Science:宏基因组研究挑战DNA编码规则
人们一直认为DNA编码的指令是所有生命通用的,例外情况极少。但本期Science杂志上的一项新研究显示,自然界中的生物又一次打破了既定的规则。 美国能源部联合基因组研究所的Edward Rubin领导研究团队,获得来自1776种环境(包括17个人体区域)的微生物宏基因组数据,以便在其中寻找重编码事件(对遗传编码的解读不同于绝大多数生物)。 研究团队专门就终止密码子(命令蛋白合成停止的遗传序列)的重编码进行了分析,寻找那些将终止密码子当成“前进”信号,还继续往蛋白上添加氨基酸的事件。他们发现,这样的事件在环境样本中大量存在。 这一发现对于合成生物学有着重要的启示:人们可以利用重编码让合成生物抵抗病毒感染,或者阻止合成生物感染计划以外的宿主。“这项研究向人们展示了遗传密码的可变性,”耶鲁大学的生物工程师Farren Isaacs说。 从“停”到“行” 研究人员先用传统的编码规则预测1kb以上的DNA序列编码什么样的蛋白......阅读全文
MNDA基因编码功能及结构描述
髓样细胞核分化抗原(mnda)仅在粒单核细胞系的细胞核中检测到。人类MNDA的200个氨基酸区域与干扰素诱导的小鼠基因家族(指定为Ifi-201、Ifi-202和Ifi-203)编码的蛋白质中的一个区域惊人地相似,这些基因不以细胞或组织特异性方式调节1.8-kb的mnda mrna在5-原代未翻译区
MTOR基因编码功能及结构描述
雷帕霉素(mTOR)的哺乳动物靶标,也称为雷帕霉素和FK506结合蛋白12-雷帕霉素相关蛋白1(FRAP1)的机制靶标,是人类中由MTOR基因编码的激酶。 mTOR是蛋白激酶的磷脂酰肌醇3-激酶相关激酶家族的成员。 mTOR与其他蛋白质结合,并作为两种不同蛋白质复合物的核心成分,mTOR复合物1和m
AIP基因编码功能及结构描述
这个基因编码的蛋白质是芳香烃的受体和配体激活的转录因子。编码的蛋白质作为多蛋白复合物的一部分存在于细胞质中,但在配体结合后被转运到细胞核。这种蛋白质可以调节许多外源代谢酶的表达。此外,编码的蛋白可以特异性地结合并抑制乙型肝炎病毒的活性。已经发现了三个编码不同亚型的转录变体。[由RefSeq提供,20
PALLD基因编码功能及结构描述
这个基因编码一种细胞骨架蛋白,这是组织肌动蛋白细胞骨架所必需的。这种蛋白质是含有肌动蛋白微丝的一种成分,它参与控制细胞的形状、粘附和收缩。该基因多态性与1型胰腺癌易感性相关,也与心肌梗死风险相关。选择性剪接导致多个转录变体。This gene encodes a cytoskeletal prote
FLNA基因编码功能及结构描述
这个基因编码的蛋白质是一种肌动蛋白结合蛋白,它将肌动蛋白丝交联,并将肌动蛋白丝连接到膜糖蛋白编码蛋白参与重塑细胞骨架,影响细胞形态和迁移这种蛋白质与整合素、跨膜受体复合物和第二信使相互作用该基因缺陷是多种综合征的病因,包括室周结节性异位(pvnh1,pvnh4)、耳腭趾综合征(opd1,opd2)、
DNTT基因编码功能及结构描述
该基因是DNA聚合酶X型家族的一员,编码一种对寡核苷酸引物的3'-羟基末端添加脱氧核苷酸进行催化的模板无关DNA聚合酶在体内,编码蛋白在正常和恶性的前b和前t淋巴细胞的限制性群体中在早期分化过程中表达,通过在重组ig重链和t细胞受体基因片段的连接处合成非生殖系元素(n区)来产生抗原受体多样性
BTLA基因编码功能及结构描述
这个基因编码免疫球蛋白超家族的一个成员编码的蛋白质包含一个免疫球蛋白(Ig)结构域,是一个受体,通过传递抑制信号来抑制免疫应答选择性剪接导致多个转录变体这个基因的多态性与类风湿关节炎的风险增加有关[由RefSeq提供,2011年8月]This gene encodes a member of the
EPCAM基因编码功能及结构描述
该基因编码癌相关抗原,是一个家族的成员,至少包含两种I型膜蛋白。这种抗原在大多数正常上皮细胞和胃肠道癌上表达,并作为一种同型钙依赖性细胞粘附分子发挥作用。该抗原正被用作人类癌免疫治疗的靶点。该基因突变导致先天性丛生性肠病。This gene encodes a carcinoma-associate
GAST基因编码功能及结构描述
胃泌素是一种激素,其主要功能是刺激胃粘膜分泌盐酸,从而抑制胃泌素的形成这种激素也是胃肠道上皮细胞有丝分裂因子胃泌素有两种生物活性肽形式,G34和G17[由RefSeq提供,2008年7月]Gastrin is a hormone whose main function is to stimulate
AR基因编码功能及结构描述
雄激素受体(AR),也称为NR3C4(核受体亚家族3,C组,成员4),是一种核受体,通过结合任何雄激素激活,包括睾酮和二氢睾酮在细胞质中,然后易位到细胞核。 雄激素受体与孕酮受体的关系最为密切,较高剂量的孕激素可以阻断雄激素受体。 雄激素受体的主要功能是作为调节基因表达的DNA结合转录因子; 然而,
CEBPA基因编码功能及结构描述
这个无内含子基因编码一个转录因子,该转录因子包含一个碱性亮氨酸拉链(bzip)结构域,并识别目标基因启动子中的ccaat基序。编码蛋白在具有CCAAT/增强子结合蛋白β和γ的同二聚体和异二聚体中起作用。这种蛋白的活性可以调节参与细胞周期调节和体重平衡的基因表达。该基因突变与急性髓系白血病有关。在非a
结构基因的编码区的介绍
自起始密码至终止密码的一般DNA序列称为编码区。编码区含有若干段编码/顷序,是该基因表达为多肽 链的部分,称为外显子。外显子是不连续的,其间有不编码的间隔顺序隔开,间隔顺序称为内含子。转录后的内含子顺序,在初级转录物加工时被切掉;因此,结构基因又称为不连续基因或断裂基因。如果一个结构基因含有n个
DEK基因编码功能及结构描述
这个基因编码一种具有一个SAP结构域的蛋白质。这种蛋白结合十字形和超螺旋DNA,诱导阳性的超螺旋形成闭合的环状DNA,并参与在mRNA处理过程中的剪接位点选择。涉及该区域的染色体畸变、该基因的表达增加以及抗该蛋白抗体的存在都与各种疾病有关。两个编码不同亚型的转录变体已经被发现。This gene e
CHUK基因编码功能及结构描述
这个基因编码丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族的一个成员。编码蛋白是一种细胞因子激活蛋白复合物的组成部分,它是必需转录因子nf-kappa-b复合物的抑制剂,磷酸化位点通过增溶途径触发抑制剂的降解,从而激活转录因子。[由RefSeq提供,2008年7月]This gene encodes a member
APLNR基因编码功能及结构描述
该基因编码G蛋白偶联受体基因家族的一个成员编码蛋白与血管紧张素受体有关,但实际上是一种抑制腺苷酸环化酶活性的apelin受体,通过发挥高血压作用,对血管紧张素ii的压力作用起反调节作用。它在心血管和中枢神经系统、葡萄糖代谢、胚胎和肿瘤血管生成以及作为人类免疫缺陷病毒(HIV-1)受体发挥作用由选择性
KIT基因编码功能及结构描述
KIT基因编码的蛋白是干细胞因子受体SCFR,也被称为原癌基因c-kit或酪氨酸蛋白激酶kit或CD117,是一种受体酪氨酸激酶,这个基因突变与胃肠道间质瘤,肥大细胞病,急性髓性白血病有关。
IKBKE基因编码功能及结构描述
ikbke是一种非特异性的i-kappa-b激酶(见mim 164008),对调节抗病毒信号通路至关重要。ikbke也被确定为乳腺癌(mim 114480)癌基因,在超过30%的乳腺癌和乳腺癌细胞系中被扩增和过度表达(hutti等人,2009年[pubmed 19481526])。[由omim提供,
GMPS基因编码功能及结构描述
在嘌呤核苷酸的从头合成中,IMP是支点代谢物,在支点代谢物处,途径分化为鸟嘌呤或腺嘌呤核苷酸的合成。在鸟嘌呤核苷酸途径中,有2种酶参与IMP转化为GMP,即IMP脱氢酶(IMPd1),它催化IMP氧化成XMP和GMP合成酶,催化XMP向GMP的胺化。[由RefSeq提供,2008年7月]In the
GUSB基因编码功能及结构描述
该基因编码一种降解糖胺聚糖的水解酶,包括硫酸乙酰肝素、硫酸皮肤素和硫酸软骨素。这种酶形成一个定位于溶酶体的四聚体该基因突变导致粘多糖病第七型。选择性剪接导致多个转录变体人类基因组中有许多这个位点的假基因。[由RefSeq提供,2014年5月]This gene encodes a hydrolase
IFNG基因编码功能及结构描述
这个基因编码一种可溶性细胞因子,它是Ⅱ型干扰素的一个成员。编码的蛋白质由先天免疫系统和适应性免疫系统的细胞分泌。活性蛋白是一种与干扰素γ受体结合的同二聚体,它触发细胞对病毒和微生物感染的反应。这种基因突变与病毒、细菌和寄生虫感染以及一些自身免疫疾病的易感性增加有关。[由RefSeq提供,2015年1
ITPA基因编码功能及结构描述
该基因编码一种肌苷三磷酸焦磷酸水解酶。编码蛋白水解肌苷三磷酸和脱氧肌苷三磷酸,得到一磷酸核苷酸和二磷酸。这种蛋白质是ham1 ntpase蛋白家族的一员,存在于细胞质中,起着同二聚体的作用。编码蛋白的缺陷可导致肌苷三磷酸焦磷酸化酶缺乏,从而导致红细胞中itp的积聚。交替剪接导致多个转录变体。[由Re
GAPDH-基因编码功能及结构描述
这个基因编码甘油醛-3-磷酸脱氢酶蛋白家族的一个成员。编码的蛋白质已被鉴定为一个月光蛋白的基础上,它能执行机械上不同的功能该基因产物在糖代谢过程中起着重要的产能作用,在无机磷和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)的存在下,可逆的氧化磷酸化作用。编码的蛋白质在细胞核中还具有尿嘧啶DNA糖苷酶活性此外,这种蛋
KLLN基因编码功能及结构描述
这种无内含子基因编码的蛋白质存在于细胞核中,在那里它可以抑制DNA合成,促进S相停滞,并与凋亡相结合。这种DNA结合蛋白的表达被转录因子p53上调。The protein encoded by this intronless gene is found in the nucleus, where i
JUN基因编码功能及结构描述
该基因是禽肉瘤病毒17的假定转化基因。它编码一种与病毒蛋白高度相似的蛋白质,并与特定靶DNA序列直接相互作用以调节基因表达。这个基因是无内含子的,被定位到1P32-P31,一个涉及人类恶性肿瘤易位和缺失的染色体区域。This gene is the putative transforming gen
HCK基因编码功能及结构描述
这个基因编码的蛋白质是酪氨酸激酶src家族的成员。这种蛋白质主要是造血的,特别是在髓系和B淋巴细胞系的细胞中。它可能有助于将fc受体与呼吸爆发的激活结合起来。此外,它可能在中性粒细胞迁移和中性粒细胞脱颗粒中发挥作用。由于选择性剪接和选择性翻译起始密码子(包括非aug密码子)的使用,产生了具有不同亚细
CBLC基因编码功能及结构描述
该基因编码E3泛素连接酶CBL家族的一个成员。cbl蛋白通过泛素化和随后的酪氨酸激酶下调在细胞信号传导中发挥重要作用。该基因的表达可能仅限于上皮细胞,而且还观察到该基因编码多种亚型的选择性剪接转录变体。This gene encodes a member of the Cbl family of E
WAS基因编码的功能和结构描述
The Wiskott-Aldrich syndrome (WAS) family of proteins share similar domain structure, and are involved in transduction of signals from receptors on th
ASMTL基因编码功能及结构描述
该基因编码的蛋白有一个N-末端,与枯草芽孢杆菌的多拷贝相关丝状(maf)蛋白和大肠杆菌的orfE相似,而C-末端与N-乙酰5-羟色胺O-甲基转移酶相似该基因位于X染色体和Y染色体的假常染色体区1(PAR1)。已经发现了三个编码不同亚型的转录变体[由RefSeq提供,2010年3月]The prote
INHBA基因编码功能及结构描述
这个基因编码tgfβ(转化生长因子β)超家族的一个成员。编码的前蛋白经蛋白质水解处理,生成二聚激活素和抑制素蛋白复合物的亚单位。这些复合物分别激活和抑制垂体的促卵泡激素分泌。编码的蛋白质也在眼睛、牙齿和睾丸的发育中起作用。该基因的高表达可能与癌症恶病质有关。[由RefSeq提供,2016年8月]Th
ATRX基因编码功能及结构描述
该基因编码的蛋白含有一个atpase/螺旋酶结构域,因此属于染色质重塑蛋白的swi/snf家族。这种蛋白被发现经历了细胞周期依赖性磷酸化,它调节其核基质和染色质的结合,并表明它参与有丝分裂的间期基因调节和染色体分离。该基因突变与X连锁精神发育迟滞(XLMR)综合征有关,通常伴有α-地中海贫血(ATR