高通量测序技术技术的应用及前景

高通量测序技术技术的应用及前景 (作者:生物芯片上海国家工程研究中心 滕晓坤, 肖华胜) 高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变, 一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变, 同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能, 所以又被称为深度测序(deep sequencing). 高通量测序平台的代表是罗氏公司(Roche)的454测序仪(Roch GS FLX sequencer), Illumina公司的Solexa基因组分析仪(Illumina Genome Analyzer)和ABI的SOLiD测序仪(ABI SOLiD se-quencer). 2008年4月Helico BioScience公司的Timothy等人在Science上报道了他们开发的真正的单......阅读全文

时空分辨单细胞测序技术在医疗领域的应用前景

时空分辨单细胞测序技术在医疗领域的应用前景十分广阔,包括但不限于以下几个方面:癌症诊断与治疗早期诊断:更精确地识别癌前病变细胞,在肿瘤形成的早期阶段进行检测。肿瘤分型:确定肿瘤的分子亚型,为个性化治疗提供依据。监测治疗反应:实时跟踪肿瘤细胞在治疗过程中的变化,评估治疗效果。发现转移灶:明确肿瘤细胞的

单细胞测序技术在细胞呼吸研究中的应用前景

单细胞测序技术在细胞呼吸研究中的应用前景非常广阔。未来,它有望帮助我们更深入地理解细胞呼吸的精细调控机制。通过对大量单个细胞的分析,可以揭示不同细胞类型和状态下细胞呼吸的特异性变化,发现新的与细胞呼吸相关的基因和调控网络。在疾病研究方面,单细胞测序能够精确解析病变组织中细胞呼吸异常的细胞亚群,为疾病

高通量测序技术-中的“高通量”-是什么意思

高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。在2000年的时候,3700、MegaBace等仪器上的测序也是高通量测序,是相对手工测序或者跑平板胶来说的。不过到2005年以后,高通

国内首家高通量测序技术创新应用示范中心揭牌

  9月1日,解码(上海)生物医药科技有限公司(以下简称“解码DNA”)和深圳华大智造科技股份有限公司(以下简称“华大智造”)举行合作签约仪式,并正式为国内首家“高通量测序技术创新应用示范中心”揭牌。该中心将基于全球最高日通量的基因测序仪DNBSEQ-T7等国产化测序平台,面向长三角地区的高通量测序

单细胞测序技术在细胞呼吸研究中的应用前景如何?

单细胞测序技术在细胞呼吸研究中具有广阔的应用前景:揭示细胞异质性:细胞呼吸在不同细胞类型和同一类型的不同细胞之间可能存在差异。单细胞测序可以精确地揭示这种异质性,帮助确定哪些细胞群体在细胞呼吸方面具有独特的特征。发现新的细胞亚型:通过分析与细胞呼吸相关基因的表达模式,有可能发现具有特殊呼吸特性的新细

时空分辨单细胞测序技术在临床上的应用前景如何?

时空分辨单细胞测序技术在临床上具有广阔的应用前景:肿瘤诊断和治疗早期诊断:可以检测到肿瘤发生早期的少量异常细胞,提高诊断的敏感性。精确分型:确定肿瘤的分子亚型和异质性,为个性化治疗方案提供依据。治疗监测:实时跟踪肿瘤细胞在治疗过程中的变化,评估治疗效果,及时调整治疗策略。免疫治疗评估分析免疫细胞在肿

高通量测序技术的两大难点

   没有测序的癌症诊断是不完整的,完整的癌症诊断应该包括一系列基于细胞遗传学技术、荧光原位杂交技术、标准分子技术以及NGS的预后与预测性分析。对于早期癌症患者来说,NGS序列分析在多种癌症的筛查技术中具有不容忽视的代表性;而对于晚期癌症患者,大量的侵入性测试往往只能筛查出少数几个药物靶点。  随着

焦磷酸测序技术原理及应用

  焦磷酸测序(Pyrosequencing)技术   焦磷酸测序技术(pyrosequencing)是由Nyren等人于1987年发展起来的一种新型的酶联级联测序技术,焦磷酸测序法适于对已知的短序列的测序分析,其可重复性和精确性能与SangerDNA测序法相媲美,而速度却大大的提高。焦磷酸测

焦磷酸测序技术原理及应用

焦磷酸测序技术(pyrosequencing)是由Nyren等人于1987年发展起来的一种新型的酶联级联测序技术,焦磷酸测序法适于对已知的短序列的测序分析,其可重复性和精确性能与SangerDNA测序法相媲美,而速度却大大的提高。焦磷酸测序技术产品具备同时对大量样品进行测序分析的能力,为大通量、低成

克隆技术的应用前景

  克隆技术已展示出广阔的应用前景,概括起来大致有以下四个方面:  (1)培育优良畜种和生产实验动物;  (2)生产转基因动物;  (3)生产 人胚胎干细胞用于细胞和组织替代疗法;  (4)复制濒危的动物物种,保存和传播动物物种资源。  以下就生产 转基因动物和胚胎干细胞作简要说明。  转基因动物研

单细胞测序这样的高通量技术的优势

单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin

PCR测序技术的应用

PCR测序是对生物遗传信息的最终判定。随着各种基因组计划的开展,PCR测序工作在不断加强和完善,特别是全自动DNA测序仪的开发,为提前完成人类基因组计划奠定了基础。此外,在临床遗传病、传染性疾病和癌症的基因诊断、农业畜牧业的动植物育种、法医鉴定等领域上有广泛的应用前景。过去由于全自动DNA测序的仪器

高通量测序技术研究进展介绍

  第二代测序技术, 又称新一代测序技术, 是相应于以Sanger 测序法为代表的第一代测序技术而得名。第二代测序中3种主流测序技术分别为依次出现的 Roche/454 焦磷酸测序(2005 年)、Illumina/Solexa 聚合酶合成测序(2006 年)和 ABI/SOLiD 连接酶测序(

单细胞分析技术的应用前景

单细胞分析技术具有广阔而令人振奋的应用前景,主要体现在以下几个重要方面:癌症研究与治疗:肿瘤异质性分析:能够揭示肿瘤内部不同细胞的基因表达、突变和细胞周期状态等的差异,帮助理解肿瘤的发生、发展、转移机制以及耐药性的产生。精准治疗:指导个性化的癌症治疗方案,例如确定对特定药物敏感的肿瘤细胞亚群,从而提

单细胞分析技术的应用前景

单细胞分析技术具有广阔而令人振奋的应用前景:在医学领域:疾病的早期诊断:能够在疾病症状出现之前检测到细胞层面的细微变化,实现超早期诊断。例如,在癌症的萌芽阶段,识别出具有恶变倾向的单个细胞,大幅提高患者的生存率。精准医疗:根据患者肿瘤细胞的单细胞特征,为其定制个性化的治疗方案,包括选择最有效的药物和

基因检测技术的应用前景如何?

基因检测技术具有广阔而光明的应用前景,主要体现在以下几个方面:精准医疗:随着对基因与疾病关系的深入了解,基因检测将在疾病的早期诊断、精准治疗和预防策略制定方面发挥越来越关键的作用。通过识别个体的基因变异,能够为患者量身定制更有效的治疗方案,提高治疗效果,降低医疗成本。疾病预防和健康管理:基因检测可以

高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用

  近年来, 新兴的生物技术, 主要包括基因工程、生物工程、发酵工程和酶工程。利用生物技术, 可以通过生物遗传基因的重组,开发出新的优良品种和新的物种; 可以通过新陈代谢作用, 生产出许多有用的新有机物质; 可以通过酶促反应, 大大改善许多现有生产工艺的条件和效率。由于造纸工业的基本原料是生物体(

高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用

在人体肠道中生活着数以万亿的共生菌群,它们的种类繁多,可达上千种,数量也很惊人,是人体细胞总量的10倍以上,迄今为止,仍有80%以上的微生物不为人知。这些肠道微生物和人体存在着互利共生的关系,对于维持人类的健康发挥着重要的作用。它们在肠道中保持着一种动态的平衡,能够合成维生素、帮助人体从食物中吸收

测序技术及测序仪器的比较

自sanger测序技术发明以来,经人类基因组计划的促进,测序技术有了跨越式的发展,以实验方法与实验仪器的改进为标志,测序技术经历了三代的发展,同时测序技术向着高通量测序,单分子测序,低价格测序的方向发展,目前测序技术已成为分子生物学实验中的重要的实验手段。本文主要简单回溯了测序技术的发展历史,介绍了

llumina高通量测序平台的应用

  Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收

llumina高通量测序平台的应用

  Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收

基因测序技术的应用介绍

英国伦敦大学学院和美国罗格斯大学的联合研究团队,将基因测序技术和超级计算机技术相结合,试图探索解决这一命题。研究人员把艾滋病(HIV)蛋白酶分子作为对象,酶在不同人体中形状略有不同,尤其是在蛋白质活动区,在那里酶完成切片并构成了下一个病毒,进而形成特定的病毒基因序列。如果知道了酶的形状,就可以找到相

基因测序技术的主要应用

英国伦敦大学学院和美国罗格斯大学的联合研究团队,将基因测序技术和超级计算机技术相结合,试图探索解决这一命题。研究人员把艾滋病(HIV)蛋白酶分子作为对象,酶在不同人体中形状略有不同,尤其是在蛋白质活动区,在那里酶完成切片并构成了下一个病毒,进而形成特定的病毒基因序列。如果知道了酶的形状,就可以找到相

新一代高通量测序技术SOLiD简介

   目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligation

新一代高通量测序技术SOLiD简介

   目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligation

罗氏454高通量测序平台的特点及应用

Genome Sequencer FLX (GS FLX)系统是罗氏454 公司的第二代测序台,GS FLX的命名正是来源于其在多领域的灵活(flexible)应用。随着该系统性能和应用领域的不断提升和扩展,必将带动整个测序领域的技术发展,对大规模基因序列研究的相关应用领域产生巨大的推动作用。美吉生

高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用(一)

在人体肠道中生活着数以万亿的共生菌群,它们的种类繁多,可达上千种,数量也很惊人,是人体细胞总量的10倍以上,迄今为止,仍有80%以上的微生物不为人知。这些肠道微生物和人体存在着互利共生的关系,对于维持人类的健康发挥着重要的作用。它们在肠道中保持着一种动态的平衡,能够合成维生素、帮助人体从食物中吸收营

高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用(二)

二、肠道菌群与疾病发生之间的关联1.  Gut Microbiota in Human Adults with Type 2 Diabetes Differs from Non-Diabetic Adults——2010《PLoS One》以往文献报道肠道菌群与人类代谢疾病之间存在着某种关联,为了研

高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用(三)

一、饮食、能量摄取、肥胖与肠道菌群之间的关系:1.  A core gut microbiome in obese and lean twins——2009《Nature》——if 36.102.  An obesity-associated gut microbiome with increase

农药残留快速检测技术的应用前景

  大量农药的违规使用已经对环境造成了严重的污染,也正在危及人类的健康,开发农药残留快速检测方法日益受到社会各界的重视。随着人们对环境保护问题关注的不断提高,对食品安全的关注也在逐步提高。新品种的农药不断涌入市场,要求对农药的检测低限越来越低,因此需要更为灵敏、准确、高效的检测技术,来实现提高检测灵