邻位连接技术PLA在蛋白蛋白相互作用,蛋白磷酸化修饰..

邻位连接技术PLA在蛋白-蛋白相互作用,蛋白磷酸化修饰的应用摘要 邻位连接技术(proximityligationassay,PLA),是新研发的一项高灵敏度的蛋白质体外分析技术。该方法利用一对邻位探针(proximityprobes)对靶分子进行双识别,通过连接反应产生可扩增的检测信号,以实时PCR进行放大和检测,将对蛋白质的检测转变成为对DNA的检测,实现痕量蛋白的分析,具有极高的检测灵敏度和特异性。综述了邻位连接技术的原理、研究进展以及该技术在蛋白质分析及疾病诊断领域的初步应用。关键词 邻位连接技术 邻位探针 蛋白质分析 疾病诊断中图分类号 Q51收稿日期:20090210 修回日期:20090413 通讯作者,电子信箱:bzshenzq@sina.com邻位连接技术是近几年建立的一种可以用于研究蛋白质的定量、定位、相互作用、修饰以及功能的新DNA连接技术[1~3]。该技术通过一对邻位探针将特异性蛋白质检测转换......阅读全文

蛋白质磷酸化的测定实验

代谢标记 X射线片放射自显影检测32P标记的蛋白质             实验材料 细胞

相互作用蛋白鉴定实验

鉴定诱饵蛋白(半乳糖苷酶) 鉴定诱饵蛋白(LacZ 的活性分析) 相互作用蛋白捕获             实验方法原理 捕捉相互作用蛋白的第一步是构建能够表达

相互作用蛋白鉴定实验

实验方法原理 捕捉相互作用蛋白的第一步是构建能够表达 LexA 与目的蛋白的融合体的质粒。这种质粒转化到包含 LEU2 和lacZ 报道基因的报道酵母株中,并要行一系列的对照实验来鉴定所构建的诱饵蛋白是否适用,是否需要修饰,或是否应改变酵母菌报道条件。这些对照实验实现了诱饵蛋白在酵母菌中作为

蛋白质相互作用

Interaction Trap/Trap Two-Hybrid System·         Yeast Two-Hybrid System (Finley Lab)This is one of the most comprehensive and detailed guide to yeast

使用Azurespot分析软件定量非磷酸化与磷酸化蛋白

  在上期我们回顾了使用多重来成像磷酸化蛋白的技巧,在这部分中,我们将介绍使用Azurespot分析软件进行定量。   背景去除   背景扣除对于有效定量是必不可少的。 例如,AzureSpot有五个自动后台选项和三个手动选项。    > 如果背景不均匀,请使用 Rolling Bal

使用Azurespot分析软件定量非磷酸化与磷酸化蛋白

  背景去除背景扣除对于有效定量是必不可少的。 例如,AzureSpot有五个自动后台选项和三个手动选项。> 如果背景不均匀,请使用 Rolling Ball。 类似指定半径的圆盘在泳道轮廓下“滚动”,对信号求平均,从而产生平滑小的变化。 半径越大,滚动越平滑。> 如果轮廓的末端与轮廓的其余部分没有

磷酸化蛋白质组鉴定技术路线及经典案例介绍

  今天,小编跟您聊聊磷酸化蛋白质组鉴定!    蛋白质翻译后修饰(PTMs)几乎参与了细胞所有正常生命活动的过程,并发挥十分重要的调控作用。蛋白修饰已经成为国际上蛋白质研究的一个极其重要的领域,目前研究比较成熟的有磷酸化、乙酰化、糖基化、泛素化等。    蛋白质磷酸化是生物体中最常见、最重要的

植物磷酸化蛋白质组学技术研发方面获进展

  蛋白质磷酸化是在激酶催化下将磷酸基团转移到底物蛋白质上的可逆过程,是能够调控蛋白质结构与功能且参与细胞内信号转导的重要翻译后修饰,在植物的生长、发育、环境适应以及作物的产量和品质调控中发挥着重要作用。深度解析磷酸化蛋白质组,是探讨磷酸化如何参与这些生物学过程以及筛选与作物重要农艺性状相关的关键磷

靶向蛋白降解技术:“借刀”清除致病蛋白

人体就像是一台精密的仪器,任何一个零件出现问题,都有可能带来意想不到的麻烦。蛋白质就是其中一类最为重要的“零件”。很多疾病是由细胞内某种蛋白质表达失衡,特别是某种蛋白质过多表达引起的。科学家想到:如果消灭掉这些不该出现的“坏”蛋白质,疾病不就迎刃而解了吗?于是,靶向蛋白降解技术应运而生,作为一颗冉冉

Nat-Met:新技术可揭示蛋白间相互作用

 加拿大多伦多大学研究人员开发出一种研究人体蛋白质的新技术。该技术可追踪膜蛋白与其他蛋白之间的相互作用         据报道,加拿大多伦多大学研究人员开发出一种研究人体蛋白质的新技术。该技术可追踪膜蛋白与其他蛋白之间的相互作用。   膜蛋白占人体所有蛋白的约三分之一,有500多种疾病与其失能相关

相互作用蛋白鉴定实验——鉴定诱饵蛋白(LacZ的活性分析)

实验方法原理捕捉相互作用蛋白的第一步是构建能够表达 LexA 与目的蛋白的融合体的质粒。这种质粒转化到包含 LEU2 和lacZ 报道基因的报道酵母株中,并要行一系列的对照实验来鉴定所构建的诱饵蛋白是否适用,是否需要修饰,或是否应改变酵母菌报道条件。这些对照实验实现了诱饵蛋白在酵母菌中作为一种稳定蛋

组蛋白修饰基因通路MEN1基因

这个基因编码脑膜,一种与多发性内分泌肿瘤1型综合征相关的假定的肿瘤抑制因子。体外研究表明,脑膜定位于细胞核,具有两种功能性核定位信号,并通过JUND抑制转录激活,但这种蛋白的功能尚不清楚。在Northern blots上检测到两条信息,但未对较大的信息进行描述。选择性剪接导致多个转录变体。

组蛋白修饰基因通路HDAC1基因

多亚基复合物催化的组蛋白乙酰化和脱乙酰化在调节真核基因表达中起关键作用。 该基因编码的蛋白质属于组蛋白脱乙酰基酶/ acuc / apha家族,是组蛋白脱乙酰基酶复合物的组成部分。 它还与视网膜母细胞瘤肿瘤抑制蛋白相互作用,这种复合物是控制细胞增殖和分化的关键因素。 它与转移相关蛋白2一起使p53脱

组蛋白修饰基因通路KDM5A基因

该基因编码Jumonji,富含AT的相互作用域1(JARID1)组蛋白脱甲基酶蛋白家族的成员。 编码的蛋白质通过组蛋白编码使组蛋白H3的赖氨酸4脱甲基,从而在基因调控中发挥作用。 编码的蛋白质与许多其他蛋白质(包括成视网膜细胞瘤蛋白质)相互作用,并与Hox基因和细胞因子的转录调控有关。 该基因可能在

组蛋白修饰基因通路BRD4基因

该基因编码的蛋白质与小鼠蛋白MCAP(有丝分裂过程中与染色体相关)和人类Ring3蛋白(丝氨酸/苏氨酸激酶)同源。每一种蛋白质都包含两个溴域,一个保守的序列基序,可能参与染色质靶向。该基因被认为是T(15;19)易位的19号染色体靶基因(q13;p13.1),它定义了年轻人的上呼吸道癌。已经描述了两

组蛋白修饰基因通路HDAC2基因

该基因产物属于组蛋白脱乙酰基酶家族。组蛋白脱乙酰基酶通过形成大的多蛋白复合物起作用,并负责核心组蛋白(H2A、H2B、H3和H4)N端赖氨酸残基的脱乙酰化。这种蛋白通过与许多不同的蛋白质结合形成转录抑制复合物,包括哺乳动物锌指转录因子YY1。因此,它在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着重要作用。

组蛋白甲基化修饰研究再获突破

  日前,复旦大学徐彦辉课题组在组蛋白甲基化修饰研究领域获得新进展,相关成果发布在《分子细胞》上,该项研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助。  组蛋白甲基化修饰是一种非常重要的表观遗传修饰,参与调节异染色质形成、X染色体失活、基因印记及DNA的损伤修复等多种生命过程。关于组蛋白去甲基化酶的研究是

组蛋白修饰基因通路KMT2A基因

该基因编码一个转录辅激活子,在早期发育和造血过程中起到调节基因表达的重要作用。编码蛋白包含多个保守功能域。其中一个域,即集合域,负责其组蛋白H3赖氨酸4(H3K4)甲基转移酶活性,介导与表观遗传转录激活相关的染色质修饰。这种蛋白由酶Taspase 1加工成两个片段,MLL-C和MLL-N。这些片段重

氧化修饰低密度脂蛋白测定的概述

  氧化修饰低密度脂蛋白(OX-LDL)是低密度脂蛋白(LDL)内大量多价不饱和脂肪酸在过量自由基及其他致氧因素作用下发生过氧化反应,最后产生丙二醛(MDA),MDA与LDL载脂蛋白B(APOB)中的赖氨酸残基结合发生化学修饰的产物。大量的基础及临床研究资料证明,OX-LDL引发的一系列病理生理改变

组蛋白修饰基因通路HDAC2基因

该基因产物属于组蛋白脱乙酰基酶家族。组蛋白脱乙酰基酶通过形成大的多蛋白复合物起作用,并负责核心组蛋白(H2A、H2B、H3和H4)N端赖氨酸残基的脱乙酰化。这种蛋白通过与许多不同的蛋白质结合形成转录抑制复合物,包括哺乳动物锌指转录因子YY1。因此,它在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着重要作用。

组蛋白修饰基因通路MEN1-基因

这个基因编码脑膜,一种与多发性内分泌肿瘤1型综合征相关的假定的肿瘤抑制因子。体外研究表明,脑膜定位于细胞核,具有两种功能性核定位信号,并通过JUND抑制转录激活,但这种蛋白的功能尚不清楚。在Northern blots上检测到两条信息,但未对较大的信息进行描述。选择性剪接导致多个转录变体。

阿尔茨海默症与蛋白修饰

  阿尔茨海默症(Alzheimer's disease,简称AD)俗称老年痴呆症,是一种中枢神经系统退行性疾病,引发患者的认知障碍和记忆能力损害,导致患者日益恶化的生活能力减退和死亡。已故的美国前总统里根,英国的前首相撒切尔夫人等名人均受此病困扰和折磨。  AD的主要病理特征为脑内分布有大量的β-

组蛋白修饰基因通路EP300基因

该基因编码腺病毒E1A相关的细胞p300转录辅激活蛋白。作为组蛋白乙酰转移酶,通过染色质重塑调节转录,在细胞增殖和分化过程中起重要作用。通过与磷酸化CREB蛋白特异性结合来介导cAMP基因调控。该基因也被鉴定为HIF1A(缺氧诱导因子1α)的共激活物,因此在缺氧诱导基因如VEGF的刺激中起到作用。这

组蛋白修饰基因通路CHD4基因

该基因的产物属于SNF2 / RAD54解旋酶家族。 它代表核小体重塑和脱乙酰基酶复合物的主要成分,并且在表观遗传转录抑制中起重要作用。 皮肌炎患者会产生针对这种蛋白质的抗体。 该基因的体细胞突变与浆膜性子宫内膜肿瘤有关。 选择性剪接导致编码不同同工型的多个转录变体。

有证据了!更“经济”的蛋白修饰机制

  费力不讨好的事情,哪个“人”也不会干。  可是,人的细胞里却在天天上演出大力办小事的戏码,这种不符合常理的现象让生物学家百思不得其解。  3月26日,《自然-结构与分子生物学》在线发表了中国农业科学院哈尔滨兽医研究所基础免疫创新团队贾洪林课题组同日本东京大学教授Noboru Mizushima,

德国院士Cell获蛋白修饰新发现

  来自德国马普生物化学研究院的研究人员以DNA双链断裂修复作为例,解析了类泛素蛋白SUMO的作用新机制――SUMO化修饰过程靶向的是一组蛋白,而负责特异性修饰的则是局部修饰酶和高特异性启动过程。这一相关成果公布在Cell杂志上。   领导这一研究的是德国马普生物化学研究所分子细胞生物学系主任St

组蛋白修饰基因通路TAF1基因

rna聚合酶ii启动转录需要70多种多肽的活性。协调这些活动的蛋白质是基础转录因子tfiid,它与核心启动子结合以正确定位聚合酶,充当组装其余转录复合物的支架,并充当调控信号的通道。tfiid由tata结合蛋白(tbp)和一组进化上保守的蛋白质(tbp相关因子或taf)组成。tafs可能参与基础转录

关于组蛋白的其他修饰方式的介绍

  相对而言,组蛋白的甲基化修饰方式是最稳定的,所以最适合作为稳定的表观遗传信息。而乙酰化修饰具有较高的动态,另外还有其他不稳定的修饰方式,如磷酸化、腺苷酸化、泛素化、ADP核糖基化等等。这些修饰更为灵活的影响染色质的结构与功能,通过多种修饰方式的组合发挥其调控功能。所以有人称这些能被专识别的修饰信

组蛋白修饰基因通路KDM6A基因

该基因位于X染色体上,是编码四肽重复序列(TPR)蛋白的Y连锁基因的相应位点。该基因的编码蛋白包含一个JMJC结构域,并催化三/二甲基化组蛋白H3的去甲基化。已发现该基因的多个选择性剪接转录变体。

973项目:蛋白修饰促癌作用

  细胞凋亡是维持机体组织平衡的重要生物学过程,肿瘤细胞的抗凋亡现象是目前癌症治疗领域中的主要障碍。在细胞凋亡过程中,caspase家族扮演着关键角色,其中 caspase-8作为凋亡起始因子显得尤为重要。HECTD3是近年来发现的一个新的E3泛素连接酶。中科院昆明动物研究所陈策实研究员课题组前