RNAi实验中双链短RNA(dsRNA)制备过程

RNAi 实验中双链短RNA(dsRNA)制备过程,本实验方法来自于加州大学Jim教授实验,很权威!Procedure for the Generation of dsRNA for use in RNAi1. Design polymerase chain reaction (PCR ) primers that will amplify 600-800 bp of sequence corresponding to the message of interest. Both primers should contain the following T7 RNA polymerase binding site at the 5’ end:GAA TTA ATA CGA CTC ACT ATA GGG AGA.Here's one for T3:AAT TAA CCC TCA CTA AAG GGA......阅读全文

RNAi技术研究进展

  RNA干扰(RNA interference,RNAi)是多种生物体内由双链RNA(doublestranded RNA,dsRNA)介导同源mRNA 降解的现象。RNAi现象先后在不同生物中被发现,植物学家称它为共抑制(co-suppression)或转录后基因沉默(post transcri

RNAi技术研究进展

  RNA干扰(RNA interference,RNAi)是多种生物体内由双链RNA(doublestranded RNA,dsRNA)介导同源mRNA 降解的现象。RNAi现象先后在不同生物中被发现,植物学家称它为共抑制(co-suppression)或转录后基因沉默(post transcri

RNAi技术研究进展

RNA干扰(RNA interference,RNAi)是多种生物体内由双链RNA(doublestranded RNA,dsRNA)介导同源mRNA 降解的现象。RNAi现象先后在不同生物中被发现,植物学家称它为共抑制(co-suppression)或转录后基因沉默(post tran

miRNA和siRNA的基本介绍及区别

1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室中是

miRNA和siRNA简介及区别

1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室

RANi术语表

RNAi RNA干扰是最近发现的一种功能工具。当RNA导入一个细胞时,最终会引起细胞内互补mRNA的降解,从而导致基因功能活性的阻断。PTGS 转录后基因沉默(post transcriptional gene silencing);一种首先在植物中确定,然后发现在动物中也存在的现象。尽管PTGS最

RNAi干扰技术及应用进展研究(一)

RNAi是Napoli CD等在试图向紫色矮牵牛花转导色素合成基因,用以增加其花色时发现的。结果出乎预料,转基因的植株不仅没有新基因的表达,反而自身的色素合成也减弱了,一些转基因的花出现了全白色或部分白色。他们把这种导入的基因未表达和植物本身合成色素基因的失活现象命名为共抑制(cosuppressi

RANi(RNA干扰)术语表

RNA干扰是最近发现的一种功能工具。当RNA导入一个细胞时,最终会引起细胞内互补mRNA的降解,从而导致基因功能活性的阻断。PTGS转录后基因沉默(posttranscriptionalgenesilencing);一种首先在植物中确定,然后发现在动物中也存在的现象。尽管PTGS最初被描述作一种病毒

RNAi的研究进展(二)

三,RNAi的应用前景RNAi 技术中的相关问题主要涉及以下几点:(1) dsRNA 序列的选择dsRNA 主要选自已知的cDNA 的开放阅读框架(ORF) 中的基因区域。为防止mRNA 调控蛋白对RISC 与靶RNA 结合的干扰,应避免选择包括:1) 起始密码子下游或终止密码的50~100 核

RNAi的机理与应用

  RNAi 技术的机理与应用   关于 RNAi 技术   RNA 干扰(RNA interference,RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链 RNA( double-stranded RNA,dsRNA) 诱发的、同源 mRNA 高效特异性降解的现象。   RNAi 受到追捧的

RNA干扰实验技术介绍(一)

通过生化和遗传学研究表明,RNA干扰包括起始阶段和效应阶段(inititation and effector steps)。在起始阶段,加入的小分子RNA被切割为21-23核苷酸长的小分子干扰RNA片段(small interfering RNAs, siRNAs)。证据表明;一个称为Dic

RNAi的发现和起源

首次发现dsRNA能够导致基因沉默的线索来源于线虫Caenorhabditis elegans的研究。>1995年,康乃尔大学的Su Guo博士和>Kemphues在试图阻断秀丽新小杆线虫(C.  elegans)中的par-1基因时,发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断

简述RNA干扰的特征

  ①RNAi是转录后水平的基因沉默机制;  ②RNAi具有很高的特异性,只降解与之序列相应的单个内源基因的mRNA;  ③RNAi抑制基因表达具有很高的效率,表型可以达到缺失突变体表型的程度,而且相对很少量的dsRNA分子(数量远远少于内源mRNA的数量)就能完全抑制相应基因的表达,是以催化放大的

RNAi具有的特征

①RNAi是转录后水平的基因沉默机制;②RNAi具有很高的特异性,只降解与之序列相应的单个内源基因的mRNA;③RNAi抑制基因表达具有很高的效率,表型可以达到缺失突变体表型的程度,而且相对很少量的dsRNA分子(数量远远少于内源mRNA的数量)就能完全抑制相应基因的表达,是以催化放大的方式进行的;

RNAi的基本特征

①RNAi是转录后水平的基因沉默机制;②RNAi具有很高的特异性,只降解与之序列相应的单个内源基因的mRNA;③RNAi抑制基因表达具有很高的效率,表型可以达到缺失突变体表型的程度,而且相对很少量的dsRNA分子(数量远远少于内源mRNA的数量)就能完全抑制相应基因的表达,是以催化放大的方式进行的;

RNAi的特征

①RNAi是转录后水平的基因沉默机制;②RNAi具有很高的特异性,只降解与之序列相应的单个内源基因的mRNA;③RNAi抑制基因表达具有很高的效率,表型可以达到缺失突变体表型的程度,而且相对很少量的dsRNA分子(数量远远少于内源mRNA的数量)就能完全抑制相应基因的表达,是以催化放大的方式进行的;

基因干扰技术的基本特征

①RNAi是转录后水平的基因沉默机制;②RNAi具有很高的特异性,只降解与之序列相应的单个内源基因的mRNA;③RNAi抑制基因表达具有很高的效率,表型可以达到缺失突变体表型的程度,而且相对很少量的dsRNA分子(数量远远少于内源mRNA的数量)就能完全抑制相应基因的表达,是以催化放大的方式进行的;

RNAi技术

 DNA芯片检测siRNA专一性  长片断的双链RNA  (dsRNA) 导入例如植物,真菌,果蝇,线虫等生物的细胞中会引发同源mRNA的降解——这就是所谓的RNA interference  (RNAi)。RNAi分两个步骤,首先是长片断双链dsRNAs被核酶Dicer切割成21—25个碱基的sm

RNAi的作用机制(起始阶段和效应阶段)

现有的RNAi作用机制模型包括起始阶段和效应阶段:1)起始阶段:dsRNA进入细胞的方式可以是外源导入或者转基因、病毒感染等。引入的dsRNA被核酸酶RNaseⅢ家族中特异识别dsRNA的Dicer酶,以一种ATP依赖的方式逐步切割成长约 21-23nt的由正反义链组成的双链小分子干扰RNA

RNAi表达载体构建(二)

(2)、序列同源性分析: 将潜在的序列和相应的基因组数据库(人,或者小鼠,大鼠等等)进行比较,排除那些和其他编码序列/EST同源的序列.例如使用BLAST( www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/)选出合适的目标序列进行合成.并非所有符合条件的siRNA都一样有效,其原因还不清楚

Dicer酶结构及作用原理

1、Dicer酶在RNA干扰研究中会用到Dicer酶,Dicer酶是RNaseIII型家族中的蛋白酶,可特异识别dsRNA,它可以切割以各种方式进入到细胞内的dsRNA,将其切割成19-21bp大小的短RNAs。Dicer是来自果蝇RNA干扰必须的RNaseIII型蛋白。Dicer酶是RNase I

RNAi总结

RNA干涉(RNAi)是指双链RNA分子使基因表达沉寂的现象,是在线虫中发现的,在 1998年的一篇Nature论文中被公诸于众。过去几年中,科研工作者已明确转录后基因沉默现象普遍存在于动、植物中,在机体防御病毒入侵和转座子沉默效应中起着重要作用。近年来的研究表明,将与mRNA对应的正义RNA和反义

关于RNA干扰的发现介绍

  RNAi是在研究秀丽新小杆线虫(C. elegans)反义RNA(antisense RNA)的过程中发现的,由dsRNA介导的同源RNA降解过程。1995年,Guo等发现注射正义RNA(sense RNA)和反义RNA均能有效并特异性地抑制秀丽新小杆线虫par-1基因的表达,该结果不能使用反义

RNA干扰的发现与研究

RNAi是在研究秀丽新小杆线虫(C. elegans)反义RNA(antisense RNA)的过程中发现的,由dsRNA介导的同源RNA降解过程。1995年,Guo等发现注射正义RNA(sense RNA)和反义RNA均能有效并特异性地抑制秀丽新小杆线虫par-1基因的表达,该结果不能使用反义RN

RNA干扰的发现背景

RNAi是在研究秀丽新小杆线虫(C. elegans)反义RNA(antisense RNA)的过程中发现的,由dsRNA介导的同源RNA降解过程。1995年,Guo等发现注射正义RNA(sense RNA)和反义RNA均能有效并特异性地抑制秀丽新小杆线虫par-1基因的表达,该结果不能使用反义RN

RNA干扰技术的发现历史

RNAi是在研究秀丽新小杆线虫(C. elegans)反义RNA(antisense RNA)的过程中发现的,由dsRNA介导的同源RNA降解过程。1995年,Guo等发现注射正义RNA(sense RNA)和反义RNA均能有效并特异性地抑制秀丽新小杆线虫par-1基因的表达,该结果不能使用反义RN

概述基因沉寂的实现工具

  Sigma-Aldrich公司近日在全球推出MISSION®; esiRNA,一种基因特异的siRNA库,它为哺乳动物细胞中的RNAi筛选提供了一种强有力的方法。与传统的合成siRNA不同,esiRNA集合了数百个针对单个基因靶点的siRNA。这种新工具能避免鉴定有效siRNA的反复试验过

脊髓动物细胞中特殊的RNAi现象

1 .由长dsRNA引起的非特异性基因沉默寻找哺乳动物细胞中存在RNAi的证据颇费了一番周折。将较长的dsRNA(超过30个碱基对)转染几种特定脊髓动物细胞系统如小鼠的早期胚胎中,斑马鱼和中华仓鼠卵巢细胞中,能够诱发细胞内的RNAi现象,而在大部分脊髓动物的成体细胞中不存在类似于RNAi的机制,却引

产生RNA干扰RANi-的方法

4 产生RANi 的方法产生RANi 的方法主要有体外合成和体内合成siRNA 法。将siRNA 导入细胞的方法又分为微量注射法、电穿孔法、浸泡法、工程菌喂养法、转基因法和病毒感染法等。Harborth 等[14 ]设计体外合成21nt siRNA 的方法是:在基因库中寻找靶向基因的mRNA 序列,

核糖核酸干扰技术(RNAi技术)介绍

转录后基因沉默(PTGS, post- transcriptional gene silencing)-最初被认为仅限于矮牵牛花和其它一些植物中的奇异现象,是目前分子生物学研究中一个最热门的话题。过去几年中,科研工作者已明确转录后基因沉默现象普遍存在于动、植物中,在机体防御病毒入侵和转座子沉默效应中