RealTimePCR—CycleavePCR法原理

■ CycleavePCR法原理 CycleavePCR法是由RNA和DNA构成的杂合Cycling 探针与RNase H组合使用的高灵敏度检测方法,能够高效率地检出目的基因。Cycling 探针内部夹有RNA部分,5′端标记荧光物质,3′端标记淬灭物质,当探针处于完整状态时,由于荧光淬灭作用抑制荧光物质发出荧光,但当探针与扩增产物中的互补序列杂交后,RNase H在RNA部分将探针切断,淬灭抑制作用解除,荧光物质发出荧光,通过测定荧光强度,能够实时监测扩增产物量。如果探针的RNA部分或与RNA部分相邻的2 ~ 3个碱基与模板不互补,RNase H就不能在RNA部分将探针切断,所以该检出方法是一种即使一碱基不同也能识别的高特异性检出方法,特别适合于SNP解析。 Cycling 探针碱基数少,一般为十二个碱基左右,荧光报告基团和淬灭基团的距离近,淬灭效果好,荧光背景低,信噪比高。具体原理详见图1:■ 利用C......阅读全文

realtime-PCR中内参基因的CT值

这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

realtime-PCR中内参基因的CT值

这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

realtime-PCR中内参基因的CT值

这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

做real-time-pcr,逆转录引物怎么选择

显然是选random primer更好,其实说明书是有写的啦,原因是RT-PCR逆转录是要得到一个所有的RNA的cDNA库,然后再P出你要的“几个基因”,所以不是每个基因的mRNA都是有polyA的,很多都是没有的,microRNA,piRNA,很多都没有哦,所以如果你用oligo dT引物,就自然

realtime-PCR中内参基因的CT值

这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

Realtime-PCR实验心得和RNA提取心得

并不是所有的实验都可以做real-time的,技术路线要选好当你的基因表达量少或有些不表达具体就是做普通pcr跑胶条带比较弱,不是很亮的情况下个人觉得最好不要选择real,不容易做好,特别是融解曲线用sbgr green染料做的话,引物设计时扩增片断最好小于250bp,太长了不好扩预实验先rt-pc

引物设计原则(Principle-of-realtime-quantiation-PCR-primer-)

1、引物的长度一般为15-30bp,常用的是18-27bp,但不应大于38,因为过长会导致其延伸温度大于74°C,不适于Taq DNA聚合酶进行反应。2、引物序列在模板内应当没有相似性较高,尤其是3’端相似性较高的序列,否则容易导致错配。引物3’端出现3个以上的连续碱基,如GGG或CCC,也会使错误

realtime-PCR中内参基因的CT值

这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

realtime-PCR中内参基因的CT值

这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

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这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

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这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

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这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

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Realtime-PCR-数据导出-——-ABI仪器篇(二)

 •    6. StepOne阈值(Threshold):选中孔板中所有的数值,如下界面选择log、Target对话框•    将每个基因的Tredshold Auto勾选掉,阈值数值调整范围原则在指数增长期。阈值数值调整范围原则在指数增长期,该范围中,曲线斜率相同,ΔCT值不变 •    注意同

realtime-PCR中内参基因的CT值

这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

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real-time-PCR实验为什么要使用内参基因

这个是根据定量PCR算法决定的,如果是相对定量,就需要内参,内参主要是使样品均一化,你做实验的时候,可能提取RNA时所用的样品是相同的,反转录时所用的mRNA的量是相同的,做定量PCR时所加的cDNA量也是相同的。但是你的样品是新长的部分,还是老的部分?反转录时是加相同的体积还是相同打质量,这些对结

realtime-PCR中内参基因的CT值

这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

realtime-PCR中内参基因的CT值

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realtime-PCR负对照有信号问题分析

引物设计不够优化:应避免引物二聚体和发夹结构的出现。 引物浓度不佳:适当降低引物的浓度,并注意上下游引物的浓度配比。 镁离子浓度过高:适当降低镁离子浓度,或选择更合适的 mix 试剂盒。 模板有基因组的污染:RNA 提取过程中避免基因组 DNA 的引入,或通过引物设计避免非特异扩增。

Realtime-PCR-数据导出-——-ABI仪器篇(一)

1. Real-time PCR数据:Real-time PCR完成后,所有数据并非可以直接导出,由于每一次实验的情况都不相同,仪器的很多默认设定都会对最终数据结果造成重大偏差,所以在完成PCR过程后,需要人为对实验结果进行条件设置,才能提取到科学有效的实验结果,进而完成对实验结果的分析和判断。

Real-time-PCR-mRNA-定量实验路线选择FQ

  本期专文要来跟大家讨论的话题是核糖核酸(RNA)的萃取,看到这里各位心中可能已经起了疑问: RNA 萃取不是很简单吗?只要照着标准步骤操作,加一加试剂就完成了,有必要大费周章特地开篇幅来谈这件事吗?其实越简单的东西遇到困难时就越难解,各位看倌就请耐着性子,听我们娓娓道来。   Lab 的经验和

Real-time-PCR-mRNA-定量实验路线选择FQ

问题一:Real time PCR mRNA的相对定量和绝对定量的选择;测定mRNA, 一般采用相对定量,因为绝对定量,标准品的制备和定量是有难度的,具体可以参考这篇文献:http://www.biotnt.com/news/news_105.htm;“Analysis of Relative Ge

食物过敏原的检测和定量方法即时(realtime)PCR法

  即时PCR方法与其他DNA定量方法相比,即时PCR方法需要昂贵的实验室设备,但准确度高,劳动强度低。即时PCR方法不用凝胶制品而使用特定目标的低聚核苷酸探子,因而实现即时分析。

Realtime同电泳检测产物的PCR有何优势?

 Real-time qPCR通过荧光信号在每个反应循环终点检测,反应指数增长期,可以真实监测模板起始量,线性范围可达5——7个数量级;而终点法重复性不佳、线性范围较窄,且产物电泳检测受限于片段大小和凝胶分辨率、胶染料灵敏度等因素,线性范围在100-fold左右。

RealTime-PCR-(qPCR)常见问题及解决方案

Real Time PCR(qPCR),即实时荧光定量核酸扩增检测系统,是一种利用荧光染剂检测每次PCR循环后产物总量的方法技术,是常规PCR的衍生反应。主要是通过荧光信号的变化实时监测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化,通过ct值和标准曲线的关系对起始模板进行定量分析。因其具有灵敏、特异、

做-realtime-PCR之前,你应该如何着手设计引物

正在着手做 real-time PCR 的朋友们,我想最开始肯定要考虑引物设计的问题。看完下面的文字,我保证你得到想要的引物设计方法和引物序列。第一步:拿到你所要研究的基因的序列。不要告诉我你不会找序列。如果真的不会,请参考丁香园内其他版块,如NCBI使用,序列查找等。第二步:确定你想用哪种方法。T

realtime-PCR复孔间的重复性差怎么办

学习做Realtime PCR, 实验结果是出来了,得到的内参、目的基因的Ct 值在15-25 之间,熔 融曲线基本上也是单峰,但不太会处理这个结果,对着数据发愁.不同的处理方法得到不 同的结果. 做的是相对定量,SYBR Green, 选用2^(-△ △ Ct)法 内参基因:对照。

无需ROX校准的Azure-Cielo™-RealTime-PCR光学系统的应用

ROX是一种广泛使用的惰性荧光染料,通常添加到qPCR反应液中以校正荧光信号。然而,随着荧光技术在仪器中的发展,比如在Azure Cielo™实时荧光定量PCR系统,为了标准化而单独使用染料的步骤已不再需要。当实时荧光定量PCR系统首次引入市场时,许多产品使用固定光源和检测系统对96孔整板进行同

Realtime-PCR实验注意事项(防RNA酶污染和常用RNA酶抑制...3

DEPC处理方法如下:1.DEPC处理(1)DEPC水:100ml超纯水加入0.2ml DEPC,充分混匀,高压灭菌。(2)Tip头(枪头)、EP管等在提RNA过程中及做RT时接触RNA的器材(包括1ml、200μl、20μl Tip头;EP管和PCR反应管等):用0.1%的DEPC水(1000 m