使用GWAS研究鸡攻击行为的相关基因

研究背景攻击行为是很多物种共有的进化属性,它可以帮助雄性物种快速建立生存空间或社会主导地位。然而可想而知,这种属性在禽类的饲养中是十分不利的。之前已有一些研究表明鸡的攻击行为可由遗传因素导致,并估计了遗传力大小约为0.57,说明群体中一半以上的攻击行为是由遗传导致的。研究人员试图使用GWAS方法来探究攻击行为背后的遗传因素,以期改善养殖效率和动物福利。本文是第一篇使用GWAS方法来研究鸡攻击行为的文章。研究思路研究结果研究共使用了265只雄性家鸡,在出生第60天时开始测量攻击性状,共4个,分别为T1:在记录期间(16天)内打斗的次数;T2:每天打斗的次数(超过4次则被记录);T3:打斗的天数;T4:超过4次打斗的天数。基因分型工作由上海伯豪完成,使用了Affymetrix Axiom平台的高密度芯片,型号为600K Affymetrix Axiom HD chicken genotyping array,共生成了599,898个......阅读全文

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

  叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式

具有遗传风险的基因介绍PRSS1基因

这个基因编码一种胰蛋白酶原,它是丝氨酸蛋白酶家族的一员。这种酶由胰腺分泌,在小肠内分裂成活性形式。它对涉及赖氨酸或精氨酸的羧基的肽键具有活性。该基因突变与遗传性胰腺炎有关。这个基因和其他一些胰蛋白酶原基因定位在7号染色体上的T细胞受体β位点。

具有遗传风险的基因介绍PALB2基因

这个基因编码一种可能抑制肿瘤的蛋白质。这种蛋白与乳腺癌2早发蛋白(BRCA2)在核病灶结合并与之共定位,可能允许BRCA2稳定的核内定位和积累。

具有遗传风险的基因介绍NTHL1基因

这个基因编码的蛋白质是一种核酸内切酶iii家族的dna n-糖基化酶。与大肠杆菌中的类似蛋白质一样,编码的蛋白质在含有氧化嘧啶残基的dna底物上具有dna糖苷酶活性,并且具有无嘌呤/无嘧啶裂解酶活性。

新基因图谱揭示基因组交叉地带

  据英国《新科学家》网站近日报道,美国科学家绘制出了目前世界上最先进的人类基因图谱,该图谱能帮助更准确地识别某些影响特定人群的遗传病根源。   这一基因图谱发现,西非人后裔的基因中有着欧洲人后裔所没有的基因重组的高发地带,这有可能是导致特定人种先天性疾病诸如贫血症的遗传学原因。当然

与食管癌相关的突变基因EGFR基因

EGFR编码的蛋白是一种跨膜糖蛋白,也是表皮生长因子受体家族中的一员,该家族包括HER1(erbB1,EGFR)、HER2(erbB2,NEU)、HER3(erbB3)及HER4(erbB4),也属于受体酪氨酸激酶家族。EGFR作为细胞表面蛋白可与配体如表皮生长因子(EGF)结合,EGFR可被激活,

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

超进展基因MDM4基因的临床解释

该基因编码一种核蛋白,在N端含有一个p53结合域,在C端含有一个环指结构域,与p53结合蛋白mdm2结构相似。这两种蛋白结合p53肿瘤抑制蛋白并抑制其活性,已被证明在多种人类癌症中过表达。然而,与降解p53的MDM2不同,这种蛋白通过结合其转录激活域抑制p53。该蛋白还通过环指域与MDM2蛋白相互作

与肾癌相关的基因突变类型FLCN基因

该基因位于17号染色体的Smith-Magenis综合征区域。该基因突变与Birt-Hogg-Dube综合征有关,后者以纤维滤泡瘤、肾肿瘤、肺囊肿和气胸为特征。该基因的选择性剪接导致编码不同亚型的两个转录变体。

细胞代谢信号通路相关的基因介绍RPTOR基因

该基因编码一个信号通路的组成部分,该信号通路调节细胞生长以响应营养素和胰岛素水平。编码蛋白与mtor激酶形成化学计量复合物,并与真核起始因子4e结合蛋白-1和核糖体蛋白s6激酶相关。该蛋白正调控下游效应核糖体蛋白s6激酶,负调控mtor激酶。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提

超进展基因DNMT3A基因的临床解释

CpG甲基化是一种表观遗传修饰,对胚胎发育、印记和X染色体失活具有重要意义。对小鼠的研究表明,DNA甲基化是哺乳动物发育所必需的。这个基因编码一种DNA甲基转移酶,被认为在从头甲基化中起作用,而不是维持甲基化。该蛋白定位于细胞质和细胞核,其表达受发育调节。

具有遗传风险的基因介绍SDHC2基因

这个基因编码四个核编码亚单位之一,包括琥珀酸脱氢酶,也被称为线粒体复合物ii,一个三羧酸循环和线粒体有氧呼吸链的关键酶复合物。编码的蛋白质是两个完整的膜蛋白之一,它们将复合物的其他亚单位(形成催化核心)固定在线粒体内膜上。这个基因在不同染色体上有几个相关的假基因。这个基因的突变与副神经节瘤有关。另外

中外合作发现与基因沉默有关的基因

中外科学家发现与基因"沉默"有关的特殊基因    奥地利格雷戈尔·门德尔植物分子生物学研究所日前宣布,一个包括该研究所、中国同济大学、美国加利福尼亚大学等机构科学家在内的国际科研小组发现了一种特殊基因,没有它,植物细胞内其他一些基因就只能保持沉默。    最新一期英国《自然》杂志网络版发表

《转基因之争》书评:转基因食物安全吗?

前言:人类历史上有哪次技术革命经历了最广泛持久和最激烈的争论?中国科学院动物研究所研究员沈孝宙编写的《转基因之争》回答了这个问题。 安全性是人们最关心的问题 人类的生存、发展和进化离不开食物。任何一种食物,无论是传统的还是转基因的,健康安全是首要问题。没有安全,其他皆无意义。 但是,人类对食物

新“基因剪刀”可切除免疫缺陷病毒基因

  据在线发表于《自然·通信》上的一项最新研究,美国科学家已成功从非人类灵长类动物的基因组中编辑了SIV(猴免疫缺陷病毒,与人类免疫缺陷病毒HIV密切相关,即艾滋病的病因)。这一突破是在艾滋病病毒研究方面迈出的重要一步,将使研究人员比以往任何时候都更接近于开发出治疗人类HIV感染的方法。 主持研

具有遗传风险的基因介绍RB1基因

RB1基因编码的蛋白是细胞周期的负调控因子,是第一个发现的抑癌基因,因为该基因与视网膜母细胞瘤的发生相关,因此被命名为视网膜母细胞瘤基因(Retinoblastomal,RB1)。RB1具有维持染色质结构稳定的作用,处于去磷酸化形式的RB1可以与转录因子E2F1结合,作为细胞周期的负调控因子,阻止细

具有遗传风险的基因介绍GREM1基因

这个基因编码bmp(骨形态发生蛋白)拮抗剂家族的一个成员。和BMP一样,BMP拮抗剂含有胱氨酸结,通常形成同型和异型二聚体。bmp拮抗剂的c an(cerberus和dan)亚家族是该基因所属的一个亚家族,其特征是具有八元环的c-末端胱氨酸结。由该基因编码的分泌糖基化蛋白的拮抗作用可能与其与bmp蛋

与肾癌相关的基因突变类型TERT基因

端粒酶是一种核糖核蛋白聚合酶,通过添加端粒重复序列TTagg来维持端粒末端。这种酶由一种具有逆转录酶活性的蛋白质成分(由该基因编码)和一种作为端粒重复模板的RNA成分组成。端粒酶的表达在细胞衰老中起作用,因为它通常在出生后的体细胞中被抑制,导致端粒逐渐缩短。体细胞端粒酶表达的放松调控可能与肿瘤发生有

与肾癌相关的基因突变类型GNAS基因

GNAS作为一个重要的信号转导蛋白,主要功能是在G蛋白偶联受体信号转导途径中,激活腺苷酸环化酶,导致cAMP水平的升高,参与调控细胞生长和细胞分裂。

与食管癌相关的突变基因​GNAS基因

GNAS作为一个重要的信号转导蛋白,主要功能是在G蛋白偶联受体信号转导途径中,激活腺苷酸环化酶,导致cAMP水平的升高,参与调控细胞生长和细胞分裂。

与食管癌相关的突变基因​AURKA基因

该基因编码的蛋白是一种细胞周期调节激酶,在染色体分离过程中似乎与纺锤体极的微管形成和/或稳定有关。编码蛋白存在于有丝分裂的间期细胞的中心体和纺锤体两极。该基因可能在肿瘤的发展和进展中起作用。在1号染色体上发现一个经过加工的假基因,在10号染色体上发现一个未经加工的假基因。已发现该基因的多个编码相同蛋

与食管癌相关的突变基因​MYC基因

该基因编码的蛋白质是一种多功能的核磷蛋白,在细胞周期进展、凋亡和细胞转化中起到作用。作为调节特定靶基因转录的转录因子发挥作用。这种基因的突变、过度表达、重排和易位与多种造血肿瘤、白血病和淋巴瘤,包括伯基特淋巴瘤有关。有证据表明,来自上游、非aug(cug)帧和下游aug起始位点的选择性翻译起始导致两

与食管癌相关的突变基因​AXL基因

酪氨酸蛋白激酶受体UFO是一种人类由AXL基因编码的酶。 该基因最初被命名为UFO,因为这种蛋白质的功能不明。 然而,自其发现以来的几年中,对AXL表达谱和机制的研究使其成为一个越来越有吸引力的目标,特别是对于癌症治疗。 近年来,AXL已成为癌症细胞免疫逃逸和耐药性的关键促进因素,导致侵袭性和转移性

正相关基因-BRCA1基因的临床解释

该基因编码一种在维持基因组稳定性中起作用的核磷蛋白,并作为肿瘤抑制因子发挥作用。编码蛋白与其他肿瘤抑制因子、DNA损伤传感器和信号转导子结合形成一个大的多亚单位蛋白复合物,称为BRCA1相关基因组监测复合物(BASC)。该基因产物与RNA聚合酶Ⅱ结合,并通过C端域与组蛋白脱乙酰基酶复合物相互作用。因

正相关基因BRCA2基因的临床解释

BRCA1和BRCA2基因的遗传突变会增加患乳腺癌或卵巢癌的终生风险。BRCA1和BRCA2都参与了基因组稳定性的维持,特别是双链DNA修复的同源重组途径。BRCA2蛋白含有一个70 a a基序的几个拷贝,称为BRC基序,这些基序介导了与在DNA修复中起作用的RAD51重组酶的结合。BRCA2被认为

正相关基因MSH2基因的临床解释

该基因座在遗传性非息肉性结肠癌(HNPCC)中经常发生突变。克隆时,发现它是大肠杆菌错配修复基因muts的人类同源物,与在hnpcc中发现的微卫星序列(rer+表型)的特征性变化一致。两个编码不同亚型的转录变体已经被发现。

正相关基因PBRM1基因的临床解释

这个位点编码一个ATP依赖染色质重塑复合物的亚单位。编码蛋白被鉴定为核激素受体激活配体依赖性转录所必需的复合物的组成部分。该位点的突变与原发性透明细胞肾细胞癌有关。

正相关基因POLD1基因的临床解释

该基因编码DNA聚合酶δ的125kDa催化亚单位。DNA聚合酶三角洲既具有聚合酶活性,又具有3-5'外切酶活性,在DNA复制和修复中起着关键作用。另外还观察到该基因的剪接转录变体,该基因的假基因位于6号染色体的长臂上。

正相关基因PALB2基因的临床解释

这个基因编码一种可能抑制肿瘤的蛋白质。这种蛋白与乳腺癌2早发蛋白(BRCA2)在核病灶结合并与之共定位,可能允许BRCA2稳定的核内定位和积累。

负相关基因JAK2基因的临床解释

JAK2基因所编码的蛋白是一种非受体酪氨酸激酶,是Janus激酶家族的一员,该家族包括JAK1、JAK2、JAK3和TYK2。JAK/STAT是一条非常重要的信号通路,许多细胞因子如IFN、IL-2等和生长因子如EGF、CSF等都通过该信号传导途径诱导细胞的增殖、分化和凋亡。JAK与多种肿瘤尤其是血