高通量测序技术研究进展介绍

第二代测序技术, 又称新一代测序技术, 是相应于以Sanger 测序法为代表的第一代测序技术而得名。第二代测序中3种主流测序技术分别为依次出现的 Roche/454 焦磷酸测序(2005 年)、Illumina/Solexa 聚合酶合成测序(2006 年)和 ABI/SOLiD 连接酶测序(2007 年)技术。与 Sanger测序相比, 3种新一代测序技术共有的突出特征是, 单次运行(run)产出序列数据量大, 故而又被通称为高通量测序技术。 研究人员以“高通量测序技术在动植物研究领域中的应用”为题,就高通量测序技术应用于动植物基因组学和功能基因组学研究进展进行了系统阐述,并对当前高通量测序技术的现状和热点及未来的发展趋势作了深入剖析和讨论。 这篇文章从多个方面入手,包括全基因组de novo测序、全基因组重测序、简化基因组测序、转录组测序、数字基因表达谱技术、小RNAs 测序、降解组测序和基于测序的......阅读全文

高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用(一)

在人体肠道中生活着数以万亿的共生菌群,它们的种类繁多,可达上千种,数量也很惊人,是人体细胞总量的10倍以上,迄今为止,仍有80%以上的微生物不为人知。这些肠道微生物和人体存在着互利共生的关系,对于维持人类的健康发挥着重要的作用。它们在肠道中保持着一种动态的平衡,能够合成维生素、帮助人体从食物中吸收营

单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里

单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析-1

随着人类基因组计划(human genome project )在2003年顺利完成,基因组测序技术取得了长足的进步,这直接导致了每兆基因组成本的大幅下降以及检测的基因组数量越来越多。人们对基因组的复杂性深感震惊,这也引导着测序技术的进一步发展。最近的一些突破性技术使得测序技术在更短的时间内可以

在CRISPR/Cas9相关研究中应用高通量测序技术(二)

四.CRISPR/Cas9技术与新一代测序技术的联用 革命性技术总是发展迅速、应用广泛的。作为另一项革命性的生命科学研究技术,DNA新一代测序技术在近五、六年得到快速发展和推广。它已经用于生命科学相关领域的许多方面。同样地,也可以用在CRISPR/Cas9相关的研究中。两者之间的应用领域有许多交叉或

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析-3

边合成边测序:SNA(454,Ion Torrent)与CRT不同的是,SNA方法依赖于单信号标记dNTP来对链进行延伸。四种核糖核酸都必须反复添加到测序反应过程中。不仅如此,SNA不需要将dNTP屏蔽,因为测序反应过程中下一个碱基的缺失会阻止链的延伸。碱基的寡聚体则是一个例外,在这种情况下,信号的

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析-4

表一:NGS平台概述。单分子长读长测序(PacBio和ONT)最近这段时间,最常用的长读长测序法平台就是使用PacBio Biosciences(PacBio)57的单分子实时测序法(single-molecule real-time sequencing, SMRT)(图5a)。该设备使用

高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用(三)

一、饮食、能量摄取、肥胖与肠道菌群之间的关系:1.  A core gut microbiome in obese and lean twins——2009《Nature》——if 36.102.  An obesity-associated gut microbiome with increase

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析-5

图5: 长读长实时测序原理。长reads的合成与真正测序的平台不同的是,合成长读长技术依赖于一个barcode系统来结合不同的片段,通过已有的短读长测序仪来获得长读长reads61。该方法将大的DNA分子分割成若干个小片段到微孔中或者乳液中。每个微孔或者乳液中的模板被切割并且加上了barcodes。

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析-6

应用WGS正在成为NGS中最广泛的应用。通过该技术并且结合生物学应用,研究人员可以获得基因组信息中最值得注意的信息73。举例来说,2012年,Ellis等报道了基因与乳腺癌患者芳香酶抑制剂(aromatase inhibitor)治疗法之间的关联。他们指出突变,后果与诊断之间的关联,同样还有

新技术实现单端高通量测序的平衡易位携带者筛查

  染色体平衡易位是人类中最多见的一类染色体结构畸变,在新生婴儿中的发生率约为1/500~1/1000。平衡易位携带者通常没有临床表征,传统的诊断办法无法识别胚胎的染色体平衡易位携带状态。如今,研究人员攻克技术难关,成功研发BaseMapping技术,实现了单端高通量测序的平衡易位携带者筛查。  新

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析-2

边连接边测序(SOLiD和Complete Genomics)从根本上来说,SBL法包含了杂交和对标记的探针的连接15。探针包含了一到两个特定碱基序列和一系列通用序列,这可以使得探针与模板之间进行互补配对。锚定的片段则包含一段已知的和接头互补的序列用于提供连接位点。连接之后,模板被系统进行测序反应1

Predica与华大智造携手开启肿瘤精准医疗新纪元:高通量测序平台赋能靶向RNA测序技术

  7月11日,肿瘤诊断领域的领先创新者Predica Diagnostics与华大智造宣布达成合作,共同在华大智造高通量测序平台上开发Predica的靶向RNA测序技术,助力精准医疗。  此次合作旨在通过实现早期癌症检测和促进个性化靶向治疗策略,通过将Predica Diagnostics的先进测

DNA测序的测序技术

高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(Next-generation sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以

关于基因组高通量测序的基本介绍

  高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(

PNAS:高通量测序揭示B细胞的生死抉择

  作为机体免疫应答的中坚力量,B细胞时刻准备着识别和摧毁入侵机体的抗原(包括感染和癌细胞)。为了做好这项工作,每一个新生B细胞都配备了高度特异性的武器——与抗原特定部分选择性结合的抗体蛋白。B细胞的成熟要经过仔细的筛选,要么被选中得以成熟,要么被淘汰而死去。这一过程的关键在于,决定B细胞特异性的抗

高通量测序基因分型系统规范-即将实施!

  国家标准《信息技术 生物特征识别 高通量测序基因分型系统规范》将于2023年12月1日正式实施。 该标准由TC28(全国信息技术标准化技术委员会)归口,TC28SC37(全国信息技术标准化技术委员会生物特征识别分会)执行 ,主管部门为国家标准化管理委员会。  主要起草单位 深圳华大法医科技有限公

高通量单细胞转录组测序发展与展望

单细胞转录组测序技术这几年的发展之快,运用之广已众所周知。为更好的在国内推广该技术,也为更好的将该技术运用到广大科研工作者的实际工作中,上海生物芯片有限公司生物信息团队通过对该技术的整理和归纳,在《生命科学》杂志上发表了名为“高通量单细胞转录组测序发展与展望”综述文章,希望能进一步提升科研工作者对该

中国高通量测序、生物信息服务公司表

  1. 华大基因。    137台HiSeq;3台MiSeq; 31台Proton。    全方位高通量测序应用。    联系方式:400-706-6615,info@bgitechsolutions.com   2. 药明康德基因中心。    4台HiSeq;4台MiSeq;1台

一篇就够了,带你了解高通量测序!

说到近十年来发展最迅猛的生物技术,首先想到了高通量测序,我们研究基因组学都离不开它。目前,高通量测序已经深入到生命科学的各个领域,不仅有力地推动了基础研究的发展,也在逐渐征服临床应用。所谓的高通量测序技术,又名大规模平行测序,是将 DNA(或者 cDNA)随机片段化、加接头,制备测序文库,通过对文库

药物高通量筛选技术

药物高通量筛选技术简单介绍一下关于药物高通量筛选技术的知识。一.概念高通量筛选(High throughputscreening,HTS)技术是指以分子水平和细胞水平的实验方法为基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机对实验数

什么是普通的基因测序,它和高通量测序有什么区别

  “普通的基因测序”应该是指“常规DNA测序”吧,是用Sanger法(也就是双脱氧法)进行测序的方法,目前非常普遍的是直接用ABI 3730xl 进行的自动测序,基本上可以做到600bp-800bp的读长。  高通量测序的概念其实是一个相对的概念,在2000年的时候,3700、MegaBace等仪

高通量测序技术鉴定新生儿窒息性胸廓发育不良症2

A: 全外显子组测序显示患儿存在DYNC2H1基因c.8512C>T(p.R2838*)突变; B: 全外显子组测序显示患儿存在DYNC2H1基因c.10163C>T(p.P3388L)突变图 2   患儿全外显子组测序DYNC2H1突变截屏图A: Sanger测序验证患儿存在DYNC2H1基因

高通量测序技术鉴定新生儿窒息性胸廓发育不良症1

窒息性胸廓发育不良(asphyxiating thoracic dystrophy,ATD), 由Jeune等于1955年发现, 又称为Jeune综合征(Jeunesyndrome)[1-2], 是一种罕见的常染色体隐性遗传病, 为多系统受累疾病, 在活产新生儿中发病率约1/130 000~1/10

基于高通量测序技术(NGS)的肿瘤基因变异检测伴随诊断试剂的检测范围

  基于高通量测序技术(NGS)的肿瘤基因变异检测伴随诊断试剂的检测范围可以包括哪些基因及位点?  基于高通量测序技术(NGS)检测人福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织样本的肿瘤基因变异检测伴随诊断试剂,针对特定的适应证,其检测范围基于方法学特点一般包括多个变异基因及变异位点。  上述变异基因及位

污染水体土著微生物DNA稳定同位素探针和高通量测序技术

  当污染环境中的土著微生物缺乏降解能力时,可通过从环境中分离具有较强污染物降解能力的土著微生物,经过扩大培养,再接种到原环境,用以提高污染物降解。这就是所谓土著微生物强化技术,在环境修复方面具有巨大的应用潜力。对土壤多环芳烃(PAHs)的研究表明,土著微生物强化技术能够显著提高PAHs的矿化速率,

强强联合:在CRISPR/Cas9相关研究中应用高通量测序技术

  摘要:   CRISPR/Cas9基因组编辑技术和新一代测序技术(也称高通量测序技术),是当今对生命科学研究有重大影响的两项技术。二者并非毫不相干。有效地将二者联用,有时可以大大加速科研进程。两者之间有什么样的联系呢?在哪些研究领域或方向上可以联用呢?上海伯豪生物根据在这两个领域的技术服务经验

DNA测序技术的测序规律

生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等,因此上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物,这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。在可以区分长度仅差一个核苷酸

DNA测序技术的测序原理

化学修饰法测序原理化学试剂处理末段DNA片段,造成碱基的特异性切割,产生一组具有各种不同长度的DNA链的反应混合物,经凝胶电泳分离。化学切割反应:包括碱基的修饰,修饰的碱基从其糖环上转移出去在失去碱基的糖环处DNA断裂。Sanger法测序的原理就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物

IntegraGen为巴斯德研究所提供高通量测序服务

  IntegraGen公司今天宣布与巴斯德研究所达成合作协议,在微生物学领域开展高通量测序。  根据协议细则,IntegraGen公司将为法国国家参考中心与巴斯德研究所微生物基因组文库提供测序服务。另外,IntegraGen公司也将开发一款新型管理软件以供巴斯德研究所内部使用。  合作双方表示,该

罗氏454高通量测序平台的特点及应用

Genome Sequencer FLX (GS FLX)系统是罗氏454 公司的第二代测序台,GS FLX的命名正是来源于其在多领域的灵活(flexible)应用。随着该系统性能和应用领域的不断提升和扩展,必将带动整个测序领域的技术发展,对大规模基因序列研究的相关应用领域产生巨大的推动作用。美吉生