肽键的空间结构特征

多肽分子中构成多肽链的基本化学键是肽键,肽键与相邻的两个碳原子所组成的基团(—C—CO—NH—C—)称为肽单元。肽链就是由许多肽单元连接而成的,它们构成多肽链的主链骨架。通过对一些简单的肽和蛋白质肽键的X射线晶体衍射法分析,证明肽单元的空间结构具有以下3个显著的特征:1. 肽单元是平面结构。组成肽单元的6个原子位于同一平面内,形成一个肽键的平面结构,称为肽键平面。2. 肽键具有局部双键性质,不能自由旋转。肽键中的C一N键长为0.132nm,比相邻的C一N单键(0.147nm)短,而较一般的C=N(0.127nm)长,介于两者之间。这表明羰基的x电子发生离域现象,使肽键局部具有双键性质,因此C一N之间的旋转受到一定的阻碍。 3. 肽键呈反式构型。由于肽键不能自由旋转,肽键平面上各原子可出现顺反异构现象,与C一N键相连的O与H或两个C。原子之间一般呈较稳定的反式构型。肽键平面中除C一N键不能旋转外,两侧的C一N和C一C。键......阅读全文

营养学词汇异肽键

异肽键:两个氨基酸通过侧链羧基或侧链氨基形成的肽键。

关于离子晶体的空间结构的介绍

  一、对称性  1) 旋转和对称轴 n重轴, 360度旋转, 可以重复n次。  2) 反映和对称面:晶体中可以找到对称面。  3) 反演和对称中心:晶体中可以找到对称中心。  二、晶胞  晶胞是晶体的代表, 是晶体中的最小单位, 晶胞可以无隙并置起来, 得到晶体. 晶胞的代表性体现在以下两个方面:

次氯酸的空间结构是怎样的?

  HClO中,氧的电负性最大,所以氧是中心原子。次氯酸的价层电子对数为(6+2)/2=4。所以次氯酸的VSEPR模型是四面体型,氧是sp³杂化。次氯酸中有2个σ键,有2对成键电子对,所以有2对孤电子对。所以次氯酸的分子构型为V型。

蛋白质的结构及蛋白质的功能(一)

   蛋白质为生物高分子物质之一,具有三维空间结构,因而执行复杂的生物学功能。蛋白质结构与功能之间的关系非常密切。在研究中,一般将蛋白质分子的结构分为一级结构与空间结构两类。  一、蛋白质的一级结构  蛋白质的一级结构(primary structure)就是蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序(

简述酰胺键和肽键的区别

  酰胺键(—CO—NH—)中的C和N原子均为sp2杂化,具有平面结构,氮原子上的孤对电子与羰基之间形成p-π共轭体系。由于N原子上电子对的离域化,CN键的键长比胺中C—N键的键长要短,具有部分双键的性质。另外,氧的吸电子作用也使氮上电子云密度降低,从而使氮的碱性减弱。  肽键都是酰胺键,酰胺键包括

关于蛋白质结构肽键的介绍

  两个氨基酸可以通过缩合反应结合在一起,并在两个氨基酸之间形成肽键。而不断地重复这一反应就可以形成一条很长的残基链(即多肽链)。这一反应是由核糖体在翻译进程中所催化的。肽键虽然是单键,但具有部分的双键性质(由C=O双键中的π电子云与N原子上的未共用电子对发生共振导致),因此C-N键(即肽键)不能旋

土壤养分速测仪进行空间结构的分析

为筛选出与油茶产量、质量相关的土壤养分指标,将油茶土壤15个养分指标与油茶仁含油率、棕榈酸、硬脂酸、油酸、亚油酸、亩鲜果重6个品质指标进行相关分析,根据土壤养分速测仪相关性结果筛选出对油茶品质较敏感的养分指标作为评价指标。 通过土壤养分速测仪的相关仪器应用对广西油茶林地土壤养分指标进行了系统研究,结

蛋白质的空间结构包括哪些

蛋白质是一种生物大分子,基本上是由20种氨基酸以肽键连接成肽链。肽键连接成肽链称为蛋白质的一级结构。不同蛋白质其肽链的长度不同,肽链中不同氨基酸的组成和排列顺序也各不相同。肽链在空间卷曲折叠成为特定的三维空间结构,包括二级结构和三级结构二个主要层次。有的蛋白质由多条肽链组成,每条肽链称为亚基,亚基之

关于芋螺毒素的空间结构介绍

  芋螺毒素(Cys残基排列方式-C-C-CC-C-C-)肽链由24~31个氨基酸组成,分别含有3对二硫键成4-Loop框架。Marian Price-Carter等研究了ω-芋螺毒素MVIIA中二硫键对该毒素的稳定性和肽段折叠的影响,发现每个二硫键均对毒素的稳定构象有重要贡献,缺少任何一个二硫键都

氨基酸脱水缩合分子结合方式

  氨基酸分子结合的方式是由一个氨基酸分子的羧基(—COOH)和另一个氨基酸分子的氨基(—NH2)结合连接,同时脱去一分子水,这种结合方式叫做脱水缩合。连接两个氨基酸分子的(—NH—CO—)其中左数的第二个“—”是叫做肽键的化学键,具有部分双键性质。  其中生成的水分子中的氢来自于氨基和羧基  以此

关于肽键平面的基本内容的介绍

  多肽分子中构成多肽链的基本化学键是肽键,肽键与相邻的两个碳原子所组成的基团(—C—CO—NH—C—)称为肽单元。肽链就是由许多肽单元连接而成的,它们构成多肽链的主链骨架。通过对一些简单的肽和蛋白质肽键的X射线晶体衍射法分析,证明肽单元的空间结构具有以下3个显著的特征:  1. 肽单元是平面结构。

葡萄糖氧化酶的空间结构

GOD是由两个完全相同的糖蛋白经二硫键共价结合而形成的一个同型二聚体结构,每个糖蛋白单体又含有2个区域:一个与底物β-D-葡萄糖以4个α螺旋支撑一个反向平行的β 折叠形式结合;另一个与部分辅基FAD以非共价的β 折叠的形式紧密结合,

简述丝裂原活化蛋白激酶的空间结构

  1、大体结构:  p38与ERK2具有约40%序列同源性。将p38和ERK2的两个结构域同时重叠在一起时,其根均平方(root mean square ,RMS)偏离为0.17nm。JNK与ERK2和p38的同源性分别为40%和51%,其总体结构也与ERK2和p38非常相似。将ERK2和p38的

马克俭:克勤克俭,开拓新空间结构

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500508.shtm 马克俭,我国著名结构工程专家,2007年当选中国工程院院士。 1954年考入中南土木建筑学院(现湖南大学)营造建筑系工业与民用建筑专业。1958年被分配到贵州工学院土建系任教

关于蛋白质结构的一级结构介绍

  蛋白质的一级结构(primary structure)就是蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序(sequence),也是蛋白质最基本的结构。它是由基因上遗传密码的排列顺序所决定的。各种氨基酸按遗传密码的顺序,通过肽键连接起来,成为多肽链,故肽键是蛋白质结构中的主键。  迄今已有约一千种左右蛋白质的

AI指导空间结构优化-开发小型基因编辑工具

近日,南方医科大学基础医学院教授荣知立团队通过空间结构优化和AI结构预测,显著提升了小型CRISPR-Cas12f系统的基因编辑效率,为精准高效的基因治疗提供了新的技术手段。相关成果发表于《自然-通讯》(Nature Communications)。CRISPR-Cas系统作为一种基因编辑工具,因其

二硫键是什么?是肽键吗?怎么脱水的

二硫键(S-S) 是连接不同肽链或同一肽链的不同部分的化学键。二硫键不是肽键。脱水方式:两个二硫键—SH中的H与一个O结合形成一分子水,二硫键变为-S-S-。二硫键由含硫氨基酸形成,半胱氨酸被氧化成胱氨酸时即形成二硫键,二硫键是比较稳定的共价键,在蛋白质分子中,起着稳定肽链空间结构的作用。二硫键数目

氨基酸类衍生物是不是通过肽键链接

氨基酸类衍生物是通过肽键链接。氨基酸通过肽键链接形成肽。一分子氨基酸的α-氨基与另一分子氨基酸的α-羧基脱水缩合形成的共价键(—CO—NH—)称为肽键(peptide bond)。两分子氨基酸缩合成为二肽,二肽仍有自由α-氨基和α-羧基,能同样借肽键与其他氨基酸缩合成三肽,相同的反应可继续进行,依次

什么叫酰胺键?和肽键有什么区别

其实肽键的别名就叫酰胺键。酰胺键是一种带负电性的官能团。在有机化学中,酰胺键是-CO-NH-,其中碳氧成双键,氮氢成单键。酰胺键肽键的区别有:1、范围不一样:肽键都是酰胺键,酰胺键包括肽键但不等同于肽键,酰胺键所指的范围比肽键的大。2、在生物化学中,酰胺键就是指肽键,由一分子氨基酸的氨基与另一分子氨

关于核糖体核酶的介绍

  核糖体由大小两个亚基组成,其rRNA占到组分的50%,剩余的50%是一些小型蛋白。蛋白质的主要作用是维持rRNA的正确折叠,但值得注意的是,所有的催化作用都是rRNA介导的。  核糖体有两个通道:mRNA-tRNA通道(贯穿三个tRNA结合位点:A、P、E)和肽链出口通道。大部分新合成的肽链都是

关于蛋白质变性的介绍

  蛋白质变性(protein denaturation)天然蛋白质受物理或化学因素的影响,分子内部原有的特定构像发生改变,从而导致其性质和功能发生部分或全部丧失,这种作用称作蛋白质的变性作用。  蛋白质是由多种氨基酸通过肽键构成的高分子化合物,在蛋白质分子中各氨基酸通过肽键及二硫键结合成具有一定顺

利用小分子化合物可以改变基因组的空间结构

  研究人员发现,利用小分子化合物可以改变基因组的空间结构,这些小分子化合物被认为是很有前途的抗癌药物。这项工作为开发一类可以改变三维基因组的新的抗癌表观遗传药物开辟了新方向,研究结果发表在《Nature Communications》杂志上。图片来源:Nature Communications  

兔朊病毒蛋白具有独特的空间结构和动力学性质

rabbit prion protein及其I173V突变体的溶液结构  兔子是极少数能抵抗传染性海绵状脑病(TSE)的哺乳动物之一。研究表明,兔朊病毒蛋白(PrPC)与大多数哺乳动物的PrPC不同,它不发生PrPC→PrPSc的构象转变,但其分子机制尚不清楚,预期与兔PrPC蛋白的

关于蛋白质二级结构肽键平面的介绍

  Pauling等人对一些简单的肽及氨基酸的酰胺等进行了X线衍射分析,从一个肽键的周围来看,得知:  (1)肽键平面—肽键中的C-N键长0.132nm,比相邻的N-C单键(0.147nm)短,而较一般C=N双键(0.128nm)长,可见,肽键中-C-N-键的性质介于单、双键之间,具有部分双键的性质

氨基酸的检测方法

1、茚三酮反应(ninhydrin reaction)试剂:茚三酮(弱酸环境加热)颜色:紫色(脯氨酸、羟脯氨酸为黄色)原理:检验α-氨基酸2、坂口反应 (Sakaguchi reaction)试剂:α-萘酚+碱性次溴酸钠颜色:红色原理:检验胍基,精氨酸有此反应3、米隆反应(又称米伦氏反应)试剂: H

蛋白质一级结构介绍生化检验

蛋白质一级结构介绍:蛋白质的一级结构就是蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序,也是蛋白质最基本的结构。它是由基因上遗传密码的排列顺序所决定的。各种氨基酸按遗传密码的顺序,通过肽键连接起来,成为多肽链,故肽键是蛋白质结构中的主键。迄今已有约一千种左右蛋白质的一级结构被研究确定,如胰岛素,胰核糖核酸酶、胰

蛋白质一级结构介绍临床生化

蛋白质一级结构介绍:蛋白质的一级结构就是蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序,也是蛋白质最基本的结构。它是由基因上遗传密码的排列顺序所决定的。各种氨基酸按遗传密码的顺序,通过肽键连接起来,成为多肽链,故肽键是蛋白质结构中的主键。迄今已有约一千种左右蛋白质的一级结构被研究确定,如胰岛素,胰核糖核酸酶、胰

二硫键是什么

二硫键(S-S) 是连接不同肽链或同一肽链的不同部分的化学键。二硫键不是肽键。脱水方式:两个二硫键—SH中的H与一个O结合形成一分子水,二硫键变为-S-S-。二硫键由含硫氨基酸形成,半胱氨酸被氧化成胱氨酸时即形成二硫键,二硫键是比较稳定的共价键,在蛋白质分子中,起着稳定肽链空间结构的作用。二硫键数目

蛋白质三级机构(空间结构)预测-从头预测法

H-P模型是基于三种简化的,即蛋白质中各个氨基酸残基的α碳原子都位于二维网格或三维网格的格点上,疏水作用是蛋白折叠中唯一的重要因素,同时通过计算疏水残基接触的数目代替构象的能量计算。虽然这样的处理非常简单,但是,通过H-P模型的计算分析,能够发现蛋白质折叠的一些机制。如果在蛋白质模型中取消氨基酸定位

蛋白质结构分为四个结构水平是具有特定构象的

蛋白质是具有特定构象的大分子,为研究方便,将蛋白质结构分为四个结构水平,包括一级结构、二级结构、三级结构和四级结构。一般将二级结构、三级结构和四级结构称为三维构象或高级结构。  一级结构指蛋白质多肽链中氨基酸的排列顺序。肽键是蛋白质中氨基酸之间的主要连接方式,即由一个氨基酸的α-氨基和另一个氨基酸的