中国科大攻克复杂肿瘤全基因组异常的检测难题

中国科学技术大学信息科学与技术学院副教授李骜研究组以原创性论文(Original paper)的形式,在Bioinformatics上在线发表了最新研究成果。论文的第一作者是博士生余振华。 基因组异常是多种恶性肿瘤的标志性特征,在肿瘤发病机理、临床诊断和治疗等研究中具有极为重要的作用。传统的肿瘤基因组异常检测技术存在着通量低、分辨率差等问题,随着近年来大规模平行测序实验技术的快速兴起,新一代测序凭借其在通量和分辨率方面的独特优势,目前已经成为癌症基因组学研究中最流行的实验手段。但由于肿瘤本身的复杂性,从新一代测序数据中准确检测基因组异常仍面临着正常细胞掺杂和污染、肿瘤基因组非整倍体性等棘手问题。 该研究组提出一种基于全局参数化隐Markov模型的新算法,通过期望最大化方法对模型进行训练和参数估计,从而有效解决了利用新一代测序技术检测复杂肿瘤全基因组异常的国际性难题。 审稿人认为,该算法具有令人关注的特性并为解决......阅读全文

我可以看到灰尘!什么是清洁检查灯?

  该灯可以很容易地看到产品上粘附的灰尘和划痕以及设备和工作环境等粗糙颗粒(灰尘和异物)。   清洁检查灯通过结合暗场照明方法,潮汐现象和倾斜光方法(*)可视化异物。为了使其可见,不可能仅通过光的亮度来可视化异物。由于需要非常强的平直度,因此Clean Check Light系列使用反射器方法(M

PerkinElmer推出用于定量病理学成像研究的Vectra®-3系统

  分析测试百科讯  2015年11月30日,PerkinElmer宣布推出其自动化、高通量的定量病理学成像系统Vectra® 3。这个解决方案的七色联用和可视化功能旨在为病理学家和肿瘤学家的研究提供帮助,从而让他们更深层的理解新的癌症免疫治疗方法相关的疾病机制。    Vectra® 3

细胞凋亡检测方法总览(早期检测、晚期检测和mRNA水平)

细胞凋亡的检测方法,从大类上还可以分为早期检测、晚期检测和mRNA水平的检测。一、早期检测1、PS(磷脂酰丝氨酸)在细胞外膜上的检测2、细胞内氧化还原状态改变的检测3、细胞色素C的定位检测4、线粒体膜电位变化的检测二、 晚期检测1、TUNEL2、LM-PCR Ladder (连接介导的PCR检测)当

工业CT为什么能够应用于市场?

  工业CT即工业计算机断层扫描成像,它能在对检测物体无损伤条件下,以二维断层图像或三维立体图像的形式,清晰、准确、直观地展示被检测物体的内部结构、组成、材质及缺损状况。  工业CT的优势  接触式三坐标测量机、非接触式激光和结构光测量技术在记录形状和尺寸方面都有自己的优势,但即使是它们也无法提供C

高光谱成像在咖啡豆、可可豆、小麦品质检测方面的应用

作物成分的分析和检测通常采用化学方法,使用高效液相色谱(HPLC)或者分光光度法测量提取物。但是化学方法检测需要研磨,具有破坏性,提取和分析所需的大量时间对于工业环境来说是不切实际的。高光谱成像(HSI)是食品科学领域中新技术。它可以快速,非破坏性和非接触方式分析单个谷物或豆类样品,并提供以高通量扫

尿里取宝,氨氮污染源头资源化研究获进展

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508151.shtm氮循环关系到生态环境的可持续发展,也是“能源-食物-水”耦合的重要内容。人类尿液占城市水体积的1%,却富含70%以上的活性氮,将其进行源头分离即可源头控制水体中营养素的来源,又可以实现

做核酸检测能检测出什么

目前我国的核酸检测手段是取咽拭子,通过网络、电视节目,相信很多人看到过取咽拭子的视频,一般是医护人员使用消过毒的棉签,深入被测人员口腔或鼻腔,到达咽喉部位,取该区域的痰液,进行化验。核酸检测采样前两小时尽量不进食;前三十分钟不喝水、不吸烟、不嚼口香糖;排队时保持一米以上间距;临检时,减少吞咽,不做清

荧光检测器的检测原理

  化合物受紫外光激发后,发射出比激发光波长更长的光,称为荧光;  荧光强度 (F) 与激发光强度 (I0) 及荧光物质浓度 (C) 之间的关系为:F=2.3QKI0εCl  F=KC  Q为量子产率,K为荧光效率,ε为摩尔吸光系数,l为光径长度。

激光检测仪的检测原理

  采用可调谐半导体激光吸收光谱(TDLAS)气体分析技术。与传统红外光谱技术相同,TDLAS 气体分析技术本质上是一种吸收光谱技术,通过分析所测光束被气体的选择吸收获得气体浓度。  但与传统红外光谱技术不同,TDLAS 气体分析技术采用的半导体激光光源的光谱宽度远小于气体吸收谱线的展宽。  因此,

PID检测器的检测原理

  使用紫外灯(UV)光源将有机物分子电离成可被检测器检测到的正负离子(离子化)。检测器捕捉到离子化了的气体的正负电荷幵将其转化为电流信号实现气体浓度的测量。  气体离子在检测器的电极上被检测后,很快会电子结合重新组成原来的气体和蒸汽分子。PID是一种非破坏性检测器,它不会改变待测气体分子。可以实现

细胞生长检测方法:NAG检测法

1、按MTT检测法培养细胞和用不同稀释度的细胞因子处理细胞。 2、吸去培养液,用PBS洗涤两次(如为悬浮细胞,应在吸去上清液前先离心)。 3、每孔加60μl NAG染液,在37℃ 5% CO2 的饱和水汽CO2 培养箱中培养4小时。 4、每孔加90μl终止液,混匀后置酶联检测仪上测定光密

核酸检测能检测出什么病

核酸检测能检测出什么病目前来说,核酸检测主要用于检测新冠病毒,但所有病毒都含有核酸,而核酸检测就是通过检测患者的呼吸道分泌物、血液及粪便标本,来判断是否有受到病毒感染的一种检查方式,因此不同的核酸检测,是可以检测到不同病毒的,也就是说,核酸检测能检测出什么病,完全是根据患者做的是什么类型的核酸检测。

甲醛检测仪的检测耗材

  甲醛检测试剂,配合空气检测仪器一起使用,10多分钟就可检测出各种气体的浓度值。

臭氧检测仪的检测原理

  1、半导体式气体检测仪  半导体式气体检测仪是利用一些金属氧化物半导体材料,在一定温度下,电导率随着环境气体成份的变化而变化的原理制造的。比如,酒精传感器,就是利用二氧化锡在高温下遇到酒精气体时,电阻会急剧减小的原理制备的。  半导体式气体检测仪可以有效地用于:甲烷、乙烷、丙烷、丁烷、酒精、甲醛

荧光检测器的检测原理

化合物受紫外光激发后,发射出比激发光波长更长的光,称为荧光;荧光强度 (F) 与激发光强度 (I0) 及荧光物质浓度 (C) 之间的关系为:F=2.3QKI0εClF=KCQ为量子产率,K为荧光效率,ε为摩尔吸光系数,l为光径长度。

作物无损检测—无损检测技术概述

  无损检测与无损评价技术是在物理学、材料科学、断裂力学、机械工程、电子学、计算机技术、信息技术以及人工智能等学科的基础上发展起来的一门应用工程技术。随着现代工业和科学技术的发展,无损检测与无损评价技术正日益受到各个工业领域和科学研究部门的重视,不仅在产品质量控制中其不可替代的作用已为众多科技人员和

ph检测仪检测蚝油方法

ph检测仪检测蚝油方法是:1、准备工作:确保已经获得一台可靠的pH检测仪,并确保已经进行了校准,校准确保pH测量的准确性和精确性。2、样品准备:使用干净的容器将要测试的蚝油样品取出。3、准备pH电极:将pH电极洗净并用纯水冲洗干净,轻轻将其擦干,以确保电极干净且没有任何污物残留。4、进行测量:将准备

臭氧浓度检测仪检测原理

我们知道地球大气层上有一层臭氧层,科学家们已经发现臭氧层能吸收紫外线,研究表明臭氧仅对波长253.7nm的紫外线具有大吸收系数,在此波长下紫外线通过臭氧会产生衰减,符合兰波特——比尔定律。该方法已被美国等国家作为臭氧标准分析方法。该臭氧浓度检测仪就是采用紫外线吸收法的原理,用稳定的紫外灯光源产生紫外

细胞生长检测3:XTT检测法

XTT检测法用XTT代替MTT可省去溶解还原产物结晶的步骤,XTT可以被活细胞中的代谢酶还原成黄色水溶性的代谢产物(formazan)。代谢产物在OD450处有吸收峰。

饭后核酸检测影响检测结果吗?

不会影响结果,但是由于棉签接触测试仪的喉咙,会使测试仪感到不舒服,并可能导致呕吐,建议在进食后2小时收集咽签。同时,采样前30分钟应避免吸烟、饮酒和嚼口香糖。核酸检测新型冠状病毒肺炎仍较准确。如果操作标准,结果通常是准确的。样本采集、储存和检测的准确度、准确度和准确度仍然很高。新冠肺炎病毒仍然依赖于

防腐层检测仪偷油检测

  对于输油管道的偷油卡子可采用金属探测仪辅助探测。金属探测仪是一种磁力仪,能够探测到磁性金属的剩磁磁场,具有超高灵敏度、大测深、自动消除干扰磁场等特点,对盗油(气)卡子有明显信号响应,是查找定位偷接金属管道、查找偷油(气)卡子的理想辅助工具。  对于未经过绝缘处理且与土壤接触的盗油(气)卡子,由于

检测限与检测范围的关系

检测限是指检测数值的最大值或者最小值,检测范围则是指检测物品的检测物品的范围。两者所指的目标会不一样。

食品检测农药残留检测项目

随着农药的批量生产和大面积使用,农药残留问题越来越突出。20世纪40年代之前所使用的农药主要是除虫菊酯、尼古丁等从植物中提取的有机物,以及含砷或含硫、铅、铜等的无机物。20世纪40年代,人们开始采用化学合成的有机农药。目前,全球化学农药年产量近200万吨,大约有1000多种化学合成的化合物用于杀虫除

荧光检测器的检测原理

化合物受紫外光激发后,发射出比激发光波长更长的光,称为荧光;荧光强度 (F) 与激发光强度 (I0) 及荧光物质浓度 (C) 之间的关系为:F=2.3QKI0εClF=KCQ为量子产率,K为荧光效率,ε为摩尔吸光系数,l为光径长度。

热导检测器的检测原理

 热导检测器(TCD)属于浓度型检测器,即检测器的响应值与组分在载气中的浓度成正比。它的基本原理是基于不同物质具有不同的热导系数,几乎对所有的物质都有响应,是目前气相色谱仪中zui广泛应用的通用型检测器。由于在检测过程中样品不被破坏,因此可用于制备和其他联用鉴定技术。其特点是结构简单,灵敏度适宜,稳

气体检测仪检测原理

以常见的红外线气体检测仪为例,说明气体检测仪的原理:测量这种吸收光谱可判别出气体的种类;测量吸收强度可确定被测气体的浓度。红外线检测仪的使用范围宽,不仅可分析气体成分,也可分析溶液成分,且灵敏度较高,反应迅速,能在线连续指示,也可组成调节系统。工业上常用的红外线气体检测仪的检测部分由两个并列的结构相

细胞生长检测5:NAG检测法

NAG检测法1.按MTT检测法培养细胞和用不同稀释度的细胞因子处理细胞。2.吸去培养液,用PBS洗涤两次(如为悬浮细胞,应在吸去上清液前先离心)。3.每孔加60μl NAG染液,在37℃ 5% CO2的饱和水汽二氧化碳培养箱中培养4小时。4.每孔加90μl终止液,混匀后置酶联检测仪上测定光密度(OD

血液检测可以检测出哪些内容?

血液检测可以检测出以下的一些内容:丙氨酸氨基转移酶乙型肝炎病毒表面抗原丙型肝炎病毒抗体艾滋病病毒抗体梅毒试验

生物安全柜检测检测项目

1、过滤器完整性a)运行安全柜的风机和灯,去掉过滤器的散流装置和保护盖。安放气溶胶发生器,将气溶胶导入安全柜,产生均匀分布的过滤器上游气流。b)打开气溶胶光度计,进行调整;对含有气溶胶的过滤器上游气流进行测试,至少应有20ug/L PAO 。c)光度计探头在过滤器下游距过滤器表面不超过25mm,以小