加拿大建成首个人类小分子代谢物数据库
加拿大阿尔伯塔大学的研究小组日前宣布,他们建成了世界上首个人类小分子代谢物组数据库。专家认为,这将对许多传染病、遗传病或环境引发的疾病的诊断、预防和监测产生重大影响。 人类小分子代谢物组是所有人体内产生的小分子代谢物的总称,是化学意义上的“人类基因组”。科学家认为,如果说人类基因组描绘了生命的蓝图,那么就可以讲小分子代谢物组展示的是生命的成分。由于小分子代谢物对人体健康和生理的影响更为直接,研究小组认为该项目将比人类基因组计划带来更加直接的医疗影响。 小组发表在最新一期《核酸研究》杂志上的报告称,目前,科学家已经在人体中分析识别出了2500多种小分子代谢物、1200种药物分子和3500种食物成分。加拿大人类小分子代谢物组计划起步于2004年。参与该计划的50位科学家分别来自阿尔伯塔大学和卡尔加利大学。他们在2年半的时间里研究并收集了所有已知的人类代谢物及其与化学、生物和疾病有关的数据,将其编入了人类小分子代谢物组......阅读全文
细胞代谢信号通路相关的基因介绍CDK8基因
该基因编码细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶(cdk)家族的一个成员。cdk家族成员是细胞周期进展的重要调节者。这种激酶及其调节亚单位,细胞周期蛋白c,是介体转录调节复合物的组成部分,参与转录激活和rna聚合酶ii最大亚单位羧基末端结构域磷酸化的抑制。该激酶通过靶向一般转录起始因子iih的细胞周期蛋白依赖性
细胞代谢信号通路相关的基因介绍GATA2基因
该基因编码一个锌指转录因子GATA家族的成员,该家族以它们在靶基因启动子区域结合的一致核苷酸序列命名。编码蛋白在调节参与造血和内分泌细胞谱系发育和增殖的基因转录中起着重要作用。选择性剪接导致多个转录变体。This gene encodes a member of the GATA family of
细胞代谢信号通路相关的基因介绍PARP2基因
聚[ADP-核糖]聚合酶2是人体中由PARP2基因编码的酶。 它是PARP家族的酶之一。 该基因编码聚(ADP-核糖基)转移酶样2蛋白,其含有催化结构域并且能够催化聚(ADP-核糖基)反应。 该蛋白质具有与聚(ADP-核糖基)转移酶同源的催化结构域,但缺少激活聚(ADP-核糖基)转移酶的C-末端催化
细胞代谢信号通路相关的基因介绍ABCC1基因
该基因编码的蛋白质是atp结合盒(abc)转运蛋白超家族的成员。abc蛋白通过细胞外和细胞内的膜运输各种分子。abc基因分为七个不同的亚家族(abc1,mdr/tap,mrp,ald,oabp,gcn20,white)。这种全转运蛋白是mrp亚家族的一员,参与多药耐药。该蛋白作为一种多特异性有机阴离
细胞代谢信号通路相关的基因介绍ABCG2基因
由该基因编码的膜相关蛋白包含在ATP结合盒(ABC)转运子的超家族中。ABC蛋白通过细胞外膜和细胞内膜转运各种分子。ABC基因分为7个不同的亚家族(abc1,mdr/tap,mrp,ald,oabp,gcn20,white)。这种蛋白是白色亚家族的成员。或者称为乳腺癌抵抗蛋白,这种蛋白作为外源性转运
细胞代谢信号通路相关的基因介绍FBXW7基因
FBXW7基因所编码的蛋白属于F-box蛋白家族的一员,为SCF(SKP1-cullin-F-box)型泛素连接酶的靶蛋白识别成分,包含了若干蛋白质相互作用的保守结构域。作为泛素蛋白酶体降解途径的重要识别因子之一,FBXW7的底物很多都是癌基因,例如cyclinE、 c-myc、c-jun及Notc
细胞代谢信号通路相关的基因介绍FAT1基因
这个基因是果蝇脂肪基因的一个直系同源基因,它编码一种在果蝇发育过程中控制细胞增殖所必需的肿瘤抑制因子。该基因产物是钙粘蛋白超家族的一员,是一组完整的膜蛋白,具有钙粘蛋白型重复序列。该基因产物除含有34个钙黏蛋白串联型重复序列外,还含有5个表皮生长因子(egf)样重复序列和1个层粘连蛋白a-g结构域。
细胞代谢信号通路相关的基因介绍AKT2基因
这个基因是一个假定的癌基因,编码一个属于丝氨酸/苏氨酸激酶亚家族的蛋白质,包含sh2样(SRC同源2样)结构域。该基因在8个卵巢癌细胞系中的2个和15个原发性卵巢肿瘤中的2个被扩增和过度表达。过度表达导致人导管胰腺癌亚群的恶性表型。编码蛋白是一种普通的蛋白激酶,能够对几种已知的蛋白进行磷酸化。Thi
细胞代谢信号通路相关的基因介绍ABCC4基因
该基因编码的蛋白质是atp结合盒(abc)转运蛋白超家族的成员。abc蛋白通过细胞外和细胞内的膜运输各种分子。abc基因分为七个不同的亚家族(abc1,mdr/tap,mrp,ald,oabp,gcn20,white)。该蛋白是mrp亚家族的一员,参与多药耐药。这一家族成员在细胞解毒过程中扮演着泵的
细胞代谢信号通路相关的基因介绍IDH1基因
IDH1基因所编码的蛋白名为异柠檬酸脱氢酶1,人类IDH有三种类型,分别为IDH1、IDH2和IDH3,IDH1定位与细胞质和过氧化物酶体中,IDH2和IDH3定位与线粒体中。该类蛋白酶可以将异柠檬酸氧化为草酰琥珀酸,然后在转化为α-酮戊二酸。最先研究发现IDH1的突变与脑胶质瘤密切相关,之后又发现
细胞代谢信号通路相关的基因介绍HNF1A基因
该基因编码的蛋白是一种转录因子,在肝脏中高度表达并参与多种肝脏特异性基因的表达调控。HNF1A基因突变会引起糖尿病。HNF1A基因的27个单核苷酸多态性(SNP)与冠状动脉疾病的风险增加有关。
北京基因组所开发表观组关联分析数据库
近日,由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核
华中农大建成全球首个水稻基因索引数据库
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498200.shtm 华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室张建伟教授课题组近日发表最新研究成果,他们建成世界上首个基于同源基因的水稻泛基因组综合数据库——水稻基因索引数据库。 据
全国HIV毒株的基因变异和流行特征数据库建立
为查清我国目前艾滋病病毒HIV-1亚型的种类和变化、新重组病毒的类型及其在人群中的传播特点,并利用其研究成果解决我国HIV防治工作中遇到的实际问题,以中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心牵头,在全国各省疾病预防控制中心的积极配合下开展了我国HIV毒株的基因变异和流行特征研究。该项目日前获得20
华中农大建成全球首个水稻基因索引数据库
华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室张建伟教授课题组近日发表最新研究成果,他们建成世界上首个基于同源基因的水稻泛基因组综合数据库——水稻基因索引数据库。据介绍,这个数据库如同一本近义词词典。在数据库里,亚洲稻的每一个基因都能轻松找到同源或相近的基因,以及追踪其演变历史。目前,数据库
《植物学报》英文版基因信息被TAIR数据库收录
《植物学报》英文版(Journal of Integrative Plant Biology,JIPB)已和国际最完善的物种基因功能数据库TAIR建立正式合作关系,TAIR将于2010年5月开始收录发表于JIPB的所有关于拟南芥的基因数据(含过刊)。今后,读者将可以直接从TAIR点击发
我国发布首个柑桔全基因组变异数据库
近日,《园艺研究》(Horticulture Research)在线发表了中国农业科学院柑桔研究所构建完成的柑桔全基因组变异数据库CitGVD(http://citgvd.cric.cn/home),这是第一个园艺类作物全基因组变异数据库。 柑桔是全世界最重要的商业水果作物之一。当前,柑桔类物
南京农大构建世界首个植物重复基因数据库
图片说明:植物界不同类型重复基因含量分布及其随时间变化规律 2月21日,南京农业大学园艺学院教授张绍铃团队在国际著名学术期刊Genome Biology在线发表研究论文,系统鉴定了梨等141种植物基因组中不同类型重复基因,构建世界首个植物重复基因数据库,揭示重复基因进化的普遍规律。 植物在千百年
线粒体或能改变机体的代谢和基因表达!
大约15亿年前,微小的访客来到细胞中生活,随后这些细胞进化成为植物和动物生命(包括人类),这些访客就是线粒体,其是一种小型的细胞器,能够产生细胞生存所需要的大约90%的化学能量,从进化学的角度来讲,人类、动物和植物实际上是两种有机体的完美结合。线粒体拥有自身的DNA,人类细胞的线粒体有13个基因
肿瘤代谢基因调控的新机制揭示
中国科学技术大学生命科学学院高平课题组和张华凤课题组在肿瘤代谢基因调控研究领域取得重要进展,相关研究成果日前在线发表于《自然·通信》上。 众所周知,肿瘤通过对自身细胞代谢的重编程而获得增殖优势。因此,探索肿瘤代谢异常的机制已成为肿瘤研究的焦点。c-Myc是一个重要的癌基因,它的异常表达会导致3
酒精代谢能力基因检测能测什么
酒精代谢能力基因检测能测什么可以的,研究表明人们的对酒精的这种耐受性相关的不同表现,主要与其自身的酒精代谢能力有关。那么,酒精代谢能力为什么会出现如此重大的差别?现代医学研究认为,关键在于基因,不同的基因决定了对酒精的不同的敏感度和代谢能力。从而导致有些人千杯不醉,有些人却半杯就醉。每个人体内乙醇脱
细胞代谢信号通路相关的基因介绍CYP3A5基因
该基因编码细胞色素p450酶超家族的一个成员。细胞色素p450蛋白是一种单加氧酶,催化药物代谢和胆固醇、类固醇等脂类的合成。编码的蛋白质代谢药物以及类固醇激素睾酮和孕酮。该基因是7q21.1染色体上一组细胞色素p450基因的一部分。该基因的两个假基因已在7号染色体上的这个簇内被鉴定出来。该基因的表达
细胞代谢信号通路相关的基因介绍SCL22A16基因
该基因编码一个转运肉碱的两性离子转运蛋白家族成员。编码的蛋白质也被证明可以运输抗癌药物如博莱霉素(pmid:20037140),成功的治疗与肿瘤细胞中这种转运蛋白的活性水平有关。[由RefSeq提供,2011年12月]This gene encodes a member of the organic
细胞代谢信号通路相关的基因介绍MEF2b基因
该基因的产物是mads/mef2家族dna结合蛋白的一员。该蛋白被认为可以调节基因表达,包括平滑肌肌球蛋白重链基因的表达。该区域经历了相当多的选择性剪接,转录本支持两个不重叠的位点(基因ID 729991和100271849)以及跨越两个位点的大量通读转录本(注释为基因ID 4207)。该蛋白的几个
细胞代谢信号通路相关的基因介绍PIK3CG基因
磷酸肌醇3激酶(pi3ks)是肌醇磷脂的磷酸化产物,参与免疫应答。该基因编码的蛋白质是PI3K的I类催化亚单位,与其他I类催化亚单位(p110αp110β和p110δ)一样,编码蛋白结合p85调节亚单位形成pi3k,该基因位于先前在髓性白血病中发现的第7号染色体的一个普遍缺失片段。已经发现了一些编码
细胞代谢信号通路相关的基因介绍IGF1R基因
胰岛素样生长因子1(IGF-1)受体是在人细胞表面发现的蛋白质。 它是一种跨膜受体,被称为胰岛素样生长因子1(IGF-1)的激素和称为IGF-2的相关激素激活。 它属于大类酪氨酸激酶受体。 该受体介导IGF-1的作用,IGF-1是一种与胰岛素分子结构相似的多肽蛋白激素。 IGF-1在生长中起重要作用
细胞代谢信号通路相关的基因介绍IGF2R基因
这个基因编码胰岛素样生长因子2和6-磷酸甘露糖的受体。每个配体的结合位点都位于蛋白质的不同片段上。该受体具有多种功能,包括溶酶体酶的细胞内转运、转化生长因子β的激活和胰岛素样生长因子2的降解。该基因的突变或杂合性丧失与肝癌的风险有关。直系小鼠基因被印记,显示来自母体等位基因的唯一表达;然而,人类基因
细胞代谢信号通路相关的基因介绍PIK3CA基因
PIK3CA基因编码的蛋白是PI3Ks的催化亚单位,PI3Ks是一种脂激酶家族,能特异性磷酸化磷脂酰肌醇的3位羟基,产生第二信使肌醇类物质。PI3Ks家族分I型、II型和III型,其中IA型又分为IA和IB两个亚型,PIK3CA则是IA型的催化亚单位。PIK3CA基因的突变可以导致PI3Ks的催化活
细胞代谢信号通路相关的基因介绍UGT1A1基因
这个基因编码一个UDP葡萄糖醛酸基转移酶,一种葡萄糖醛酸化途径的酶,能将小的亲脂性分子,如类固醇、胆红素、激素和药物,转化为水溶性、可排泄的代谢物。这个基因是一个复杂基因座的一部分,编码几个UDP葡萄糖醛酸转移酶。该位点包括13个唯一的交替第一外显子,随后是4个常见外显子。四个交替的第一外显子被认为
细胞代谢信号通路相关的基因介绍INPP4B基因
inpp4b编码肌醇聚磷酸4-磷酸酶Ⅱ型,它是磷脂酰肌醇信号传导途径中的一种酶。这种酶从3,4-二磷酸肌醇中除去肌醇环4位的磷酸基团。有有限的数据表明,人类II型酶受到选择性剪接的影响,正如已经为I型酶建立的那样。[由RefSeq提供,2008年7月]INPP4B encodes the inosi