PCR引物设计原则简介

实验步骤首先引物与模板的序列要紧密互补,其次引物不能在模板的非目的位点引发DNA 聚合反应(即错配) ,再次引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构。引物设计应注意如下要点:1.引物的长度一般为15-30 bp,常用的是18-27 bp。2.引物序列在模板内应当没有相似性较高,尤其是3’端相似性较高的序列,否则容易导致错配。引物3’端出现3 个以上的连续碱基,如GGG 或CCC,也会使错误引发机率增加。3.引物3’端的末位碱基对Taq 酶的DNA 合成效率有较大的影响。不同的末位碱基在错配位置导致不同的扩增效率,末位碱基为A 的错配效率明显高于其他3个碱基,因此应当避免在引物的3’端使用碱基A。4.引物序列的GC 含量一般为40-60%,过高或过低都不利于引发反应。上下游引物的GC含量不能相差太大。5.引物的另一个重要参数是熔解温度(Tm)。这是当50%的引物和互补序列表现为双链DNA分子时的温度。合理的退火温度从55℃到7......阅读全文

PCR引物

PCR Primer Design and Reaction Optimization (Molecular Biology Techniques Manual)  PCR Primer Design (Newman Lab)  PCR Primer Design (Eppendorf)Detail

Degenerate-PCR

Degenerate PCR is in most respects identical to ordinary PCR, but with one major difference. Instead of using specific PCR primers with a given sequen

菌落PCR

实验方法原理 直接挑取菌落进行PCR,PCR的95℃加热可以破胞,释放基因组DNA或质粒,成为PCR体系的模板,然后进行链式扩增。实验材料 基因样品试剂、试剂盒 dNTPPCR混合液仪器、耗材 PCR仪实验步骤 1.  PCR混合液的制备(1)Taq buffer(10×) 180 ul(2)dNT

简并PCR

简并PCR就是引物合成的时候在某个位置用两种以上的碱基代替原来的单碱基渗入oligo链合成的是一堆混和物实际上能够起做用的在其中占一定比例这个比例一般用简并度表示比如agctN合成的时候最后一位用4种碱基反应真正用的agctc,占总数的1/4agctNN其中agctCC就占1/16一般公司推荐3‘端

菌落PCR

菌落PCR可用于:(1)重组体的筛选;(2)重组体DNA测序分析。实验方法原理直接挑取菌落进行PCR,PCR的95℃加热可以破胞,释放基因组DNA或质粒,成为PCR体系的模板,然后进行链式扩增。实验材料菌落样品试剂、试剂盒dNTPPCR混合液仪器、耗材PCR仪实验步骤1.  PCR混合液的制备(1)

PCR技术

            实验方法原理 PCR是在模板DNA、引物和dNTPs的存在下依赖于DNA聚合酶的酶促反应。PCR技术的特异性取决于引物和模板结合的特异性。反应分为变性、退火、延伸三步,经过一定的循环,介于两个引物之间的特异DNA片段得到大量扩增。 

Inverse-PCR

Genomic DNA Prepfrom 5 ml culture, resuspend in 50 µl TEDigestionsUse either AciI, AluI, HaeIII, HpaII, RsaI or TaqI for Leu transposon libraries37 de

pcr原理

PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作用下可以变性解旋成单链,在DNA聚合酶的参与下,根据碱基互补配对原则复制成同样的两分子拷贝。在实验中发现,DNA在高温时也可以发生变性解链

菌落PCR

            实验方法原理 直接挑取菌落进行PCR,PCR的95℃加热可以破胞,释放基因组DNA或质粒,成为PCR体系的模板,然后进行链式扩增。 实验材料 菌落样品

标准PCR

·         What's PCR? (Michael Blaber's Lab)Illustrated introduction to usr/localious aspects of PCR technique. It's very valuable not onl

标准PCR

What's PCR? (Michael Blaber's Lab)Illustrated introduction to usr/localious aspects of PCR technique. It's very valuable not only for thos

免疫PCR

免疫PCR (Immuno PCR, Im-PCR) 是利用抗原抗体反应的特异性和PCR扩增反应的极高灵敏性而建立的一种微量抗原检测技术。是用一段已知DNA分子标记抗体作为探针,用此探针与待测抗原反应,PCR扩增粘附在抗原抗体复合物上的这段DNA分子,电泳定性,根据特异性PCR产物的有无,来判断待测

反向PCR

主要内容如下:·         RT-PCR·         Competitive and Quantative RT-PCR·         In Situ RT-PCR·         RL-PCR·         DNA Contamination·         RT-PCR

降落PCR

降落PCR(touchdown PCR),一种PCR技术,主要用于PCR的条件的优化。实验方法原理基于PCR原理三步骤而设置变性-退火-延伸三个温度点。在标准反应中采用三温度点法,双链DNA在90~95℃变性,再迅速冷却至40 ~60℃,引物退火并结合到靶序列上,然后快速升温至70~75℃,在Taq

PCR仪

简单的说,PCR就是利用DNA聚合酶对特定基因做体外或试管内In Vitro的大量合成,基本上它是利用DNA聚合酶进行专一性的连锁复制。目前常用的技术,可以将一段基因复制为原来的一百亿至一千亿倍。根据DNA扩增的目的和检测的标准,可以将PCR仪分为普通PCR仪,梯度PCR仪,原位PCR仪,实时荧光定

PCR-Additives

A variety of PCR additives and enhancing agents have been used to increase the yield, specificity and consistency of PCR reactions. Whilst these addit

反向PCR

实验方法原理 标准 PCR 技术应用于定位在两个引物之间(指向内部)的一段 DNA 片段的扩增。与此相反,反向 PCR (inverse PCR) 应用于扩增和克隆与已知 DNA 序列某一个末端相邻的侧翼的未知 DNA 序列,这种未知序列没有引物可以利用。该项技术由几个研究小组开发(Ochm

实时-PCR

            试剂、试剂盒 cDNA 样品 rRNA 引物和探针 目的基因的引物和探针 Tag Man Universal PCR Master Mix   超纯水

Colony-PCR

Colony PCRDavid AmbergThis procedure will work for both yeast and E. coli:Take a small colony and suspend it in 5ul of H2O in a PCR tube. Heat for 5 m

PCR技术

1 导论 多聚酶链式反应(Polymerase Chain Reaction, PCR)是美国Perkin-Elmer/Cetus公司人类遗传研究室Mullis K. B.等人于1985年发明的一种快速体外DNA片段扩增技术,是八十年代分子生物学资源领域的一项革命性突破,被誉为分子生物学资源发展史上

Long-PCR

Two long PCR steps:First round of the nested PCR step of the end point dilution procedure to quantitate the cDNA.First round of the nested PCR step of

PCR技术

 PCR常见问题总汇 PCR产物的电泳检测时间  一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚致消失。 假阴性,不出现扩增条带  PCR反应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量及, ④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。  模板:①模

降落PCR

基本方案             实验方法原理 基于PCR原理三步骤而设置变性-退火-延伸三个温度点。在标准反应中采用三温度点法,双链DNA在90~95℃变性,再迅速冷却至40

定量PCR

            实验方法原理 定量PCR(即时聚合酶链锁反应,Real-time Polymerase Chain Reaction,简称 Real-time PCR、即时PCR),又称定量即时聚合酶链锁反应(Quantitative real time

PCR-protocol

PCR reactionProtocol for 50µl reaction - adjust amounts if necessary, for a 20µl reaction use the same volumes of primer and dNTP-mix, but adjust the

降落PCR(Touchdown-PCR)技术的的优点

综合比较普通PCR技术和最大耐受量聚合酶链反应,认为前者程序简单,省时,一般的PCR扩增仪都可完成,但缺点是退火温度不适当时容易出现假阳性;而最大耐受量聚合酶链反应虽然程序复杂,需要扩增仪有较大的内存,但能非常有效地降低或避免假阳性,且不在理想的工作条件(比如最佳镁离子浓度)下也可扩增出产物。 这就

PEQLAB推出最新PCR技术与PCR仪

  PEQLAB是一家专注于分子生物学领域试剂、仪器及耗材研发、生产及销售的德国公司。旗下的全资子公司Clemens 成立于1989年,是德国三大PCR仪器制造商之一,拥有近20年的PCR仪研发及生产经验。其新近研发的peqSTAR是集高通量,快速,多功能,触摸屏设计于一体的高端PCR仪,引领21s

PCR技术(十三):PCR用于进化分析

进化遗传学具有两个并列的研究方向:系统发育的重建和种群分析。自1962年, Zuckerkandl和Pauling提出蛋白质序列和基因序列的比较可以象分子种一样用于标志 现存物种分化的时间以来,各种生化方法被用于系统发育的研究。在最初二十年内, 同功酶的电泳分析、免疫学比较和蛋白质序列分析被广泛地应

PCR产物的检测PCRELISA法

在一个引物的5’端标记上生物素以便使其能与包被板上的亲合素结合而固定PCR产物,而在另一引物的5’端标记FITC,用HRP标记的抗FITC抗体与之结合显色,即可进行常规ELISA检测。如设立标准对照,此技术还可用于定量分析。 【试剂与配置】 包被液:4.3mmol/L Na2HPO4,

定量RTPCR-(Quantitative-RTPCR)

Application: Quantitative RT-PCR is used to quantify mRNA in both relative and absolute terms. It can be applied for the quantification of mRNA expres