序列图谱的定义
随着遗传图谱和物理图谱的完成,测序就成为重中之重的工作。DNA序列分析技术是一个包括制备DNA片段化及碱基分析、DNA信息翻译的多阶段的过程。通过测序得到基因组的序列图谱。......阅读全文
XPS图谱解释
(1)谱线识别X射线入射在样品上,样品原子中各轨道电子被激发出来成为光电子。光电子的能量统计分布(X射线光电子能谱)代表了原子的能级分布情况。不同元素原子的能级分布不同,X射线光电子能谱就不同,能谱的特征峰不同,从而可以鉴别不同的元素。电子能量用E = Enlj 表示。光电子则用被激发前原来所处的能
关于尾随序列的内容简介
DNA分子是由4种核苷酸(A,T,G,C)排列组成,DNA序列就是组成某一DNA分子的核苷酸的排列次序。 蛋白质的一级结构是由20种氨基酸线性排列构成。蛋白序列就是构成某种蛋白质如氨基酸线性排列次序。因此,测序(sequencing)就是用实验方法,测定DNA 分子中核苷酸的种类及其排列次序,
DNA保守序列的结构特点
保守序列(Conserved Sequence):指在进化过程中基本保持不变的 DNA 分子中的一个核苷酸片段或者蛋白质中的氨基酸片段。
序列特异性引物的作用
序列特异性引物指一种测定基因突变的方法。即利用针对点突变的2个等位特异性寡核苷酸(ASO)引物(A、B标记其中之一)与另一共同引物(C)组成引物系统;在引物延伸时,A与B同时竞争靶序列上同一复性位点,扩增反应后,经凝胶电泳及放射自显影,胶片上的显带是标记同位素的引物所扩增的产物。
核酸序列扩增法的技术特点
中文名称核酸序列扩增法英文名称nucleic acid sequence-based amplification;NASBA定 义一种在等温系统中扩增核酸的方法。即利用T7RNA聚合酶仅在结合核酸上相应位点时才能起作用的特点,将结合位点序列与靶序列相连,然后产生靶分子的RNA拷贝,形成反转录和RN
RGD序列的主要用途
该序列肽能够竞争性抑制包括纤维蛋白在内的各种粘附蛋白与血小板的结合,可达抑制血小板与纤维蛋白结合的目的,有较好的临床研究价值。
人体鱼序列征的畸形特征
人体鱼序列征的主要畸形特征是双下肢融合,足缺如或发育不良,形似鱼尾,双下肢可完全融合、部分融合、可仅有软组织融合,也可有下肢骨性融合,骨盆骨发育不全。腰骶-尾椎骨发育不全或缺如。其他畸形有:肛门闭锁,直肠不发育,双肾不发育,膀胱、输尿管、子宫缺如,内外生殖器官异常等。偶可伴有先天性心脏病、肺发育
短散在重复序列的概念
中文名称短散在重复序列英文名称SHORT INTERSPERSED REPEATED SEQUENCE定 义以散在方式分布于基因组中的较短的重复序列。重复序列单元长度在50BP以下。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
内质网信号序列的概念
中文名称内质网信号序列英文名称ER signal sequence定 义引导合成中的蛋白质进入内质网腔的N端信号序列。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞通信与信号转导(二级学科)
氨基酸序列的测定方法
有两种方法,一是直接测序列法,常用Edman降解法,在弱碱性条件下多肽连N端氨基酸(阿尔发)与PITC反应,标记为苯氨基硫代甲酰蛋白质。肽链中的第一个肽键变弱,在无水酸的存在下发发生降解,第一个氨基酸(AA1)经过分子重排成为PTH-AA1结合层析技术即可确定氨基酸的性质。C端氨基酸残基分析,可用;
序列特异性引物的概念
中文名称序列特异性引物英文名称sequence specific primer;SSP定 义一种测定基因突变的方法。即利用针对点突变的2个等位特异性寡核苷酸(ASO)引物(A、B标记其中之一)与另一共同引物(C)组成引物系统;在引物延伸时,A与B同时竞争靶序列上同一复性位点,扩增反应后,经凝胶电泳
DNA序列测定的技术和策略
目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由于DNA上的每一个碱
依赖核酸序列的扩增技术叙述
国内外的研究结果均表明,草莓组织中富含多糖等物质,分离优质核酸较困难,核酸巾的杂质影响taq DNA聚合酶的活性,从而影响PCR技术在草莓病毒检测中的应用。为了提高利用PCR技术草莓病毒检测的稳定性,国内外的学者在草莓核酸提取方法做了较多的研究,利用OIAGEN公司生产的植物RNA提取试剂盒(P
什么是基因的间插序列?
中文名称间插序列英文名称intervening sequence;IVS定 义基因间或基因内的非编码序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
多序列比对的目标是什么?
多序列比对的目标是使得参与比对的序列中有尽可能多的列具有相同的字符,即使得相同残基的位点位于同一列,这样以便于发现不同的序列之间的相似部分,从而推断它们在结构和功能上的相似关系,主要用于分子进化关系,预测蛋白质的二级结构和三级结构、估计蛋白质折叠类型的总数,基因组序列分析等。
氨基酸序列的测定方法
有两种方法,一是直接测序列法,常用Edman降解法,在弱碱性条件下多肽连N端氨基酸(阿尔发)与PITC反应,标记为苯氨基硫代甲酰蛋白质。肽链中的第一个肽键变弱,在无水酸的存在下发发生降解,第一个氨基酸(AA1)经过分子重排成为PTH-AA1结合层析技术即可确定氨基酸的性质。C端氨基酸残基分析,可用;
依赖核酸序列的扩增技术相关
NASBA的简要过程如下:1.RNA模板链进入反应混合物后,第一个引物首先与模板链的3'端结束。2. 反转录酶,合成反义的补偿的DNA链。3. RNA 酶H(一种核糖核酸内切酶,能够特异性地水解杂交到DNA链上的RNA磷酸二酯键,分解RNA/DNA杂交体系中的RNA链,但不能消化单链或双
DNA共有序列的结构特点
共有序列(consensus sequence) 决定启动序列的转录活性大小。各种原核启动序列特定区域内(通常在转录起始点上游-10及-35区域)存在共有序列(consensus sequence)
着丝粒DNA序列的概念
中文名称着丝粒DNA序列英文名称centromere DNA sequence定 义真核细胞染色体着丝粒部位可与动粒结合的DNA序列。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞化学(二级学科)
分析无心畸胎序列征的病因
无心畸胎序列征的病因不明,已被广泛接受的假说是“血管反向灌注理论”。双胎之间的血管交通极为复杂,存在动脉-动脉异常吻合。在胚胎发育早期,大血管吻合导致两个胎儿间血液循环的相互竞争。当一个胎儿的动脉压超过另一个时,一胎的反向血循环使另一胎的器官形成中断和减少,最终导致无心畸形。受血胎儿与胎盘之间缺
标准核酸序列的使用和维护
标准核酸序列的使用 将按DNA测序技术指导原则测定得到的供试品DNA序列与标准核酸序列进行计算比对,进而结合判定标准进行种属鉴别或鉴定。判定标准的制定应考虑不同物种的变异范围,并在相应通则或品种项下予以明确。核酸序列比对方法一般建议根据样品特点从以下三种方法中选择采用。 1.BLAST法
长散在重复序列的概念
中文名称长散在重复序列英文名称long interspersed repeated sequences定 义以散在方式分布于基因组中的较长的重复序列。重复序列的单元长度在1000bp以上。常具有转座活性。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
核酸序列的扩增技术优势
相对于免疫学方法或其他基因检测法,NASBA在试验的快速、敏感性、特异性方面有更多的优势。 特异性强:NASBA是一种快速、等温的RNA扩增技术,通过AMV逆转录酶和T7 RNA聚合酶进行的扩增反应,因为反应条件温和以及比PCR短的反应时间,因此转录更加忠实于模板,错配率很低,因而特异性更强。
核苷酸序列的分析方法
根据核苷酸序列频率分布的特点和离散傅立叶变换所固有的“栅栏效应”,提出采用调频Z变换的分析方法,定义了相应的表达式,同时构造了短时调频Z变换用于识别基因区域中的外显子部分和内含子部分。与已有的基因区域识别算法相比,该方法不需要依赖于训练样本序列。测试结果表明了该方法的有效性。
端粒DNA-序列的基本信息
端粒DNA 序列(telomere DNA sequence,TEL)端粒的功能是与端粒酶结合,完成染色体末端复制。端粒酶以其自身的RNA 为模板,在染色体端部添加上端粒的重复序列。作为模板的RNA 比较短,含有1.5 个端粒重复单元。端粒结构还能防止染色体融合及降解。 端粒是保护DNA分子中的基因
关于增强子序列的简介
增强子是指能使和它连锁的基因转录频率明显增加的DNA序列。作为基因表达的重要调节元件,增强子序列大多为重复序列,一般长约50bp,适合与某些蛋白因子结合。其内部常含有一个核心序列:(G)TGGA/TA/TA/T(G),是产生增强效应时所必需的。 1981年Benerji在SV40DNA中发现一
核苷酸序列的分析方法
根据核苷酸序列频率分布的特点和离散傅立叶变换所固有的“栅栏效应”,提出采用调频Z变换的分析方法,定义了相应的表达式,同时构造了短时调频Z变换用于识别基因区域中的外显子部分和内含子部分。与已有的基因区域识别算法相比,该方法不需要依赖于训练样本序列。测试结果表明了该方法的有效性。
序列特异性引物的概念
中文名称序列特异性引物英文名称sequence specific primer;SSP定 义一种测定基因突变的方法。即利用针对点突变的2个等位特异性寡核苷酸(ASO)引物(A、B标记其中之一)与另一共同引物(C)组成引物系统;在引物延伸时,A与B同时竞争靶序列上同一复性位点,扩增反应后,经凝胶电泳
简述原核生物的序列结构
与真核生物相比,原核染色体含有更少的基于序列的结构。细菌通常具有一个复制起点,而一些古菌含有多个复制起点 [5] 。原核生物的基因不含内含子,并以操纵子的形式组成基因表达调控单元,这与真核生物也不同。
依赖核酸序列的扩增技术解析
1.概述:依赖核酸序列的扩增(Nucleic acid sequence-basedamplification,NASBA),又称自主序列复制系统(self-sustainedsequence replication,3SR)或再生长序列复制技术。1990年Guatelli等首先报道了这一技术.NA