中国学者葡萄基因组学研究取得新进展

葡萄是世界上第二大果树作物,鲜果及用其加工品葡萄酒一直广受消费者喜爱。随着社会对葡萄需求量进一步增加,如何高效快速地培育优良葡萄品种是目前葡萄产业发展的瓶颈。近年来,通过新一代测序技术和生物信息学手段相结合,对植物基因组结构和特点深入解析,将获得的信息应用于分子辅助或基因工程育种,成为植物品种选育的有效手段。因此,开展葡萄基因组学研究,将极大地促进葡萄产业的发展。 中国科学院武汉植物园园艺作物学科组深入开展了葡萄基因组学研究,并取得一系列进展。该课题组研究人员首先构建了葡萄种间杂交F1群体,利用 RAD-seq分子标记技术,构建了一张目前文献报道的最高密度遗传图谱。该图谱含有完整的序列信息SNP分子标记约4400个,全部19个连锁群总遗传距离约2000厘摩。该遗传图谱将用于葡萄关键农艺性状QTL定位,并开发与优异性状紧密连锁的分子标记,应于用葡萄分子标记辅助育种。 同时,该课题组研究人员还利用国际上公布的葡萄......阅读全文

农科院构建首张苎麻分子标记遗传图谱

  中国农业科学院麻类研究所刘头明博士及其团队在苎麻产量性状的遗传研究方面取得新进展,构建了苎麻的首张分子标记遗传连锁图谱,并完成了苎麻纤维产量相关性状的数量性状位点(QTL)定位。图谱中的QTL将可以直接应用于苎麻的分子标记辅助选择育种。  苎麻是我国特色的天然纤维作物,其产量、品质等重要农艺性状

新发现生物标记PGDM分子有助诊断食物过敏

  近日,日本一项新研究发现,通过检测尿液中存在的一种生物标记,可以帮助诊断食物过敏的风险。  东京大学一个研究小组日前在英国《科学报告》杂志上发表报告说,他们在有食物过敏问题实验鼠的尿液中发现了一种名为PGDM的分子,这种分子的含量与过敏症状有明显相关性。此外,在食物过敏的人类患者尿液中也发现了高

关于活性氧分子荧光探针标记法的应用

众所周知,氧气是生命运动过程中不可缺少的一种气体,而细胞使用氧气时会产生副产品,以高能氧气分子形式存在的废弃物质即为自由基。自由基会对人体组织和细胞结构造成损害,我们把这种损害称为氧化应激,人体在利用氧气过程中会加重自身的压力。活性氧(ROS)是含有氧的化学活性分子,ROS是需氧细胞在代谢过程中产生

SNP分子标记的原理及其分型方法的比较

美国学者Eric S. Lander于1996年正式提出单核苷酸多态性(SNP)为第三代分子标记以后,SNP已经广泛应用于经济性状关联分析、生物遗传连锁图谱构建、人类致病基因筛选、致病风险诊断及预测、个体化药物筛选等生物、医学研究领域。在经济作物育种领域,检测SNP可实现对所需性状的早期选择。这

非标记检测(分子互作)市场概况-年增速8.3%

非标记检测(Lable-free detect,LFD)市场主要由仪器和消耗品构成,仪器技术包括:SPR表面等离子体共振,BLI生物层干涉测量,ITC等温滴定量热,DSC差示扫描量热法和其它非标记检测技术。其应用包括:结合动力学,结合热力学,内源性受体检测,活性样品确定,先导物生成和其它应用,最终用

日本研究人员首次成功绘制日本人基因组图谱

  据日本共同社报道,日本理化学研究所基因组医科学研究中心日前通过新一代DNA测序仪成功绘制出首份日本人基因组图谱。该成果10月24日发表在美国《自然—遗传学》杂志网络版上。  DNA一共有4种碱基排列组合,人类大约有30亿对碱基对。新一代测序仪可将DNA进行极其精细的切片,对大量切片同时

安捷伦授予临床基因组研究人员Peter-Robinson“思想领袖奖”

  分析测试百科网讯 2016年11月29日,安捷伦科技宣布将安捷伦思想领袖奖授予给Peter Robinson, M.D., MSC,以表彰其对临床基因组学和计算生物学的贡献。在今年早些时候,中国中医科学院中药研究所所长陈士林(详见本网报道:中药研究所所长陈士林获得“安捷伦思想领袖奖”)和癌症研究

研究人员完成枣和酸枣单倍型基因组组装

近日,西北农林科技大学林学院红枣团队黄建研究员课题组以我国制干枣主栽品种‘骏枣’和著名“秦药”代表清涧酸枣为研究材料,整合了PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C等多种先进测序技术以及多种组装策略完成了枣和酸枣T2T gap-free和T2T gap-free单倍型基因组的组

研究人员成功测序蒙特莫朗西酸樱桃基因组

密歇根州的酸樱桃产量在全美名列前茅,密歇根州立大学的一个研究小组启动了一个项目,旨在确定与酸樱桃树晚开有关的基因,以满足不断变化的气候的需要。他们首先将晚开的樱桃树的DNA序列与一个相关物种--桃子的基因组测序进行了比较。他们首先将开花迟缓的酸樱桃树的DNA序列与它们的亲戚桃子的基因组序列进行比较。

加拿大研究人员发现检测血液中癌症生物标记的新方法

  据最新一期《自然·化学》杂志报道,加拿大研究人员发现了一种检测人体血液中癌症生物标记物的新方法:利用肽核酸钳及纳米微电子芯片检测游离核酸。  核酸可分为DNA(脱氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸),通常位于细胞内,但有时也能在循环血液中找到。癌症患者的血液中往往有更多的这种脱离细胞的核酸,其中一小

研究人员揭示细胞粘附多稳态机械敏感分子机制

近日,深圳湾实验室特聘研究员Artem Efremov团队在《自然—物理》上发表最新研究,揭示了机械转导蛋白的弹性特性在细胞粘附多稳态机械敏感行为中的关键作用。该研究中,研究人员构建了一个半解析模型,用以整合单个分子离合器组件的力响应数据,从而能够精准预测Tension-gauge-tether实验

北京基因组所发现肾癌预后监测的新型表观标记物

  透明肾细胞癌(clear cell Renal Cell Carcinoma, ccRCC)是肾癌中最常见的亚型,90%以上的ccRCC患者中VHL抑癌基因是失活的,但在小鼠实验中却发现该基因的缺失并未能引起透明细胞癌形成,这意味着还存在其他的致瘤机制。近些年的研究发现,与肾癌发生发展、患者总体

单分子测序轻松升级参考基因组

  现代基因组学的最大需求之一,就是得到人类和模式生物的高质量完成基因组。目前,人们利用二代测序技术对越来越多的物种(从原核生物到真核生物)进行了基因组测序,取得了许多重要的研究成果。   不过大部分物种的基因组还中存在有大量的缺口gap,就目前的数据来说,各种已测序物种的基因组中缺口gap所占的

北京基因组所揭示胃癌耐药分子机制

  多药耐药基因MDR1过表达是造成肿瘤化疗耐受和肿瘤病人生存和预后较差的主要原因之一,但MDR1过表达的调控机制还不清楚。中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室赵永良课题组利用胃癌为模型,在研究耐药性分子机制方面获得新进展,发现人类解旋酶RecQL4通过促进转录因子YB1的磷酸化而调控

分子的重复机制全基因组复制

又称多倍性,是减数分裂不分离导致整个基因组复制的现象。多倍体在植物中很常见,但动物上也发生过 [3]  。全基因组复制会使得许多其它基因最终丢失,返回到单一状态。然而,许多基因的保留导致了适应性创新。多倍体也是众所周知的物种形成的一个来源,因为具有与亲本物种不同染色体数目的后代通常不能与非多倍体生物

首个棉花泛基因组图谱助力分子育种

  近日,华中农业大学棉花遗传改良团队发表了题为“Cotton pan-genome retrieves the lost sequences and genes during domestication and selection”的研究论文,公布了目前为止变异类型最丰富的棉花遗传变异数据集。文章

非侵入式光学成像检测疾病的早期分子标记

  分析测试百科网讯 包括肥胖,心血管疾病和癌症在内的慢性疾病通常始于细胞代谢的早期细微变化。现在,塔夫茨大学的研究人员开发了一种无创光学成像技术,可以检测这些变化,为新研究和潜在的治疗发展提供了一个早期的机会窗口。  “在出现可见的疾病症状和损伤之前,疾病始于与新陈代谢有关的分子的变化,这阻碍了组

新型分子标记物可稳定预测帕金森病治疗结果

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/6/481002.shtm 6 月15日,《临床研究杂志》在线发表中科院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、上海脑科学与类脑研究中心研究员陈跃军团队的最新成果。研究人员解析了中脑多巴胺能神经分化

原位分子杂交技术依标记物的不同分类

  原位杂交技术依据其标记物的不同可分为电镜放射性原位杂交技术和电镜非放射性原位杂交技术。  原位杂交技术应用放射性同位素作为标记,具有敏感性高,标记物不会干扰杂交反应,并且结果适合于进行定量分析等特点。常用的几种放射性同位素:3H,35S,125I和32P都已经被用于电镜原位杂交,但各有优缺点,目

关于活性氧分子荧光探针标记法的应用介绍

  众所周知,氧气是生命运动过程中不可缺少的一种气体,而细胞使用氧气时会产生副产品,以高能氧气分子形式存在的废弃物质即为自由基。自由基会对人体组织和细胞结构造成损害,我们把这种损害称为氧化应激,人体在利用氧气过程中会加重自身的压力。活性氧(ROS)是含有氧的化学活性分子,ROS是需氧细胞在代谢过程中

关于活性氧分子荧光探针标记法的应用介绍

  众所周知,氧气是生命运动过程中不可缺少的一种气体,而细胞使用氧气时会产生副产品,以高能氧气分子形式存在的废弃物质即为自由基。自由基会对人体组织和细胞结构造成损害,我们把这种损害称为氧化应激,人体在利用氧气过程中会加重自身的压力。活性氧(ROS)是含有氧的化学活性分子,ROS是需氧细胞在代谢过程中

分子标记用于疾病诊断和遗传病连锁分析

  1980年,Botstein等成功的将PFLP技术用于镰刀型贫血症的诊断分析,开创了基因诊断的先河。PFLP是以孟德尔方式遗传,因此可以作为染色体上致病基因座位的遗传标志。许多与相连锁的致病基因得以定位。小卫星和微卫星因其高度多态性而被广泛用于疾病诊断和遗传病的连锁分析。随着高通量SNP检测技术

研究人员观测到人类基因组新的“暗物质”

  人类对基因组变异的认识又向前推进一大步:西安交通大学日前传出消息,该校叶凯青年科学家工作室团队与荷兰、美国、德国的20个科研机构,通过开发新的计算机算法和分析处理流程,分析并报道了在250个健康家庭的基因组中的所有类型变异,其中包括以前从未观测到的大量复杂型变异,即基因组中的“暗物质”。  据介

研究人员解析人类基因组计划的赢利奥秘

  人类基因组计划(genome project)为美带来1万亿美元经济增长。   美国巴特尔纪念研究所6月12日发布的一份颇具争议的报告指出,解码人类基因组项目的经济收益持续增长。该项目结束10年后,目前其带来的收益已接近1万亿美元。   1988~2003 年进行的人类基因组计划(genom

研究人员破译了一种基因缺陷补偿分子机制

  许多疾病都是由基因缺陷引起的。然而,它们的严重程度可能因个体患者而异。如今,在一项新的研究中,来自德国马克斯普朗克心肺研究所的研究人员破译了一种导致这种现象的分子机制。因此,缺陷基因的mRNA确保相关基因被激活从而补偿这种基因缺陷。他们希望利用这种机制开发新的治疗方法。相关研究结果发表在2019

研究人员揭示全小分子有机太阳能电池

  有机太阳能电池作为新一代太阳能电池技术近年来受到广泛关注。相比较于传统的硅基太阳能电池,有机太阳能电池具有成本低、柔性、可大面积印刷制备等优点。目前制备高效有机太阳能电池的主流策略是使用聚合物给体和非富勒烯受体材料构建活性层。但聚合物材料在制备过程中通常存在分子量和分散度难以精确控制、难提纯、材

-Cell特辑:从基因组到代谢组学——癌症标记物的进展

  “Cell Press Selections”是由Cell出版社推出的一份推荐文章集合手册,主要介绍某个生命科学研究领域最新的进展及突出成果。相关特辑内容包括研究论文,评论性文章以及snapshots,涉及了同一领域的方方面面,更为重要的是这些文章由赞助商赞助,可以免费获取。  癌症生物标记物是

Cell:单分子测序揭示惊人的基因组重排

  科学家们发现,生活在池塘里的单细胞生物Oxytricha trifallax有一种非凡的能力,它们能在交配时将DNA打碎并快速重排这些片段。这项研究发表在上一期的Cell杂志上。  Oxytricha的基因重排是一个非常精密的过程,“这是大自然早期一种的复杂化尝试,”文章的资深作者,Prince

单分子测序改善微生物基因组组装

  美国国家生物防卫分析和反制中心的研究人员近日在《Genome Biology》上发表文章,介绍了SMRT技术在微生物基因组组装上的应用。他们认为,单分子测序数据能降低测序费用,并带来更多完整的基因组,改善微生物基因组数据库的质量。   随着测序费用的不断下降,测序项目的数量也在不断上升。G

Cell:单分子测序揭示惊人的基因组重排

  科学家们发现,生活在池塘里的单细胞生物Oxytricha trifallax有一种非凡的能力,它们能在交配时将DNA打碎并快速重排这些片段。这项研究发表在上一期的Cell杂志上。  Oxytricha的基因重排是一个非常精密的过程,“这是大自然早期一种的复杂化尝试,”文章的资深作者,Prince