MolBioEvo:人类基因组研究揭示“古老”信号
利用新的基因组分析工具,科学家们在我们对现代人类起源和古代迁徙的理解方面取得了重大进展。 分子生物学和进化学(MBE)的一项新研究通过重建人工基因组增加了这种理解,通过分析565当代南亚个体的基因组来提取古老的信号,重现人类迁徙和该地区混合的悠久历史。(图片来源:Www.pixabay.com) “总而言之,我们的研究结果为从当代人类受试者中检索古代遗传信号的可行性提供了原理验证”,作者说道。 “鉴于南亚人类遗骸中缺乏古老的DNA,我们设法从现代基因组中提取的遗传成分是非常宝贵的,并允许我们阐明居住在该地区的古代种群的遗传组成”。 ,研究人员还指出,基因组的某些部分未按预期混合,就像在南亚演化的遗传变异或从西欧亚大陆演化的遗传变异一样。通过混合适应当地生活方式很重要。 “在这些变种中,我们发现了对免疫和饮食变化很重要的基因,人们可能期望适应新的病原体或食物”。 皮肤色素沉着的人类进化也揭示了所研究人群的许多遗传变......阅读全文
细胞代谢信号通路相关的基因介绍SDHA基因
这个基因编码琥珀酸泛醌氧化还原酶的一个主要催化亚单位,一个线粒体呼吸链的复合物。该复合物由四个核编码亚单位组成,位于线粒体内膜。这种基因突变与一种线粒体呼吸链缺乏症(leigh综合征)有关。在染色体3q29上发现了一个假基因。另外,已经发现该基因编码不同亚型的剪接转录变体。[由RefSeq提供,20
NFκB信号通路相关基因介绍NFKBIA基因
该基因编码NF-Kappa-B抑制剂家族的一个成员,该家族包含多个Ankrin重复结构域。编码蛋白与rel二聚体相互作用,抑制参与炎症反应的nf-kappa-b/rel复合物。编码蛋白通过核定位信号和crm1介导的核输出在细胞质和细胞核之间移动。在外胚层发育不良伴T细胞免疫缺陷常染色体显性遗传病的无
细胞代谢信号通路相关的基因介绍TYMS基因
胸苷酸合成酶利用5,10-亚甲基四氢叶酸(亚甲基四氢叶酸)作为辅因子催化脱氧尿苷酸甲基化为脱氧胸苷酸。此功能维持DNA复制和修复的关键DTMP(胸腺嘧啶-5-一磷酸素)池。这种酶作为肿瘤化疗药物的靶点一直备受关注。它被认为是5-氟尿嘧啶、5-氟尿嘧啶-2-原脱氧尿苷和一些叶酸类似物的主要作用部位。该
细胞代谢信号通路相关的基因介绍UMPS基因
这个基因编码尿苷5'-单磷酸合酶。编码的蛋白质是一种双功能酶,对从头嘧啶生物合成途径的最后两个步骤进行催化。第一个反应是由N-末端的酶-磷酸核糖基转移酶进行的,该酶将乳清酸转化为5'-单磷酸盐。末端反应是由C末端酶OMP脱羧酶进行的,该酶能将5'-单磷酸列替丁转化为单磷酸尿苷
细胞代谢信号通路相关的基因介绍SDHD基因
这个基因编码呼吸链复合物ii的一个成员,负责琥珀酸的氧化。编码蛋白是将复合物锚定在线粒体内膜基质侧的两个完整膜蛋白之一。该基因突变与肿瘤的形成有关,包括遗传性副神经节瘤。疾病的传播几乎完全通过父系等位基因发生,这表明该位点可能是母系印记。这个基因在1号、2号、3号、7号和18号染色体上有假基因。选择
细胞代谢信号通路相关的基因介绍DHFR基因
二氢叶酸还原酶将二氢叶酸转化为四氢叶酸,这是嘌呤、胸苷酸和某些氨基酸从头合成所需的甲基穿梭剂。功能性二氢叶酸还原酶基因已被定位到5号染色体上,多个无内含子处理的假基因或类似二氢叶酸还原酶的基因已被鉴定在不同的染色体上。二氢叶酸还原酶缺乏与巨幼细胞性贫血有关。已经发现了一些编码不同亚型的转录变体。[由
细胞代谢信号通路相关的基因介绍SDHC基因
这个基因编码四个核编码亚单位之一,包括琥珀酸脱氢酶,也被称为线粒体复合物ii,一个三羧酸循环和线粒体有氧呼吸链的关键酶复合物。编码的蛋白质是两个完整的膜蛋白之一,它们将复合物的其他亚单位(形成催化核心)固定在线粒体内膜上。这个基因在不同染色体上有几个相关的假基因。这个基因的突变与副神经节瘤有关。另外
细胞代谢信号通路相关的基因介绍ATIC基因
该基因编码一种双功能蛋白,对从头嘌呤生物合成途径的最后两个步骤进行催化。N-末端结构域具有磷酸核糖氨基咪唑甲酰胺甲酰转移酶活性,C-末端结构域具有IMP环水解酶活性。该基因突变导致AICA核糖尿症。[由RefSeq提供,2009年9月]This gene encodes a bifunctional
细胞代谢信号通路相关的基因介绍GNAQ基因
GNAQ基因所编码的蛋白属于鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白)的家族,GNAQ与GNA11形成的复合物为G蛋白α亚基,这两个基因调控细胞分裂,增强MEK(有丝分裂原活化蛋白激酶的激酶)蛋白活性,在80%的葡萄膜黑色素瘤病人中发现GNA11和GNAQ基因的突变,其机制为基因突变导致MEK的异常激活,目前正
细胞代谢信号通路相关的基因介绍MTOR基因
雷帕霉素(mTOR)的哺乳动物靶标,也称为雷帕霉素和FK506结合蛋白12-雷帕霉素相关蛋白1(FRAP1)的机制靶标,是人类中由MTOR基因编码的激酶。 mTOR是蛋白激酶的磷脂酰肌醇3-激酶相关激酶家族的成员。 mTOR与其他蛋白质结合,并作为两种不同蛋白质复合物的核心成分,mTOR复合物1和m
细胞代谢信号通路相关的基因介绍SDHB基因
呼吸链的复合物II,特别参与琥珀酸的氧化,携带电子从FADH到COQ。复合物由四个核编码亚单位组成,并定位于线粒体内膜。铁硫亚单位高度保守,包含三个富含半胱氨酸的簇,这些簇可能包含酶的铁硫中心。该基因的零星和家族性突变导致副神经节瘤和嗜铬细胞瘤,并支持线粒体功能障碍和肿瘤发生之间的联系。Comple
细胞代谢信号通路相关的基因介绍POLE基因
该基因编码DNA聚合酶epsilon的催化亚单位。这种酶参与DNA修复和染色体DNA复制。该基因突变与结直肠癌12和面部畸形、免疫缺陷、利维多和身材矮小有关。This gene encodes the catalytic subunit of DNA polymerase epsilon. The
NFκB信号通路相关基因介绍-REL基因
该基因编码一种属于rel同源域/免疫球蛋白样折叠、丛蛋白、转录因子(rhd/ipt)家族的蛋白质。这个家族的成员调节参与细胞凋亡、炎症、免疫反应和致癌过程的基因。这种原癌基因在B淋巴细胞的存活和增殖中起作用。这种基因的突变或扩增与B细胞淋巴瘤,包括霍奇金淋巴瘤有关。该基因的单核苷酸多态性与溃疡性结肠
细胞代谢信号通路相关的基因介绍GNAS基因
GNAS作为一个重要的信号转导蛋白,主要功能是在G蛋白偶联受体信号转导途径中,激活腺苷酸环化酶,导致cAMP水平的升高,参与调控细胞生长和细胞分裂。
细胞代谢信号通路相关的基因介绍MYC基因
该基因编码的蛋白质是一种多功能的核磷蛋白,在细胞周期进展、凋亡和细胞转化中起到作用。作为调节特定靶基因转录的转录因子发挥作用。这种基因的突变、过度表达、重排和易位与多种造血肿瘤、白血病和淋巴瘤,包括伯基特淋巴瘤有关。有证据表明,来自上游、非aug(cug)帧和下游aug起始位点的选择性翻译起始导致两
细胞代谢信号通路相关的基因介绍DPYD基因
该基因编码的蛋白是嘧啶分解代谢酶,是尿嘧啶和胸腺嘧啶分解代谢途径的起始和限速因子。该基因突变导致二氢嘧啶脱氢酶缺乏,嘧啶代谢错误与胸腺嘧啶尿嘧啶尿有关,癌症患者接受5-氟尿嘧啶化疗后毒性增加。两个编码不同亚型的转录变体已经被发现。The protein encoded by this gene is
细胞代谢信号通路相关的基因介绍TPMT基因
该基因编码通过S-腺苷-L-蛋氨酸作为S-甲基供体和S-腺苷-L-同型半胱氨酸作为副产物代谢硫嘌呤药物的酶。硫嘌呤类药物如6-巯基嘌呤被用作化疗药物。影响这种酶活性的遗传多态性与个体内对此类药物的敏感性和毒性的变化相关,从而导致硫嘌呤s-甲基转移酶缺乏。相关假基因已在第3、18和X染色体上鉴定。[由
细胞代谢信号通路相关的基因介绍CEBPA基因
这个无内含子基因编码一个转录因子,该转录因子包含一个碱性亮氨酸拉链(bzip)结构域,并识别目标基因启动子中的ccaat基序。编码蛋白在具有CCAAT/增强子结合蛋白β和γ的同二聚体和异二聚体中起作用。这种蛋白的活性可以调节参与细胞周期调节和体重平衡的基因表达。该基因突变与急性髓系白血病有关。在非a
细胞代谢信号通路相关的基因介绍MTHFR基因
该基因编码的蛋白质催化5,10-亚甲基四氢叶酸转化为5-甲基四氢叶酸酯,这是同型半胱氨酸再甲基化为蛋氨酸的共基质。该基因的遗传变异影响对闭塞性血管病、神经管缺陷、结肠癌和急性白血病的易感性,该基因的突变与亚甲基四氢叶酸还原酶缺乏有关。The protein encoded by this gene
NFκB信号通路相关基因介绍ATM基因
ATM基因编码的蛋白属于PI3/PI4激酶家族,这种蛋白是一种重要的细胞周期检查点激酶,通过磷酸化调控下游一系列重要蛋白,包括抑癌蛋白p53和BRCA1、检查点激酶CHK2、检查点蛋白RAD17和RAD9以及DNA修复蛋白NBS1。ATM和与其密切相关的蛋白ATR被认为是在细胞周期调控以及DNA损伤
DNA修饰QKI基因信号通路介绍
该基因编码的蛋白质是一种RNA结合蛋白,可调节mRNA的前剪接,从细胞核输出mRNA,蛋白质翻译和mRNA稳定性。 编码的蛋白质参与髓鞘化和少突胶质细胞分化,并且可能在精神分裂症中起作用。 已经为该基因发现了编码不同同工型的多个转录物变体。
发现重复基因剪接信号演化特点
近日,中科院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所孔祥银课题组张振国等人发现基因重复后基因剪接信号演化特点,以及这些变化对基因新结构形成的影响,该成果在线发表在《基因组生物学》(Genome Biology)杂志上。 在物种进化过程中,基因重复是经常发生的。那么基因重复后,基
Hippo信号通路相关的基因介绍CTNNB1基因
CTNNB1基因编码的蛋白β-catenin是一种粘着连接蛋白,与钙粘蛋白、α-catenin共同组成粘附连接(adherens junctions,AJs)复合体的,通过调控细胞生长以及细胞间的粘附,对上皮细胞层的构建与维持起着重要作用。β-catenin可与APC蛋白结合,发生突变后可导致结直肠
Wnt信号通路的相关基因介绍SMARCA4基因
该基因编码的蛋白是Swi/SNF蛋白家族的一员,与果蝇的布拉马蛋白相似。这个家族的成员有螺旋酶和ATP酶活性,被认为通过改变这些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。编码蛋白是大型ATP依赖染色质重塑复合物snf/swi的一部分,这是染色质抑制的基因转录激活所必需的。此外,该蛋白能结合BRCA1
Wnt信号通路的相关基因介绍CCND2基因
该基因编码的蛋白质属于高度保守的细胞周期蛋白家族,其成员在细胞周期内具有显著的蛋白质丰度周期性。细胞周期蛋白起着调节CDK激酶的作用。不同的细胞周期蛋白表现出不同的表达和降解模式,这有助于每个有丝分裂事件的时间协调。该细胞周期蛋白与CDK4或CDK6形成复合物,并作为该复合物的调节亚单位发挥作用,其
Wnt信号通路的相关基因介绍AMER1基因
该基因编码的蛋白上调了wilms肿瘤蛋白的转录激活,并与许多其他蛋白相互作用,包括ctnnb1、apc、axin1和axin2。这种基因的缺陷是导致头颅硬化(OSCS)的纹状体骨病变的原因。
Wnt信号通路的相关基因介绍CUL3基因
这个基因编码一个库林蛋白家族的成员。编码蛋白作为e3泛素连接酶复合物的核心组分和支架蛋白,在多泛素化和随后的降解过程中起着关键作用。包括编码蛋白在内的复合物也可能在内胚体的晚期成熟中起作用。该基因突变是2e型假醛固酮减少症的一个原因。另外,已经观察到该基因编码多个亚型的剪接转录变体。
Notch信号通路的相关基因介绍FOXP1基因
该基因属于叉头盒转录因子家族的P亚科。叉头盒转录因子在发育和成年期间对组织和细胞类型特异性基因转录的调节中起着重要作用。叉头盒P1蛋白包含DNA结合域和蛋白质结合域。该基因可能作为肿瘤抑制因子发挥作用,因为它在多种肿瘤类型中丢失,并映射到据报道含有肿瘤抑制基因的染色体区域(3P14.1)。选择性剪接
Notch信号通路的相关基因介绍HNF1A基因
该基因编码的蛋白是一种转录因子,在肝脏中高度表达并参与多种肝脏特异性基因的表达调控。HNF1A基因突变会引起糖尿病。HNF1A基因的27个单核苷酸多态性(SNP)与冠状动脉疾病的风险增加有关。
hog信号通路的相关基因介绍FOXP1基因
该基因属于叉头盒转录因子家族的P亚科。叉头盒转录因子在发育和成年期间对组织和细胞类型特异性基因转录的调节中起着重要作用。叉头盒P1蛋白包含DNA结合域和蛋白质结合域。该基因可能作为肿瘤抑制因子发挥作用,因为它在多种肿瘤类型中丢失,并映射到据报道含有肿瘤抑制基因的染色体区域(3P14.1)。选择性剪接