我国研究团队建立人类病毒组多样性变化模型

作为人类微生物菌群的重要组成部分,病毒大量存在于人体口腔、皮肤、肺、胃肠道、血液甚至脑脊液中。记者9日从中科院昆明动物研究所获悉,该所计算生物与医学生态学组利用最新成果,建立了人类病毒组多样性变化模型。 病毒几乎遍布地球的每个角落。在人体中,它们以病毒群落形式存在,这些病毒群落的集合即为人类病毒组。 “与肠道菌群中的细菌相比,病毒数量是细菌的10倍以上,可高达万亿。人类病毒群落包括内源性逆转录病毒、感染人类细胞的真核病毒、感染细菌的噬菌体和感染古菌的病毒。”学科组负责人马占山研究员介绍说,人体病毒群落与宿主间存在协同进化,因而存在着复杂的相互作用。 现有研究发现,人体病毒组与许多疾病间存在着紧密的联系,疾病可能会影响病毒组的多样性及其组成;同时,病毒组的改变也会反过来影响疾病的发病与进程。这些疾病不仅包括如艾滋病、埃博拉出血热和流行性感冒等由病毒感染直接引发的病毒源性疾病,还包括如囊性纤维化、牙周疾病、炎症性肠病等非病......阅读全文

数学模型如何助力人类疾病研究?

  在科学研究的道路上,科学家们常常会开发多种模型来帮助研究,其中数学模型就是研究者们经常使用的一种模型,随着近年来研究的不断深入,就有研究人员开发出新型的数学模型来解析中和抗体和HIV-1之间相互作用的机制,当然除此之外,科学家们还利用数学模型对其它疾病进行了大量研究,本文中,小编盘点了近年来多篇

小鼠模型不能很好模拟人类炎症疾病

  数十年以来,在进行人体试验之前,实验小鼠模型一直被用于确认和测试候选药物,但是一项研究发现这些模型不能准确地代表人类对炎症疾病的响应。   Junhee Seok及其同事研究了创伤、烧伤和来自例如大肠杆菌等细菌的毒素是如何影响病人的遗传应答的。这组作者将观察到的模式与在小鼠模型中观察到的模

乙脑病毒组装奥秘获揭示

中国农业科学院哈尔滨兽医研究所重要人畜共患病与烈性外来病专家团队在乙型脑炎病毒复制周期机制研究方面取得新进展,首次揭示了宿主因子SPCS1参与乙型脑炎病毒组装的奥秘。相关学术成果近日在线发表于国际著名专业期刊《病毒学杂志》上。 流行性乙型脑炎病毒与登革热病毒、西尼罗病毒、寨卡病毒等同属黄病

“折纸DNA”设计控制病毒组装

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504958.shtm 衣壳涂层在不同厚度和形状的结构上的适用性。图片来源:《自然·纳米技术》科技日报北京7月17日电 (记者张梦然)据发表在最新一期《自然·纳米技术》上的一项研究,澳大利亚格里菲斯

生态代谢模型引入pH值-准确预测细菌多样性

土壤生物多样性极其复杂,通常少量土壤中就存在数十亿种生物,包括土壤微生物(细菌、真菌和原生生物)以及土壤动物(线虫)等。明确土壤生物多样性地理分布模式仍是一个巨大的挑战。以前的研究使用定性和图形框架等简单分析方法,仅仅包含少数共存物种或整体系统模型,侧重于突发模式但忽略了其潜在机制。著名生态学家Ja

人类肚脐生物多样性:含有67种不同细菌

你想过这里居住着什么生物吗?研究发现的大部分微生物种类都属于微球菌属(Micrococcus),为放线菌的种类  北京时间11月13日消息,科学家已经知道我们肚脐里最常见的细菌种类,但不同人的肚脐里细菌种类是否相同?是什么在影响细菌种类的变化?这些都是北卡罗来纳州立大学的罗布·邓恩博

多种模型合力揭示未来气候变化真相

  最近在《自然—气候变化》杂志上发表的一篇论文中,一个由美国和英国的四名科学家组成的小组解释了如何将不同的气候模型联合起来共同预测未来的气候变化。  气候模型研究在过去30年中取得了重大进展,科学家们研发出了各种气候预测模型。气候预测取决于如何评估与温室气体排放相关的不确定性和可能的风险,但是,即

如何利用生态模型逻辑斯蒂增长模型评估环境容纳量的变化趋势?

可以通过以下步骤利用逻辑斯蒂增长模型评估环境容纳量的变化趋势:一、数据收集与整理收集种群数量数据:长期监测目标种群的数量变化,获取多个时间点的种群数量数据。可以通过实地调查、采样、标记重捕法等方法进行数据收集。确保数据的准确性和可靠性,对异常值进行处理和分析,了解数据的误差范围。收集环境变量数据:同

气候变化会导致人类灭亡么?

  认为气候变化导致人类只剩下10多年的说法是一种误解。2018年,联合国政府间气候变化专门委员会(IPCC)发布的一个相当难懂的报告警告说, 到2030年人类需要将二氧化碳排放量减半,以避免全球变暖至工业革命前1.5°C以上的水平。  这实际上大致意味着,"在解决气候变化变得非常昂贵和困难之前,我

全球病毒组项目欲揪出百万未知病毒

据美国《科学新闻》双周刊网站近日报道,定于2018年启动的“全球病毒组项目(Global Virome Project)”计划耗资12亿美元,在今后10年内,确定仍未“现身”的约百万种病毒(其中40%—50%的病毒可能感染人类),以便预防下一次病毒大流行。俗话说:知己知彼,百战不殆。为了有效防范下一

首次用干细胞制备人类心脏早期发育模型

  近期,加州大学伯克利分校的研究人员,与Gladstone研究所的科学家合作,开发出一种模板,利用干细胞制备跳动的心脏组织,从而创建了一种系统,可以作为早期心脏发育模型,以及让怀孕更安全的一种药物筛选工具。延伸阅读:PNAS:多能干细胞来源的体外心脏组织模型。  相关研究结果发表在七月十四日的《N

人类胚胎模型可模拟受精早期发育特征

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508019.shtm

人类多样性调查发现近3亿基因突变

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517755.shtm美国一项大规模人类多样性调查研究项目“All of Us”已取得实质性成果。2月19日,美国国立卫生研究院(NIH)等机构的研究人员对“All of Us”收集的多达24.5万个基因组

科学家揭示人类表观遗传多样性模式

  来自美国和加拿大的研究团队发表了关于世界各地不同人群之间表观遗传变异的最新研究进展。研究人员对来自世界五个不同种群 DNA 甲基化、基因型和基因表达的数据进了分析。研究发现,在人群范围内的表观遗传变化比 DNA 序列的变化快得多。相关研究于今日发表在 Nature Ecology and Evo

生物多样性受损-人类难寻治疗癌症等疾病良方

有专家指出,随着地球上植物和动物灭绝的脚步加快,生物多样性正面临挑战,人类找到治疗癌症等疾病的希望也因此会变得渺茫。 据法新社23日报道,联合国环境规划署执行主任阿希姆·施泰纳在他即将出版的新书《生命不息》中提到,现在地球上已知的物种中,有1.6万个物种面临灭绝的危险,这意味着生物多样性正在受到破

显微技术突破揭秘植物病毒组装

  最近,一项关于“一种植物病毒如何组装”的新研究,可以为将来病毒载药进入人体的应用,奠定基础。  这项研究,是由来自英国利兹大学Astbury结构分子生物学中心和英国John Innes中心的一个研究小组完成,描述了豇豆花叶病毒CPMV)的空版结构,以及可让病毒构建自我并压缩其基因组的分子“胶水”

全球病毒组项目欲揪出百万未知病毒-砸12亿美元

  据美国《科学新闻》双周刊网站近日报道,定于2018年启动的“全球病毒组项目(Global Virome Project)”计划耗资12亿美元,在今后10年内,确定仍未“现身”的约百万种病毒(其中40%—50%的病毒可能感染人类),以便预防下一次病毒大流行。图片来源于网络  俗话说:知己知彼,百战

复旦大学最新Cell

  蝙蝠、啮齿动物和鼩鼱是人类传染病最重要的动物来源。然而,病毒在它们之间的进化和传播在很大程度上仍未被探索。  2023年9月20日,复旦大学张永振团队在Cell 在线发表题为“Host traits shape virome composition and virus transmission

科研人员深度挖掘人类肠道宏基因组的古菌病毒

  北京时间12月30日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所马迎飞团队在国际学术期刊《自然-通讯》(nature communications,IF=17.69)上发表了题为"Metagenomic analysis reveals unexplored diversity of arch

中俄专家共议全球变化背景下海洋生物多样性

   日前,中国科学院国际伙伴计划对外合作重点项目“全球变化驱动下的中—俄远东近海生物多样性演变与生态系统健康评估”启动会暨学术研讨会以视频会议形式召开。中国科学院海洋所研究员孙松、于仁成、孙晓霞,烟台海岸带所研究员李宝泉,俄罗斯科学院远东分院国家海洋生物科学中心副所长Konstantin Luta

60%的土地变化与人类直接活动有关

  据英国《自然》杂志8月8日在线发表的一篇环境科学研究,研究人员利用30多年的卫星数据绘制成了全球土地覆盖的变化图,他们发现地球的森林植被覆盖正在增加,而裸地覆盖正在减少——这主要是由人类活动造成,而其余的因素则是气候变化引起的。  土地变化是指地表的植被覆盖物(森林、草原、耕作植被等)和非植被覆

研究发现4个基因主导人类胚胎早期变化

据物理学家组织网30日报道,14年前牛津大学的研究人员测定和命名了4个基因,但这些基因的功能却始终没有破解。最近他们发现,这些基因主导着人类胚胎早期的变化,离解开谜团更近了一步。 2002年,在人类基因组计划中,进化生物学家彼得·霍兰教授和研究生安妮·布斯测定了4个基因,分别命名

气候变化开始改变人类计时的方式

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JAMA:人类基因组终生在变化

这一发现将有助于解释为什么疾病易感性会随着年龄增长而增加 图片说明:不同的家庭拥有不同类型的终生DNA变化。(图片来源:Getty) 美国科学家近日研究发现,人类DNA上的表观遗传(epigenetic)化学标记一生中不断变化,并且变化程度在家庭成员之间是相似的。科学家据此认为,表观遗传特

环境变化彻底改变古人类工具制造

  几十万年生存的关键工具——石制手斧——在70万年里几乎没有什么变化。研究人员一直在争论长时间停滞背后的原因。10月21日,《科学进展》发表的一项对肯尼亚古湖床异常环境数据的研究表明,大约40万年前,在气候变化、地貌演变和动物种群快速变化的综合影响下,新的社会技术形成了,包括更小的黑曜石刀片和远距

Nat-Microbiol:科学家在婴儿粪便中发现近10000种病毒

肠道微生物组是在婴儿期被塑造形成,并会影响机体免疫系统的成熟,从而保护机体抵御后期发生的慢性疾病;噬菌体(感染细菌的病毒)能通过溶菌和溶原性来调节细菌的生长,而溶原性在婴儿肠道中尤为突出;病毒宏基因组(viromes)非常难以分析,因为其跨越了未知的病毒多样性,并缺乏标记基因和标准化的检测方法。近日

大语言模型在线辩论说服力超人类

实验设计示意图。图片来源:英国《自然·人类行为》在线版《自然·人类行为》19日发表的一项人工智能(AI)研究发现,在线辩论中,GPT-4一类的大语言模型(LLM)如能根据对手的个性化信息调整它们的论据,其说服力比人类辩手高出64%。研究结果显示了GPT-4生成有针对性和说服力论据的能力,揭示出AI工

人类中枢神经早阶三维模型面世

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第一个完整人类囊胚模型诞生!

  人类生命的绽放始于受精卵发育,在受精卵的发育过程中,囊胚(blastocyst)期是胚胎着床前的最后一个时期,此后胚胎将附着于母体子宫壁上进行后续的发育。  囊胚期也是胚胎发育过程中的一个关键时期,此时的胚胎会形成中空的球状胚,其内壁有一团细胞最终发育成为胎儿的各个器官,这团细胞称为内细胞团(i

培育人类脊索组织的干细胞模型成功开发

英国弗朗西斯·克里克研究所科学家开发了一种能培育出人类脊索的干细胞模型,这是人类首次在干细胞模型中培育出脊索组织。在胚胎发育过程中,脊索就像是一个GPS导航系统,引导细胞构建脊柱和神经系统。这一成果标志着科学家在研究人体早期发育形态方面迈出了重要一步,相关论文18日发表在《自然》杂志上。人类躯干状类