20分文章中的RNA甲基化,热度与实力并存
近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用,表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》(影响因子:23.394)。 研究背景: 每一年,“Nature Methods”都会对过去一年中推动生物学发展的技术方法做出总结,并评选出当年影响力最大的技术。2016年,表观转录组分析(Epitranscriptome analysis)荣膺Nature Methods年度生命科学技术。Epitranscriptome广义的指添加到核糖核苷酸上的一切修饰,并引起机体相关表型变化的现象。其中,RNA甲基化研究是表观转录组学一面大旗,在世界引起了新的科研热潮。N6-甲基腺苷(m6A)是真核细胞信使RNA(messenger RNAs,mR......阅读全文
m6A“RNA甲基化”研究汇总—病毒篇
RNA甲基化领域是当前最耀眼的国际科研明星,也是国自然申请的大热点;究其原因,是因为最近一两年,RNA甲基化的功能与分子机制方面取得了巨大的进展。RNA甲基化已被证实在癌症发生发展,病毒感染,神经发育,干细胞分化等过程中发挥着关键作用。今天,我们承接上一期的癌症篇,为您带来病毒领域的RNA甲基化研究
拟南芥RNA核糖甲基化修饰研究方面获进展
3月30日,中国科学院生物物理研究所研究员叶克穷课题组、北京大学现代农学院博士王玉秋和中科院遗传与发育研究所研究员李家洋课题组合作在Nucleic Acids Research上发表了题为Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis tha
C/D-RNA蛋白质复合物催化RNA核糖甲基化的结构机理
上海光源用户研究发现C/D RNA蛋白质复合物催化RNA核糖甲基化的结构机理 1月27日,北京生命科学研究所叶克穷实验室在《自然》杂志发表了题为Structural basis for site-specific ribose methylation by box C/D RNA
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
云序生物独家首发m5C-RNA甲基化测序
m5C RNA甲基化简介 通过分析近几年的国自然立项,可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势:特别是从2015年的5项到2017年的25项,项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇,可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段,多篇文章荣登CNS级别期刊
分子细胞卓越中心发表关于环形RNA的综述文章
5月17日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲团队在Cell上,在线发表了题为Circular RNAs: characterization, cellular roles and applications的综述论文。该论文系统梳理了针对环形RNA研究的生物学技术手段,总结了其以非编码RN
小儿肾上腺皮质与髓质增生并存综合征的简介
小儿肾上腺皮质与髓质增生并存综合征是由肾上腺皮质与髓质同时发生腺瘤引起,也可由嗜铬瘤组织分泌ACTH(促肾上腺皮质激素)导致肾上腺皮质增生,从而引起库欣综合征,即异位ACTH嗜铬细胞瘤。
舌尖上的“一带一路”挑战与机遇并存
丝绸之路经济带为亚欧陆路经济带,从东南亚、东北亚国家通向欧洲,形成欧亚大陆经济融合体;21世纪海上丝绸之路通过海洋,联通欧亚非三个大陆。“一带一路”战略最终形成一个陆地和海上经济圈的闭环。 “一带一路”陆路集合了我国的西部欠发达地区,这些地区有着丰富的农业资源和相对清洁的土地资源;而海路则集合
揭示eccDNA新功能—驱动神经母细胞瘤基因组重排
在刚刚过去不到一个月的时间,染色体外环状DNA(eccDNA)重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊,这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖,吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增,极大地促进肿瘤
云序生物最新“RNA-甲基化”研究汇总拟南芥篇
关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期,
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
美丽与实力兼备,科研“女团”立功“离子液体”
二氧化碳的化学转化作为一种合理利用碳资源、实现碳循环的重要途径,受到全球科学家的高度关注。在化学家看来,碳原子与氧原子相连形成的“碳-氧键”能量过高,成为二氧化碳转化的掣肘,也是绿色化学领域的难题之一。 日前,中国科学院化学研究所(以下简称化学所)研究员张建玲等研究人员采用了一种有“离子液体”参
植物所解析RNA甲基化调控果实成熟的作用机制
DNA甲基化(5mC)和RNA甲基化(m6A)是两种重要的核酸修饰,在基因表达调控中发挥重要作用并参与诸多生物学过程。然而,这两种核酸修饰之间是否存在内在关联性却不清楚。近日,中国科学院植物研究所秦国政研究组和田世平研究组合作,揭示了DNA甲基化可通过调节m6A去甲基化酶基因表达的方式影响番茄果
RNA-m6A甲基化修饰研究相关研究的应用
如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行对我们有任何启发的话,那么要数对RNA修饰的研究了,此时研究病毒RNA以及其甲基化修饰等功能,显得比以往任何时候都更加重要。 而这是否意味着要研究病毒RNA本身不同的各种突变体或者表观遗传变化如何使这些病毒更灵活和感染力?还是研究从细胞和组织中收集的R
Nature-Genetics-揭示eccDNA功能—驱动神经母细胞瘤基因组重排
在刚刚过去不到一个月的时间,染色体外环状DNA(eccDNA)重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊,这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖,吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增,极大地促进肿瘤
解锁5分m6A甲基化谱文章新思路
1.构建OSC细胞模型--MG63/DXR作者选择人的OS细胞系--MG63,通过阿霉素DXR诱导,建立了多药耐药性细胞株--MG63 / DXR。并通过分析其特定的细胞表面标志物CD133和CD117 / STRO-1;干细胞相关基因的表达量;皮下注射对裸鼠的致瘤潜力等多个方面数据证明MG
汉邦科技科创板IPO过会:机遇与挑战并存
《科创板日报》2月22日讯,科创板在今年迎来了首家IPO过会企业——汉邦科技。这一消息在资本市场引起了广泛关注,也为其在科学仪器领域的发展开启了新的篇章。一、过会详情及募资规划2月21日,上交所官网披露的信息显示,汉邦科技的科创板IPO已顺利过会。作为一家专注于色谱装备、耗材及应用技术的企业,汉邦科
加拿大年度科学政策会议乐观与疑虑并存
2012年加拿大国旗在渥太华一个水幕上的投影 近日,加拿大科学家和政策专家共聚一堂,参加总理科学政策会议。这是新自由党政府执政后的首次总理科学政策会议,此前的保守党政府曾招致很多科学家的强烈谴责,因为其封锁科学家的言论、关闭科学顾问系统以及打乱优先支持的科学项目。尽管当前很多科学家在大选之后
水利部部长:我国水资源短缺与浪费并存
十一届全国人大常委会第二十六次会议4月25日举行第二次全体会议。水利部部长陈雷向大会报告了农田水利建设工作情况。目前,我国农业用水方式粗放,水资源利用效率效益不高,一些地方还存在大水漫灌现象,水资源不足与灌溉用水浪费并存。我国农田灌溉水有效利用系数远低于0.7—0.8的世界先进水平;水分生产率(
心血管病与心理疾病常并存
据统计,心内科门诊患者40%以上合并心理问题;抑郁患者与非抑郁患者相比,心血管疾病死亡率增加1.6倍。在近日举行的中国医师协会精神科医师分会第七届年会上,与会专家用上述数据说明,合并心理疾病和心血管疾病的患者在临床并不少见,医务人员及公众应加强对“双心”疾病的认识,提高诊疗效果。
云序超微量MeRIP测序技术在m6A甲基化文章发表的应用2
3) m6A修饰与基因表达联合分析通过m6A-MeRIP-seq和RNA-seq联合分析,文章展示了m6A修饰水平与基因表达水平间的关系,统计发现表达高的基因分组中,受m6A修饰的基因比例也更高。4)甲基化相关酶的表达通过qPCR检测了两组样品中6个甲基化相关酶的表达,发现在高度近视白内障患者中甲基
揭秘m6A修饰新功能----调控染色质状态和转录活性
文章导读 m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。 2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院
RNA分离与分析实验_分离RNA
实验材料标记细胞试剂、试剂盒乙酸缓冲液仪器、耗材漩涡器实验步骤1. 收获标记细胞。2. 小心处置上清液,用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸缓冲液悬浮细胞沉淀,每 1 ml 压积细胞用 10 ml 缓冲液。3. 于室温用漩涡器振荡裂解细胞。4. 加等体积的水饱和酚,充分混匀,于 60
eRNA与Super-Enhancer-RNA在转录调控中扮演的角色
增强子是真核生物中关键的顺式作用基因调控元件,能有效地促进基因表达。它们可以通过作为转录因子和辅助因子的结合平台来维持转录的精确控制。超级增强子是由一簇典型增强子串联组成的具有更强转录调控能力的顺式元件。而全基因组分析发现增强子和超级增强子可以普遍进行转录,产生eRNA和SE-lncRNA。它们都具
5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分
2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。 云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台,也是客户发表文章最多的RNA甲基化测
m6A文章盘点(二)
是不是甲基化一定发生在mRNA的3’UTR区域才能有重要作用呢?在这篇Nature Communication文章当中的故事则有所不同。上皮间质转换(epithelial-mesenchymal transition)是癌细胞转移的重要步骤,在这一过程当中发现mRNA的m6A水平会有所升高,
表观遗传研究热点:RNA-甲基化(m6A)研究
随着表观遗传学研究的不断深入,组蛋白修饰(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和 DNA 甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现,遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中,遗传信息从 DNA、RNA 流向蛋白。基因组 DNA 和组蛋白上都存在可逆的表观遗
中科院、复旦Nature子刊解析RNA甲基化
在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,并由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。 N6-methyladenosine(m6A)是真
表观遗传研究热点:RNA-甲基化(m6A)研究
随着表观遗传学研究的不断深入,组蛋白修饰(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和 DNA 甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现,遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中,遗传信息从 DNA、RNA 流向蛋白。基因组 DNA 和组蛋白上都存
昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星
m6A RNA甲基化是当前在LncRNA,环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星,到底有多火?摆出数据告诉你! 2019年才过去一半还不到,已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域,不仅文章数量多,高分文章也有许多。据统计,仅2019年上半年就发表了多篇Nature,Cell