环。

简述DNA滚环复制的特点

  1、以亲本链(+链)为模板合成互补的环状负链,形成闭合环状的复制形RF1;  2、以成环滚环复制产生多个子代RF;  3、以RF的负链为模板进行滚环复制产生多拷贝正链单环。

揭示了组蛋白促进停滞DNA复制叉重启的重要功能

  DNA复制是一个十分精细的分子调控过程, 在DNA复制过程中体内体外大量的刺激因素如UV、染色质高级结构的阻拦等会产生DNA复制压力(replication stress),从而使得复制叉停滞(fork stall)甚至垮塌(fork collapse)造成DNA损伤(DNA damage),进

关于前导链的基本信息介绍

  DNA的双螺旋结构中的两条链是反向平行的,当复制开始解链时,亲代DNA分子中一条母链的方向 为5'—3',另一条母链的方向为3' —5'。由 于DNA聚合酶只能催化5' —3'方向合成。 在以3' —5'方向的母链为模板时,DNA1

前导链的概念和结构

DNA的双螺旋结构中的两条链是反向平行的,当复制开始解链时,亲代DNA分子中一条母链的方向 为5'—3',另一条母链的方向为3' —5'。由 于DNA聚合酶只能催化5' —3'方向合成。 在以3' —5'方向的母链为模板时,DNA1U

分子遗传学词汇前导链

中文名称:前导链外文名称:leading strand定义:DNA的双螺旋结构中的两条链是反向平行的,当复制开始解链时,亲代DNA分子中一条母链的方向 为5'—3',另一条母链的方向为3' —5'。由 于DNA聚合酶只能催化5' —3'方向合成。 在以

细胞化学词汇前导链

中文名称:前导链外文名称:leading strand定义:DNA的双螺旋结构中的两条链是反向平行的,当复制开始解链时,亲代DNA分子中一条母链的方向 为5'—3',另一条母链的方向为3' —5'。由 于DNA聚合酶只能催化5' —3'方向合成。 在以

DNA重组的作用机制

遗传重组由许多不同的酶催化。重组酶是DNA重组过程中催化链转移步骤的关键酶。 RecA是在大肠杆菌中发现的主要重组酶,负责修复DNA双链断裂(DSBs)。在酵母和其它真核生物中,修复DSB需要两种重组酶。 RAD51蛋白是有丝分裂和减数分裂重组所必需的,而DNA修复蛋白DMC1对减数分裂重组具有特异

科学家发现DNA复制叉移动速度是细胞命运变化的基础

  细胞的全能性在早期胚胎发育中出现,但其分子基础的特征仍不明显。德国慕尼黑大学的研究团队发现,DNA复制叉移动速度是细胞命运变化的基础,并促进细胞重编程。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》上,题为:DNA replication fork speed underlies ce

细胞化学词汇DNA滚环式复制

滚环式复制(rolling circle replication)是噬菌体中常见的DNA复制方式。许多病毒DNA的复制、质粒、F因子在接合(conjugation)转移时其DNA的复制,以及许多基因扩增时都采用这种方式。

DNA滚环式复制的特点介绍

1、以亲本链(+链)为模板合成互补的环状负链,形成闭合环状的复制形RF1;2、以成环滚环复制产生多个子代RF;3、以RF的负链为模板进行滚环复制产生多拷贝正链单环。

水分解链式反应-量子动力学研究揭示光解水产氢新机制

  光激发分解水产生氢气是人类梦寐以求,能够持续获取清洁能源,最终解决能源问题的途径之一。然而,自上世纪七十年代第一次在实验上展示以来,虽然有大量的实验和理论研究,人们对原子层次上的光解水过程及其机理并不清楚。这也阻碍着光解水新材料的发现和光解水效率的进一步提高。图1:模型示意图(a),含时演化的激

《细胞》《科学》两篇文章发表酶学研究新突破

酶是生物体活细胞产生的具有特殊催化活性和特定空间构象的生物大分子,包括蛋白质及核酸,又称为生物催化剂。这种重要的生物分子一直以来都是科学家们研究的重点之一,近期在《Science》和《Cell》杂志上分别报道了两项重要的成果。 原文检索:Science 27 July 2007:Vol. 317

解旋酶的基本信息和作用

解旋酶是一类解开氢键的酶,而不是一种酶,由水解ATP供给能量来解开DNA的酶。它们常常依赖于单链的存在,并能识别复制叉的单链结构。一般在DNA或RNA复制过程中起到催化双链DNA或RNA解旋的作用。与解链有关的酶和蛋白质包括:1.单链结合蛋白2.解旋酶 3.拓扑异构酶Ⅰ 4.拓扑异构酶Ⅱ。在细菌中类

关于解旋酶的基本信息介绍

  解旋酶是一类解开氢键的酶,是由水解ATP供给能量来解开DNA的酶。它们常常依赖于单链的存在,并能识别复制叉的单链结构。一般在DNA或RNA复制过程中起到催化双链DNA或RNA解旋的作用。  与解链有关的酶和蛋白质包括:1.单链结合蛋白2.解旋酶 3.拓扑异构酶Ⅰ 4.拓扑异构酶Ⅱ。  在细菌中类

关于DNA解旋酶的简介

  解旋酶是一类解开氢键的酶,是由水解ATP供给能量来解开DNA的酶。它们常常依赖于单链的存在,并能识别复制叉的单链结构。一般在DNA或RNA复制过程中起到催化双链DNA或RNA解旋的作用。  与解链有关的酶和蛋白质包括:1.单链结合蛋白2.解旋酶 3.拓扑异构酶Ⅰ 4.拓扑异构酶Ⅱ。  在细菌中类

知识分享:变性梯度凝胶电泳

  实验原理   DNA 双链分子在全长不断增加温度或用化学变性剂条件处理下,两条链就会开始分开(即解链)。首先解链的区域由解链温度较低的碱基组成。GC碱基对比AT碱基对结合得要牢固,因此GC含量高的区域具有较高的解链温度。同时影响解链温度的因素还有相邻碱基间的吸引力。解链温度低的区域,通常位于端