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打通菌群多样性与功能的研究策略

近几年,肠道微生物可以说是最热的研究热点,频繁登上在CNS期刊的封面,不仅相关主题的学术论文表现强势,而且国自然资助的肠道微生物项目数也呈显著增长的趋势,其中2018年一共资助了近180项研究,资助金额高达7600万。由此可见肠道微生物一直是科研领域的研究热点,相信2019年肠道微生物仍是国自然申请的热点。总之,紧跟这个热点,不仅容易发文、发好文,申请基金也更加容易。现有常用研究策略的不足16S测序或宏基因是最常用的肠道微生物研究手段,主要侧重研究肠道微生物的多样性与生理、疾病之间的相关性。尽管这样的研究方法能够有助于了解生物过程中的菌群迁移情况以及找出潜在的参与疾病发生的菌株,在此基础上可进一步借助动物模型采用粪便移植或者特定菌株的灌胃实验等技术,可以相对直接地揭示肠道微生物或特定菌株与疾病之间的因果关系,但是对菌的功能与作用机制却知之甚少,也就是说仅仅采用16S测序或宏基因测序难以实现对菌群功能的探究。因此,从国自然申请标书......阅读全文

肠道菌群的检测与筛选

最近,在Nature上有一篇题为“The gutmicrobiota is associated with immune cell dynamics in humans”的研究报告中,科学家们通过研究揭示了机体微生物菌群与免疫系统之间的关联,研究人员首次发现,血液中不同类型免疫细胞浓度的改变

Science:揭示两栖动物真菌杀手很可能起源自东亚地区

  一种致命性的称为蛙壶菌(Batrachochytrium dendrobatidis, Bd)的真菌长期以来就被认为是导致几大洲的青蛙、蟾蜍、蝾螈和其他的两栖类动物种减少和灭绝的原因。蛙壶菌分布在世界各地,但是迄今为止人们还不清楚这种病原菌最初出现在哪里。这种真菌会引起一种叫做壶菌病(chytr

BMC:NCAS可作为饮食糖替代品

  糖尿病是一组以高血糖为特征的代谢性疾病,是现代疾病中的第二杀手,其对人体的危害仅次于癌症。因此遏制糖尿病的流行成为医学界研究的热点问题。“控糖限糖”是预防糖尿病最直接的方式,也是对甜食爱好者最“残忍”的方式。为解决这一难题,糖替代品——非卡路里人造甜味剂(NCAS)逐渐走进人们的生活。  近日,

高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用(一)

在人体肠道中生活着数以万亿的共生菌群,它们的种类繁多,可达上千种,数量也很惊人,是人体细胞总量的10倍以上,迄今为止,仍有80%以上的微生物不为人知。这些肠道微生物和人体存在着互利共生的关系,对于维持人类的健康发挥着重要的作用。它们在肠道中保持着一种动态的平衡,能够合成维生素、帮助人体从食物中吸收营

科学家阐明肠道微生物组与机体动脉硬化之间的神秘关联

  近日,一项刊登在国际杂志European Heart Journal上的研究报告中,来自诺丁汉大学等机构的研究人员通过研究发现,消化系统中有益菌群多样性的水平或许与心血管疾病的一个特征—动脉硬化有一定的关联。在医学研究中肠道微生物组受到了科学家们越来越多的关注,因为如今我们都知道肠道菌群对机体多

科学家阐明肠道微生物组与机体动脉硬化之间的神秘关联

   近日,一项刊登在国际杂志European Heart Journal上的研究报告中,来自诺丁汉大学等机构的研究人员通过研究发现,消化系统中有益菌群多样性的水平或许与心血管疾病的一个特征—动脉硬化有一定的关联。在医学研究中肠道微生物组受到了科学家们越来越多的关注,因为如今我们都知道肠道菌群对机体

基金委与南非国家研究基金会合作项目批准通知

  2014年度国家自然科学基金委员会与南非国家研究基金会合作研究项目批准通知  根据国家自然科学基金委员会(NSFC)与南非国家研究基金会(NRF)达成的合作共识,将共同资助双方科学家开展合作研究。2014年经过公开征集、双方分别评审和共同协商,以下9个项目获得批准,实施周期为3年(2014年10

喝红酒或能提高肠道微生物多样性 增强肠道健康

  近日,一项刊登在国际杂志Gastroenterology上的研究报告中,来自伦敦国王学院的科学家们通过研究发现,与不喝红酒的人群相比,喝红酒的人群机体肠道微生物多样性较高(肠道健康的一个标志),同时其患肥胖风险较低,机体坏胆固醇水平较低。文章中,研究人员对916对英国女性双胞胎进行研究,分析了啤

《Nature》:2017引用最多的年度论文

  生物通报道:近期Nature杂志展开了2017年度的年终大盘点,包括多项具有影响力的科学事件,年度图片,以及科学人物。同时杂志也列出了学术媒体,大众媒体,以及预印媒体中最受关注的论文:  1月-3月  Evolocumab and Clinical Outcomes in Patients wi

“肠道菌群—肠—脑”互作调控动物对寒冷环境的适应机制

  冬季的严寒和食物短缺对于温带地区非冬眠哺乳动物的生存是极大的挑战。恒温动物维持高而恒定的体温需要付出很高的代价。褐色脂肪组织(brown adipose tissue, BAT)产热(非颤抖性产热)是一种高效迅速的产热方式,受交感神经支配,在小型哺乳动物(包括冬眠动物)的体温调节中发挥关键作用。

微生物所在念珠菌有性生殖研究方面取得进展

  有性生殖是生命进化的主要推动力,是真核生物遗传变异和多样性产生的加速器。有性生殖有利于剔除有害遗传突变,积累有利变异,从而促进物种环境适应能力的提升和长期进化优势的保持。白色念珠菌是一种重要的人体病原真菌,临床菌株具有很高的多样性和致病性。全世界每年由念珠菌引起的阴道炎和鹅口疮等浅部感染病例达到

Cell:肠道菌群又立功!粪便移植或能让“癌王”患者长寿

  近日,美国MD安德森癌症中心发表在《Cell》杂志上的研究揭秘为什么有的胰腺癌患者能够“长寿”,而大部分胰腺癌患者只有普通短生存期。  胰腺导管腺癌是最常见的一种胰腺癌,大多数患者在确诊时都处于晚期。只有9%的人能活到5年。早期癌症可以通过手术切除,复发率高,中位生存期为24-30个月,因此胰腺

西班牙学者揭示抗生素对肠道菌群及代谢影响巨大

  肠道的微生态是一个复杂的生态系统,而人类结肠则可以被看做是一个厌氧的生物反应器。肠道存在着万亿数量级的微生物,这大大增加了宿主基因组资源。同时这些庞大的微生物生态系统为人体能量捕获、食物消化、生物活性物质的合成等等提供了补充性代谢途径,否则人体将无法实现饮食中营养物质的同化。  人类肠道菌群主要

昆明动物所发布精准诊断一类疾病的核心使能技术

  近日,中国科学院昆明动物研究所马占山团队发布了两项生物信息技术(算法和软件),这两项技术可用于精准诊断菌群相关疾病指标的研发,也可用于其它环境微生物群系监测的研究。其技术报告以The P/N (Positive-to-Negative Links) ratio in complex networ

肠道菌群失调引起自闭症?

   自闭症又称孤独症,是一种有生物基础的发育障碍类疾病,包括一系列复杂的神经发育障碍。来自不同国家的统计数据显示,自闭症患者已经占据总人口比例的2%,甚至更高。  以往研究发现,自闭症患者的肠道菌群和大脑神经发育存在异常。最近,一项来自意大利的研究为自闭症与肠道菌群之间的关系提供了新的证据。  自

科学家探究接触过艾滋病病毒的婴儿缘何健康差

  全世界每年有超过100万名新生儿是感染艾滋病病毒的女性所生。虽然抗逆转录病毒疗法成功防止了其中大部分母婴传播,但那些接触但未感染艾滋病病毒的孩子仍有较高患病风险,其死亡风险也比一般婴儿高近2倍。  洛杉矶儿童医院的杰弗里·本德和同事在新一期美国《科学—转化医学》杂志上报告说,他们怀疑肠道菌群失调

Nature等五篇文章直指肠道细菌特殊的代谢途径

  来自UT西南医学中心,MD安德森癌症中心等多处的多个研究小组2018年开年陆续发表了五篇论文,分别论述了肠道细菌特殊的代谢途径,以及这种途径在多个疾病中的重要作用。相关成果分别发表在Nature,Science,以及Cell Host & Microbe杂志上。  肠道菌群与肠道疾病  

肠道微生物最新研究进展

  肠道是人体最大的消化和排毒器官,其回旋盘转的结构被形象地称为人体第二大脑。肠道中寄生着数以计亿的细菌,它们是人体内最重要的一种外环境,各种微生物按一定比例组合,相互制约,相互依存,在质和量上形成一种生态平衡。然而肠道菌群并不都是人类的朋友,按特性来讲,它们可分为3大类,即好菌、坏菌和中性菌。当人

我国一研究在船员肠道健康方面获新成果

   日前,《肠道微生物学》在线发表了青岛特种食品研究院在船员肠道健康研究方面的新成果。  高盐度、紫外线辐射、新鲜水果和蔬菜供应不足等海上环境会使人体免疫力下降,严重威胁船员的生理和心理健康。人体肠道的微生物菌群是保持人体免疫系统正常、维持人体健康的基础。因此,保证船员正常的肠道微生物菌群结构,对

剖腹产可降低后代肠道微生物群落的多样性

相比顺产的儿童来说,通过剖腹产手术出生的儿童更容易经常发生机体变态反应。   近日,刊登在国际杂志Gut上一篇研究报告中,来自瑞典和苏格兰的研究者通过研究发现,相比顺产的儿童来说,通过剖腹产手术出生的儿童更容易经常发生机体变态反应,这或许是因为这些儿童肠道中的微生物菌群多样性较低而导致的。   

这些因素可能会影响后代健康 你知道吗?

  近年来,越来越多的研究证据都表明,父母在很多方面都会给未来后代的健康产生一定影响,比如父母的饮食方式、年龄、体重、是否感染、女性孕期所暴露的物质等等都会对后代的生长发育产生一定效应,本文中,小编整理了近年来的相关研究进展,分享给各位!这些研究报告将告诉各位哪些因素会影响后代的健康!  【1】Fr

肠道菌群随季节改变

  对现存为数不多的其中一个狩猎—采集者群体开展的研究表明,生活在人类肠道中的微生物随着季节发生变化。相关成果日前发表于《科学》杂志。  来自“人类食物工程”的Jeff Leach及其团队用一年多时间收集了生活在坦桑尼亚的350名哈扎人的粪便样本。“人类食物工程”是一个非营利性机构,旨在研究微生物组

研究发现肠道菌群随季节改变

   对现存为数不多的其中一个狩猎—采集者群体开展的研究表明,生活在人类肠道中的微生物随着季节发生变化。相关成果日前发表于《科学》杂志。  来自“人类食物工程”的Jeff Leach及其团队用一年多时间收集了生活在坦桑尼亚的350名哈扎人的粪便样本。“人类食物工程”是一个非营利性机构,旨在研究微生物

“专性猎杀” “精准靶向”——噬菌体的强大之处远不止如此

   噬菌体是环境中普遍存在的一类专门侵染细菌的病毒。此前,科学家对噬菌体能否抑制土壤中的病原菌不甚了解。  当地时间12月2日,《自然-生物技术》发表南京农业大学资源与环境科学学院最新研究成果。该成果揭示,噬菌体不仅可以“专性猎杀”和“精准靶向”土传青枯病的病原菌,降低其生存竞争能力;同时还能够重

epicPCR技术拓展对硫酸盐还原菌的认知

  在高度复杂的环境微生物群落中,承载生物地球化学循环的特定功能微生物类群往往也具有高度的多样性,这种功能上的冗余使得微生物群落面对环境剧烈变化时具有较强的适应性和稳定性。然而,以单一16S rRNA基因或者以功能基因为主的高通量测序均无法实现特定微生物功能类群的多样性检测。中国科学院生态环境研究中

Cell重磅!个体对流感疫苗的反应受肠道微生物的影响

  作为当下最热门的研究领域,肠道微生物被报道发现和多种人类疾病有关,如肥胖,糖尿病,癌症等。近年来有研究证明,肠道微生物在免疫反应中也扮演着重要角色。但是大多相关研究都使用动物模型,针对人类群体的研究结果相对较少。  近日,斯坦福大学的研究团队通过对健康成年人注射广谱抗生素,以改变其体内肠道微生物

女性机体的肠道微生物组或许比男性更早熟一些!

    近日,一项刊登在国际杂志mSystems上的研究报告中,来自加利福尼亚大学等机构的科学家们通过研究发现,一个人的年龄和性别会明显影响其机体肠道微生物组的多样性。人类肠道微生物组是一种非常复杂的微生物生态系统,其在人类机体健康中扮演着非常关键的角色,比如诸如细菌、病毒和真菌等微生物或能帮助调节

肠道菌群 | Science专刊:决定你健康状况的"第二基因组"

  肠道菌群与人体健康密切相关,二者之间的关系是目前研究的热点。随着研究者的不断深入,我们发现,对人体微生物的了解还远远不够,它们能帮助我们做什么,以及我们如何改变它们?  4月29日,美国《科学》杂志以“Microbiota at work”为主题发了一期专刊,从不同的方面介绍了人体微生物与健康的

“哥斯达黎加生物多样性调查与研究”项目启动会召开

  3月2日,由中国科学院昆明植物研究所所长李德铢研究员牵头主持的中国科学院知识创新工程重点部署项目“哥斯达黎加生物多样性调查与研究”在昆明植物所举行了项目启动会。   项目总负责人李德铢研究员向与会专家和项目组人员介绍了该项目的背景、项目总体目标、预期成果和考评指标、年度计划及20

研究人员发现保存完好真菌菌丝化石的两项新研究成果

  地史时期的木化石除保存有木材解剖特征外,还往往蕴含有大量植物生理学及生态学信息,包括昆虫觅食痕迹、蛀孔等遗迹化石和真菌菌丝等微生物化石。对这些矿化植物内含化石的深入研究有助于揭示地史时期植物与昆虫、真菌等生物间的生态及协同演化关系。中国白垩纪木化石数量丰富、类型多样,但以往的研究多侧重于木化石的