Nature重大成果:首张人体蛋白详细图谱

说起第一张人类基因组图谱,那已经是十几年前的事了,当年科学家们破解了24对染色体之后,满以为就此人体的奥秘可以破解了,然而时间过去了许多年,我们对于人体的功能,发育的过程,疾病的发生依然一知半解,这其中的原因也许就在于蛋白的奥秘还蒙着一层厚厚的面纱。 5月底,来自慕尼黑工业大学的一组研究人员编撰了18000多个蛋白,绘制了一张几乎完整的人类蛋白质组图谱,目前这一图谱相关信息可免费获取(ProteomicsDB database, https://www.proteomicsdb.org/)——由慕尼黑工业大学与软件公司SAP共同开发。其中包含了不同细胞,组织,以及体液中多种蛋白类型,蛋白分布和蛋白丰度的相关信息。 这项研究表明,一方面多个不同区域的基本功能过程涉及了上万种蛋白,另外一方面,每个器官中的蛋白图谱都是独一无二的,具有功能特异性。 同时在这项研究中还采用了两种高通量技术,用于确保这项研究的顺利进行,这两项技术......阅读全文

组蛋白修饰基因通路HDAC2基因

该基因产物属于组蛋白脱乙酰基酶家族。组蛋白脱乙酰基酶通过形成大的多蛋白复合物起作用,并负责核心组蛋白(H2A、H2B、H3和H4)N端赖氨酸残基的脱乙酰化。这种蛋白通过与许多不同的蛋白质结合形成转录抑制复合物,包括哺乳动物锌指转录因子YY1。因此,它在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着重要作用。

组蛋白修饰基因通路TAF1基因

rna聚合酶ii启动转录需要70多种多肽的活性。协调这些活动的蛋白质是基础转录因子tfiid,它与核心启动子结合以正确定位聚合酶,充当组装其余转录复合物的支架,并充当调控信号的通道。tfiid由tata结合蛋白(tbp)和一组进化上保守的蛋白质(tbp相关因子或taf)组成。tafs可能参与基础转录

组蛋白修饰基因通路KDM5A基因

该基因编码Jumonji,富含AT的相互作用域1(JARID1)组蛋白脱甲基酶蛋白家族的成员。 编码的蛋白质通过组蛋白编码使组蛋白H3的赖氨酸4脱甲基,从而在基因调控中发挥作用。 编码的蛋白质与许多其他蛋白质(包括成视网膜细胞瘤蛋白质)相互作用,并与Hox基因和细胞因子的转录调控有关。 该基因可能在

绿色荧光蛋白基因与红色荧光蛋白基因是同源的吗

绿色荧光蛋白基因与红色荧光蛋白基因是同源的(1)在该实验中,绿色荧光蛋白基因是目的基因.(2)③是将目的基因导入受体细胞的过程,当受体细胞是动物细胞时,采用最多也最有效的方法是显微注射技术.(3)GFP基因可以作为标记基因,标记基因的作用是鉴定受体细胞中是否含有目的基因.(4)动物细胞培养时,其培养

华大基因中心正研究智商基因

  中国有基因中心进行天才基因比对研究,希望解开人类智力密码。相关研究容易引起道德争议,被利用来针对某个族群。亦有学者担心,人类有朝一日会藉研究成果,透过胚胎筛选技术製造天才婴儿。   深圳华大基因中心进行的基因智力专桉,是将从世界各地收集到的2000组聪明人的基因样本,和普通人的基因样本做比对,

研究发现载脂蛋白B-(APOB)基因突变可能预防心脏病

  在预防心脏病方面,现代医学研究发现一种罕见的基因突变可能有效。但是由于脂肪肝的风险,针对载脂蛋白B (APOB)基因的临床试验尚未对心血管结果进行检测,但自然发生的突变表明它可能是有效的。  图片来源:http://cn.bing.com  一项由波士顿大学公共卫生学院(BUSPH)研究人员共同

时空特异性蛋白质递送及基因编辑研究方面获进展

  蛋白质是生命体内最重要的生物大分子之一,在生命活动过程中执行着多种关键功能。利用外源性获取的蛋白质,可以在细胞及体内实现生物大分子的化学标记与功能调控,进而应用于生命机制的解析研究及疾病的靶向治疗。然而,由于蛋白质本质上具有亲水性,难以自主穿透疏水性细胞膜到达胞内靶点并实现特定器官组织的靶向。因

昆明植物所枯草杆菌蛋白酶类基因家族进化研究获进展

  枯草杆菌蛋白酶(subtilase)是一类丝氨酸蛋白酶,广泛存在于古细菌、细菌与真核生物中。这类蛋白酶在结构上具有典型的 Asp/Ser/His 催化结构域,具有广泛的生理学功能,包括从非特异性的降解蛋白功能,(比如降解地衣芽孢杆菌中的丝氨酸蛋白),到特异性的参与多肽类激素的形成,(比如特异性降

基因置换实验——构建融合蛋白

实验材料菌株BY4741质粒PDB118试剂、试剂盒磷酸盐缓冲液仪器、耗材YPD 平板YPD 液体培养基血球计数板SC-his平板实验步骤YPD 平板 第 1 天将菌株 7-3 在 YPD 平板上划单克隆,30°C 下培养两天。第 3 天挑取单克隆,在 5 mlYPD 液体培养基中培养,30°C 过

黏蛋白的基因的介绍

  至少有20人黏蛋白基因已经被区别在于基因的克隆-MUC1,MUC2,MUC3A,MUC3B,MUC4,MUC5AC,MUC5B,MUC6,MUC7,MUC8,MUC12,MUC13,MUC15,MUC16,MUC17,MUC19,MUC20,MUC21和MUC22。  主要的分泌呼吸道粘蛋白是M

调整基因编码蛋白的检测

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调整基因编码蛋白的检测

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关于组蛋白基因的简介

  组蛋白基因(histone gene) 组蛋白基因是已知的重复基因中唯一具有蛋白质编码机能的基因。它们在DNA合成开始前短暂地表达,因而它的活动与细胞周期密切相关。  基因组中存在大量重复序列用以编码组蛋白是有其重要意义的。DNA复制时,组蛋白也要成倍增加,而且往往在DNA合成一小段后,组蛋白马

组蛋白修饰基因通路KMT2D基因

这个基因编码的蛋白质是组蛋白甲基转移酶,它甲基化组蛋白H3的Lys-4位置。编码蛋白是一种叫做抗坏血酸的大蛋白复合物的一部分,它被证明是β-珠蛋白和雌激素受体基因的转录调节器。这种基因的突变被证明是导致歌舞伎综合征的原因。

组蛋白修饰基因通路KMT2C基因

该基因是髓系/淋巴系或混合系白血病(MLL)家族的成员,编码核蛋白,具有AT-Hook DNA结合域、DHHC型锌指、六个PhD型锌指、一个集合域、一个后集合域和一个环状锌指。该蛋白是ASC-2/NCOA6复合物(ASCOM)的成员,具有组蛋白甲基化活性,参与转录协同激活。

组蛋白修饰基因通路KDM5C基因

该基因是smcy同系物家族的成员,编码一个干旱区、一个jmjc区、一个jmjn区和两个phd型锌指蛋白。DNA结合基序表明该蛋白参与转录和染色质重塑的调节。这种基因的突变与X连锁精神发育迟滞有关。选择性剪接导致多个转录变体。

血糖研究热门靶标:糖化白蛋白研究

白蛋白是一类球蛋白,最常见的是血清白蛋白。白蛋白家族的所有蛋白质都是水溶性的,在浓盐溶液中有一定的溶解性。白蛋白通常存在于血浆中,与其他血液蛋白的不同之处在于它们没有糖基化。含有白蛋白的物质,如蛋清,称为类白蛋白。许多血液转运蛋白是进化相关的,包括血清白蛋白,甲胎蛋白,维生素D结合蛋白等。糖化白蛋白

蛋白组学应用前沿:肝脏疾病研究进入后基因组时代

蛋白组学应用前沿:肝脏疾病研究进入后基因组时代

华南农业大学团队研究揭示作物中杀虫剂转运蛋白基因

  近日,华南农业大学亚热带农业生物资源与利用国家重点实验室、天然农药与化学生物学教育部重点实验室徐汉虹与林菲课题组首次研究报道了作物中杀虫剂转运蛋白基因。他们克隆了噻虫嗪高效利用吸收转运蛋白基因OsATL15,并对其潜在的分子机制和应用价值进行了初步探究。相关研究发表于Plant Biotechn

水生所在原核生物的蛋白基因组分析研究中取得进展

  蛋白基因组学(Proteogenomics) 是基于高精度的串联质谱数据对基因组进行注释,不仅能在蛋白质水平上验证基因表达和模式,还能提供蛋白质组层面特有的信息,如翻译后修饰、信号肽等。目前,蛋白基因组学已成为功能基因组学研究不可或缺的重要工具。然而,对海量质谱数据实现全面和精准的解读仍是当前蛋

研究揭示水稻RNA识别结构域蛋白抑制外源基因沉默的机制

  植物是复杂的生物系统。植物体内基因的表达受到多种水平的调控,如转录水平、转录后水平、DNA甲基化/去甲基化等,从而对基因表达进行精密高效的调控。  中国科学院遗传与发育生物学研究所张劲松研究组筛选OsEIN2过表达材料的抑制子,鉴定到一个包含RNA识别结构域(RRM)的蛋白SOE。SOE可以与剪

Nature发布大规模癌症蛋白质基因组学研究重要成果

  基于来自癌症基因组图谱(TCGA)计划的数据,一个多机构科学家小组完成了首个大规模的乳腺癌“蛋白质基因组学”( proteogenomic)研究,将一些DNA突变与蛋白质信号联系到一起,并帮助确定了一些驱动癌症的基因。  这项研究旨在通过蛋白质和它们的修饰来更好地认识癌症。发表在5月25日《自然

如何研究细胞关键蛋白

来自上海生科院生化与所的研究人员利用多种细胞手段发现了两种关键细胞蛋白的作用机理,这两种蛋白分别是C末端Src激酶(C-terminal Src kinase,Csk)和细胞极性封闭蛋白Occludin。研究论文分别发表在《Proteomic》和《Developmental Cell》上。

研究核蛋白的意义

  因为核蛋白的核酸与生物遗传与蛋白质生物合成关系密切,所以有关核蛋白结构与功能的研究十分活跃。如烟草斑纹病毒与小儿麻痹症病毒、流行性感冒病毒等动植物病毒本身就是核蛋白,所以核蛋白的研究在动及植物病害的防治及临床医学上有十分重要意义。

常见癌基因编码蛋白的检测

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免疫球蛋白基因的介绍

  在通过生殖细胞而传递的基因(germ line genes)中,这些表达各个肽链的基因形成多重基因族。例如小鼠,其κ链基因有从数十到数百个可变区基因族(V基因族)和一个恒定区基因族(C基因族)并列于染色体上,而λ链基因为数个V基因族和数个C基因族,H链基因为从数十至数百个V基因族和约十个C基因族

常见癌基因编码蛋白的检测

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核蛋白基因组指纹技术

Fine Mapping of Genomic Targets of Nuclear Proteins in Cultured CellsAchim Breiling and Valerio OrlandoDulbecco Telethon Institute, Institute of Genet