研究绘制四种罂粟属物种的着丝粒序列图谱
西安交通大学叶凯教授带领信息与生物医学交叉团队,开发了针对基因组超复杂区域的计算方案,成功绘制了四种罂粟属物种的着丝粒序列图谱。7月30日,相关研究成果发表在《细胞-基因组学》上。这四种罂粟属物种包括大红罂粟、虞美人、鸦片罂粟和渥美罂粟,它们各自拥有独特的核型特征。该团队开发混合组装技术,基于高精度长读长测序数据,克服了基因组超复杂区域的解析难题,为理解着丝粒在物种形成和演化中的作用提供了新视角。着丝粒作为染色体上的枢纽区域,对于生物遗传信息的稳定性和精确传递起着决定性作用。然而,由于着丝粒DNA序列由大量高度相似的串联重复序列组成,其序列特征的精细解析一直是一个科学难题。该研究发现,着丝粒介导的染色体重排是形成物种复杂核型的关键机制,为生物重要性状的形成和稳定遗传提供了新的解释。该研究成果以"The centromere landscapes of four karyotypically diversePapaver......阅读全文
非单着丝粒染色体的概念
中文名称非单着丝粒染色体英文名称aneucentric chromosome定 义着丝粒不止一个的染色体。如双着丝粒染色体、三着丝粒染色体。应用学科遗传学(一级学科),细胞遗传学(二级学科)
塑造着丝粒分布的“世纪之谜”解开
自1800年代以来,科学家们已经注意到细胞核中着丝粒的分布问题。着丝粒是一种特殊染色体区域,对细胞分裂至关重要,但其分布的决定机制和生物学意义仍悬而未决。日本东京大学团队最近提出了一种塑造着丝粒分布的两步调节机制。研究表明,细胞核中的着丝粒结构在维持基因组完整性方面发挥着作用。研究成果发表在《
关于着丝粒的基本信息介绍
着丝粒是指中期染色体的两条姐妹染色单体的连接处,位于染色体的主缢痕处,着丝粒将两条染色单体分为短臂(p)和长臂(q),由高度重复的异染色质组成,其主要成分为DNA和蛋白质。着丝粒和动粒是存在于主缢痕的两个特殊结构。中期染色体的两条姐妹染色单体的连接处,有一向内凹陷、着色较浅的缢痕,称为主缢痕(p
端着丝粒染色体的概念
端着丝粒染色体( telocentric chromosome),其着丝粒位于染色体的顶端,没有短臂。人类正常染色体中没有端着丝粒染色体,但在肿瘤细胞中可以看到。
用着丝粒距离法进行基因定位
着丝粒距离法一个基因与它所属染色体的着丝粒之间的距离称为着丝粒距离。在不同的生物中,可用不同的方法测定着丝粒距离。在粗糙脉孢菌中,着丝粒和基因之间的距离可以根据子囊中子囊孢子的排列顺序来测定,这是1932年美国微生物遗传学家CC.林德格伦所首创的方法。在同一染色体上两个基因的着丝粒距离都被测定后,这
双着丝粒染色体的定义
在经染色体断裂剂处理或染色体断裂综合征病人的细胞中,双着丝粒染色体(DC)相当常见。它们起源于两条非同源染色体片段或两条同源染色体片段,后一种情况常常导致等臂双着丝粒染色体(IDC)。能恒定遗传的DC,其着丝粒之一功能失活,这种失活作用可能发生在DV形成后,其机理尚不清楚 。
中着丝粒染色体的概念
中文名称中着丝粒染色体英文名称metacentric chromosome定 义着丝粒位于染色体中部的染色体。即长、短臂相等或接近相等的染色体。应用学科遗传学(一级学科),细胞遗传学(二级学科)
双着丝粒染色体的定义
在经染色体断裂剂处理或染色体断裂综合征病人的细胞中,双着丝粒染色体(DC)相当常见。它们起源于两条非同源染色体片段或两条同源染色体片段,后一种情况常常导致等臂双着丝粒染色体(IDC)。能恒定遗传的DC,其着丝粒之一功能失活,这种失活作用可能发生在DV形成后,其机理尚不清楚。
染色体的不同状态
基因和染色体 基因在细胞里并非一盘“散沙”或“散兵游勇”,它们大多有规律地集中在细胞核内的染色体上,而且每一种生物细胞内染色体的形态和数目都是一定的。 染色体复制时 染色体在复制以后,含有纵向并列的两个染色单体(c hroma-tids),只有在着丝粒(centromere)区域仍联在一
染色体的结构序列
染色体要确保在细胞世代中保持稳定,必须具有自主复制、保证复制的完整性、遗传物质能够平均分配的能力,与这些能力相关的结构序列是: 自主复制 20世纪70年代末首次在酵母菌中发现。自主复制DNA序列具有一个复制起始点,能确保染色体在细胞周期中能够自我复制,从而保证染色体在世代传递中具有稳定性和连
科学家构建出目前最高质量的植物基因组参考序列
随着PacBio单分子实时(SMRT)测序技术的发展,利用它已能够独立完成高质量基因组草图的组装。然而,这些草图序列中仍然存在多种错误,比如序列中会包含有很多嵌合体(即不同位置的序列连接到了一起)或是组装质量比较差的区域等,特别是重复序列区域有的没有组装出来,有的组装出来多个序列,而且这些错误通
DNA微序列技术
· Protocols for Making Drosophila Arrays (Stanford U.)Detailed protocol for making arrays including PCR Amplification of cDNAs for Printing,
DNA-序列分析技术
试剂、试剂盒 琼脂糖TE 水饱和酚无水乙醇70%乙醇TEMED测序酶溴化乙锭仪器、耗材 电泳仪离心管离心机冰浴箱恒温板DNA 测序仪
序列排比额概念
中文名称序列排比英文名称sequence alignment定 义核酸或蛋白质序列的比较分析法。将序列之间的相同和不同部分排列出来,由此显示序列间的相关性或同源性程度。常借助计算机软件进行分析。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
核心序列的概念
中文名称核心序列英文名称core sequence定 义重复序列共有的核苷酸序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
转化序列的概念
中文名称转化序列英文名称transforming sequence定 义起变化作用的基因或序列。应用学科遗传学(一级学科),发育遗传学(二级学科)
DNA-序列分析技术
DNA序列分析技术可用于:(1)分析物种的遗传多样性;(2)鉴定新的物种;(3)用于比较基因组学。实验方法原理本节描述运用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自动DNA 测序仪进行双链DNA 测序的方法。热循环测序反应使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDe
信号序列的概念
信号序列是引导蛋白质定向转移的线性序列,通常有16-26个氨基酸残基,对所引导的蛋白质没有特异性要求。
RGD序列的定义
RGD序列由精氨酸、甘氨酸和天冬氨酸组成,存在于多种细胞外基质中,可与11种整合素特异性结合,能有效地促进细胞对生物材料的粘附。
RGD序列的用途
该序列肽能够竞争性抑制包括纤维蛋白在内的各种粘附蛋白与血小板的结合,可达抑制血小板与纤维蛋白结合的目的,有较好的临床研究价值。
转化序列的概念
中文名称转化序列英文名称transforming sequence定 义起变化作用的基因或序列。应用学科遗传学(一级学科),发育遗传学(二级学科)
核酸序列分析实验
实验方法原理针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因,找出基因的位置和功能位点的位置,以及标记已知的序列模式等过程。在此过程中,确认一段 DNA 序列是一个基因需要有多个证据的支持。一般而言,在重复片段频繁出现的区域里,基因编码区和调控区不太可能出现;如果某段 DNA 片段的假想产物与某个已知的蛋
AluI序列的定义
人基因组约有50万~70万份拷贝,AluI序列长282个核苷酸,由两个同源但略有差别的亚基组成。
互补序列的定义
中文名称互补序列英文名称complementary sequence定 义在双链核酸中,一条多核苷酸链可与另一条多核苷酸链互补的那部分序列。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
DNA序列测定技术
DNA序列测定技术序列测定的技术和策略Sanger双脱氧链终止法Maxam-Gilbert DNA化学降解法测序策略目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的若干
SD序列的作用
SD序列的作用是与16S rRNA的3'端上一段富含嘧啶的序列结合,小亚基16S rRNA的3'端的这个小片段就被称为反SD序列。当mRNA中的SD序列于16S rRNA上的反SD序列结合后,就指示了下游的AUG,即是蛋白质合成的起始密码子。
DNA序列测定技术
DNA序列测定技术序列测定的技术和策略Sanger双脱氧链终止法Maxam-Gilbert DNA化学降解法测序策略 目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的
DNA-序列分析技术
实验方法原理 本节描述运用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自动DNA 测序仪进行双链DNA 测序的方法。热循环测序反应使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDeoy TM Terminator
同位序列的概念
同位序列(Homeobox)或称同源异型盒,是某些影响动物、真菌及植物发育的基因所拥有的一段DNA序列,拥有homeobox的基因称作homeobox基因,统称homeobox基因家族。同源异形盒模体在进化中广泛存在。其重要意义是通过同源异形盒探针与很多真核的基因组进行杂交而获得。在蛙,小鼠和人的D
什么是回文序列?
遗传学上讲的回文序列指的是双链DNA或RNA分子中的特定的核苷酸片段,该片段在其中一条链上按5'到3'读取的序列与其互补链上按相同的5'到3'读取的序列一致。回文序列的单链DNA或RNA,存在对称中心,对称中心两侧碱基关于该对称中心对称,可形成互补。故回文序列能够形成