序列图谱的定义
随着遗传图谱和物理图谱的完成,测序就成为重中之重的工作。DNA序列分析技术是一个包括制备DNA片段化及碱基分析、DNA信息翻译的多阶段的过程。通过测序得到基因组的序列图谱。......阅读全文
人体鱼序列征的概述
人体鱼序列征(sirenomelia seguence)即并腿畸胎序列征,因其形体与神话中的美人鱼相似而得名。此种畸形少见,发生率约1/24000-1/67000(由于以往将此种畸形归于尾发育不全,发生率可能被低估)。此种畸形的形成可能与血管窃血现象有关。即一条由卵黄动脉衍化而来的粗大畸形血管起
SD序列的基本信息
SD序列还存在于一些叶绿体和线粒体的转录本中 。由6个碱基组成的SD序列的保守序列为AGGAGG。SD序列是由澳大利亚科学家John Shine和Lynn Dalgarno提出。
随机序列库的纯化实验
实验方法原理 实验材料 DNA 库试剂、试剂盒 氢氧化铵正丁醇TE 缓冲液 尿素上样缓冲液NaCl 乙醇仪器、耗材 荧光薄层层析板(VWR)紫外灯剃刀刀片小孔注射器能耐受极端温度的 13 ml 离心管(Sarstedt) 90℃水浴旋转混合器实验步骤 实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他
序列标签位点的简介
任何DNA序列,只要知道它在基因组中的位置,都能被用作STS标签。作为基因组中的单拷贝序列,是新一代的遗传标记系统,其数目多,覆盖密度较大,达到平均每1kb一个STS或更密集。这种序列在染色体上只出现一次,其位置和碱基顺序都是已知的。在PCR反应中可以检测出STS来,STS适宜于作为人类基因组的一种
随机序列库的纯化实验
实验方法原理 实验材料 DNA 库 试剂、试剂盒 氢氧化铵
RGD序列的主要组成成分
RGD序列由精氨酸、甘氨酸和天冬氨酸组成,存在于多种细胞外基质中,可与11种整合素特异性结合,能有效地促进细胞对生物材料的粘附。
回文序列的特征与功能
特征有对称中心。例如,DNA序列ACCTAGGT之所以是回文序列,是因为它的互补序列是TGGATCCA,而反向互补序列是ACCTAGGT,和其原来序列一致。功能1)是限制性内切酶的识别位点;2)具有调节基因的表达作用,如色氨酸操纵子的前的弱化子;3)转录终止时的识别结构;4)基因工程的"手术刀"。
共有序列的结构特点
共有序列(consensus sequence) 决定启动序列的转录活性大小。各种原核启动序列特定区域内(通常在转录起始点上游-10及-35区域)存在共有序列(consensus sequence)。
侧翼序列的主要组成
侧翼序列包括前导区、尾部区、调控区,调控区又包括启动子、增强子、终止子等:1、前导区和尾部区 此二区被转录并参与成熟mRNA的组成,但不被翻译,前者位于转录起始点和第一外显子之间,相当于mRNA5’端的非翻译区(5’UT);后者位于最末外显子和终止子之间,相当于mRNA3’端非翻译区(3'U
回文序列的特征和功能
特征有对称中心。例如,DNA序列ACCTAGGT之所以是回文序列,是因为它的互补序列是TGGATCCA,而反向互补序列是ACCTAGGT,和其原来序列一致。功能1)是限制性内切酶的识别位点;2)具有调节基因的表达作用,如色氨酸操纵子的前的弱化子;3)转录终止时的识别结构;4)基因工程的"手术刀"。
SD序列的特点和应用
Shine-Dalgarno (SD)是细菌和古细菌中信使RNA中核糖体结合位点序列。通常位于翻译起始密码子AUG上游约8~10个碱基位置。SD序列帮助招募核糖体RNA,并将核糖体比对并结合到信使RNA(mRNA)的起始密码子,从而开始蛋白质合成。一旦被招募,tRNA可以按照密码子的指令顺序添加氨基
核苷酸序列的概念
核苷酸序列,就是指DNA或RNA中碱基的排列顺序。这意味着DNA中A,T,G,C的排列顺序,或者mRNA中A,U,G,C的排列顺序,也包括rRNA,tRNA中碱基的排列顺序。
信号锚定序列的功能特点
中文名称信号锚定序列英文名称signal-anchor sequence定 义穿膜蛋白中的一种独特的信号序列,其作用是将这些蛋白质锚定在脂双层膜上。有两种类型。Ⅰ型序列介导穿膜蛋白的N端域移位,Ⅱ型则介导其余部分的移位。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),信号转导(二级学科)
简述SD序列的形成过程
在原核生物中,起始密码子的选择取决于核糖体的小亚基与mRNA模板之间的相互作用。30S亚基与处于紧靠正确起始密码子上游的富含嘌呤的mRNA模板结合,这个区称为SD序列(Shine—Dalgarno sequence),它与16S rRNA 3'端的一个富含嘧啶区互补。在起始复合物形成过程
关于尾随序列的基本介绍
尾随序列指真核基因组转录单位中位于3'末端不翻译为肽链的部分,在遗传信息由DNA转录为mRNA过程中尾随序列同时被转录。真核细胞的mRNA长度约1〜2kb;包括前导序列、编码区及尾随序列;后者的长度有时可达lkb。
DNA-下游序列的结构特点
中文名称下游序列英文名称downstream sequence定 义DNA或RNA分子中,相对于某一序列的3′方向的序列。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),总论(二级学科)
回文序列的特征与功能
特征有对称中心。例如,DNA序列ACCTAGGT之所以是回文序列,是因为它的互补序列是TGGATCCA,而反向互补序列是ACCTAGGT,和其原来序列一致。功能1)是限制性内切酶的识别位点;2)具有调节基因的表达作用,如色氨酸操纵子的前的弱化子;3)转录终止时的识别结构;4)基因工程的"手术刀"。
染色体的结构序列
染色体要确保在细胞世代中保持稳定,必须具有自主复制、保证复制的完整性、遗传物质能够平均分配的能力,与这些能力相关的结构序列是: 自主复制 20世纪70年代末首次在酵母菌中发现。自主复制DNA序列具有一个复制起始点,能确保染色体在细胞周期中能够自我复制,从而保证染色体在世代传递中具有稳定性和连
功能基因cDNA序列的分析
(一) cDNA序列的测定一.原理DNA 序列测定技术,目前主要是根据Sanger 等提出的酶法和Maxam和Gilber 提出的化学降解法,这两种方法的原理大致相同。这里主要介绍Sanger 的酶法——双脱氧链终止法。双脱氧链终止法是Sanger 等人于1977 年建立起来的。它是利用了2'
高度重复序列的结构特点
倒位(反向)重复序列这种重复顺序复性速度极快,即使在极稀的DNA浓度下,也能很快复性,因此又称零时复性部分,约占人基因组的5%。反向重复序列由两个相同顺序的互补拷贝在同一DNA链上反向排列而成。变性后再复性时,同一条链内的互补的拷贝可以形成链内碱基配对,形成发夹式或“+”字形结构。倒位重复(即两个互
旁侧序列的的功能特点
中文名称旁侧序列英文名称flanking sequence定 义结构基因两侧的核苷酸序列,对基因的表达及表达水平具有调控作用。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
酿酒酵母的序列特征的简介
遗传信息分布在16个染色体中。其中有大约1/3的编码基因被认为是“孤儿”基因,也就是说,这些基因没有已知功能,这是因为这些基因的转录产物与酿酒酵母成其他生物所赋子功能的基因缺乏重要的同源性。这一数据仍在不断的体改中。 此染色体是由高、低G-C含量DNA结构域交替组成的,这和基因密度在染色体中的
拉曼图谱的原理
拉曼(Raman)光谱作为现代物质分子结构研究的重要方法之一,被广泛应用于物质微结构的研究,其主要是通过拉曼位移(拉曼振动频率) Δv来确定物质的结构。它提供的结构信息是关于分子内部各种简正振动频率及有关振动能级的情况,从而可以用来鉴定分子中存在的官能团,进而进行分子结构的识别。拉曼位移就是分子振动
阅读质粒图谱的方法
载体主要有病毒和非病毒两大类,其中质粒DNA是一种新的非病毒转基因载体。一、一个合格质粒的组成要素 复制起始位点Ori 即控制复制起始的位点。原核生物DNA分子中只有一个复制起始点。而真核生物DNA分子有多个复制起始位点。 抗生素抗性基因 可以便于加以检测,如Amp+ ,Kan+ 多克隆
拉曼图谱的原理
拉曼(Raman)光谱作为现代物质分子结构研究的重要方法之一,被广泛应用于物质微结构的研究,其主要是通过拉曼位移(拉曼振动频率) Δv来确定物质的结构.它提供的结构信息是关于分子内部各种简正振动频率及有关振动能级的情况,从而可以用来鉴定分子中存在的官能团,进而进行分子结构的识别.拉曼位移就是分子振动
拉曼图谱的原理
拉曼(Raman)光谱作为现代物质分子结构研究的重要方法之一,被广泛应用于物质微结构的研究,其主要是通过拉曼位移(拉曼振动频率) Δv来确定物质的结构.它提供的结构信息是关于分子内部各种简正振动频率及有关振动能级的情况,从而可以用来鉴定分子中存在的官能团,进而进行分子结构的识别.拉曼位移就是分子振动
拉曼图谱的原理
拉曼(Raman)光谱作为现代物质分子结构研究的重要方法之一,被广泛应用于物质微结构的研究,其主要是通过拉曼位移(拉曼振动频率) Δv来确定物质的结构.它提供的结构信息是关于分子内部各种简正振动频率及有关振动能级的情况,从而可以用来鉴定分子中存在的官能团,进而进行分子结构的识别.拉曼位移就是分子振动
诡异DSC图谱的解析
图1. 一张集诡异之大成的DSC图谱 热分析做多年了,好像经常碰到一些很诡异的图谱,令人百思不得其解。可能很多人得到一张很奇怪的图谱时,就会开始怀疑是否仪器有问题?或是样品有问题?否则怎么跟预期完全不同呢?其实,热分析毕竟还是属于材料科学的一环,再怎样诡异的图谱,经过理性的思维和分
阅读质粒图谱
载体主要有病毒和非病毒两大类,其中质粒DNA是一种新的非病毒转基因载体。一、一个合格质粒的组成要素 复制起始位点Ori 即控制复制起始的位点。原核生物DNA分子中只有一个复制起始点。而真核生物DNA分子有多个复制起始位点。 抗生素抗性基因 可以便于加以检测,如Amp+ ,Kan+ 多克隆
红外图谱口诀
红外识谱图看似复杂,其实也有规律可循,试试这个口诀,说不定 也是一种方法。 红外可分远中近,中红特征指纹区, 1300来分界,注意横轴划分异。 看图要知红外仪,弄清物态液固气。 样品来源制样法,物化性能多联系。 识图先学饱和烃,三千以下看峰形。 2960、2870是甲基