MolCell.:基因突变的“连锁”反应
约翰霍普金斯大学科学家发现在酵母中删除任何一个基因都会对基因组产生压力,造成其他基因的突变。研究人员称该发现对人类遗传学有启示作用,因为DNA序列在物种之间具有保守性,该研究对癌症和其他领域的遗传分析有重要意义。相关报道发表在近期的Molecular Cell杂志上。 该文章的通讯作者J. Marie Hardwick博士称,剔除任何一个基因往往会导致另一个(有时候是两个)基因的连锁反应。对比原始突变基因和二次突变基因将会让我们了解到大量的之前未知的基因联系。 科学家随机选取了250个单基因突变株,每一株又产生六个亚株。然后对每一个亚株进行"压力测试"。最终科学家发现77%的突变株另外又获得了一个或两个突变。 Hardwick博士称,以后科学家要重新审视他们的遗传操作,因为诱导的基因突变产生的现象有可能是二次突变造成的。 Hardwick博士称,该研究在癌症领域中重要的应用前景。我们认为癌症发......阅读全文
癌症相关的基因突变类型及临床解释BIRC2
该基因编码的蛋白是一个蛋白家族的成员,通过与肿瘤坏死因子受体相关因子traf1和traf2结合抑制细胞凋亡,可能通过干扰类冰蛋白酶的激活。这种编码蛋白抑制由血清剥夺和甲萘醌(一种有效的自由基诱导剂)诱导的细胞凋亡另一种编码不同的异构体的剪接转录变体已被发现用于该基因。
癌症相关的基因突变类型及临床解释-BTG1
这个基因是一个抗增殖基因家族的成员,它调节细胞的生长和分化。该基因在细胞周期g0/g1期表达最高,在细胞进入g1期时表达下调。编码蛋白与多种核受体相互作用,并作为细胞分化的共同激活因子。该位点与一例b细胞慢性淋巴细胞白血病的t(8;12)(q24;q22)染色体易位有关。
癌症相关的基因突变类型及临床解释-APOL2
该基因是载脂蛋白L基因家族的成员编码的蛋白质存在于细胞质中,可能影响脂质的运动或使脂质与细胞器结合。在这个基因中发现了两个编码相同蛋白质的转录变体。
癌症相关的基因突变类型及临床解释--AKT2
这个基因是一个假定的癌基因,编码一个属于丝氨酸/苏氨酸激酶亚家族的蛋白质,包含sh2样(SRC同源2样)结构域。该基因在8个卵巢癌细胞系中的2个和15个原发性卵巢肿瘤中的2个被扩增和过度表达。过度表达导致人导管胰腺癌亚群的恶性表型。编码蛋白是一种普通的蛋白激酶,能够对几种已知的蛋白进行磷酸化。
癌症相关的基因突变类型及临床解释-BRWD1
这个基因编码WD重复蛋白家族的一个成员。WD重复是大约40个氨基酸的最小保守区域,通常由GLY HIT和Trp ASP(GH-WD)残基包围,这可能促进异源三聚体或多蛋白复合物的形成。该家族成员参与多种细胞过程,包括细胞周期的进展、信号转导、凋亡和基因调控。该蛋白含有2个溴脱氧核糖和多个WD重复序列
癌症相关的基因突变类型及临床解释--ACTG1
肌动蛋白是高度保守的蛋白质,参与各种类型的细胞运动和维持细胞骨架。脊椎动物中肌动蛋白亚型主要有三类:α、β和γ。α肌动蛋白存在于肌肉组织中,是收缩装置的主要组成部分。β和γ-肌动蛋白在大多数细胞类型中共存,作为细胞骨架的组成部分,并作为细胞内运动的调节剂。肌动蛋白γ1,由该基因编码,是一种细胞质肌动
癌症相关的基因突变类型及临床解释BTG2
该基因编码的蛋白是btg/tob家族的一员。这个家族有结构上相关的蛋白质,似乎具有抗增殖的特性。这种编码蛋白参与细胞周期g1/s转换的调控。
癌症相关的基因突变类型及临床解释-ABL2
ABL2是一种细胞质酪氨酸激酶,与ABL1密切相关但不同。 蛋白质的相似性包括酪氨酸激酶结构域并延伸氨基末端以包括SH2和SH3结构域。 ABL2在正常细胞和肿瘤细胞中均表达。 KRAS突变型非小细胞肺癌中ABL2基因的表达较高。 ABL2基因产物表达为两个带有不同氨基末端的变体,长度均约为12kb
癌症相关的基因突变类型及临床解释AK7
这个基因编码腺苷酸激酶家族的一个酶编码的酶是一种磷酸转移酶,催化腺嘌呤核苷酸的可逆磷酸化。这种酶在细胞的能量平衡中起作用。选择性剪接导致多个转录变体小鼠基因突变与原发性睫状体运动障碍有关。
癌症相关的基因突变类型及临床解释ARFRP1
该基因编码的蛋白是一种膜相关gtp酶,定位于质膜,与adp核糖基化因子(arf)和arf样蛋白(arl)有关。这个基因在跨高尔基体网络和内切体之间的膜运输中起作用。另外,还发现了编码不同亚型的剪接转录变体。
癌症相关的基因突变类型及临床解释-BCL6
该基因编码的蛋白是锌指转录因子,含有一个n端poz结构域。该蛋白作为一种序列特异性的转录抑制因子,已被证明调节b细胞stat依赖性il-4应答的转录。这种蛋白质可以与多种poz蛋白相互作用,poz蛋白具有转录辅压作用。该基因在弥漫性大细胞淋巴瘤(dlcl)中常发生易位和过度突变,可能参与dlcl的发
癌症相关的基因突变类型及临床解释-ARHGAP4
该基因编码rhoGAP家族的一个成员,在调节属于RAS超家族的小GTP结合蛋白中起作用大鼠原基因编码的蛋白质定位于高尔基复合体,能重新分布到微管大鼠蛋白在体外刺激某些rho-gtpase活性。在肾病性尿崩症患者中发现该基因及其邻近基因的基因组缺失。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。
癌症相关的基因突变类型及临床解释BCL9
BCL9与B细胞急性淋巴细胞白血病相关。它可能是1q21异常的B细胞恶性肿瘤易位的靶点。其功能未知。BCL9的过度表达可能在B细胞恶性肿瘤中具有致病意义。
癌症相关的基因突变类型及临床解释ANGPT1
该基因编码属于血管生成素家族的分泌糖蛋白。这个家族的成员在血管发育和血管生成中起着重要的作用。所有的血管生成素都与内皮细胞特异性酪氨酸蛋白激酶受体有相似的亲和力。这个基因编码的蛋白质是一种分泌的糖蛋白,通过诱导其酪氨酸磷酸化激活受体它在介导内皮细胞与周围基质和间充质的相互作用和抑制内皮细胞通透性方面
癌症相关的基因突变类型及临床解释ADRB1
肾上腺素能受体(α1、α2、β1和β2亚型)是鸟嘌呤核苷酸结合调节蛋白偶联受体的一个原型家族,介导肾上腺素和神经递质去甲肾上腺素的生理效应。β1肾上腺素受体主要位于心脏。该基因的特异性多态性已被证明影响静息心率,并可能与心力衰竭有关。
癌症相关的基因突变类型及临床解释ASPSCR1
该基因编码的蛋白质含有一个UBX结构域,与葡萄糖转运蛋白4(GLUT4)相互作用这种蛋白质是一种系链,在没有胰岛素的情况下,它将肌肉和脂肪细胞内囊泡中的glut4隔离,并在胰岛素刺激的几分钟内将glut4重新分配到质膜上。该基因与转录因子tfe3基因的易位t(x;17)(p11;q25)导致肺泡软组
癌症相关的基因突变类型及临床解释BICC1
该基因编码一种RNA结合蛋白,该蛋白在胚胎发育过程中通过调节蛋白质翻译来积极调节基因表达。小鼠研究发现,相应的蛋白质在细胞分化过程中受到严格控制,是母体提供的基因产物。
癌症相关的基因突变类型及临床解释AKAP9
A激酶锚定蛋白(AKAPs)是一类结构多样的蛋白质,具有与蛋白激酶A(PKA)调节亚单位结合和将全酶限制在细胞内离散位置的共同功能这个基因编码一个akap家族的成员。该基因的交替剪接导致至少两种亚型定位于中心体和高尔基体,并与来自多种信号转导途径的许多信号蛋白相互作用。这些信号蛋白包括Ⅱ型蛋白激酶a
癌症相关的基因突变类型及临床解释BCLAF1
这个基因编码一个转录抑制物,它与BCL2家族的几个成员相互作用。该蛋白的过度表达可诱导细胞凋亡,bcl2蛋白的共同表达可抑制细胞凋亡。这种蛋白质在整个细胞核内定位成点状结构,并在细胞凋亡过程中重新分布到核膜附近的区域已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。
癌症相关的基因突变类型及临床解释-ABRAXAS1
该基因编码一种通过磷酸化sxxf基序与乳腺癌1(brca1)的c末端重复序列结合的蛋白质。编码蛋白将含有1蛋白的泛素相互作用基序招募到brca1蛋白中,用于dna损伤抗性、dna修复和细胞周期检查点控制。该基因的假基因出现在第3和第8染色体上。选择性剪接导致多个转录变体。
癌症相关的基因突变类型及临床解释ALG9
该基因编码一种α-1,2-甘露糖基转移酶,该酶在脂链低聚糖组装中发挥作用。该基因突变导致先天性糖基化型Il紊乱已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。
癌症相关的基因突变类型及临床解释BCAS1
该基因位于20q13区,在多种肿瘤类型中被扩增,并与更具侵袭性的肿瘤表型相关。在从该区域鉴定的基因中,发现在三个扩增的乳腺癌细胞系和一个在20q13.2处未扩增的乳腺肿瘤中高表达。然而,该基因不在最大扩增的共同区域中,在乳腺癌细胞系MCF7中未检测到其表达,该区域被高度扩增。尽管不一致表达,这个基因
癌症相关的基因突变类型及临床解释-ASCL1
该基因编码转录因子的碱性螺旋-环-螺旋(bhlh)家族的一个成员。该蛋白通过与E盒(5’-canntg-3’)结合激活转录。与其他bhlh蛋白二聚是有效DNA结合所必需的。这种蛋白在神经元承担和分化以及嗅觉和自主神经细胞的生成中起到作用。这种基因的突变可能导致罕见病例的先天性中枢通气不足综合征(CC
癌症相关的基因突变类型及临床解释BCL3
该基因是原癌基因候选基因。在某些B细胞白血病病例中,通过将其易位到免疫球蛋白α位点来识别。该基因编码的蛋白质包含7个锚蛋白重复序列,与IκB蛋白中发现的序列最为接近。该蛋白作为转录共激活剂发挥作用,通过与NF-κB同源二聚体的结合激活。该基因的表达可由NF-κB诱导,NF-κB形成控制p50 NF-
癌症相关的基因突变类型及临床解释ZRSR2
这个基因编码一个重要的剪接因子。编码的蛋白与U2辅助因子异源二聚体相关,这是识别前体mRNA剪接中功能性3’剪接位点所必需的,并且可能在剪接体组装过程中起到网络相互作用的作用。
癌症相关的基因突变类型及临床解释-BACH1
该基因编码一种转录因子,属于碱性区亮氨酸拉链因子家族(cnc-bzip)的帽领型。编码蛋白包含广泛的复合物、tramrack、bric-a-brac/poxvirus和锌指(btb/poz)结构域,这是cnc-bzip家族成员的非典型结构域。这些btb/poz结构域促进了蛋白质-蛋白质相互作用和同源
癌症相关的基因突变类型及临床解释--ACIN1
细胞凋亡是由核的形态变化所决定的,包括染色质浓缩和核碎裂。该基因编码一种核蛋白,在caspase-3激活后诱导凋亡染色质浓缩,而不诱导dna断裂。该蛋白还被证明是一种剪接依赖性多蛋白外显子连接复合体(EJC)的组成部分,其在mRNAs的剪接连接处沉积,是mRNA前剪接的结果因此,它可能参与与剪接相关
癌症相关的基因突变类型及临床解释-ARHGAP29
RAP1是一种小的GTPase,通过效应器调节Rho GTPase信号。这些效应因子-rasip1,radil和由这个基因编码的蛋白质-转移到细胞膜上,在那里形成一个多蛋白复合物。这种复合物是Rap1诱导Rho信号抑制的必要条件该基因缺陷可能是非综合征性唇腭裂伴或不伴腭裂的原因。
癌症相关的基因突变类型及临床解释-BCL10
该基因在一例黏膜相关淋巴组织(malt)淋巴瘤中的易位鉴定。该基因编码的蛋白含有一个caspase募集结构域(card),已被证明能诱导细胞凋亡并激活nf-kappab。据报道,该蛋白与其他包含card9、10、11和14等蛋白质的card结构域相互作用,这些蛋白质被认为在nf-kappab信号传导
癌症相关的基因突变类型及临床解释ANK2
这个基因编码一个蛋白的ankyrin家族的成员,该家族将完整的膜蛋白与潜在的spectrin肌动蛋白细胞骨架连接起来锚蛋白在细胞运动、活化、增殖、接触和维持特殊膜结构等方面发挥着重要作用。大多数锚蛋白通常由三个结构域组成:含有多个锚蛋白重复序列的氨基末端域;具有高度保守的谱蛋白结合域的中心区域;以及