单细胞测序数据分析中，如何避免假阳性结果？
在单细胞测序数据分析中，为避免假阳性结果，可以采取以下几种策略： 1. 严格的数据质量控制 - 对原始数据进行仔细的评估，去除低质量的细胞、测序深度不足或存在大量技术噪声的数据。 - 检查基因表达的分布是否符合预期，排除异常的数据点。 2. 合适的统计学方法和阈值设定 - 选择适当的统计检验方法，并根据数据特点和研究目的合理设定 p 值等阈值。避免过于宽松的阈值导致假阳性。 - 进行多重检验校正，如 Bonferroni 校正、FDR 校正等，以控制总体的假阳性率。 3. 生物学验证 - 对于通过数据分析得到的显著结果，尽可能通过独立的实验方法进行生物学验证，如 qPCR、免疫组化、Western blot 等。&n......阅读全文
单细胞测序方法介绍
单细胞RNA测序（scRNA-seq）作为一种全基因组测序的方式，在单细胞层面广泛用于确定细胞类型和细胞变异的鉴定。Namocell单细胞分离仪可以通过细胞标记CD27以及一种细胞活性的染料，来分选出单个活的B细胞。通过分析分离后的单细胞基因表达情况，对比静息记忆B细胞，可以从单细胞层面研究基因表达
什么是单细胞测序？
单细胞测序是一种能够在单个细胞水平上对基因组、转录组、表观遗传组等进行分析的技术。通过单细胞测序，可以：揭示细胞的异质性：了解即使是看似相同的细胞群体中，每个细胞在基因表达、染色质可及性等方面的独特特征。发现新的细胞类型和状态：识别出传统方法难以区分的稀有细胞类型以及细胞在不同生理或病理条件下的特殊
单细胞生物的种类
概括 单细胞生物主要分有核和无核的单细胞。 有核的如草履虫就是典型的有核单细胞生物。有核单细胞生物主要由细胞核、细胞质、还有细胞器。 它包括：线粒体、高尔基体、核糖体、细胞膜、这是动物型单细胞。如果是植物型单细胞比如 红藻，就是细胞壁、细胞核、细胞质，它的细胞器就包括线粒体、高尔基体、核糖体
时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术的区别
时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术主要有以下区别：空间信息获取传统单细胞测序：通常无法获取细胞在组织中的空间位置信息，只是对分离出的单细胞进行独立分析。时空分辨单细胞测序：能够在测定单细胞基因表达等信息的同时，明确细胞在原始组织中的具体空间位置。细胞互作研究传统单细胞测序：难以直观地揭示基于
时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术的差异
时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术主要在以下方面存在区别：空间信息获取普通单细胞测序技术：通常不提供细胞在原始组织中的空间位置信息。时空分辨单细胞测序技术：能够同时获取细胞的基因表达等信息以及它们在组织内的空间位置。细胞间相互作用分析普通单细胞测序技术：难以直接推断细胞间基于空间位置的相互作
时空分辨单细胞测序技术与传统单细胞测序技术有何不同？
时空分辨单细胞测序技术与传统单细胞测序技术主要有以下几个方面的不同：空间信息获取传统单细胞测序技术通常无法提供细胞在组织中的空间位置信息，只是对分离的单细胞进行独立分析。时空分辨单细胞测序技术能够在获取单个细胞基因表达等信息的同时，明确细胞在组织中的具体位置。细胞间相互作用研究传统技术难以直接揭示细
单细胞表观组学：单细胞ChIPseq解码细胞命运决定机制
在国家重点研发计划“干细胞及转化”重点专项（批准号：2017YFA0103402）等资助下，北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬课题组近期突破单细胞表观遗传研究的瓶颈，开发了两种具有普适性、操作简单、风格迥异的单细胞ChIP-seq技术，可适应于不同课题研究需要，解析发育与疾
单细胞mRNA差异显示实验
实验方法原理 ##流程图试剂、试剂盒 溶液和缓冲液仪器、耗材 水浴槽PCR热循环仪微量离心机塑料制品和滤器实验步骤 一、RNA 的分离收集对照组和实验组细胞，放入含 45ul2 mmol/L DTT 的 1.5 ml 微量离心管中。95℃ 水浴热解 2 min。每管加入以下物质：37℃ 温育 30
单细胞生物的科技应用
单细胞分析 单细胞分析是分析化学、生物学和医学多学科相互渗透发展形成的跨学科前沿领域。单细胞分析的各种方法，包括毛细管电泳、微流控芯片、多种光学显微镜（荧光显微镜、聚焦荧光显微镜、全内反射荧光显微镜、多光子荧光显微镜、荧光相关显微镜、近场扫描光学显微镜等）、扫描电化学显微镜、质谱成像、原子力显
单细胞分选效率的分析
引言在单克隆细胞培养时，手动有限稀释法是最经典的分离单细胞手段之一。这种方式分离单细胞，每个孔中落进去的细胞数目符合泊松分布。依靠单细胞分选仪器分离单细胞的效率，无论从分选能力还是重复性都要明显优于手动的有限稀释方法。测定一款设备分选效率的标准方法，是用荧光校准微球来分选检验。实验方法Namocel
单细胞分离仪最新应用
随着人们对环境研究的不断深入，研究人员逐渐将目光转向藻类的单细胞层面：有些需要对藻类进行单细胞级别的分析（如藻类单细胞测序等），也有需要对单细胞藻类进行培养。这样就面临一个棘手的问题，那就是如何获取藻类的单个细胞。通常实验室里的方式，是在显微镜下用毛细管吸取。这种方式比较直观，对哪个细胞感兴趣就挑哪
新型单细胞活性分析技术
近日，一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究论文中，来自加利福尼亚大学的研究人员通过运用一种分析单一细胞基因活性的先进技术，鉴别出了人类大脑脑细胞的特性，该研究揭示，如今进行大规模的细胞调查分析比过去我们所认为的要更加高效，而且廉价。 研究者Arnold
单细胞生物也具有“智慧”
虽然"智慧"是一种十分复杂难以定义的概念，我们却都明白具备一个大脑是生物具有智慧的生理前提。但是对于单细胞生物来讲，它们是否也存在智慧呢？ 如果我们坚信智慧来源于大脑，那么答案就是否定的。不过，最近一项研究表明情况比我们想象的要复杂，研究者们发现"无脑"的单细胞生物也具有学习的能力。 正如科
单细胞生物的主要影响
单细胞生物虽然个体微小，但是与人类的生活有着密切的关系。多数单细胞生物是浮游生物的组成部分，是鱼类的天然饵料。草履虫对污水净化有一定的作用，据统计，一只草履虫每小时大约能形成60个食物泡，每个食物泡中大约含有30个细菌，因此，一只草履虫每天大约能吞食43000个细菌。但是单细胞生物也有对人类有害
单细胞蛋白的营养特性
单细胞蛋白质饲料由于原料及生产工艺不同，其营养成分组成变化较大，一般风干制品含粗蛋白质在50%以上。因为这类蛋白质是由多个独立生存的单细胞构成，所以富含多种酶系。动物对其消化率高。例如，猪对啤酒酵母的消化率可达92%，对木糖酵母的消化率可达88%。必需氨基酸组成和利用率与优质豆饼相似。单细胞生物
单细胞研究指南：细胞分离
多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过，近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们，每一个细胞都是独一无二的。不同类型的细胞激活特定组合的机制，即使是同类型细胞，基因表达也会出现差异。 那么，细胞之间的哪些差异有生物学意义，哪些差异来自于技术偏好呢？要获得可靠的结果又需要研究多少细胞呢？这
单细胞mRNA差异显示实验
实验方法原理 ##流程图 试剂、试剂盒 溶液和缓冲液 仪器、耗材
单细胞分析重大突破
生物学家对单个细胞的行为而不是对整个细胞群体的行为越来越感兴趣。在一项新的研究中，来自瑞士联邦理工学院（ETH）的研究人员开发出一种新方法可能引发单细胞分析变革。这一技术利用世界上zui小的注射器来对单个细胞的内含物进行取样以便进行分子分析。相关研究结果发表在2016年7月14日那期Cell期刊上，
单细胞动物的进化过程
当生命进化到真核细胞以后，便有了动物和植物之分。最早的动物叫原生动物，是最低等的一类动物，它的个体是由一个细胞构成的。仅管如此，“麻雀虽小却五脏俱全”，这是一个完整的生命活动体，拥有作为一个动物应具备的主要生活机能，如新陈代谢、刺激感应、运动和繁殖等，它的体内有了原始的分化，各具一定功能，形成了
单细胞生物的相关介绍
单细胞生物指的是身体只有一个细胞，在生物圈中还有肉眼很难看见的生物。 生物可以根据构成的细胞数目分为单细胞生物（Protozoa）和多细胞生物（Metazoa）。单细胞生物只由单个细胞组成，而且经常会聚集成为细胞集落。单细胞生物个体微小，全部生命活动在一个细胞内完成，一般生活在水中。 第一个
单细胞蛋白的生产特性
单细胞蛋白质生产周期短。单细胞生物繁殖特别快，世代周转迅速。如酵母菌在良好条件下每接种100千克，1天即可获得2500千克酵母，其生长繁殖速度约为大豆的1300倍，为动物生长的2000倍。所以，这类饲料生长速度快，世代周转迅速。 生产单细胞蛋白质饲料产品的原料多为烃类及其衍生物、天然气、石油加
单细胞mRNA差异显示实验
目前有几种方法可以显示生理刺激下组织样本中未知基因的表达水平变化。然而, 很多组织内的细胞又存在形态和功能上的异质性，因此常常需要从单个细胞水平研究基因表达的差异。现在，我们介绍一种新方法，它常规用来在单细胞水平考察未知基因的差异性表达。现代神经科学研究技术作者：U.Windhorst & H. J
单细胞铺板的原理介绍
单细胞铺板是将一个孔加入少量无血清培养基，晃动浸润整个孔底，然后用移液枪吸至第二孔，同样方法浸润孔底，其它孔依此类推，这样整个孔底都是湿润的，细胞悬液会平铺在整个孔底。 加细胞悬液的时候可以避免加在中间中间细胞多，而加在周边晃匀后周边细胞多中间少的现象，细胞分散较均匀，注意加完细胞悬液后要放工作台
单细胞测序的临床应用
近期精准医学的进展集中在发展基于基因组学的诊断和治疗。这些方法通常包括从患者的组织样本中生成DNA或RNA序列信息，并分析它以确定可用于诊断、预后或通知临床管理的特定特征。‘bulk’一词指的是从大量细胞中集体生成基因组数据的方法，或者在无细胞DNA的情况下，来自许多细胞的基因组材料。因此，这些基因
单细胞凝胶电泳介绍
单细胞凝胶电泳（single-cell gel eiectrophoresis，SCGE）又称慧星试验（comet assay）是一项较新的电泳方法。自1978年被Rydcbert B.等人成功地用于检验DNA单链断裂以来，经过不断的改进，已成为一种快速、灵敏、简便的检测DNA损伤的方法，广泛地应用
单细胞生物的生产特性
单细胞蛋白质生产周期短。单细胞生物繁殖特别快，世代周转迅速。如酵母菌在良好条件下每接种100千克，1天即可获得2500千克酵母，其生长繁殖速度约为大豆的1300倍，为动物生长的2000倍。所以，这类饲料生长速度快，世代周转迅速。 生产单细胞蛋白质饲料产品的原料多为烃类及其衍生物、天然气、石油加
单细胞测序基准数据集对单细胞分析方法的发展有哪些影响？
单细胞测序基准数据集对单细胞分析方法的发展具有多方面的重要影响：促进方法的比较和评估为不同的单细胞分析方法提供了共同的测试平台，使得研究人员能够客观地比较各种方法的性能，从而筛选出更优的方法。推动方法的改进和优化当新的分析方法在基准数据集上表现不佳时，能够促使开发者反思和改进算法，以提高准确性和可靠
多功能单细胞显微操作系统FluidFM－BOT在单细胞力学实验...
多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT在单细胞力学实验中的创新应用瑞士Cytosurge公司的多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT，是将原子力系统、微流控系统、纳米位移台系统合为一体的单细胞操作系统，能够在单细胞水平上为研究者提供很大的便利，可应用于单细胞力谱、单细胞质谱、单细
解读单细胞RNAseq技术
多年来，跟踪一个单细胞的转录组，超出了我们的能力。但是现在，时代已经变了，新的单细胞RNA-seq方法，可以分析大量的细胞及它们的命运。 我们都参加过大型生日派对：在拥挤的房间里，与许多人聊天、吃饭和庆祝。但是，试想你并不知道寿星是谁，只是像一个局外者看待这个派对。你可能会觉得整个事件看起来与
单细胞凝胶电泳标准操作
实验原理在细胞核中，DNA是环状附着在核基质上，细胞裂解过程中，核基质被溶解、抽提，DNA的结构则未发生变化。如果DNA链上存在缺口，则使DNA超螺旋变的松弛，DNA环向外展，同时由于暴露了阴电荷，在电场力的作用下，松动的DNA环向阳极迁移，但是由于这种松动的DNA环一端仍附着于核DNA，其迁移距离