Antpedia LOGO WIKI资讯

空间转录组学开启生命科学基因研究的3D模式

近来单细胞组学研究的发展使生命科学研究步入更加微观的层面。对单个细胞基因功能的了解不仅刷新了我们对组成组织的细胞类型的发现,也让我们对组织中的细胞功能和互作机制有了全新认识。但是,需要将新鲜组织进行单细胞解离,需要足够活性的细胞进行实验,这些要求使得很多研究在一开始就被拒之门外。另外,虽然通过数据还原,结合已有认知可以大概推断出来不同的细胞类群在原有组织中的情况。但真实的组成我们不能清晰描绘。因此,面对这样的现状,有没有更好的解决方案呢?当二代测序近乎完胜基因芯片时,谁也不会想到,芯片会有一个华丽转身,而这次,基因芯片将为二代测序的拓展研究发挥决定性的作用,这就是空间转录组测序研究的横空出世--10x Genomics Visium空间基因表达解决方案。 空间转录组测序以冰冻切片为材料,解决了细胞解离和细胞活性要求的限制,也将样本取下后到单细胞测序建库留有足够的时间。通过将冰冻切片进行组织染色和芯片的细胞捕获,实现了同......阅读全文

空间转录组学开启生命科学基因研究的3D模式

近来单细胞组学研究的发展使生命科学研究步入更加微观的层面。对单个细胞基因功能的了解不仅刷新了我们对组成组织的细胞类型的发现,也让我们对组织中的细胞功能和互作机制有了全新认识。但是,需要将新鲜组织进行单细胞解离,需要足够活性的细胞进行实验,这些要求使得很多研究在一开始就被拒之门外。另外,虽然通过数据

空间转录组学开启生命科学基因研究的3D模式

  近来单细胞组学研究的发展使生命科学研究步入更加微观的层面。对单个细胞基因功能的了解不仅刷新了我们对组成组织的细胞类型的发现,也让我们对组织中的细胞功能和互作机制有了全新认识。但是,需要将新鲜组织进行单细胞解离,需要足够活性的细胞进行实验,这些要求使得很多研究在一开始就被拒之门外。另外,虽然通过数

新产品前瞻 空间转录组学开启生命科学基因研究的3D模式

  近来单细胞组学研究的发展使生命科学研究步入更加微观的层面。对单个细胞基因功能的了解不仅刷新了我们对组成组织的细胞类型的发现,也让我们对组织中的细胞功能和互作机制有了全新认识。但是,需要将新鲜组织进行单细胞解离,需要足够活性的细胞进行实验,这些要求使得很多研究在一开始就被拒之门外。另外,虽然通过数

空间转录组学研究案例简析

01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1]影响因子:11.878发表时间:2018.06发表期刊:Nat Commun肿瘤内异质性是当今癌症治疗中最大的挑战之一。在这里,研究人员使用空间转录组学(ST)技术研究整个多灶性前列腺癌的全组织基因表达异质性。利用一种新的去卷积方法,分析12个区域的近6

前沿:空间转录组学研究案例简析

  上一期,我们介绍了空间转录组测序产品,对于它的优势和特点进行了总结。这么一款优秀产品,用起来到底好不好使呢?我们从现有在疾病研究中发表文章略窥一二。   01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1]   影响因子:11.878   发表时间:2018.06   发

前沿:空间转录组学研究案例简析

  上一期,我们介绍了空间转录组测序产品,对于它的优势和特点进行了总结。这么一款优秀产品,用起来到底好不好使呢?我们从现有在疾病研究中发表文章略窥一二。   01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1]   影响因子:11.878   发表时间:2018.06   发表期刊:Nat

2018年新技术:空间转录组学技术

  ——也许不久的将来,定位组织中的基因表达就会成为一种常规技术了。  对于基因表达研究来说,空间一直都是具有挑战性的前沿研究领域。但是随着越来越多的研究人员获得了技术进展,这已经不再是令人望而生畏的领域了。这些方法的多样性和创造性使其成为一个值得关注的技术方向。  空间基因表达对于理解组织中细胞的

掀开空间转录组学的面纱:可视化观察组织中的基因表达

  在一项新的研究中,来自瑞典卡罗琳斯卡研究所和皇家理工学院等机构的研究人员开发出一种新的被称作空间转录组学(spatial transcriptomics)的高分辨率方法研究一种组织中哪些基因是有活性的。这种方法能够被用于所有类型的组织中,而且在临床前研究和癌症诊断中是有价值的。相关研究结果发表在

基因组所等RNA甲基化表观转录组学研究获进展

  2014年1月,中国科学院北京基因组研究所基因组变异与精准生物医学实验室“百人计划”研究员杨运桂研究组,与中国科学院动物研究所“百人计划”研究员刘峰研究组合作开展的“m6A甲基转移酶复合物鉴定”研究,发现了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)

空间转录组和单细胞转录组测序联合应用的典型案例

单细胞转录组测序技术的如火如荼,伴随着空间转录组测序技术的蓬勃发展,可以看到,在现有的高通量检测技术领域,这两种技术已为科学研究的发展提供了前所未有的技术支撑。从2019年单细胞多组学被评为《Nature Methods》年度技术进展,到2020年空间转录组技术也被评为年度技术进展,相信在接