Cell突破性成果:基因调控拼图
来自瑞典卡罗琳斯卡医学院的研究人员取得了基因调控研究的突破性进展——他们识别出了结合在调控基因表达的400多个蛋白上的DNA序列,这将有助于解析为什么不同的个体,其基因组对疾病患病风险的影响不同。 2000年,科学家们完成了人类基因组测序,希望能将这整个人类DNA序列信息,迅速转换到临床应用上来,比如新型药物,和能判断有患病风险的个体的预测工具。 然而结果却证明这实际上比预期的更难以实现,其中的一个原因就在于基因组中只有1%的序列用于编码蛋白,其余的大部分都用于了调控这些蛋白在不同的细胞和组织中如何表达。而科学家们又不清楚哪些DNA序列能结合一些特异性蛋白,也就是转录因子,调控基因表达,因此阻挡了临床应用前进的步伐。 “基因组就像是一本用外文撰写的书,我们知道每个字母,却不理解为什么人类基因组造就出的是人,而小鼠基因组生成的是小鼠,”领导这一研究的Jussi Taipale教授表示,“为什么某些人患上常......阅读全文
探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究(一)
ESC在体外可无限自我更新和分化为机体内任何种类的细胞,在器官再生和细胞替代治疗中具有广阔的应用前景。然而,hESC维持自我更新及发育多能性的分子调控机制还有很多问题尚不清楚,妨碍了将其分化的细胞安全有效地应用于临床。因此,对人ESC如何维持其自身特性的机制进行深入的研究尤为重要。研究思路 研究结果
分子植物卓越中心揭示抗铝毒转录因子调控机制
10月21日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心研究员黄朝锋研究组在Plant Cell上在线发表题为Regulation of Aluminum-Resistance in Arabidopsis Involves the SUMOylation of the Zin
遗传发育所鉴定出小麦穗发育的转录调控因子
小麦是重要的粮食作物之一。小麦的产量主要由亩穗数、千粒重和穗粒数决定。穗型结构影响小麦的小穗数、穗粒数和产量,是育种改良地重要的选择性状。挖掘小麦穗发育重要调控因子与解析分子调控机制,对小麦穗型的分子设计与精准改良、突破产量瓶颈具有重要意义。由于小麦功能基因组学发展较晚,穗发育关键基因挖掘及作用
转录因子调控番茄碱代谢合成新机制获解析
甾体生物碱(SA)及其糖基化形式(SGA)是广泛存在于茄科植物中一类特殊的代谢产物,对植物病原菌和草食动物具有防御作用。迄今为止,在番茄中检测到近百种甾体类生物碱,其中α-番茄碱(α-tomatine)是茄科植物的叶片、花蕾和果实中最主要的一种SGA。在番茄成熟过程中,有毒的生物碱及其糖基化产物由一
探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究(三)
5. PHB与HIRA复合体共同作用控制着IDH的表达研究者随后探究了PHB,HIRA对IDH-a-KG代谢通路的影响。研究发现,PHB,HIRA缺失导致了IDH表达显著减低,并伴随着细胞内α酮戊二酸的显著降低。而α酮戊二酸对于hESC干性的自我维持具有重要的作用。6. PHB和HIRA共同调控H3
转录水平的调控
该模型认为在整合基因的5’端连接着一段具有高度专一性的DNA序列,称之为传感基因。在传感基因上有该基因编码的传感蛋白。外来信号分子和传感蛋白结合相互作用形成复合物。该复合物作用于和它相邻的综合基因组,亦称受体基因,而转录产生mRNA,后者翻译成激活蛋白。这些激活蛋白能识别位于结构基因(SG) 前面的
研究揭示转录因子MYC2调控玉米抗虫响应机制
茉莉酸是重要的植物激素,在植物响应昆虫取食的过程中发挥着重要的作用,而MYC2是茉莉酸信号转导途径中关键的转录因子。近日,中国科学院昆明植物研究所研究员吴建强团队通过遗传学、生物化学、分子生物学和生物信息学手段,确定了玉米MYC2在茉莉酸介导的抗虫防御响应过程中的功能。该研究在线发表在《植物学报》。
罗克明等发现调控杨树抗病性关键转录因子
者从中科院西北高原生物研究所获悉,该所研究员罗克明等人与其他单位合作,得到了可显著提高杨树对溃疡病抗性的PtrWRKY89转录因子。该成果近日在线发表于《实验植物学杂志》。 据介绍,WRKY转录因子是一类广泛存在于植物中的转录因子家族,其广泛参与了植物胁迫反应、木质素形成、种子萌发等各种生理过
转录因子活性ELISA
转录因子活性ELISA是建立在ELISA基础上的高灵敏度的检测方法,比EMSA的灵敏度高l0倍,在5h内就能完成。不涉及放射性和凝胶电泳,安全简便,而且这种微孔板的形式能同时检测1—96个样品。ArrayStarTM转录因子活性ELISA试剂盒可以快速、灵敏地检测细胞核提取物中转录因子的DNA结合活
转录后水平的调控
真核生物基因转录在细胞核内进行,而翻译则在细胞质中进行。在转录过程中真核基因有插入序列,结构基因被分割成不同的片段,因此转录后的基因调控是真核生物基因表达调控的一个重要方面,首要的是RNA的加工、成熟。各种基因转录产物RNA,无论rRNA、tRNA还是mRNA,必须经过转录后的加工才能成为有活性的分
信使RNA转录的调控
一、遗传信息的表达有时序调控和适应调控,转录水平的调控是关键环节,因为这是表达的第一步。转录调控主要发生在起始和终止阶段。 二、操纵子是细菌基因表达和调控的单位,有正调节和负调节因子。阻遏蛋白的作用属于负调控。环腺苷酸通过其受体蛋白(CRP)促进转录,可促进许多诱导酶的合成。操纵子可构成综合性
转录因子和转录因子之间可以有相互作用吗
可以转录因子真核生物转录起始十分复杂,往往需要多种蛋白因子的协助,转录因子与RNA聚合酶Ⅱ形成转录起始复合体,共同参与转录起始的过程。根据转录因子的作用特点可分为二类;第一类为普遍转录因子,它们与RNA聚合酶Ⅱ共同组成转录起始复合体时,转录才能在正确的位置开始。除TFⅡD以外,还发现TFⅡA,TFⅡ
神经所发现转录因子Tlx1/3与Ptf1a调控基因的特异性表达
6月20日,《神经科学杂志》(The Journal of Neuroscience) 发表了中科院上海生命科学研究院神经所神经发育及其调控机理研究组的论文Tlx1/3 and Ptf1a control the expression of distinct
关于真核生物的基因调控—真核基因的转录分类介绍
几乎所有的真核生物的 mRNA都有一个5′帽端,但并不是所有基因的mRNA都有3′多聚A尾部,也不是所有基因的mRNA都必须经过拼接。根据这后两种加工过程的有无和复杂程度,可将真核基因的转录单位分为两大类型:一类是简单的只编码产生一种蛋白质的基因,另一类是复杂的编码两种或更多种蛋白质的转录单位。
版纳园研究揭示转录因子WRKY57调控拟南芥干旱耐受能力
干旱是限制农作物产量和品质的重要环境因子之一,但是植物对干旱耐受性的潜在分子机制却仍不清楚。据报道,WRKY转录因子在植物适应非生物胁迫过程中起着重要的作用。WRKY蛋白质是一个转录调控因子大家族,在拟南芥中有74个成员,大量研究证实,WRKY基因家族各成员参与调控植物的抗逆反应及其信号转导途径
水稻双重活性转录因子可调控细胞死亡和抗病性
近日,中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队首次报道植物bZIP类型转录因子APIP5具有结合DNA和RNA的双重活性,在转录和转录后水平调控水稻细胞死亡和防御反应的新机制。研究论文发表于Nucleic Acids Research(《核酸研究》)。 稻瘟菌侵染引起的稻
数学院等调控网络数学建模揭示干细胞分化关键转录因子
近期,国际学术期刊《细胞-干细胞》(Cell Stem Cell)在线发表了由中国科学院数学与系统科学研究院和美国斯坦福大学科研人员合作的干细胞分化的基因调控网络建模成果。这一成果提出了利用匹配的基因表达和染色质可及性数据刻画转录因子和调控元件结合调控下游基因表达的数学模型,构建了描绘细胞状态转
遗传发育所发现调控拟南芥分枝和种子角果发育的转录因子
Dof转录因子家族是一类植物特有的转录因子家族,它们参与调控了多种生长发育过程。在以前的研究中发现,大豆GmDOF4和GmDOF11可提高种子的脂肪酸含量并增加种子千粒重。本研究筛选了在拟南芥种子/花中高表达的Dof转录因子AtDOF4.2并进一步研究其功能。 AtDOF4.
Nature发现癌基因MYC的主调控因子
根据来自明尼苏达大学共济会癌症中心的一项新研究中,一个导致了20%的癌症的关键致癌基因MYC,其盔甲上或许有一个弱点。MYC与非编码RNA PVT1之间的伙伴关系,有可能是了解MYC推动癌细胞机制的关键。这项研究发表在最新一期的《自然》(Nature)杂志上。 论文的主要作者、明尼苏达大学医学
Cell:武汉大学阐明真核基因中的转录调控机制
近日,来自武汉大学、加州大学圣地亚哥分校的研究人员在新研究中证实,SR蛋白与7SK和启动子相关新生(Nascent )RNA协同作用,促进了转录过程中停顿的聚合酶释放。这一研究发现为阐明真核基因中的转录调控机制,深入了解相关疾病提供了重要的理论依据。相关论文发表在5月9日的《细胞》(Cell
关于转录因子的转录抑制区的介绍
也是转录因子调控表达的重要位点,但是对其作用机理研究尚不深入。可能的作用方式有三种:1)与启动子的调控位点结合,阻止其它转录因子的结合;2)作用于其它转录因子,抑制其它因子的作用;3)通过改变DNA的高级结构阻止转录的发生。 转录因子必须在核内作用,才能起到调控表达的目的。因此,转录因子上的核
概述转录因子的组成
真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分: 1、亚基 RNA聚合酶的亚基,它们是转录必须的,但并不对某一启动子有特异性。 2、复合物 某些转录因子能
通用转录因子的定义
通用转录因子(general transcription factors, GTFs) 。真核生物中有效的和启动子特异性的起始过程中需要几个起始因子,这些起始因子称为通用转录因子
简述转录因子的作用
是通过和顺式因子的互作来实现的。这段序列可以和转录因子的DNA结合域实现共价结合,从而对基因的表达起抑制或增强的作用。 目前,人工转录因子(Artificial Transcription Factor,ATF)的构建已用于转录因子的生物学功能研究中起到重要作用。ATF是指将不同的DNA结合结
通用转录因子的定义
通用转录因子(general transcription factors, GTFs) 。真核生物中有效的和启动子特异性的起始过程中需要几个起始因子,这些起始因子称为通用转录因子。
依赖ρ因子的转录终止
ρ因子是一种分子量为46kDa的蛋白质,以六聚体为活性形式。
转录终止因子的定义
中文名称转录终止因子英文名称transcription termination factor定 义辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等),其作用导致转录终止。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
研究发现调控杨树生长发育及耐盐性的转录因子
近日,山西农业大学林学院林木分子遗传育种创新工作室在《经济作物和产品》(Industrial Crops and Products)接连发表了两项研究成果。研究发现,热休克因子PagHSF4和乙烯响应因子ERF194,在介导杨树发育过程、环境胁迫适应等方面发挥着重要作用。 植物由于自身生长的固
中国科学家揭示热纤梭菌转录调控因子新机制
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510487.shtm
关于核因子κB的调控的基因的介绍
NF-κB在调节细胞反应中是相当重要的,因为它属于“快速作用”的初级转录因子,不需要新的蛋白质合成就能被激活(有该特性的其他成员包括c-Jun,STAT和核激素受体)。NF-κB是对有害细胞刺激的第一反应者。已知的NF-κB通路激活因子有很多,包括:TNF-α、IL-1β、IL-2、IL-6、I