北京基因组所细菌陆生化研究取得阶段性成果
近日,中国科学院北京基因组研究所章张课题组对DnaE2酶的研究取得了新进展。该研究合理地解释了新基因产生和基因组进化对细菌环境适应性的影响,并进一步讨论了真核生物与陆生菌之间的共进化。研究成果在Nature子刊The ISME (International Society for Microbial Ecology) Journal上发表。 DnaE2酶是细菌复制酶DnaE1的一个同源蛋白,但研究发现该酶已经发生功能异化——主要参与易错修复而不是复制,而且被认为是造成细菌基因组GC 含量增加的主要原因。另外,有研究发现该酶还与部分细菌的耐药性有关,因此,近年来对DnaE2酶的功能及结构研究备受关注。 在该研究中,科研人员通过对菌群结构归类、进化分析及大规模宏基因组数据(metagenomics)筛选发现,DnaE2基因很可能在陆生菌(terrabacteria,最先开始陆生化的一类细菌)中最先出现,含有D......阅读全文
研究发现一种细菌的最古老基因组-或助力揭示梅毒起源
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516659.shtm
北京基因组所细菌陆生化研究取得阶段性成果
近日,中国科学院北京基因组研究所章张课题组对DnaE2酶的研究取得了新进展。该研究合理地解释了新基因产生和基因组进化对细菌环境适应性的影响,并进一步讨论了真核生物与陆生菌之间的共进化。研究成果在Nature子刊The ISME (International Society for Micro
科学家为细菌重编基因组密码-提高抗病毒能力
据物理学家组织网10月18日(北京时间)报道,最近,美国耶鲁大学和哈佛大学的科学家合作,为一种细菌重新编写了完整的基因组编码,并提高了其抗病毒能力。相关论文发表在10月18日的《科学》杂志上。 “这是第一次从根本上改变了遗传密码。”论文共同高级作者、耶鲁大学分子、细胞与发育生物学副教授法伦
中科院微生物所在细菌耐药基因组学研究获进展
中科院微生物所朱宝利课题组在细菌耐药基因组学研究中的最新进展,研究首次以基因组学大数据为依托,深入解析了耐药基因在细菌间的传播网络和规律,对深入认识细菌耐药性的进化、细菌耐药的形成机制等具有重要意义。成果近日在线发表于《应用与环境微生物学》,并将于第82卷22期以“封面故事”形式发表。副研究员
-Illumina和梅里埃合作推出细菌性感染全基因组测序服务
抵御抗生素耐药性意味着临床医生们需要小型工具来鉴别出哪种感染是细菌性的,以及引发感染的细菌种类,同时还要揭示出这些细菌对于多种抗生素是否是敏感性的。近日,Illumina公司和生物梅里埃公司(bioMerieux)就通过联合研究推出了一项全基因组测序服务,目的在于改善医源性感染的控制和流行病学的
北京基因组所细菌陆生化研究取得阶段性成果
近日,中国科学院北京基因组研究所章张课题组对DnaE2酶的研究取得了新进展。该研究合理地解释了新基因产生和基因组进化对细菌环境适应性的影响,并进一步讨论了真核生物与陆生菌之间的共进化。研究成果在Nature子刊The ISME (International Society for Micro
科学家从人体细菌基因组中发现两种新型抗生素
目前使用的大多数抗生素其实是细菌产生的天然分子。由于细菌耐药性的不断增强,医学方面迫切需要研发新的的抗生素。然而,诱导细菌产生新的抗生素是一件棘手的事。大多数细菌不会在实验室中生长,就算实验室中培养出了这些细菌,大多数的产生抗生素的基因很少表达。近日,洛克菲勒大学(Rockefeller Uni
科学家彻底改写细菌基因组成功减少大肠杆菌遗传密码子
科学家继续修补大肠杆菌基因组。 本报讯 合成生物学家日前报告了迄今为止意义最为深远的一项细菌基因组重写结果。这一进展包括重新利用了大肠杆菌3.8%的碱基对。 研究人员在8月18日出版的美国《科学》杂志上发表了这一研究成果。 研究人员换下了大肠杆菌64个遗传密码子(为氨基酸指定遗传代码的序列)中
蓝细菌属于细菌吗
蓝细菌是细菌。蓝细菌就是蓝藻,是细菌,细菌就是原核生物,没有成型的细胞核。蓝细菌是一类进化历史悠久、革兰氏染色阴性、无鞭毛、含叶绿素a,但不含叶绿体(区别于真核生物的藻类)、能进行产氧性光合作用的大型单细胞原核生物。特点:蓝细菌分布极广,普遍生长在淡水、海水和土壤中,并且在极端环境(如温泉、盐湖、贫
蓝细菌是细菌吗
是的,蓝细菌是一类特殊的细菌。它们被归类为细菌的一种,具有细胞结构、细胞壁和细胞质等细菌特征。蓝细菌得名于它们的蓝绿色色素,这种色素能够帮助它们进行光合作用。与其他细菌不同的是,蓝细菌具有一种特殊的细胞器——蓝细菌叶绿体,类似于植物的叶绿体,可以进行光合作用来合成有机物质。因此,蓝细菌既具备细菌的特
细菌
细菌是一类细胞细而短(细胞直径约0.5μm,0.5-5μm)、结构简单、细胞壁坚韧以二等分裂方式繁殖和水生性较强的原核微生物,分布广泛。一、细菌的形态: 细菌的形态分: 球菌coccus:包括双球菌Diplococcus、链球菌Streptococcus、四联球菌Tetracoccus、八叠球
利用CRISPR–Cas系统将数字视频存储到一群细菌的基因组中
科学家们正在努力利用DNA(即生物学生命蓝图)作为合成原材料在活细胞外面存储大量的数字信息。但是如果他们能够诱导活细胞像大的细菌群体那样使用它们自己的基因组作为能够被用来记录信息并且随后在任何时间能够获取这种信息的生物学硬盘,将会怎么样?这样的一种方法可能不仅为数据存储提供全新的可能性,而且也可
基因组学研究细菌抗生素耐药性如何在不同物种间传播
在最近一项研究中,来自克莱姆森大学的研究者们记录了人体内寄生菌所产生的抗生素耐药性基因向其它物种内寄生菌横向传播的趋势。 每年都会有大量的人群患有各种人畜共患病,这些疾病通常通过食物,水或与动物直接接触传播,而直接导致疾病发生的病原菌则包括沙门氏菌,大肠杆菌,炭疽等。 对此,研究员Richa
细菌噬菌体细菌防御方法
细菌防御噬菌体的主要方法是合成能够降解外来DNA的酶。这些酶被称为限制性内切酶,它们能够剪切噬菌体注入细菌细胞的病毒DNA。细菌还含有另一个防御系统,这一系统利用CRISPR序列来保留其过去曾经遇到过的病毒的基因组片段,从而使得它们能够通过RNA干扰的方式来阻断病毒的复制。这种遗传系统为细菌提供
蓝细菌和光合细菌的区别?
蓝细菌与光合细菌区别是:光合细菌(红螺菌)进行较原始的光合磷酸化作用,反应过程不放氧,为厌氧生物,而蓝细菌能进行光合作用并且放氧。
细菌感染检测细菌遗传物质
通过检测病原体遗传物质来确认病原体也许是检查病原体为直接的方法了。目前比较成熟的技术包括基因探针技术和PCR技术。 (一)基因探针技术 用标记物标记细菌染色体或质粒DNA上的特异性片段制备成细菌探针,待检标本经过短时间培养后,经过点膜、裂解变性、预杂交和杂交后,利用探针上标记物发出的信号可以
什么是铁细菌和硫细菌
两个都是化能自养型的生物,分别利用Fe和H2S氧化的到的化学能将二氧化碳合成有机物
细菌培养
Preparing Overnight Bacteria Culture (LaboratoryExperiments.com)This is a basic procedure for high school students and useful for those who are new to
细菌检测
Gram Staining (+\-) (William H. Heidcamp) Gram-Staining Procedure (MEDIC, U of Texas)Very nice and detailed method description for Gram staining Aci
细菌转化
实验概要本实验介绍了细菌转化的两种方法:电击法和热击法。主要试剂LB培养基主要设备电击杯,电击仪,1.5 mL的离心管,摇床,恒温水浴锅实验材料DNA样品或者连接产物,细菌感受态细胞实验步骤1. 电击转化 1) 加DNA样品或者连接产物于融化的细菌感受态细胞中,混匀后加入冰预冷的电击杯中。
山东大学祁庆生教授-基于CRISPRCas9一步式改造细菌基因组
同源重组介导的基因工程,已广泛应用于原核生物中,并具有较高的效率和准确性。然而,用这种方法来实现更大规模的基因组编辑(具有许多基因或大的DNA片段),还是有限的,因为DNA编辑模板构建的程序相对复杂。11月24日,在《Scientific Reports》发表的一项研究中,山东大学生命科学学院的祁庆
无害细菌与耐药细菌之间的竞争
科研人员报告说,由肠道原生的一种细菌产生的信息素能够杀死同种细菌的耐多药菌株。耐多药肠球菌是医院获得性感染的主要原因,这种细菌在抗生素破坏肠道原生细菌之后在肠道定植。粪肠球菌(E. faecalis)V583耐药菌株在其基因组中有许多可移动遗传元件,这可能妨碍它在缺少抗生素的条件下与原生细菌竞
超级细菌来袭--细菌耐药已成“全球威胁”
青霉素对许多致病菌不起作用了;结核病常规特效药对相当数量的病人失效了;青蒿素在非洲也遇到了耐药…… 日前,中科院生物物理所等单位在《自然—基因组学》上发表了揭示结核分枝杆菌耐药性的文章;与此同时,中科院武汉病毒所在《艾滋病免疫综合征》上发表了关于HIV基因进化与传播耐药研究的
怎么用细菌培养皿检测细菌
细菌和真菌的分布 作为自然界中微生物的细菌和真菌是我们肉眼看不见的,必须借助于一定的器械(显微镜),但是它们又是无处不在的。未了弄清楚它们的分布情况,特进行探究: 1、实验中要选取五套培养皿进行实验,一个做为对比,另外四个用来培养不同环境中的细菌,并且是在不同的环境中培养,以便得出细菌和真菌
细菌保存(细菌,培养物,甘油,琼脂平板)
1.细菌保存于穿刺培养物中:一般细菌保存于穿刺培养物可以维持两年。具体方法如下:用灭菌接种针挑取分散良好的单菌落,针缓慢穿过琼脂到达瓶底,连续几次,盖上瓶盖拧紧,做好标记。室温下存放于暗处。(最好一点可以将瓶盖放松,在适当温度下培养过夜,再拧紧瓶盖并加封Parafilm膜,室温或最好在4度避光保
谁在先?“鸡基因组”和“鸡蛋基因组”
是先有鸡还是先有鸡蛋?这个问题相当恼人,恐怕很难说清楚。现在,研究人员回答了与这个问题一样恼人的问题:是人类基因组中的成千上万的长重复DNA片段中,那个是第一个产生的?那些被复制了? 这个答案发表在10月7日的《自然·遗传学》杂志上。该研究给出了人类基因组中DNA重复片段复制的第一个进化证据,这种
细菌鉴定仪出现“不能鉴定细菌”的处理
我们对现今应用较为普遍的VITEK-AMS鉴定系统中报告“不能鉴定细菌”(UIO)菌株作了进一步分析,探讨其发生原因、处理方法,以期建立一套切实可行的 仪器与手工方法相结合的 细菌鉴定方法。 一、材料与方法 1.仪器与试剂:VITEK-AMS 60型全自动细菌鉴定仪及其配套GNI、GPI
磷细菌和钾细菌混合培养的研究
本文对生产菌肥的磷细菌和钾细菌进行了混合培养,设计了三因素随机区组试验,探讨混合菌肥的最佳生产工艺,并对实验结果进行了方差分析。结果表明磷细菌和钾细菌可以混合培养,各处理结果经LSR测验,主效A因素(混合比例)中A4水平、B因素(培养基配方)中B2水平和c因素(培养时间)中C5水平显著高于同组中的其
研究揭示细菌粉碎技术对抗超级耐药细菌
研究人员利用液态金属开发了新的杀菌技术,这可能是解决抗生素耐药性这一致命问题的答案。 这项技术使用磁性液态金属的纳米颗粒来粉碎细菌和细菌生物膜--细菌茁壮成长的保护性"房子"--而不伤害有益细胞。 这项由RMIT大学领导的研究发表在ACS Nano杂志上,为寻找更好的抗菌技术提供了一个突破性
细菌鉴定仪出现“不能鉴定细菌”的处理
我们对现今应用较为普遍的VITEK-AMS鉴定系统中报告“不能鉴定细菌”(UIO)菌株作了进一步分析,探讨其发生原因、处理方法,以期建立一套切实可行的仪器与手工方法相结合的细菌鉴定方法。 一、材料与方法 1. 仪器与试剂:VITEK-AMS 60型全自动细菌鉴定仪及其配套GNI、